MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28004	NC_006461	G	6	6	1030664	1030669	0 %	0 %	100 %	0 %	55981052
28005	NC_006461	GGT	2	6	1030682	1030687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981052
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28122	NC_006461	TCC	2	6	1034543	1034548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981056
28123	NC_006461	TCC	3	9	1034585	1034593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981056
28124	NC_006461	C	6	6	1034603	1034608	0 %	0 %	0 %	100 %	55981056
28125	NC_006461	G	6	6	1034630	1034635	0 %	0 %	100 %	0 %	55981056
28126	NC_006461	CTC	2	6	1034659	1034664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981056
28127	NC_006461	GGGCC	2	10	1034670	1034679	0 %	0 %	60 %	40 %	55981056
28128	NC_006461	CGG	2	6	1034711	1034716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981056
28129	NC_006461	GCC	2	6	1034761	1034766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981056
28130	NC_006461	CG	3	6	1034790	1034795	0 %	0 %	50 %	50 %	55981056
28131	NC_006461	G	6	6	1034825	1034830	0 %	0 %	100 %	0 %	55981056
28132	NC_006461	ATC	2	6	1034847	1034852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981056
28133	NC_006461	CAC	2	6	1034870	1034875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981057
28134	NC_006461	CAC	2	6	1034882	1034887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981057
28135	NC_006461	CAT	2	6	1034924	1034929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981057
28136	NC_006461	GCG	2	6	1034960	1034965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981057
28137	NC_006461	GTG	2	6	1034970	1034975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981057
28138	NC_006461	GTG	3	9	1035057	1035065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981057
28139	NC_006461	GTGG	2	8	1035069	1035076	0 %	25 %	75 %	0 %	55981057
28140	NC_006461	CGC	2	6	1035110	1035115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981057
28141	NC_006461	CCG	2	6	1035119	1035124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981057
28142	NC_006461	GGAGCT	2	12	1035194	1035205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55981057
28143	NC_006461	AGG	2	6	1035244	1035249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981057
28144	NC_006461	CGC	2	6	1035308	1035313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981057
28145	NC_006461	GGA	2	6	1035350	1035355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981057
28146	NC_006461	GAG	4	12	1035423	1035434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981057
28147	NC_006461	TCC	3	9	1035442	1035450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981057
28148	NC_006461	CGG	3	9	1035458	1035466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981057
28149	NC_006461	CAC	2	6	1035467	1035472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981057
28150	NC_006461	GTG	2	6	1035516	1035521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981057
28151	NC_006461	CTC	2	6	1035561	1035566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981057
28152	NC_006461	GAG	2	6	1035579	1035584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981057
28153	NC_006461	GCC	2	6	1035612	1035617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981057
28154	NC_006461	AGG	2	6	1035661	1035666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981057
28155	NC_006461	GCG	2	6	1035667	1035672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981057
28156	NC_006461	CAT	2	6	1035707	1035712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981057
28157	NC_006461	TCC	2	6	1035733	1035738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981057
28158	NC_006461	CG	3	6	1035743	1035748	0 %	0 %	50 %	50 %	55981057
28159	NC_006461	G	6	6	1035809	1035814	0 %	0 %	100 %	0 %	55981057
28160	NC_006461	CTC	2	6	1035822	1035827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981057
28161	NC_006461	CCT	2	6	1035839	1035844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981057
28162	NC_006461	GCA	2	6	1035851	1035856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981057
28163	NC_006461	CGG	3	9	1035934	1035942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981057
28164	NC_006461	GGA	2	6	1036013	1036018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981057
28165	NC_006461	AGGG	2	8	1036080	1036087	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28166	NC_006461	G	6	6	1036085	1036090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28167	NC_006461	TCA	2	6	1036105	1036110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981058
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28171	NC_006461	CGGGGC	2	12	1036274	1036285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981058
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28173	NC_006461	TCA	2	6	1036366	1036371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981058
28174	NC_006461	G	6	6	1036382	1036387	0 %	0 %	100 %	0 %	55981058
28175	NC_006461	ACGGGA	2	12	1036392	1036403	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55981058
