MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_006461	ATG	2	6	660867	660872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980666
18002	NC_006461	CTT	2	6	660917	660922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980666
18003	NC_006461	CTC	2	6	660935	660940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18004	NC_006461	CCG	2	6	660976	660981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980666
18005	NC_006461	GAG	2	6	661043	661048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980666
18006	NC_006461	AGG	2	6	661074	661079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980666
18007	NC_006461	AGG	2	6	661084	661089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980666
18008	NC_006461	GTA	2	6	661112	661117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980666
18009	NC_006461	GAG	2	6	661127	661132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980666
18010	NC_006461	GCGGA	2	10	661158	661167	20 %	0 %	60 %	20 %	55980666
18011	NC_006461	TCGC	2	8	661272	661279	0 %	25 %	25 %	50 %	55980666
18012	NC_006461	CTC	2	6	661280	661285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18013	NC_006461	CCT	2	6	661408	661413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18014	NC_006461	CTT	2	6	661418	661423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980666
18015	NC_006461	GAG	2	6	661511	661516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980666
18016	NC_006461	GGGC	2	8	661517	661524	0 %	0 %	75 %	25 %	55980666
18017	NC_006461	TCC	2	6	661530	661535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18018	NC_006461	CTC	2	6	661559	661564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18019	NC_006461	GGT	2	6	661613	661618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980666
18020	NC_006461	CCT	2	6	661630	661635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18021	NC_006461	CCA	2	6	661720	661725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980666
18022	NC_006461	CTGGAT	2	12	661742	661753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55980666
18023	NC_006461	GTC	2	6	661817	661822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980666
18024	NC_006461	C	6	6	661866	661871	0 %	0 %	0 %	100 %	55980666
18025	NC_006461	CCAGGC	2	12	661879	661890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980666
18026	NC_006461	CTC	2	6	661901	661906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980666
18027	NC_006461	AGG	2	6	661932	661937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980666
18028	NC_006461	GAA	2	6	661942	661947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980666
18029	NC_006461	GCC	2	6	662040	662045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_006461	AGG	2	6	662109	662114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980667
18031	NC_006461	CGG	2	6	662180	662185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980667
18032	NC_006461	GCG	2	6	662212	662217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980667
18033	NC_006461	GAG	2	6	662222	662227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980667
18034	NC_006461	CTC	2	6	662237	662242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980667
18035	NC_006461	GAG	2	6	662333	662338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980667
18036	NC_006461	AGG	2	6	662343	662348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980667
18037	NC_006461	CCA	2	6	662375	662380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980668
18038	NC_006461	GTC	2	6	662415	662420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980668
18039	NC_006461	TCC	2	6	662473	662478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18040	NC_006461	CCT	3	9	662645	662653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18041	NC_006461	CCA	2	6	662699	662704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980668
18042	NC_006461	GAT	2	6	662712	662717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980668
18043	NC_006461	GAG	2	6	662730	662735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
18044	NC_006461	TCC	2	6	662746	662751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18045	NC_006461	CTT	3	9	662754	662762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980668
18046	NC_006461	CGG	2	6	662772	662777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980668
18047	NC_006461	GAG	2	6	662820	662825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
18048	NC_006461	GAG	2	6	662859	662864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
18049	NC_006461	GGA	2	6	662945	662950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
18050	NC_006461	TCCT	2	8	662962	662969	0 %	50 %	0 %	50 %	55980668
18051	NC_006461	CTC	2	6	662973	662978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18052	NC_006461	GGA	2	6	662990	662995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
18053	NC_006461	GCG	2	6	663015	663020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980668
18054	NC_006461	TCC	4	12	663028	663039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18055	NC_006461	TCCTC	2	10	663047	663056	0 %	40 %	0 %	60 %	55980668
18056	NC_006461	CTC	2	6	663063	663068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18057	NC_006461	GGC	2	6	663081	663086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980668
18058	NC_006461	CCA	2	6	663107	663112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980668
18059	NC_006461	CCT	2	6	663173	663178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18060	NC_006461	CAT	2	6	663201	663206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980668
