MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_006461	CCT	2	6	499574	499579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_006461	CTT	2	6	499594	499599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980506
13503	NC_006461	ATG	3	9	499694	499702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980506
13504	NC_006461	CAC	2	6	499759	499764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980506
13505	NC_006461	CTT	2	6	499768	499773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980506
13506	NC_006461	GCC	3	9	499793	499801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980506
13507	NC_006461	TCC	2	6	499802	499807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980506
13508	NC_006461	TCG	2	6	499808	499813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980506
13509	NC_006461	GCC	2	6	499816	499821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980506
13510	NC_006461	GAG	2	6	499876	499881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980506
13511	NC_006461	GGT	2	6	499891	499896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980506
13512	NC_006461	GTG	4	12	499928	499939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980506
13513	NC_006461	GGC	2	6	499960	499965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980506
13514	NC_006461	TGA	2	6	499998	500003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980506
13515	NC_006461	TGA	2	6	500067	500072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980506
13516	NC_006461	C	6	6	500086	500091	0 %	0 %	0 %	100 %	55980506
13517	NC_006461	GGC	2	6	500097	500102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980506
13518	NC_006461	TCC	2	6	500120	500125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980506
13519	NC_006461	CCGC	2	8	500127	500134	0 %	0 %	25 %	75 %	55980506
13520	NC_006461	TGA	2	6	500163	500168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980506
13521	NC_006461	GCG	2	6	500207	500212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980506
13522	NC_006461	CCG	2	6	500214	500219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980506
13523	NC_006461	GGGC	2	8	500226	500233	0 %	0 %	75 %	25 %	55980506
13524	NC_006461	GAT	2	6	500239	500244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980506
13525	NC_006461	GTG	2	6	500260	500265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980506
13526	NC_006461	CCT	2	6	500274	500279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980506
13527	NC_006461	CGA	2	6	500343	500348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980506
13528	NC_006461	CCGG	2	8	500395	500402	0 %	0 %	50 %	50 %	55980506
13529	NC_006461	CGC	2	6	500448	500453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980506
13530	NC_006461	CCA	2	6	500459	500464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13531	NC_006461	GCC	2	6	500482	500487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980507
13532	NC_006461	CTT	2	6	500532	500537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980507
13533	NC_006461	CCT	3	9	500540	500548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980507
13534	NC_006461	CGG	2	6	500549	500554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980507
13535	NC_006461	CAC	2	6	500571	500576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13536	NC_006461	GAG	2	6	500586	500591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980507
13537	NC_006461	CTC	2	6	500595	500600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980507
13538	NC_006461	GCC	2	6	500646	500651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980507
13539	NC_006461	TGA	2	6	500660	500665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980507
13540	NC_006461	ACC	2	6	500695	500700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13541	NC_006461	GCCCC	2	10	500731	500740	0 %	0 %	20 %	80 %	55980507
13542	NC_006461	GCCC	2	8	500808	500815	0 %	0 %	25 %	75 %	55980507
13543	NC_006461	GAT	2	6	500823	500828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980507
13544	NC_006461	CCTCCA	2	12	500876	500887	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980507
13545	NC_006461	GTC	2	6	500949	500954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980507
13546	NC_006461	CGG	2	6	500972	500977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980507
13547	NC_006461	CGA	2	6	500978	500983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980507
13548	NC_006461	CCGT	2	8	500989	500996	0 %	25 %	25 %	50 %	55980507
13549	NC_006461	CAC	2	6	501000	501005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13550	NC_006461	CCA	2	6	501062	501067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13551	NC_006461	TTG	2	6	501082	501087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980507
13552	NC_006461	CCCG	2	8	501103	501110	0 %	0 %	25 %	75 %	55980507
13553	NC_006461	C	6	6	501217	501222	0 %	0 %	0 %	100 %	55980507
13554	NC_006461	ACC	2	6	501241	501246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13555	NC_006461	CTT	2	6	501249	501254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980507
13556	NC_006461	GTA	2	6	501279	501284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980507
13557	NC_006461	CCA	2	6	501311	501316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980507
13558	NC_006461	CTT	2	6	501321	501326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980507
13559	NC_006461	CCT	2	6	501380	501385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980507