28176	NC_006461	GGT	2	6	1036457	1036462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981058
28177	NC_006461	GC	3	6	1036499	1036504	0 %	0 %	50 %	50 %	55981058
28178	NC_006461	GAG	2	6	1036509	1036514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981058
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28182	NC_006461	AAG	2	6	1036590	1036595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981058
28183	NC_006461	TCA	2	6	1036666	1036671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981058
28184	NC_006461	TCA	2	6	1036684	1036689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981058
28185	NC_006461	CCT	2	6	1036715	1036720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981058
28186	NC_006461	CGGGG	2	10	1036751	1036760	0 %	0 %	80 %	20 %	55981058
28187	NC_006461	GGA	2	6	1036778	1036783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981058
28188	NC_006461	GGC	2	6	1036784	1036789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981058
28189	NC_006461	CCT	2	6	1036811	1036816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981058
28190	NC_006461	CTC	3	9	1036845	1036853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981058
28191	NC_006461	GTG	2	6	1036857	1036862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981058
28192	NC_006461	GAG	2	6	1036869	1036874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981058
28193	NC_006461	GCC	2	6	1036890	1036895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981058
28194	NC_006461	GGT	2	6	1036898	1036903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981058
28195	NC_006461	ACG	2	6	1036963	1036968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981058
28196	NC_006461	CGC	2	6	1037003	1037008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981058
28197	NC_006461	GTG	2	6	1037028	1037033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981058
28198	NC_006461	CCCCG	2	10	1037034	1037043	0 %	0 %	20 %	80 %	55981058
28199	NC_006461	ACGGGG	2	12	1037113	1037124	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55981058
28200	NC_006461	CCT	2	6	1037152	1037157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28201	NC_006461	CACC	2	8	1037193	1037200	25 %	0 %	0 %	75 %	55981059
28202	NC_006461	GTG	2	6	1037212	1037217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981059
28203	NC_006461	CCT	2	6	1037250	1037255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981059
28204	NC_006461	GGT	2	6	1037265	1037270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981059
28205	NC_006461	CGC	2	6	1037279	1037284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981059
28206	NC_006461	TCC	2	6	1037336	1037341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981059
28207	NC_006461	GGCGGT	2	12	1037358	1037369	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55981059
28208	NC_006461	GGA	2	6	1037370	1037375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981059
28209	NC_006461	TTC	2	6	1037380	1037385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981059
28210	NC_006461	TGGGC	2	10	1037414	1037423	0 %	20 %	60 %	20 %	55981059
28211	NC_006461	TGG	2	6	1037438	1037443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981059
28212	NC_006461	CGC	2	6	1037520	1037525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981059
28213	NC_006461	AGG	3	9	1037528	1037536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981059
28214	NC_006461	AGG	2	6	1037570	1037575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981059
28215	NC_006461	GGA	2	6	1037784	1037789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981060
28216	NC_006461	TCC	2	6	1037819	1037824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981060
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28219	NC_006461	TGGCGG	2	12	1037907	1037918	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55981060
28220	NC_006461	ACC	2	6	1037930	1037935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981060
28221	NC_006461	GGA	2	6	1037958	1037963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981060
28222	NC_006461	GAG	2	6	1038025	1038030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981060
28223	NC_006461	CCA	2	6	1038048	1038053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981060
28224	NC_006461	CGTC	2	8	1038060	1038067	0 %	25 %	25 %	50 %	55981060
28225	NC_006461	GCG	2	6	1038073	1038078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981060
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28227	NC_006461	TCC	2	6	1038161	1038166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981060
28228	NC_006461	TGA	2	6	1038174	1038179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981060
28229	NC_006461	CCGAGG	2	12	1038344	1038355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981061
28230	NC_006461	CGC	4	12	1038390	1038401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981061
28231	NC_006461	AAG	2	6	1038418	1038423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981061
28232	NC_006461	GGT	2	6	1038435	1038440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981061
