MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27004	NC_006461	GGT	2	6	996286	996291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981022
27005	NC_006461	GAG	3	9	996296	996304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981022
27006	NC_006461	GGC	2	6	996331	996336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981022
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27009	NC_006461	CCT	2	6	996427	996432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981022
27010	NC_006461	GAC	2	6	996446	996451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981022
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27012	NC_006461	TCC	2	6	996483	996488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981022
27013	NC_006461	TGG	2	6	996528	996533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981022
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27016	NC_006461	G	7	7	996587	996593	0 %	0 %	100 %	0 %	55981022
27017	NC_006461	GGC	2	6	996595	996600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981022
27018	NC_006461	GGCG	2	8	996612	996619	0 %	0 %	75 %	25 %	55981022
27019	NC_006461	TGG	2	6	996633	996638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981022
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27021	NC_006461	GAG	2	6	996722	996727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981022
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27053	NC_006461	GAC	2	6	997956	997961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981023
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27233	NC_006461	CCT	2	6	1004517	1004522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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27362	NC_006461	GGC	2	6	1009015	1009020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981031
27363	NC_006461	CTC	2	6	1009024	1009029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981031
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27426	NC_006461	TCC	2	6	1011133	1011138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981033
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27432	NC_006461	CCCG	2	8	1011301	1011308	0 %	0 %	25 %	75 %	55981033
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27443	NC_006461	GAG	2	6	1011806	1011811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981034
27444	NC_006461	CTC	2	6	1011815	1011820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981034
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27464	NC_006461	GGC	2	6	1012535	1012540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981034
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27467	NC_006461	GGCCT	2	10	1012608	1012617	0 %	20 %	40 %	40 %	55981034
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27474	NC_006461	CCT	2	6	1012849	1012854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981034
27475	NC_006461	AGG	2	6	1012860	1012865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981034
27476	NC_006461	TCCT	2	8	1012929	1012936	0 %	50 %	0 %	50 %	55981034
27477	NC_006461	TCC	2	6	1012961	1012966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981035
27478	NC_006461	AAG	2	6	1012967	1012972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981035
27479	NC_006461	GCT	2	6	1013010	1013015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981035
27480	NC_006461	TGG	2	6	1013034	1013039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981035
27481	NC_006461	GGC	2	6	1013059	1013064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035
27482	NC_006461	GGC	2	6	1013095	1013100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035
27483	NC_006461	CCTGGA	2	12	1013121	1013132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55981035
27484	NC_006461	GAA	2	6	1013151	1013156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981035
27485	NC_006461	C	7	7	1013160	1013166	0 %	0 %	0 %	100 %	55981035
27486	NC_006461	GTC	2	6	1013179	1013184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981035
27487	NC_006461	GCG	2	6	1013228	1013233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035
27488	NC_006461	AGG	2	6	1013234	1013239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981035
27489	NC_006461	CGG	2	6	1013286	1013291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035
27490	NC_006461	CTC	2	6	1013317	1013322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981035
27491	NC_006461	GGT	2	6	1013323	1013328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981035
27492	NC_006461	GGC	2	6	1013359	1013364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035
27493	NC_006461	GCC	2	6	1013367	1013372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981035
27494	NC_006461	CCA	2	6	1013382	1013387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981035
27495	NC_006461	GGCCTC	2	12	1013389	1013400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981035
27496	NC_006461	CCG	2	6	1013415	1013420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981035
27497	NC_006461	GCC	2	6	1013428	1013433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981035
27498	NC_006461	GCG	2	6	1013462	1013467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035
27499	NC_006461	CCT	2	6	1013472	1013477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981035
27500	NC_006461	GGC	2	6	1013497	1013502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981035

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