18061	NC_006461	CCA	2	6	663236	663241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980668
18062	NC_006461	CCT	2	6	663266	663271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18063	NC_006461	GAT	2	6	663288	663293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980668
18064	NC_006461	C	6	6	663329	663334	0 %	0 %	0 %	100 %	55980668
18065	NC_006461	TCC	2	6	663364	663369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18066	NC_006461	GAG	3	9	663378	663386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
18067	NC_006461	ATC	2	6	663388	663393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980668
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18070	NC_006461	CTC	2	6	663462	663467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18071	NC_006461	TTG	2	6	663535	663540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980668
18072	NC_006461	CCT	2	6	663587	663592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
18073	NC_006461	ATG	2	6	663604	663609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980668
18074	NC_006461	CGT	2	6	663611	663616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980668
18075	NC_006461	CGG	2	6	663617	663622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980668
18076	NC_006461	CGATGA	2	12	663623	663634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55980668
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18079	NC_006461	CCT	2	6	663770	663775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
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18081	NC_006461	GTC	2	6	663814	663819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980668
18082	NC_006461	ATG	2	6	663841	663846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980668
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18085	NC_006461	GCG	2	6	663879	663884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980668
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18087	NC_006461	GCT	2	6	663917	663922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980668
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18091	NC_006461	CTC	2	6	664234	664239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980669
18092	NC_006461	GCC	2	6	664272	664277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980669
18093	NC_006461	CGG	2	6	664280	664285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980669
18094	NC_006461	CTC	2	6	664347	664352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
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18101	NC_006461	CTT	2	6	664539	664544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980670
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18104	NC_006461	CGG	2	6	664753	664758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980670
18105	NC_006461	CCT	2	6	664814	664819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
18106	NC_006461	GAG	2	6	664824	664829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980670
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18108	NC_006461	CTT	2	6	664896	664901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980670
18109	NC_006461	GGT	2	6	664928	664933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980670
18110	NC_006461	GCTC	2	8	664952	664959	0 %	25 %	25 %	50 %	55980670
18111	NC_006461	ACC	2	6	665026	665031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980670
18112	NC_006461	TCCTTG	2	12	665050	665061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55980670
18113	NC_006461	CTC	2	6	665148	665153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
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18117	NC_006461	CCA	2	6	665273	665278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980670
18118	NC_006461	TCC	2	6	665344	665349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
18119	NC_006461	CCT	2	6	665393	665398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
18120	NC_006461	TCC	2	6	665416	665421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
18121	NC_006461	TGC	2	6	665449	665454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980670
18122	NC_006461	CTC	2	6	665506	665511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980671
18123	NC_006461	CTC	2	6	665560	665565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980671
18124	NC_006461	ACC	2	6	665582	665587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980671
18125	NC_006461	TCC	2	6	665588	665593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980671
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18129	NC_006461	TCC	2	6	665744	665749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980671
18130	NC_006461	GGC	2	6	665758	665763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980671
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18137	NC_006461	CCT	2	6	666011	666016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18138	NC_006461	GGTCC	2	10	666053	666062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18139	NC_006461	GCCCG	2	10	666065	666074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18140	NC_006461	GC	3	6	666126	666131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18141	NC_006461	GCTC	2	8	666312	666319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18142	NC_006461	GCC	2	6	666323	666328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18143	NC_006461	AGG	2	6	666346	666351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18144	NC_006461	CG	3	6	666371	666376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18145	NC_006461	CCG	2	6	666384	666389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18146	NC_006461	C	6	6	666417	666422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18147	NC_006461	CCA	2	6	666427	666432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18148	NC_006461	GGGGC	2	10	666466	666475	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18149	NC_006461	GCGG	2	8	666488	666495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18150	NC_006461	CCT	2	6	666505	666510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18151	NC_006461	TG	3	6	666544	666549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18152	NC_006461	CCGG	2	8	666608	666615	0 %	0 %	50 %	50 %	55980672
