MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_006461	TGA	2	6	1213582	1213587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981241
33003	NC_006461	CGG	2	6	1213623	1213628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981241
33004	NC_006461	GAT	2	6	1213655	1213660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981241
33005	NC_006461	TCC	2	6	1213731	1213736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981241
33006	NC_006461	CTTGCC	2	12	1213742	1213753	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55981241
33007	NC_006461	GTT	2	6	1213760	1213765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981241
33008	NC_006461	GAGG	2	8	1213778	1213785	25 %	0 %	75 %	0 %	55981241
33009	NC_006461	GTC	3	9	1213892	1213900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981241
33010	NC_006461	CTT	2	6	1213937	1213942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981241
33011	NC_006461	CCA	2	6	1213948	1213953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981241
33012	NC_006461	GC	3	6	1213959	1213964	0 %	0 %	50 %	50 %	55981241
33013	NC_006461	TGG	2	6	1213972	1213977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981241
33014	NC_006461	CGG	2	6	1214010	1214015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981241
33015	NC_006461	GGC	2	6	1214033	1214038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981241
33016	NC_006461	AGT	2	6	1214062	1214067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981241
33017	NC_006461	G	6	6	1214146	1214151	0 %	0 %	100 %	0 %	55981241
33018	NC_006461	TGG	2	6	1214167	1214172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981241
33019	NC_006461	GTC	2	6	1214174	1214179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981241
33020	NC_006461	GGC	2	6	1214273	1214278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981241
33021	NC_006461	CTC	2	6	1214297	1214302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981241
33022	NC_006461	GGCG	2	8	1214344	1214351	0 %	0 %	75 %	25 %	55981241
33023	NC_006461	GCG	2	6	1214358	1214363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981241
33024	NC_006461	TCA	2	6	1214428	1214433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981241
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33033	NC_006461	CTT	2	6	1214834	1214839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981241
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33035	NC_006461	CCT	2	6	1214903	1214908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981242
33036	NC_006461	CTC	3	9	1214925	1214933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981242
33037	NC_006461	C	6	6	1214999	1215004	0 %	0 %	0 %	100 %	55981242
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33042	NC_006461	CTG	2	6	1215108	1215113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981242
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33052	NC_006461	GGC	2	6	1215519	1215524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981242
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33055	NC_006461	GGC	2	6	1215578	1215583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981242
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33063	NC_006461	ACC	3	9	1216078	1216086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981242
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33118	NC_006461	CGG	2	6	1218294	1218299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981245
33119	NC_006461	GGC	2	6	1218302	1218307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981245
33120	NC_006461	GGA	2	6	1218343	1218348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981245
33121	NC_006461	TCC	2	6	1218363	1218368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981245
33122	NC_006461	CGGCCT	2	12	1218382	1218393	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981245
33123	NC_006461	GGCCTC	2	12	1218395	1218406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981245
33124	NC_006461	GGA	2	6	1218409	1218414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981245
33125	NC_006461	CCT	2	6	1218436	1218441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981245
33126	NC_006461	CCCT	2	8	1218473	1218480	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33127	NC_006461	AGG	2	6	1218504	1218509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33130	NC_006461	CGCC	2	8	1218648	1218655	0 %	0 %	25 %	75 %	55981246
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33133	NC_006461	GCC	3	9	1218755	1218763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981246
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33150	NC_006461	GAA	2	6	1219371	1219376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981247
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33152	NC_006461	GAG	2	6	1219413	1219418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981247
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33224	NC_006461	C	6	6	1222072	1222077	0 %	0 %	0 %	100 %	55981249
33225	NC_006461	AGG	2	6	1222128	1222133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981249
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33235	NC_006461	ACC	2	6	1222314	1222319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981249
33236	NC_006461	CCT	2	6	1222384	1222389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981250
33237	NC_006461	GCA	2	6	1222402	1222407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981250
33238	NC_006461	TCTGG	2	10	1222408	1222417	0 %	40 %	40 %	20 %	55981250
33239	NC_006461	GGGCC	2	10	1222423	1222432	0 %	0 %	60 %	40 %	55981250
33240	NC_006461	GAGGAC	2	12	1222433	1222444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55981250
33241	NC_006461	TGG	2	6	1222449	1222454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981250
33242	NC_006461	CTC	2	6	1222505	1222510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981250
