MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006461	CAC	2	6	481381	481386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980487
13002	NC_006461	AGG	2	6	481424	481429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980487
13003	NC_006461	TCG	2	6	481502	481507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980487
13004	NC_006461	GGCCAC	2	12	481513	481524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980487
13005	NC_006461	ACC	2	6	481574	481579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980487
13006	NC_006461	G	7	7	481613	481619	0 %	0 %	100 %	0 %	55980487
13007	NC_006461	CCT	2	6	481626	481631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980487
13008	NC_006461	AGG	2	6	481664	481669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980487
13009	NC_006461	GCC	2	6	481673	481678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980487
13010	NC_006461	CCA	2	6	481693	481698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980487
13011	NC_006461	AGG	2	6	481724	481729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980487
13012	NC_006461	AGA	2	6	481767	481772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980487
13013	NC_006461	CCG	2	6	481836	481841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980487
13014	NC_006461	CAC	2	6	481926	481931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_006461	GGT	2	6	481942	481947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_006461	G	6	6	482061	482066	0 %	0 %	100 %	0 %	55980488
13017	NC_006461	G	6	6	482069	482074	0 %	0 %	100 %	0 %	55980488
13018	NC_006461	GGT	2	6	482157	482162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980488
13019	NC_006461	ACG	2	6	482210	482215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980488
13020	NC_006461	CCCG	2	8	482377	482384	0 %	0 %	25 %	75 %	55980488
13021	NC_006461	GGA	2	6	482391	482396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980488
13022	NC_006461	ATG	2	6	482407	482412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980488
13023	NC_006461	CTA	2	6	482469	482474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980489
13024	NC_006461	T	6	6	482529	482534	0 %	100 %	0 %	0 %	55980489
13025	NC_006461	CTC	2	6	482551	482556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13026	NC_006461	GAG	3	9	482578	482586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13027	NC_006461	CGC	2	6	482587	482592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980489
13028	NC_006461	CCT	2	6	482610	482615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13029	NC_006461	C	8	8	482616	482623	0 %	0 %	0 %	100 %	55980489
13030	NC_006461	GGA	2	6	482637	482642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13031	NC_006461	CCG	2	6	482661	482666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980489
13032	NC_006461	TGG	2	6	482753	482758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980489
13033	NC_006461	ACC	2	6	482759	482764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980489
13034	NC_006461	GGA	2	6	482766	482771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13035	NC_006461	GGA	2	6	482910	482915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13036	NC_006461	CTC	2	6	482940	482945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13037	NC_006461	G	6	6	482977	482982	0 %	0 %	100 %	0 %	55980489
13038	NC_006461	CCG	2	6	483017	483022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980489
13039	NC_006461	CGGG	2	8	483023	483030	0 %	0 %	75 %	25 %	55980489
13040	NC_006461	CCT	2	6	483087	483092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13041	NC_006461	G	6	6	483134	483139	0 %	0 %	100 %	0 %	55980489
13042	NC_006461	GGC	2	6	483182	483187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980489
13043	NC_006461	GGA	2	6	483213	483218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13044	NC_006461	CCT	2	6	483272	483277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13045	NC_006461	ACG	2	6	483281	483286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980489
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13048	NC_006461	TGG	2	6	483419	483424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980489
13049	NC_006461	GAG	3	9	483451	483459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13050	NC_006461	CCT	2	6	483495	483500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13051	NC_006461	GGA	2	6	483519	483524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
13052	NC_006461	CCT	2	6	483594	483599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13053	NC_006461	TCC	2	6	483629	483634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980489
13054	NC_006461	GTG	2	6	483673	483678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980489
13055	NC_006461	CGCCC	2	10	483698	483707	0 %	0 %	20 %	80 %	55980489
13056	NC_006461	GAC	2	6	483757	483762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980489
13057	NC_006461	TGG	2	6	483791	483796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980489
13058	NC_006461	C	6	6	483813	483818	0 %	0 %	0 %	100 %	55980489
13059	NC_006461	AAC	2	6	483859	483864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980489
13060	NC_006461	CCCGGG	2	12	483905	483916	0 %	0 %	50 %	50 %	55980489
13061	NC_006461	GACG	2	8	483921	483928	25 %	0 %	50 %	25 %	55980489
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13064	NC_006461	GCC	2	6	484036	484041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980489
13065	NC_006461	GGA	2	6	484062	484067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980489
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13069	NC_006461	AAG	2	6	484230	484235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980490
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13090	NC_006461	CCT	2	6	484969	484974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980490
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13104	NC_006461	C	6	6	485358	485363	0 %	0 %	0 %	100 %	55980491
