MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_006461	CCT	2	6	1250556	1250561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981280
34003	NC_006461	GAG	2	6	1250566	1250571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981280
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34011	NC_006461	TGG	2	6	1250805	1250810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981281
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34015	NC_006461	TGG	2	6	1251009	1251014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981281
34016	NC_006461	GCGG	2	8	1251022	1251029	0 %	0 %	75 %	25 %	55981281
34017	NC_006461	TGG	2	6	1251039	1251044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981281
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34020	NC_006461	TCC	2	6	1251171	1251176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981281
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34057	NC_006461	TCC	4	12	1252210	1252221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981282
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34102	NC_006461	GGGCCA	2	12	1253912	1253923	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981284
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34113	NC_006461	AGGA	2	8	1254256	1254263	50 %	0 %	50 %	0 %	55981284
34114	NC_006461	CGG	2	6	1254323	1254328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981284
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34119	NC_006461	C	7	7	1254543	1254549	0 %	0 %	0 %	100 %	55981284
34120	NC_006461	GGA	2	6	1254560	1254565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981284
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34227	NC_006461	C	7	7	1258868	1258874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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34238	NC_006461	CCT	2	6	1259352	1259357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981290
34239	NC_006461	GGT	2	6	1259361	1259366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981290
34240	NC_006461	GGT	2	6	1259370	1259375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981290
34241	NC_006461	GGGC	2	8	1259448	1259455	0 %	0 %	75 %	25 %	55981290
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34243	NC_006461	CCT	2	6	1259535	1259540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981290
34244	NC_006461	GGGCG	2	10	1259556	1259565	0 %	0 %	80 %	20 %	55981290
34245	NC_006461	CCAGGT	2	12	1259568	1259579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55981290
34246	NC_006461	GAA	2	6	1259605	1259610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981290
34247	NC_006461	C	7	7	1259614	1259620	0 %	0 %	0 %	100 %	55981290
34248	NC_006461	TGC	3	9	1259636	1259644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981290
34249	NC_006461	CGG	2	6	1259688	1259693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981290
34250	NC_006461	GCCGG	2	10	1259701	1259710	0 %	0 %	60 %	40 %	55981290
34251	NC_006461	GCCTC	2	10	1259730	1259739	0 %	20 %	20 %	60 %	55981290
34252	NC_006461	CTA	2	6	1259751	1259756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34253	NC_006461	GC	3	6	1259770	1259775	0 %	0 %	50 %	50 %	55981291
34254	NC_006461	CGG	2	6	1259838	1259843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981291
34255	NC_006461	CGGG	2	8	1259859	1259866	0 %	0 %	75 %	25 %	55981291
34256	NC_006461	GGA	2	6	1259916	1259921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981291
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34259	NC_006461	GCCTG	2	10	1259999	1260008	0 %	20 %	40 %	40 %	55981291
34260	NC_006461	GTG	2	6	1260028	1260033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981291
34261	NC_006461	GGA	2	6	1260057	1260062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981291
34262	NC_006461	CCT	2	6	1260084	1260089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981291
34263	NC_006461	CGC	2	6	1260096	1260101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981291
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34268	NC_006461	GCG	2	6	1260236	1260241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981291
34269	NC_006461	GCG	2	6	1260248	1260253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981291
34270	NC_006461	TCC	3	9	1260261	1260269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981292
34271	NC_006461	AGG	2	6	1260279	1260284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981292
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34273	NC_006461	AGG	2	6	1260339	1260344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981292
34274	NC_006461	CGG	2	6	1260385	1260390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981292
34275	NC_006461	AGGC	2	8	1260393	1260400	25 %	0 %	50 %	25 %	55981292
34276	NC_006461	GGCG	2	8	1260403	1260410	0 %	0 %	75 %	25 %	55981292
34277	NC_006461	AGG	2	6	1260411	1260416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981292
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34282	NC_006461	GAG	2	6	1260506	1260511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981292
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34304	NC_006461	CCGG	2	8	1261087	1261094	0 %	0 %	50 %	50 %	55981292
34305	NC_006461	CCGG	2	8	1261108	1261115	0 %	0 %	50 %	50 %	55981292
34306	NC_006461	C	6	6	1261140	1261145	0 %	0 %	0 %	100 %	55981292
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34310	NC_006461	GCCCC	2	10	1261216	1261225	0 %	0 %	20 %	80 %	55981292
34311	NC_006461	GCGAG	2	10	1261269	1261278	20 %	0 %	60 %	20 %	55981292
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34317	NC_006461	GAG	3	9	1261430	1261438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981292
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34342	NC_006461	GCT	2	6	1262212	1262217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981293
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34344	NC_006461	CCT	2	6	1262265	1262270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981293
34345	NC_006461	CCT	2	6	1262286	1262291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981293
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34353	NC_006461	GACGAG	2	12	1262479	1262490	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55981293
34354	NC_006461	GCG	2	6	1262530	1262535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981293
34355	NC_006461	CCA	2	6	1262538	1262543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981293
34356	NC_006461	GCG	2	6	1262627	1262632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981293
34357	NC_006461	CGC	2	6	1262659	1262664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981293
34358	NC_006461	GCCTCC	2	12	1262675	1262686	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981293
34359	NC_006461	CCT	3	9	1262718	1262726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981293
34360	NC_006461	GCTCCC	2	12	1262760	1262771	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981293
34361	NC_006461	GTA	2	6	1262851	1262856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981293
34362	NC_006461	GTA	2	6	1262875	1262880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981293
34363	NC_006461	C	7	7	1263028	1263034	0 %	0 %	0 %	100 %	55981293
34364	NC_006461	TCC	2	6	1263056	1263061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981293
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34393	NC_006461	GGAG	2	8	1264372	1264379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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34465	NC_006461	GAG	2	6	1267934	1267939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981297
34466	NC_006461	GTG	2	6	1268025	1268030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981297
34467	NC_006461	GAT	2	6	1268036	1268041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981297
34468	NC_006461	CAC	2	6	1268060	1268065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981297
34469	NC_006461	ACC	2	6	1268133	1268138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981297
34470	NC_006461	C	6	6	1268370	1268375	0 %	0 %	0 %	100 %	55981297
34471	NC_006461	TCT	2	6	1268383	1268388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981297
34472	NC_006461	CAGGGT	2	12	1268447	1268458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55981297
34473	NC_006461	C	7	7	1268462	1268468	0 %	0 %	0 %	100 %	55981297
34474	NC_006461	GCCC	2	8	1268478	1268485	0 %	0 %	25 %	75 %	55981297
34475	NC_006461	C	6	6	1268498	1268503	0 %	0 %	0 %	100 %	55981297
34476	NC_006461	CCG	2	6	1268531	1268536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981297
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34478	NC_006461	CCG	2	6	1268573	1268578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34479	NC_006461	GCA	2	6	1268664	1268669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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