MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_006461	CAC	2	6	627506	627511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980630
17003	NC_006461	GGA	2	6	627532	627537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17004	NC_006461	GGA	2	6	627541	627546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17005	NC_006461	GAG	3	9	627578	627586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17006	NC_006461	GGA	2	6	627601	627606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17007	NC_006461	CCCG	2	8	627640	627647	0 %	0 %	25 %	75 %	55980630
17008	NC_006461	GCC	2	6	627678	627683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980630
17009	NC_006461	ACC	2	6	627702	627707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980630
17010	NC_006461	GCC	2	6	627714	627719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980630
17011	NC_006461	GCT	2	6	627770	627775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980630
17012	NC_006461	GAG	2	6	627791	627796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17013	NC_006461	GAG	2	6	627806	627811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17014	NC_006461	TGAGGG	2	12	627852	627863	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_006461	CCT	2	6	627865	627870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17016	NC_006461	GGA	2	6	627892	627897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_006461	GGA	2	6	627963	627968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980631
17018	NC_006461	ACCGGG	2	12	627969	627980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980631
17019	NC_006461	TCC	2	6	628003	628008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980631
17020	NC_006461	TGG	2	6	628047	628052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980631
17021	NC_006461	CTT	3	9	628117	628125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980631
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17028	NC_006461	CGGG	2	8	628427	628434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17029	NC_006461	GGC	2	6	628506	628511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980632
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17035	NC_006461	GCGG	2	8	628637	628644	0 %	0 %	75 %	25 %	55980632
17036	NC_006461	GGC	2	6	628649	628654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980632
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17038	NC_006461	CCCCT	2	10	628702	628711	0 %	20 %	0 %	80 %	55980632
17039	NC_006461	GAT	2	6	628754	628759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980632
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17042	NC_006461	G	6	6	628939	628944	0 %	0 %	100 %	0 %	55980632
17043	NC_006461	GACG	2	8	628949	628956	25 %	0 %	50 %	25 %	55980632
17044	NC_006461	GGA	2	6	628979	628984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980632
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17052	NC_006461	TCC	3	9	629440	629448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980632
17053	NC_006461	CG	3	6	629454	629459	0 %	0 %	50 %	50 %	55980632
17054	NC_006461	GGC	2	6	629477	629482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980632
17055	NC_006461	GAG	2	6	629508	629513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980632
17056	NC_006461	GAG	2	6	629529	629534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980632
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17058	NC_006461	CTC	2	6	629613	629618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980632
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17123	NC_006461	C	6	6	631316	631321	0 %	0 %	0 %	100 %	55980633
17124	NC_006461	GAG	2	6	631328	631333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980633
17125	NC_006461	TCC	2	6	631344	631349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980633
17126	NC_006461	CCT	2	6	631351	631356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980633
17127	NC_006461	GCCC	2	8	631384	631391	0 %	0 %	25 %	75 %	55980633
17128	NC_006461	CCT	2	6	631432	631437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980633
17129	NC_006461	CCG	3	9	631525	631533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980633
17130	NC_006461	CGC	3	9	631547	631555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980633
17131	NC_006461	CGGGC	2	10	631576	631585	0 %	0 %	60 %	40 %	55980633
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17133	NC_006461	GGC	3	9	631634	631642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980633
17134	NC_006461	CTC	2	6	631643	631648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980633
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17136	NC_006461	GCC	2	6	631712	631717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980633
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17138	NC_006461	CCA	2	6	631750	631755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980633
17139	NC_006461	CAC	2	6	631760	631765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980633
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17143	NC_006461	GCC	2	6	631919	631924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980633
17144	NC_006461	G	6	6	631952	631957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17145	NC_006461	GCC	2	6	632090	632095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980634
17146	NC_006461	C	7	7	632094	632100	0 %	0 %	0 %	100 %	55980634
17147	NC_006461	GAG	2	6	632107	632112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
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17149	NC_006461	GAG	2	6	632194	632199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
17150	NC_006461	CGG	2	6	632216	632221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980634
17151	NC_006461	CGC	2	6	632229	632234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980634
17152	NC_006461	CGC	2	6	632238	632243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980634
17153	NC_006461	GGA	2	6	632252	632257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
17154	NC_006461	GTG	2	6	632275	632280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980634
17155	NC_006461	TCCTC	2	10	632282	632291	0 %	40 %	0 %	60 %	55980634
17156	NC_006461	CGA	2	6	632292	632297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980634
17157	NC_006461	CAG	2	6	632314	632319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980634
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17160	NC_006461	TGGG	2	8	632362	632369	0 %	25 %	75 %	0 %	55980634
17161	NC_006461	GAG	2	6	632437	632442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
17162	NC_006461	CTC	3	9	632452	632460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980634
