MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_006461	GCG	2	6	607962	607967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980609
16502	NC_006461	AAGC	2	8	607968	607975	50 %	0 %	25 %	25 %	55980609
16503	NC_006461	CG	3	6	608047	608052	0 %	0 %	50 %	50 %	55980609
16504	NC_006461	GGC	2	6	608113	608118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980610
16505	NC_006461	AGG	2	6	608162	608167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980610
16506	NC_006461	GCT	2	6	608236	608241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980610
16507	NC_006461	GGGCCA	2	12	608274	608285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980610
16508	NC_006461	GCC	2	6	608408	608413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16509	NC_006461	AAG	2	6	608422	608427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980610
16510	NC_006461	CCT	2	6	608433	608438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980610
16511	NC_006461	GGGGTT	2	12	608482	608493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980610
16512	NC_006461	GGC	2	6	608560	608565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980610
16513	NC_006461	CTT	2	6	608566	608571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980610
16514	NC_006461	CCT	2	6	608595	608600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980610
16515	NC_006461	GGC	2	6	608614	608619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980610
16516	NC_006461	G	6	6	608739	608744	0 %	0 %	100 %	0 %	55980610
16517	NC_006461	CCT	2	6	608760	608765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980610
16518	NC_006461	CCG	2	6	608814	608819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16519	NC_006461	CCA	2	6	608838	608843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980610
16520	NC_006461	CTT	2	6	608910	608915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980610
16521	NC_006461	AG	3	6	608974	608979	50 %	0 %	50 %	0 %	55980610
16522	NC_006461	GCC	3	9	609044	609052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16523	NC_006461	GCCT	2	8	609059	609066	0 %	25 %	25 %	50 %	55980610
16524	NC_006461	GGC	2	6	609091	609096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980610
16525	NC_006461	CCT	2	6	609102	609107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980610
16526	NC_006461	GAT	2	6	609121	609126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980610
16527	NC_006461	GCC	2	6	609176	609181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16528	NC_006461	GGC	2	6	609193	609198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980610
16529	NC_006461	CCG	2	6	609213	609218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16530	NC_006461	GTG	2	6	609308	609313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980610
16531	NC_006461	TCT	2	6	609315	609320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980610
16532	NC_006461	G	6	6	609367	609372	0 %	0 %	100 %	0 %	55980610
16533	NC_006461	GCT	2	6	609375	609380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980610
16534	NC_006461	CGC	2	6	609463	609468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16535	NC_006461	GCC	2	6	609473	609478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16536	NC_006461	CGA	2	6	609513	609518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980610
16537	NC_006461	G	7	7	609520	609526	0 %	0 %	100 %	0 %	55980610
16538	NC_006461	CGC	2	6	609541	609546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980610
16539	NC_006461	CCT	2	6	609681	609686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980610
16540	NC_006461	AGGGCC	2	12	609692	609703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980610
16541	NC_006461	CTG	2	6	609733	609738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980610
16542	NC_006461	GCT	2	6	609750	609755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980610
16543	NC_006461	CCTGCA	2	12	609765	609776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980610
16544	NC_006461	CGA	2	6	609822	609827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980610
16545	NC_006461	AGG	2	6	609860	609865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980610
16546	NC_006461	CTC	2	6	609928	609933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980610
16547	NC_006461	GTA	2	6	610045	610050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980611
16548	NC_006461	GTG	2	6	610102	610107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980611
16549	NC_006461	GACG	2	8	610134	610141	25 %	0 %	50 %	25 %	55980611
16550	NC_006461	AGG	2	6	610158	610163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16551	NC_006461	CGC	2	6	610230	610235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980611
16552	NC_006461	CCCT	2	8	610334	610341	0 %	25 %	0 %	75 %	55980611
16553	NC_006461	C	6	6	610387	610392	0 %	0 %	0 %	100 %	55980611
16554	NC_006461	GCC	2	6	610425	610430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980611
16555	NC_006461	CCAGGT	2	12	610431	610442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980611
16556	NC_006461	CCA	2	6	610455	610460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980611
16557	NC_006461	GAG	3	9	610468	610476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16558	NC_006461	G	6	6	610482	610487	0 %	0 %	100 %	0 %	55980611
16559	NC_006461	AGG	2	6	610493	610498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