33243	NC_006461	GCC	2	6	1222533	1222538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981250
33244	NC_006461	CCGGGT	2	12	1222552	1222563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981250
33245	NC_006461	GTGG	2	8	1222567	1222574	0 %	25 %	75 %	0 %	55981250
33246	NC_006461	CGC	2	6	1222710	1222715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981251
33247	NC_006461	C	6	6	1222756	1222761	0 %	0 %	0 %	100 %	55981251
33248	NC_006461	GCTGGA	2	12	1222797	1222808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55981251
33249	NC_006461	GCCTCC	2	12	1222814	1222825	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981251
33250	NC_006461	C	6	6	1222824	1222829	0 %	0 %	0 %	100 %	55981251
33251	NC_006461	G	6	6	1222841	1222846	0 %	0 %	100 %	0 %	55981251
33252	NC_006461	GGA	2	6	1222893	1222898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981251
33253	NC_006461	GAA	2	6	1222940	1222945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33254	NC_006461	AGG	2	6	1222948	1222953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33255	NC_006461	TGG	2	6	1222961	1222966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981252
33256	NC_006461	CGG	2	6	1222988	1222993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981252
33257	NC_006461	TCC	2	6	1222994	1222999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981252
33258	NC_006461	ACGG	2	8	1223002	1223009	25 %	0 %	50 %	25 %	55981252
33259	NC_006461	GCC	2	6	1223056	1223061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981252
33260	NC_006461	CCCACG	2	12	1223102	1223113	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55981252
33261	NC_006461	AAG	2	6	1223146	1223151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981252
33262	NC_006461	GTG	2	6	1223158	1223163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981252
33263	NC_006461	G	6	6	1223229	1223234	0 %	0 %	100 %	0 %	55981252
33264	NC_006461	GGCT	2	8	1223254	1223261	0 %	25 %	50 %	25 %	55981252
33265	NC_006461	GTG	3	9	1223329	1223337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981252
33266	NC_006461	CTC	2	6	1223428	1223433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981252
33267	NC_006461	CTC	2	6	1223488	1223493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981252
33268	NC_006461	AAG	2	6	1223500	1223505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981252
33269	NC_006461	GTG	2	6	1223506	1223511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981252
33270	NC_006461	ACA	2	6	1223522	1223527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55981252
33271	NC_006461	C	7	7	1223532	1223538	0 %	0 %	0 %	100 %	55981252
33272	NC_006461	AGG	2	6	1223633	1223638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981252
33273	NC_006461	TGGGCC	2	12	1223661	1223672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981253
33274	NC_006461	GAA	2	6	1223734	1223739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981253
33275	NC_006461	CTCC	2	8	1223800	1223807	0 %	25 %	0 %	75 %	55981253
33276	NC_006461	GGA	2	6	1223896	1223901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981253
33277	NC_006461	GAG	2	6	1223930	1223935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981253
33278	NC_006461	CTC	2	6	1223948	1223953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981253
33279	NC_006461	CTC	2	6	1223993	1223998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981253
33280	NC_006461	GAC	2	6	1224080	1224085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981253
33281	NC_006461	ACGCCT	2	12	1224165	1224176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55981253
33282	NC_006461	GGC	2	6	1224210	1224215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981253
33283	NC_006461	GGC	2	6	1224226	1224231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981253
33284	NC_006461	CG	4	8	1224350	1224357	0 %	0 %	50 %	50 %	55981254
33285	NC_006461	GGA	2	6	1224434	1224439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
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33288	NC_006461	CTTCCC	2	12	1224521	1224532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
33289	NC_006461	CTT	2	6	1224536	1224541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981254
33290	NC_006461	G	6	6	1224545	1224550	0 %	0 %	100 %	0 %	55981254
33291	NC_006461	TGG	2	6	1224562	1224567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
33292	NC_006461	GCCT	2	8	1224570	1224577	0 %	25 %	25 %	50 %	55981254
33293	NC_006461	GCCC	2	8	1224596	1224603	0 %	0 %	25 %	75 %	55981254
33294	NC_006461	GGA	2	6	1224617	1224622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
33295	NC_006461	CCG	2	6	1224656	1224661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
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33297	NC_006461	CTC	2	6	1224762	1224767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
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33299	NC_006461	TCT	2	6	1224802	1224807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981254
33300	NC_006461	GCC	3	9	1224825	1224833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
33301	NC_006461	CTC	2	6	1224861	1224866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
33302	NC_006461	CTTC	2	8	1224881	1224888	0 %	50 %	0 %	50 %	55981254
33303	NC_006461	CTC	2	6	1224909	1224914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
33304	NC_006461	CCG	2	6	1224968	1224973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
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33307	NC_006461	CGC	2	6	1225030	1225035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
33308	NC_006461	GGA	2	6	1225037	1225042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
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33310	NC_006461	GCC	2	6	1225140	1225145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
33311	NC_006461	CTC	2	6	1225158	1225163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
33312	NC_006461	GAGG	2	8	1225172	1225179	25 %	0 %	75 %	0 %	55981254