17163	NC_006461	GAG	3	9	632470	632478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
17164	NC_006461	TCT	2	6	632483	632488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980634
17165	NC_006461	G	6	6	632494	632499	0 %	0 %	100 %	0 %	55980634
17166	NC_006461	GGC	2	6	632571	632576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980634
17167	NC_006461	G	6	6	632577	632582	0 %	0 %	100 %	0 %	55980634
17168	NC_006461	CGG	2	6	632594	632599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980634
17169	NC_006461	GCGG	2	8	632601	632608	0 %	0 %	75 %	25 %	55980634
17170	NC_006461	CAT	2	6	632637	632642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980634
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17173	NC_006461	GAG	2	6	632761	632766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
17174	NC_006461	TCC	2	6	632792	632797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980634
17175	NC_006461	TGA	2	6	632801	632806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980634
17176	NC_006461	CCGG	2	8	632943	632950	0 %	0 %	50 %	50 %	55980634
17177	NC_006461	TCC	2	6	632960	632965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980634
17178	NC_006461	C	6	6	633061	633066	0 %	0 %	0 %	100 %	55980634
17179	NC_006461	GGA	2	6	633070	633075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980634
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17181	NC_006461	TCCC	2	8	633119	633126	0 %	25 %	0 %	75 %	55980635
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17188	NC_006461	CCT	2	6	633394	633399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980635
17189	NC_006461	GGA	2	6	633457	633462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980635
17190	NC_006461	GTC	2	6	633512	633517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980635
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17198	NC_006461	GGA	2	6	633850	633855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980635
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17217	NC_006461	GGA	3	9	634620	634628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980636
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17226	NC_006461	C	6	6	634837	634842	0 %	0 %	0 %	100 %	55980637
17227	NC_006461	C	6	6	634856	634861	0 %	0 %	0 %	100 %	55980637
17228	NC_006461	AGG	3	9	634878	634886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
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17230	NC_006461	CCCG	2	8	634952	634959	0 %	0 %	25 %	75 %	55980637
17231	NC_006461	GAG	3	9	634970	634978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
17232	NC_006461	C	6	6	635016	635021	0 %	0 %	0 %	100 %	55980637
17233	NC_006461	AGG	2	6	635022	635027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
17234	NC_006461	AGG	2	6	635046	635051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
17235	NC_006461	CAC	2	6	635060	635065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980637
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17237	NC_006461	GGA	4	12	635092	635103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
17238	NC_006461	GCCCCG	2	12	635115	635126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980637
17239	NC_006461	GGA	2	6	635129	635134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
17240	NC_006461	GCC	2	6	635163	635168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980637
17241	NC_006461	GAA	2	6	635173	635178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980637
17242	NC_006461	TCCC	2	8	635190	635197	0 %	25 %	0 %	75 %	55980637
17243	NC_006461	AAGCCC	2	12	635225	635236	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55980637
17244	NC_006461	GAG	3	9	635264	635272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
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17246	NC_006461	C	7	7	635335	635341	0 %	0 %	0 %	100 %	55980637
17247	NC_006461	GAG	3	9	635342	635350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
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17251	NC_006461	GAG	2	6	635480	635485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980637
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17309	NC_006461	TCC	2	6	637633	637638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17310	NC_006461	CCT	2	6	637720	637725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980641
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17312	NC_006461	CCT	2	6	637738	637743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980641
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17354	NC_006461	GGCG	2	8	639307	639314	0 %	0 %	75 %	25 %	55980641
17355	NC_006461	TCCGCC	2	12	639339	639350	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980641
17356	NC_006461	GC	4	8	639362	639369	0 %	0 %	50 %	50 %	55980641
17357	NC_006461	TGG	2	6	639427	639432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17358	NC_006461	CCG	2	6	639492	639497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980642
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17361	NC_006461	C	6	6	639538	639543	0 %	0 %	0 %	100 %	55980642
17362	NC_006461	AGG	2	6	639585	639590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980642
17363	NC_006461	G	7	7	639647	639653	0 %	0 %	100 %	0 %	55980642
17364	NC_006461	AGG	2	6	639654	639659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980642
17365	NC_006461	GCG	2	6	639660	639665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980642
17366	NC_006461	AGG	3	9	639666	639674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980642
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17368	NC_006461	GGA	2	6	639754	639759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980642
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17490	NC_006461	CCT	3	9	644135	644143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980648
17491	NC_006461	TCA	2	6	644188	644193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980648
17492	NC_006461	GCCC	2	8	644204	644211	0 %	0 %	25 %	75 %	55980648
17493	NC_006461	GGGGC	2	10	644241	644250	0 %	0 %	80 %	20 %	55980648
17494	NC_006461	CTC	2	6	644292	644297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980648
17495	NC_006461	G	6	6	644298	644303	0 %	0 %	100 %	0 %	55980648
17496	NC_006461	GGT	2	6	644333	644338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980648
17497	NC_006461	GCTGG	2	10	644358	644367	0 %	20 %	60 %	20 %	55980648
17498	NC_006461	CCT	2	6	644372	644377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980648
17499	NC_006461	GGAGC	2	10	644442	644451	20 %	0 %	60 %	20 %	55980648
17500	NC_006461	GGC	2	6	644459	644464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980648

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