13560	NC_006461	G	6	6	501386	501391	0 %	0 %	100 %	0 %	55980507
13561	NC_006461	C	6	6	501409	501414	0 %	0 %	0 %	100 %	55980507
13562	NC_006461	CTCC	2	8	501424	501431	0 %	25 %	0 %	75 %	55980507
13563	NC_006461	TGA	2	6	501449	501454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980507
13564	NC_006461	CTC	2	6	501471	501476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980507
13565	NC_006461	CCT	2	6	501491	501496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980507
13566	NC_006461	CGG	2	6	501519	501524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980507
13567	NC_006461	TA	3	6	501621	501626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_006461	CGG	2	6	501848	501853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980508
13569	NC_006461	GGA	2	6	501868	501873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980508
13570	NC_006461	CCT	2	6	501883	501888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980508
13571	NC_006461	GGC	2	6	501919	501924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980508
13572	NC_006461	GCGG	2	8	501973	501980	0 %	0 %	75 %	25 %	55980508
13573	NC_006461	TGGCCT	2	12	502074	502085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980508
13574	NC_006461	AGG	2	6	502110	502115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980508
13575	NC_006461	TCCTGG	2	12	502116	502127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980508
13576	NC_006461	GAC	3	9	502130	502138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980508
13577	NC_006461	CGC	3	9	502150	502158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980508
13578	NC_006461	GTG	2	6	502181	502186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980508
13579	NC_006461	GCGG	2	8	502225	502232	0 %	0 %	75 %	25 %	55980508
13580	NC_006461	CTT	2	6	502318	502323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980508
13581	NC_006461	GAGGGG	2	12	502388	502399	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55980508
13582	NC_006461	TCC	2	6	502467	502472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980508
13583	NC_006461	CCTGGC	2	12	502554	502565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980508
13584	NC_006461	GCC	2	6	502578	502583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980508
13585	NC_006461	CTC	2	6	502625	502630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980508
13586	NC_006461	CG	3	6	502651	502656	0 %	0 %	50 %	50 %	55980508
13587	NC_006461	GAG	2	6	502679	502684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980508
13588	NC_006461	CCA	2	6	502686	502691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980508
13589	NC_006461	GGGCG	2	10	502707	502716	0 %	0 %	80 %	20 %	55980509
13590	NC_006461	GAA	2	6	502720	502725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980509
13591	NC_006461	GGC	2	6	502728	502733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980509
13592	NC_006461	ACC	3	9	502760	502768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980509
13593	NC_006461	C	6	6	502795	502800	0 %	0 %	0 %	100 %	55980509
13594	NC_006461	CCA	4	12	502803	502814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980509
13595	NC_006461	TCC	2	6	502823	502828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980509
13596	NC_006461	TGG	2	6	502844	502849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980509
13597	NC_006461	CCT	2	6	502860	502865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980509
13598	NC_006461	TGGA	2	8	502931	502938	25 %	25 %	50 %	0 %	55980509
13599	NC_006461	AGG	2	6	502973	502978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13600	NC_006461	GGC	2	6	502999	503004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980509
13601	NC_006461	GTC	2	6	503060	503065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980509
13602	NC_006461	G	6	6	503079	503084	0 %	0 %	100 %	0 %	55980509
13603	NC_006461	GCC	2	6	503225	503230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980509
13604	NC_006461	CCA	2	6	503250	503255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980509
13605	NC_006461	C	8	8	503278	503285	0 %	0 %	0 %	100 %	55980509
13606	NC_006461	G	6	6	503286	503291	0 %	0 %	100 %	0 %	55980509
13607	NC_006461	GAG	3	9	503371	503379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13608	NC_006461	GAG	2	6	503413	503418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13609	NC_006461	GGT	2	6	503419	503424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980509
13610	NC_006461	GAG	2	6	503425	503430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13611	NC_006461	GAG	3	9	503437	503445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13612	NC_006461	TGG	2	6	503451	503456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980509
13613	NC_006461	GTG	2	6	503465	503470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980509
13614	NC_006461	ACC	2	6	503477	503482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980509
13615	NC_006461	G	7	7	503485	503491	0 %	0 %	100 %	0 %	55980509
13616	NC_006461	AGG	2	6	503549	503554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13617	NC_006461	GAG	2	6	503560	503565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13618	NC_006461	GCCAGG	2	12	503570	503581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980509
13619	NC_006461	GAG	2	6	503599	503604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980509
13620	NC_006461	TCC	2	6	503633	503638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980509