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16561	NC_006461	GGA	2	6	610635	610640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16562	NC_006461	GAG	2	6	610669	610674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16563	NC_006461	CCA	2	6	610710	610715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980611
16564	NC_006461	CCT	2	6	610725	610730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980611
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16568	NC_006461	GGT	2	6	610821	610826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980611
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16571	NC_006461	GAG	3	9	610867	610875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16572	NC_006461	AGT	2	6	610887	610892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980611
16573	NC_006461	GCC	2	6	610896	610901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980611
16574	NC_006461	GAG	4	12	610918	610929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
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16577	NC_006461	GAA	2	6	611005	611010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980611
16578	NC_006461	GAG	2	6	611014	611019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16579	NC_006461	GAG	2	6	611026	611031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16580	NC_006461	C	6	6	611058	611063	0 %	0 %	0 %	100 %	55980611
16581	NC_006461	G	6	6	611072	611077	0 %	0 %	100 %	0 %	55980611
16582	NC_006461	GGC	2	6	611092	611097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980611
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16584	NC_006461	AGG	2	6	611111	611116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980611
16585	NC_006461	GGGC	2	8	611144	611151	0 %	0 %	75 %	25 %	55980611
16586	NC_006461	AGG	2	6	611209	611214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16587	NC_006461	GAGG	2	8	611220	611227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16588	NC_006461	CCT	2	6	611259	611264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980612
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16590	NC_006461	CCT	2	6	611310	611315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980612
16591	NC_006461	CCT	2	6	611323	611328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980612
16592	NC_006461	GAG	3	9	611365	611373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980612
16593	NC_006461	C	6	6	611406	611411	0 %	0 %	0 %	100 %	55980612
16594	NC_006461	CCA	2	6	611439	611444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980612
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16602	NC_006461	CAC	2	6	611827	611832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980612
16603	NC_006461	GCC	2	6	611916	611921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980612
16604	NC_006461	GGCGAG	2	12	611938	611949	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980612
16605	NC_006461	CTTC	2	8	611957	611964	0 %	50 %	0 %	50 %	55980612
16606	NC_006461	CCCGC	2	10	612024	612033	0 %	0 %	20 %	80 %	55980612
16607	NC_006461	GGA	2	6	612058	612063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980612
16608	NC_006461	GGA	2	6	612072	612077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980612
16609	NC_006461	AGG	2	6	612167	612172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980612
16610	NC_006461	TCC	2	6	612200	612205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980612
16611	NC_006461	TCC	2	6	612224	612229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980612
16612	NC_006461	GGA	2	6	612270	612275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980612
16613	NC_006461	AGG	2	6	612281	612286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980612
16614	NC_006461	TGA	2	6	612318	612323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980612
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16617	NC_006461	ACC	2	6	612458	612463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980613
16618	NC_006461	A	6	6	612489	612494	100 %	0 %	0 %	0 %	55980613
16619	NC_006461	CTCC	2	8	612705	612712	0 %	25 %	0 %	75 %	55980613
16620	NC_006461	CTT	2	6	612724	612729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980613
16621	NC_006461	TG	3	6	612736	612741	0 %	50 %	50 %	0 %	55980613
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16623	NC_006461	AGT	2	6	612987	612992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980613
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16772	NC_006461	GC	3	6	619788	619793	0 %	0 %	50 %	50 %	55980619
16773	NC_006461	G	6	6	619830	619835	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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16857	NC_006461	G	7	7	623028	623034	0 %	0 %	100 %	0 %	55980625
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16992	NC_006461	CCTG	2	8	627289	627296	0 %	25 %	25 %	50 %	55980630
16993	NC_006461	GAG	3	9	627320	627328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
16994	NC_006461	GAG	2	6	627332	627337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
16995	NC_006461	GGGGAG	2	12	627344	627355	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55980630
16996	NC_006461	GCG	2	6	627384	627389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980630
16997	NC_006461	C	6	6	627392	627397	0 %	0 %	0 %	100 %	55980630
16998	NC_006461	GGGCC	2	10	627400	627409	0 %	0 %	60 %	40 %	55980630
16999	NC_006461	AGG	2	6	627411	627416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980630
17000	NC_006461	CCA	2	6	627439	627444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980630

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