28233	NC_006461	GAG	2	6	1038553	1038558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981061
28234	NC_006461	GGA	2	6	1038573	1038578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981061
28235	NC_006461	G	6	6	1038591	1038596	0 %	0 %	100 %	0 %	55981061
28236	NC_006461	G	6	6	1038615	1038620	0 %	0 %	100 %	0 %	55981061
28237	NC_006461	CCT	2	6	1038657	1038662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981061
28238	NC_006461	GAG	2	6	1038715	1038720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981061
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28240	NC_006461	TGG	2	6	1038824	1038829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981061
28241	NC_006461	GGC	2	6	1038846	1038851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981061
28242	NC_006461	CCCG	2	8	1038853	1038860	0 %	0 %	25 %	75 %	55981061
28243	NC_006461	CGG	2	6	1038869	1038874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981061
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28249	NC_006461	CGCC	2	8	1039131	1039138	0 %	0 %	25 %	75 %	55981061
28250	NC_006461	CCT	2	6	1039169	1039174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981061
28251	NC_006461	GGC	2	6	1039203	1039208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981061
28252	NC_006461	CTA	2	6	1039212	1039217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981061
28253	NC_006461	CGA	2	6	1039224	1039229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981061
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28262	NC_006461	TGC	2	6	1039607	1039612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981062
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28270	NC_006461	GAG	3	9	1039902	1039910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981062
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28274	NC_006461	CCTCC	2	10	1040061	1040070	0 %	20 %	0 %	80 %	55981063
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28282	NC_006461	G	7	7	1040391	1040397	0 %	0 %	100 %	0 %	55981063
28283	NC_006461	GAA	2	6	1040445	1040450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981063
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28285	NC_006461	AGGT	2	8	1040482	1040489	25 %	25 %	50 %	0 %	55981063
28286	NC_006461	GC	3	6	1040518	1040523	0 %	0 %	50 %	50 %	55981063
28287	NC_006461	CCT	2	6	1040666	1040671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981063
28288	NC_006461	CGGCC	2	10	1040732	1040741	0 %	0 %	40 %	60 %	55981063
28289	NC_006461	GGT	2	6	1040772	1040777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981063
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28292	NC_006461	TGA	2	6	1040842	1040847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981064
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28300	NC_006461	GCA	2	6	1041124	1041129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981064
28301	NC_006461	C	6	6	1041130	1041135	0 %	0 %	0 %	100 %	55981064
28302	NC_006461	CCCCG	2	10	1041140	1041149	0 %	0 %	20 %	80 %	55981064
28303	NC_006461	TGCC	2	8	1041162	1041169	0 %	25 %	25 %	50 %	55981064
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28306	NC_006461	C	6	6	1041270	1041275	0 %	0 %	0 %	100 %	55981064
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28312	NC_006461	TGG	2	6	1041457	1041462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981064
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28319	NC_006461	GGA	2	6	1041724	1041729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981064
28320	NC_006461	TCC	2	6	1041732	1041737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981064
28321	NC_006461	CCCCA	2	10	1041757	1041766	20 %	0 %	0 %	80 %	55981064
28322	NC_006461	CTC	2	6	1041839	1041844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981064
28323	NC_006461	CTT	2	6	1041860	1041865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981064
28324	NC_006461	GGC	2	6	1041878	1041883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981064
28325	NC_006461	CTC	2	6	1041890	1041895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981064
28326	NC_006461	C	6	6	1041929	1041934	0 %	0 %	0 %	100 %	55981064
28327	NC_006461	G	6	6	1042064	1042069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28328	NC_006461	TGG	2	6	1042119	1042124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981065
28329	NC_006461	GAC	2	6	1042136	1042141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981065
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28332	NC_006461	TGG	2	6	1042257	1042262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981065
28333	NC_006461	AGG	2	6	1042365	1042370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981065
28334	NC_006461	GAG	2	6	1042445	1042450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981065
28335	NC_006461	AAGG	2	8	1042465	1042472	50 %	0 %	50 %	0 %	55981065
28336	NC_006461	AGG	2	6	1042479	1042484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981065
28337	NC_006461	GCC	2	6	1042706	1042711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981065
28338	NC_006461	CCT	2	6	1042723	1042728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981065
