MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_006461	CAA	2	6	1379560	1379565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37503	NC_006461	G	6	6	1379576	1379581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37504	NC_006461	C	7	7	1379592	1379598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37505	NC_006461	G	7	7	1379613	1379619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37506	NC_006461	AAG	2	6	1379629	1379634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37507	NC_006461	GGA	2	6	1379730	1379735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
37508	NC_006461	TCC	3	9	1379742	1379750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981421
37509	NC_006461	GCG	2	6	1379763	1379768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981421
37510	NC_006461	GGT	2	6	1379776	1379781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981421
37511	NC_006461	G	6	6	1379786	1379791	0 %	0 %	100 %	0 %	55981421
37512	NC_006461	TGG	3	9	1379835	1379843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981421
37513	NC_006461	G	6	6	1379860	1379865	0 %	0 %	100 %	0 %	55981421
37514	NC_006461	AGG	2	6	1379883	1379888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
37515	NC_006461	GGCG	2	8	1379946	1379953	0 %	0 %	75 %	25 %	55981421
37516	NC_006461	CCT	2	6	1379965	1379970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981421
37517	NC_006461	G	6	6	1379994	1379999	0 %	0 %	100 %	0 %	55981421
37518	NC_006461	C	6	6	1380012	1380017	0 %	0 %	0 %	100 %	55981421
37519	NC_006461	GCC	2	6	1380029	1380034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981421
37520	NC_006461	CCG	2	6	1380049	1380054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981421
37521	NC_006461	GGT	2	6	1380097	1380102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981421
37522	NC_006461	GGGCCG	2	12	1380105	1380116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981421
37523	NC_006461	ACT	2	6	1380144	1380149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981421
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37525	NC_006461	C	6	6	1380177	1380182	0 %	0 %	0 %	100 %	55981421
37526	NC_006461	TGG	2	6	1380201	1380206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981421
37527	NC_006461	GGA	2	6	1380250	1380255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
37528	NC_006461	CAC	2	6	1380257	1380262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981421
37529	NC_006461	GCC	2	6	1380267	1380272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981421
37530	NC_006461	GAG	2	6	1380323	1380328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
37531	NC_006461	GGA	2	6	1380343	1380348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
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37533	NC_006461	GGA	2	6	1380370	1380375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
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37535	NC_006461	CCT	2	6	1380426	1380431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981421
37536	NC_006461	GAG	2	6	1380521	1380526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
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37538	NC_006461	TCCG	2	8	1380602	1380609	0 %	25 %	25 %	50 %	55981421
37539	NC_006461	GAG	2	6	1380629	1380634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
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37541	NC_006461	GAG	2	6	1380646	1380651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
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37543	NC_006461	G	6	6	1380688	1380693	0 %	0 %	100 %	0 %	55981421
37544	NC_006461	GAG	2	6	1380713	1380718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981421
37545	NC_006461	C	7	7	1380797	1380803	0 %	0 %	0 %	100 %	55981421
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37548	NC_006461	GC	3	6	1380939	1380944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37549	NC_006461	C	6	6	1381149	1381154	0 %	0 %	0 %	100 %	55981422
37550	NC_006461	GGC	2	6	1381229	1381234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981422
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37553	NC_006461	TCG	2	6	1381371	1381376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981422
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37555	NC_006461	GGC	2	6	1381406	1381411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981422
37556	NC_006461	GAA	2	6	1381412	1381417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981422
37557	NC_006461	CAGGC	2	10	1381512	1381521	20 %	0 %	40 %	40 %	55981422
37558	NC_006461	TGA	2	6	1381534	1381539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981422
37559	NC_006461	AGG	2	6	1381623	1381628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981422
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37561	NC_006461	GGA	2	6	1381708	1381713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981422
37562	NC_006461	CCTC	2	8	1381734	1381741	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37563	NC_006461	TAG	2	6	1381743	1381748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981423
37564	NC_006461	TCG	2	6	1381851	1381856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981423
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37569	NC_006461	CAT	2	6	1382099	1382104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981423
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37573	NC_006461	GCGG	2	8	1382237	1382244	0 %	0 %	75 %	25 %	55981423
37574	NC_006461	CCCGG	2	10	1382252	1382261	0 %	0 %	40 %	60 %	55981423
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37588	NC_006461	GAG	2	6	1382729	1382734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981423
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37601	NC_006461	C	8	8	1383256	1383263	0 %	0 %	0 %	100 %	55981423
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37604	NC_006461	C	7	7	1383329	1383335	0 %	0 %	0 %	100 %	55981423
37605	NC_006461	GCC	2	6	1383339	1383344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981423
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37608	NC_006461	GGC	2	6	1383416	1383421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981423
37609	NC_006461	GCCC	2	8	1383428	1383435	0 %	0 %	25 %	75 %	55981423
37610	NC_006461	CACC	2	8	1383442	1383449	25 %	0 %	0 %	75 %	55981423
37611	NC_006461	GAA	2	6	1383522	1383527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981424
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37614	NC_006461	C	6	6	1383621	1383626	0 %	0 %	0 %	100 %	55981424
37615	NC_006461	GGA	2	6	1383629	1383634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981424
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37857	NC_006461	GTGG	2	8	1392816	1392823	0 %	25 %	75 %	0 %	55981435
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