18153	NC_006461	C	6	6	666643	666648	0 %	0 %	0 %	100 %	55980672
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18155	NC_006461	CCT	2	6	666782	666787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980672
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18158	NC_006461	C	6	6	666831	666836	0 %	0 %	0 %	100 %	55980672
18159	NC_006461	TGG	3	9	666955	666963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980672
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18166	NC_006461	GCC	2	6	667219	667224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980672
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18174	NC_006461	CGC	2	6	667436	667441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980672
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18176	NC_006461	GCGG	2	8	667559	667566	0 %	0 %	75 %	25 %	55980672
18177	NC_006461	GTGG	2	8	667571	667578	0 %	25 %	75 %	0 %	55980672
18178	NC_006461	GGA	2	6	667811	667816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980673
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18180	NC_006461	GAG	2	6	667927	667932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980673
18181	NC_006461	GCGGTG	2	12	667939	667950	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980673
18182	NC_006461	G	6	6	667989	667994	0 %	0 %	100 %	0 %	55980673
18183	NC_006461	ATC	2	6	668020	668025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980673
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18202	NC_006461	CTC	3	9	668801	668809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980674
18203	NC_006461	CTC	2	6	668843	668848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980674
18204	NC_006461	CTC	2	6	668891	668896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980674
18205	NC_006461	GTCTCG	2	12	668903	668914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980674
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18220	NC_006461	CTTCCT	2	12	669575	669586	0 %	50 %	0 %	50 %	55980675
18221	NC_006461	CTT	2	6	669654	669659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980675
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18231	NC_006461	AAG	2	6	669969	669974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980675
18232	NC_006461	GTG	2	6	669990	669995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980675
18233	NC_006461	GCC	2	6	670006	670011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980675
18234	NC_006461	CGG	2	6	670021	670026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980675
18235	NC_006461	CCTGGC	2	12	670028	670039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980675
18236	NC_006461	G	6	6	670072	670077	0 %	0 %	100 %	0 %	55980675
18237	NC_006461	TGG	2	6	670138	670143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980675
18238	NC_006461	CGC	2	6	670163	670168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980675
18239	NC_006461	GGC	2	6	670214	670219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980675
18240	NC_006461	ACCCTG	2	12	670269	670280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980675
18241	NC_006461	GGT	2	6	670301	670306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980675
18242	NC_006461	GGA	2	6	670325	670330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980675
18243	NC_006461	TCC	2	6	670365	670370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980675
18244	NC_006461	GGA	2	6	670424	670429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980675
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18248	NC_006461	C	6	6	670621	670626	0 %	0 %	0 %	100 %	55980675
18249	NC_006461	CCT	2	6	670679	670684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980675
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18253	NC_006461	TGG	2	6	670825	670830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980675
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18280	NC_006461	CGG	2	6	672191	672196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980677
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18361	NC_006461	GGGGC	2	10	675109	675118	0 %	0 %	80 %	20 %	55980680
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18492	NC_006461	CAC	2	6	679816	679821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980685
18493	NC_006461	GAG	2	6	679825	679830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980685
18494	NC_006461	GAG	2	6	679846	679851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980685
18495	NC_006461	GCC	2	6	679868	679873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980685
18496	NC_006461	AGCGC	2	10	679881	679890	20 %	0 %	40 %	40 %	55980685
18497	NC_006461	C	6	6	679946	679951	0 %	0 %	0 %	100 %	55980685
18498	NC_006461	ACC	2	6	679961	679966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980685
18499	NC_006461	GAG	2	6	679996	680001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980685
18500	NC_006461	GAG	2	6	680011	680016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980685

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