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33315	NC_006461	TGG	2	6	1225318	1225323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
33316	NC_006461	CTC	2	6	1225415	1225420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
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33318	NC_006461	GTG	2	6	1225485	1225490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
33319	NC_006461	ACT	2	6	1225516	1225521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981254
33320	NC_006461	G	6	6	1225523	1225528	0 %	0 %	100 %	0 %	55981254
33321	NC_006461	G	6	6	1225541	1225546	0 %	0 %	100 %	0 %	55981254
33322	NC_006461	CCG	2	6	1225597	1225602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
33323	NC_006461	GCC	2	6	1225617	1225622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
33324	NC_006461	GAG	2	6	1225632	1225637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
33325	NC_006461	GTG	2	6	1225647	1225652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
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33327	NC_006461	GAG	2	6	1225794	1225799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
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33329	NC_006461	CCT	2	6	1225811	1225816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
33330	NC_006461	CGA	2	6	1225826	1225831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981254
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33332	NC_006461	CGG	2	6	1225879	1225884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981254
33333	NC_006461	GCC	2	6	1225914	1225919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
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33335	NC_006461	GTG	2	6	1226118	1226123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
33336	NC_006461	GCC	2	6	1226127	1226132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
33337	NC_006461	GGC	2	6	1226186	1226191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981254
33338	NC_006461	CGCC	2	8	1226225	1226232	0 %	0 %	25 %	75 %	55981255
33339	NC_006461	GAAGAG	2	12	1226275	1226286	50 %	0 %	50 %	0 %	55981255
33340	NC_006461	C	7	7	1226292	1226298	0 %	0 %	0 %	100 %	55981255
33341	NC_006461	AGG	3	9	1226309	1226317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981255
33342	NC_006461	AGC	2	6	1226321	1226326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981255
33343	NC_006461	CCT	2	6	1226328	1226333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981255
33344	NC_006461	GCC	2	6	1226381	1226386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981255
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33346	NC_006461	GGA	2	6	1226400	1226405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981255
33347	NC_006461	ACCCC	2	10	1226430	1226439	20 %	0 %	0 %	80 %	55981255
33348	NC_006461	CGC	2	6	1226450	1226455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981255
33349	NC_006461	CCCA	2	8	1226480	1226487	25 %	0 %	0 %	75 %	55981255
33350	NC_006461	GAG	2	6	1226512	1226517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981255
33351	NC_006461	AGG	2	6	1226561	1226566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981255
33352	NC_006461	GGA	2	6	1226625	1226630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981255
33353	NC_006461	C	6	6	1226643	1226648	0 %	0 %	0 %	100 %	55981255
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33473	NC_006461	GCTC	2	8	1230651	1230658	0 %	25 %	25 %	50 %	55981257
33474	NC_006461	GA	3	6	1230670	1230675	50 %	0 %	50 %	0 %	55981257
33475	NC_006461	CGCCT	2	10	1230690	1230699	0 %	20 %	20 %	60 %	55981257
33476	NC_006461	CCT	2	6	1230724	1230729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33477	NC_006461	GGC	2	6	1230755	1230760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981257
33478	NC_006461	CTT	2	6	1230764	1230769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981257
33479	NC_006461	CCT	2	6	1230805	1230810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33480	NC_006461	CTC	2	6	1230827	1230832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33481	NC_006461	TCC	2	6	1230846	1230851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33482	NC_006461	GCC	2	6	1230879	1230884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981257
33483	NC_006461	GCC	2	6	1230895	1230900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981257
33484	NC_006461	C	6	6	1230946	1230951	0 %	0 %	0 %	100 %	55981257
33485	NC_006461	CCT	3	9	1230955	1230963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33486	NC_006461	GGCG	2	8	1230967	1230974	0 %	0 %	75 %	25 %	55981257
33487	NC_006461	CG	3	6	1230980	1230985	0 %	0 %	50 %	50 %	55981257
33488	NC_006461	GGC	2	6	1230989	1230994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981257
33489	NC_006461	CTC	2	6	1231010	1231015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33490	NC_006461	TCC	2	6	1231074	1231079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981257
33491	NC_006461	AGG	3	9	1231080	1231088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981257
33492	NC_006461	CCG	2	6	1231099	1231104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981257
33493	NC_006461	GAG	3	9	1231211	1231219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981257
33494	NC_006461	C	8	8	1231309	1231316	0 %	0 %	0 %	100 %	55981257
33495	NC_006461	CAG	2	6	1231319	1231324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981257
33496	NC_006461	C	6	6	1231339	1231344	0 %	0 %	0 %	100 %	55981257
33497	NC_006461	CGG	2	6	1231423	1231428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981257
33498	NC_006461	CAG	2	6	1231659	1231664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981258
33499	NC_006461	CCT	3	9	1231667	1231675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981258
33500	NC_006461	CTC	2	6	1231686	1231691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981258

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