28339	NC_006461	TCC	2	6	1042808	1042813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981065
28340	NC_006461	GCC	2	6	1042830	1042835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981065
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28342	NC_006461	CTC	2	6	1042888	1042893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28343	NC_006461	CTT	2	6	1042897	1042902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981066
28344	NC_006461	CTC	3	9	1042933	1042941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28345	NC_006461	CAC	2	6	1043002	1043007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981066
28346	NC_006461	AGG	2	6	1043063	1043068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981066
28347	NC_006461	CCT	2	6	1043172	1043177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28348	NC_006461	CCT	2	6	1043253	1043258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28349	NC_006461	CTC	2	6	1043272	1043277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
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28351	NC_006461	GCC	2	6	1043318	1043323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981066
28352	NC_006461	AGG	2	6	1043372	1043377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981066
28353	NC_006461	CTC	2	6	1043401	1043406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28354	NC_006461	GGA	2	6	1043415	1043420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981066
28355	NC_006461	TCT	2	6	1043433	1043438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981066
28356	NC_006461	CCA	2	6	1043457	1043462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981066
28357	NC_006461	GAG	2	6	1043650	1043655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981066
28358	NC_006461	TCC	2	6	1043702	1043707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28359	NC_006461	GGA	2	6	1043733	1043738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981066
28360	NC_006461	CGCC	2	8	1043754	1043761	0 %	0 %	25 %	75 %	55981066
28361	NC_006461	CTC	2	6	1043800	1043805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
28362	NC_006461	CCCG	2	8	1043889	1043896	0 %	0 %	25 %	75 %	55981066
28363	NC_006461	TCTCCT	2	12	1043934	1043945	0 %	50 %	0 %	50 %	55981066
28364	NC_006461	CGG	2	6	1043946	1043951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981066
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28372	NC_006461	CTC	2	6	1044337	1044342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
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28385	NC_006461	CTC	2	6	1044763	1044768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981066
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28387	NC_006461	GTA	2	6	1044835	1044840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981066
28388	NC_006461	AGG	2	6	1044971	1044976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28389	NC_006461	GAG	2	6	1044983	1044988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981067
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28391	NC_006461	GGA	2	6	1045052	1045057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981067
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28395	NC_006461	CTTTGA	2	12	1045220	1045231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55981067
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28462	NC_006461	CCCG	2	8	1047735	1047742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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28475	NC_006461	CTC	2	6	1048205	1048210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981069
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28478	NC_006461	CCT	2	6	1048255	1048260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981069
28479	NC_006461	AGGT	2	8	1048308	1048315	25 %	25 %	50 %	0 %	55981069
28480	NC_006461	TCC	2	6	1048326	1048331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981069
28481	NC_006461	CCCG	2	8	1048332	1048339	0 %	0 %	25 %	75 %	55981069
28482	NC_006461	AGG	2	6	1048374	1048379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981069
28483	NC_006461	TTG	2	6	1048383	1048388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981069
28484	NC_006461	GGC	2	6	1048391	1048396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981069
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28486	NC_006461	CAC	2	6	1048469	1048474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981069
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28488	NC_006461	CTC	2	6	1048547	1048552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981069
28489	NC_006461	CCA	2	6	1048567	1048572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981069
28490	NC_006461	CCT	2	6	1048615	1048620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981069
28491	NC_006461	GAG	2	6	1048643	1048648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981069
28492	NC_006461	GAG	2	6	1048652	1048657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981069
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