MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_006461	GAG	2	6	570958	570963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980572
15502	NC_006461	CCG	2	6	571021	571026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980572
15503	NC_006461	CGC	2	6	571031	571036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980572
15504	NC_006461	GAG	2	6	571042	571047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980572
15505	NC_006461	AGG	2	6	571058	571063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980572
15506	NC_006461	CCG	2	6	571079	571084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980572
15507	NC_006461	AGG	3	9	571094	571102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980572
15508	NC_006461	GGC	2	6	571126	571131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980572
15509	NC_006461	CGGGG	2	10	571138	571147	0 %	0 %	80 %	20 %	55980572
15510	NC_006461	GAG	2	6	571165	571170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980572
15511	NC_006461	CCG	2	6	571197	571202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980572
15512	NC_006461	GGCCT	2	10	571217	571226	0 %	20 %	40 %	40 %	55980572
15513	NC_006461	CCG	2	6	571279	571284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15514	NC_006461	GGA	2	6	571292	571297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_006461	GTA	2	6	571349	571354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980573
15516	NC_006461	TCC	2	6	571416	571421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15517	NC_006461	AGG	2	6	571470	571475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980573
15518	NC_006461	CTC	2	6	571487	571492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15519	NC_006461	CAC	3	9	571517	571525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15520	NC_006461	TGGGG	2	10	571549	571558	0 %	20 %	80 %	0 %	55980573
15521	NC_006461	CCA	2	6	571564	571569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15522	NC_006461	CCG	2	6	571570	571575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980573
15523	NC_006461	CCT	2	6	571576	571581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15524	NC_006461	CCCG	2	8	571637	571644	0 %	0 %	25 %	75 %	55980573
15525	NC_006461	CTC	2	6	571688	571693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
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15527	NC_006461	CCT	2	6	571756	571761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15528	NC_006461	GTA	2	6	571769	571774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980573
15529	NC_006461	CTC	2	6	571847	571852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15530	NC_006461	TCC	2	6	571917	571922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
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15532	NC_006461	C	6	6	572058	572063	0 %	0 %	0 %	100 %	55980573
15533	NC_006461	GCC	2	6	572071	572076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980573
15534	NC_006461	CGG	2	6	572146	572151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980573
15535	NC_006461	CCA	2	6	572182	572187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15536	NC_006461	CCA	2	6	572233	572238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15537	NC_006461	GGC	2	6	572243	572248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980573
15538	NC_006461	GGCA	2	8	572253	572260	25 %	0 %	50 %	25 %	55980573
15539	NC_006461	ACC	2	6	572286	572291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15540	NC_006461	GCC	2	6	572340	572345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980573
15541	NC_006461	GGA	2	6	572353	572358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980573
15542	NC_006461	ACC	2	6	572379	572384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15543	NC_006461	GTG	2	6	572409	572414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980573
15544	NC_006461	GGC	2	6	572429	572434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980573
15545	NC_006461	CCT	2	6	572461	572466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15546	NC_006461	CCT	2	6	572476	572481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15547	NC_006461	TGC	2	6	572529	572534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980573
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15552	NC_006461	CCT	2	6	572786	572791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15553	NC_006461	GGT	2	6	572816	572821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980573
15554	NC_006461	ACC	2	6	572853	572858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980573
15555	NC_006461	TCCT	2	8	572859	572866	0 %	50 %	0 %	50 %	55980573
15556	NC_006461	GCC	3	9	572877	572885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980573
15557	NC_006461	CTC	2	6	572912	572917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980573
15558	NC_006461	CAT	2	6	572921	572926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980573
15559	NC_006461	CCG	2	6	573006	573011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15560	NC_006461	CAC	2	6	573038	573043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_006461	GACCCG	2	12	573062	573073	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15562	NC_006461	CCAG	2	8	573189	573196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15563	NC_006461	CGCC	2	8	573203	573210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15564	NC_006461	GAA	2	6	573290	573295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980574
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15570	NC_006461	C	6	6	573632	573637	0 %	0 %	0 %	100 %	55980574
15571	NC_006461	GGC	2	6	573638	573643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980574
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15585	NC_006461	CGCGGG	2	12	574088	574099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15594	NC_006461	CGG	2	6	574695	574700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980576
15595	NC_006461	TCT	2	6	574715	574720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980576
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15601	NC_006461	GC	3	6	574947	574952	0 %	0 %	50 %	50 %	55980576
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15605	NC_006461	ACAACC	2	12	575035	575046	50 %	0 %	0 %	50 %	55980576
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15609	NC_006461	CGG	2	6	575374	575379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980576
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15613	NC_006461	TGCGG	2	10	575566	575575	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15614	NC_006461	GCCC	2	8	575602	575609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15615	NC_006461	GGC	2	6	575629	575634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_006461	GGA	2	6	575651	575656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15618	NC_006461	TCC	2	6	575678	575683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
