MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_006461	GAA	2	6	1398695	1398700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981437
38003	NC_006461	G	6	6	1398759	1398764	0 %	0 %	100 %	0 %	55981437
38004	NC_006461	GAC	2	6	1398861	1398866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981437
38005	NC_006461	CGC	2	6	1398878	1398883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981437
38006	NC_006461	G	6	6	1398981	1398986	0 %	0 %	100 %	0 %	55981437
38007	NC_006461	GGA	2	6	1399025	1399030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981437
38008	NC_006461	GGA	2	6	1399097	1399102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981437
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38010	NC_006461	CGG	2	6	1399195	1399200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981437
38011	NC_006461	TGG	2	6	1399213	1399218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981437
38012	NC_006461	CAG	2	6	1399230	1399235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981437
38013	NC_006461	ACC	2	6	1399264	1399269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38015	NC_006461	TCA	2	6	1399411	1399416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38017	NC_006461	CCTG	2	8	1399458	1399465	0 %	25 %	25 %	50 %	55981438
38018	NC_006461	CCT	2	6	1399523	1399528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981438
38019	NC_006461	CGC	2	6	1399559	1399564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981438
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38240	NC_006461	G	6	6	1407435	1407440	0 %	0 %	100 %	0 %	55981446
38241	NC_006461	GAG	2	6	1407460	1407465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981446
38242	NC_006461	GAA	2	6	1407525	1407530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981446
38243	NC_006461	CCT	2	6	1407633	1407638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981446
38244	NC_006461	TCC	2	6	1407671	1407676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981446
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38254	NC_006461	GA	3	6	1408039	1408044	50 %	0 %	50 %	0 %	55981447
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38299	NC_006461	CAC	3	9	1410239	1410247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981452
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38328	NC_006461	CAC	2	6	1411290	1411295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981454
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38333	NC_006461	TCG	2	6	1411452	1411457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981454
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38337	NC_006461	GGC	2	6	1411565	1411570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981454
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38345	NC_006461	GCCC	2	8	1411886	1411893	0 %	0 %	25 %	75 %	55981454
38346	NC_006461	C	6	6	1411908	1411913	0 %	0 %	0 %	100 %	55981454
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38352	NC_006461	CCGCC	2	10	1412144	1412153	0 %	0 %	20 %	80 %	55981454
38353	NC_006461	GAGG	2	8	1412209	1412216	25 %	0 %	75 %	0 %	55981454
38354	NC_006461	TCC	2	6	1412229	1412234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981454
38355	NC_006461	GAA	2	6	1412240	1412245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981454
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38357	NC_006461	GCA	2	6	1412278	1412283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981454
38358	NC_006461	CCT	2	6	1412419	1412424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981454
38359	NC_006461	TCC	2	6	1412457	1412462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981454
38360	NC_006461	ACC	2	6	1412476	1412481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981455
38361	NC_006461	CCT	2	6	1412511	1412516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981455
38362	NC_006461	TCC	2	6	1412528	1412533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981455
38363	NC_006461	TCGGGG	2	12	1412564	1412575	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55981455
38364	NC_006461	GTA	2	6	1412590	1412595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981455
38365	NC_006461	CTC	2	6	1412611	1412616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981455
38366	NC_006461	GAG	2	6	1412620	1412625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981455
38367	NC_006461	GGA	2	6	1412628	1412633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981455
38368	NC_006461	C	7	7	1412644	1412650	0 %	0 %	0 %	100 %	55981455
38369	NC_006461	CGGGG	2	10	1412662	1412671	0 %	0 %	80 %	20 %	55981455
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38382	NC_006461	TGC	3	9	1413218	1413226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981456
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38386	NC_006461	GGA	3	9	1413390	1413398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981456
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38389	NC_006461	CGGG	2	8	1413510	1413517	0 %	0 %	75 %	25 %	55981456
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38394	NC_006461	CGG	2	6	1413707	1413712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981456
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38421	NC_006461	CGG	2	6	1414938	1414943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981456
38422	NC_006461	TCCC	2	8	1415019	1415026	0 %	25 %	0 %	75 %	55981456
38423	NC_006461	CTC	2	6	1415134	1415139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981456
38424	NC_006461	GGC	2	6	1415175	1415180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981456
38425	NC_006461	TC	3	6	1415305	1415310	0 %	50 %	0 %	50 %	55981456
38426	NC_006461	AGG	2	6	1415318	1415323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981456
38427	NC_006461	GGC	2	6	1415404	1415409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981456
38428	NC_006461	CCT	2	6	1415439	1415444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38433	NC_006461	TCC	3	9	1415589	1415597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981457
38434	NC_006461	GCC	2	6	1415664	1415669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981457
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38436	NC_006461	TAG	2	6	1415728	1415733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981457
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38438	NC_006461	GCCCTT	2	12	1415841	1415852	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55981458
38439	NC_006461	TCC	2	6	1415864	1415869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981458
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38441	NC_006461	C	7	7	1415934	1415940	0 %	0 %	0 %	100 %	55981458
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38447	NC_006461	CTCCC	2	10	1416088	1416097	0 %	20 %	0 %	80 %	55981458
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38449	NC_006461	CGGA	2	8	1416115	1416122	25 %	0 %	50 %	25 %	55981458
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38461	NC_006461	TTG	2	6	1416442	1416447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981458
38462	NC_006461	GGT	2	6	1416455	1416460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981458
38463	NC_006461	TCC	2	6	1416496	1416501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981458
38464	NC_006461	GTA	2	6	1416534	1416539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981458
38465	NC_006461	CTT	2	6	1416543	1416548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981458
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38470	NC_006461	GCCA	2	8	1416756	1416763	25 %	0 %	25 %	50 %	55981459
38471	NC_006461	GAA	2	6	1416771	1416776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981459
38472	NC_006461	GTC	2	6	1416852	1416857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981459
38473	NC_006461	CTCCCG	2	12	1416897	1416908	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981459
38474	NC_006461	CTC	3	9	1416918	1416926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981459
38475	NC_006461	GAG	2	6	1416957	1416962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981459
38476	NC_006461	CTC	3	9	1416993	1417001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981459
38477	NC_006461	CGC	2	6	1417002	1417007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981459
38478	NC_006461	CTC	2	6	1417017	1417022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981459
38479	NC_006461	GGGCCT	2	12	1417025	1417036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981459
38480	NC_006461	CTC	2	6	1417086	1417091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981459
38481	NC_006461	G	6	6	1417106	1417111	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38482	NC_006461	GGGGC	2	10	1417126	1417135	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38483	NC_006461	CGT	2	6	1417182	1417187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981460
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38485	NC_006461	CTC	2	6	1417228	1417233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981460
38486	NC_006461	CTC	2	6	1417249	1417254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981460
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38488	NC_006461	TCGGGG	2	12	1417271	1417282	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55981460
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38490	NC_006461	GCG	3	9	1417429	1417437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981460
38491	NC_006461	TCC	2	6	1417439	1417444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981460
38492	NC_006461	CCT	2	6	1417461	1417466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981460
38493	NC_006461	TCC	2	6	1417484	1417489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981460
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38499	NC_006461	CGG	2	6	1417710	1417715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981460
38500	NC_006461	CGG	2	6	1417728	1417733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981460

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