13621	NC_006461	CCT	2	6	503723	503728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980510
13622	NC_006461	GGA	2	6	503753	503758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980510
13623	NC_006461	CCCG	2	8	503770	503777	0 %	0 %	25 %	75 %	55980510
13624	NC_006461	CCCT	2	8	503782	503789	0 %	25 %	0 %	75 %	55980510
13625	NC_006461	CGC	2	6	503815	503820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980510
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13630	NC_006461	ACC	2	6	504049	504054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980510
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13639	NC_006461	G	6	6	504511	504516	0 %	0 %	100 %	0 %	55980510
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13655	NC_006461	CGGGG	2	10	504858	504867	0 %	0 %	80 %	20 %	55980510
13656	NC_006461	CCT	2	6	504872	504877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980510
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13662	NC_006461	AGG	2	6	505070	505075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980511
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13694	NC_006461	TCG	2	6	506114	506119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980511
13695	NC_006461	GAT	2	6	506122	506127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980511
13696	NC_006461	GTG	2	6	506134	506139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980511
13697	NC_006461	TCC	2	6	506183	506188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980511
13698	NC_006461	GGT	2	6	506256	506261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980511
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13703	NC_006461	CTC	2	6	506416	506421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980511
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13715	NC_006461	GCCC	2	8	506979	506986	0 %	0 %	25 %	75 %	55980511
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13717	NC_006461	CTC	2	6	507004	507009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980511
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13719	NC_006461	GGA	2	6	507051	507056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980511
13720	NC_006461	GCC	2	6	507062	507067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980511
13721	NC_006461	C	7	7	507070	507076	0 %	0 %	0 %	100 %	55980511
13722	NC_006461	AGG	3	9	507092	507100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980511
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13724	NC_006461	GTC	2	6	507175	507180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980511
13725	NC_006461	GGC	2	6	507228	507233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13726	NC_006461	G	6	6	507261	507266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13727	NC_006461	GGA	2	6	507310	507315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13728	NC_006461	AGC	2	6	507330	507335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980512
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13730	NC_006461	GCG	2	6	507362	507367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980512
13731	NC_006461	G	6	6	507399	507404	0 %	0 %	100 %	0 %	55980512
13732	NC_006461	AAC	2	6	507450	507455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980512
13733	NC_006461	TGG	2	6	507468	507473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980512
13734	NC_006461	GAC	2	6	507495	507500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980512
13735	NC_006461	CACC	2	8	507527	507534	25 %	0 %	0 %	75 %	55980512
13736	NC_006461	TCC	2	6	507541	507546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980512
13737	NC_006461	ACT	2	6	507547	507552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980512
13738	NC_006461	TGG	2	6	507583	507588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980512
13739	NC_006461	AAG	2	6	507603	507608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980512
13740	NC_006461	ACC	2	6	507622	507627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980512
13741	NC_006461	AGC	2	6	507637	507642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980512
13742	NC_006461	GGA	2	6	507644	507649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
13743	NC_006461	TGGAGG	2	12	507676	507687	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980512
13744	NC_006461	GAT	2	6	507716	507721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980512
13745	NC_006461	G	7	7	507741	507747	0 %	0 %	100 %	0 %	55980512
13746	NC_006461	CGG	2	6	507754	507759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980512
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13843	NC_006461	GGCC	2	8	511715	511722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13844	NC_006461	TCA	2	6	511823	511828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980518
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13853	NC_006461	GAAGG	2	10	512292	512301	40 %	0 %	60 %	0 %	55980518
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13869	NC_006461	G	6	6	512861	512866	0 %	0 %	100 %	0 %	55980518
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13873	NC_006461	GGCTT	2	10	513023	513032	0 %	40 %	40 %	20 %	55980518
13874	NC_006461	GCTC	2	8	513047	513054	0 %	25 %	25 %	50 %	55980518
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13991	NC_006461	TGG	2	6	517149	517154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980524
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