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15623	NC_006461	AGG	2	6	575855	575860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980577
15624	NC_006461	TCC	2	6	575861	575866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
15625	NC_006461	TTC	2	6	575876	575881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980577
15626	NC_006461	GGC	2	6	575950	575955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980577
15627	NC_006461	GAG	2	6	575962	575967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980577
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15633	NC_006461	ACC	2	6	576287	576292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980577
15634	NC_006461	CCT	2	6	576312	576317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
15635	NC_006461	GAG	3	9	576328	576336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980577
15636	NC_006461	CCT	2	6	576346	576351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
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15638	NC_006461	CCT	2	6	576384	576389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
15639	NC_006461	GAG	2	6	576442	576447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980577
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15641	NC_006461	TCC	2	6	576470	576475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
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15645	NC_006461	TCC	2	6	576527	576532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
15646	NC_006461	G	6	6	576582	576587	0 %	0 %	100 %	0 %	55980577
15647	NC_006461	GCCC	2	8	576601	576608	0 %	0 %	25 %	75 %	55980577
15648	NC_006461	CCT	2	6	576663	576668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
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15652	NC_006461	G	7	7	576743	576749	0 %	0 %	100 %	0 %	55980577
15653	NC_006461	CCT	2	6	576789	576794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980577
15654	NC_006461	TGA	2	6	576798	576803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980577
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15658	NC_006461	G	7	7	576890	576896	0 %	0 %	100 %	0 %	55980577
15659	NC_006461	GAA	2	6	576928	576933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980577
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15662	NC_006461	GGA	2	6	577077	577082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980577
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15668	NC_006461	CTG	2	6	577257	577262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980578
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15673	NC_006461	CCT	2	6	577505	577510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980578
15674	NC_006461	CGTTC	2	10	577562	577571	0 %	40 %	20 %	40 %	55980578
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15684	NC_006461	GAG	2	6	577854	577859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980578
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15687	NC_006461	GGCCC	2	10	577926	577935	0 %	0 %	40 %	60 %	55980578
15688	NC_006461	GAG	2	6	577947	577952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980578
15689	NC_006461	GCCAC	2	10	577964	577973	20 %	0 %	20 %	60 %	55980578
15690	NC_006461	CCT	2	6	577980	577985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15691	NC_006461	AGGC	2	8	578157	578164	25 %	0 %	50 %	25 %	55980579
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15693	NC_006461	GAG	2	6	578234	578239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980579
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15696	NC_006461	GCC	2	6	578353	578358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980579
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15708	NC_006461	GGC	2	6	578816	578821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980579
15709	NC_006461	GAG	3	9	578831	578839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980579
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15712	NC_006461	TGA	2	6	579003	579008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980580
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15720	NC_006461	G	6	6	579248	579253	0 %	0 %	100 %	0 %	55980581
15721	NC_006461	CCA	2	6	579327	579332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980581
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15726	NC_006461	TCC	2	6	579475	579480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980581
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15730	NC_006461	GTA	2	6	579672	579677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980581
15731	NC_006461	G	7	7	579678	579684	0 %	0 %	100 %	0 %	55980581
15732	NC_006461	GCG	2	6	579742	579747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980581
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15735	NC_006461	CGAGGG	2	12	579878	579889	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980581
15736	NC_006461	GGC	2	6	579893	579898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980581
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15739	NC_006461	G	6	6	579945	579950	0 %	0 %	100 %	0 %	55980581
15740	NC_006461	AGG	2	6	579952	579957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980581
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15742	NC_006461	CCT	2	6	580022	580027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980581
15743	NC_006461	CGTCCA	2	12	580043	580054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980581
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15745	NC_006461	CTC	2	6	580101	580106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980581
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15869	NC_006461	GGC	2	6	584597	584602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980584
15870	NC_006461	GCC	2	6	584614	584619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980584
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15991	NC_006461	CCT	2	6	589241	589246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980587
15992	NC_006461	GAG	2	6	589272	589277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980587
15993	NC_006461	GCC	2	6	589279	589284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980587
15994	NC_006461	CTC	2	6	589302	589307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980587
15995	NC_006461	GGA	2	6	589313	589318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980587
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15997	NC_006461	CGAGG	2	10	589424	589433	20 %	0 %	60 %	20 %	55980587
15998	NC_006461	TCC	2	6	589474	589479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980587
15999	NC_006461	GAG	2	6	589497	589502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980587
16000	NC_006461	CCG	2	6	589535	589540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980587

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