13105	NC_006461	AGG	3	9	485393	485401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980491
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13107	NC_006461	CAAC	2	8	485436	485443	50 %	0 %	0 %	50 %	55980491
13108	NC_006461	CCG	2	6	485462	485467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980491
13109	NC_006461	GGGC	2	8	485526	485533	0 %	0 %	75 %	25 %	55980491
13110	NC_006461	GGC	2	6	485562	485567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980491
13111	NC_006461	TCC	2	6	485588	485593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980491
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13113	NC_006461	CCAGG	2	10	485634	485643	20 %	0 %	40 %	40 %	55980491
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13120	NC_006461	CGCCC	2	10	485778	485787	0 %	0 %	20 %	80 %	55980491
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13124	NC_006461	TGG	2	6	485930	485935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980491
13125	NC_006461	GGA	2	6	485997	486002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980491
13126	NC_006461	G	7	7	486010	486016	0 %	0 %	100 %	0 %	55980491
13127	NC_006461	GC	3	6	486055	486060	0 %	0 %	50 %	50 %	55980491
13128	NC_006461	AGGGG	2	10	486126	486135	20 %	0 %	80 %	0 %	55980491
13129	NC_006461	AGGC	2	8	486154	486161	25 %	0 %	50 %	25 %	55980491
13130	NC_006461	CCG	2	6	486186	486191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980491
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13132	NC_006461	C	6	6	486249	486254	0 %	0 %	0 %	100 %	55980491
13133	NC_006461	GTG	2	6	486286	486291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980491
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13231	NC_006461	CGC	2	6	490074	490079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980495
13232	NC_006461	ATC	2	6	490111	490116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980495
13233	NC_006461	G	6	6	490136	490141	0 %	0 %	100 %	0 %	55980495
13234	NC_006461	CGG	2	6	490153	490158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980495
13235	NC_006461	TGGTCC	2	12	490160	490171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980495
13236	NC_006461	CCGCCA	2	12	490196	490207	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980495
13237	NC_006461	GCC	2	6	490300	490305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980495
13238	NC_006461	AGG	2	6	490376	490381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980495
13239	NC_006461	CTA	2	6	490395	490400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980495
13240	NC_006461	CAT	2	6	490422	490427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980495
13241	NC_006461	CGG	2	6	490503	490508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980495
13242	NC_006461	GGGC	2	8	490509	490516	0 %	0 %	75 %	25 %	55980495
13243	NC_006461	TGG	2	6	490574	490579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980495
13244	NC_006461	GAG	2	6	490588	490593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980495
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13246	NC_006461	AAG	2	6	490714	490719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980495
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13358	NC_006461	G	7	7	494227	494233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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13360	NC_006461	GAA	2	6	494368	494373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980501
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13363	NC_006461	CTC	2	6	494479	494484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980501
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13366	NC_006461	GGGGA	2	10	494516	494525	20 %	0 %	80 %	0 %	55980501
13367	NC_006461	TCG	2	6	494531	494536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980501
13368	NC_006461	TCG	2	6	494567	494572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980501
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13370	NC_006461	CTG	2	6	494698	494703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980501
13371	NC_006461	TGCGG	2	10	494713	494722	0 %	20 %	60 %	20 %	55980501
13372	NC_006461	TTG	2	6	494729	494734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980501
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13399	NC_006461	TCC	2	6	495614	495619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980502
13400	NC_006461	GCC	3	9	495686	495694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980502
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13402	NC_006461	G	7	7	495748	495754	0 %	0 %	100 %	0 %	55980502
13403	NC_006461	ATG	2	6	495764	495769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980502
13404	NC_006461	GGGCCT	2	12	495816	495827	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980502
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13407	NC_006461	GCCC	2	8	495940	495947	0 %	0 %	25 %	75 %	55980502
13408	NC_006461	GCCG	2	8	495963	495970	0 %	0 %	50 %	50 %	55980502
13409	NC_006461	GAG	3	9	496009	496017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980502
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13415	NC_006461	GGGGC	2	10	496125	496134	0 %	0 %	80 %	20 %	55980502
13416	NC_006461	CTCCTT	2	12	496135	496146	0 %	50 %	0 %	50 %	55980502
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13430	NC_006461	GGT	2	6	496641	496646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980502
13431	NC_006461	TCC	2	6	496670	496675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13432	NC_006461	G	7	7	496735	496741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13433	NC_006461	AGG	2	6	496748	496753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13434	NC_006461	TGG	2	6	496766	496771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980503
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13449	NC_006461	TCC	2	6	497387	497392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980503
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13451	NC_006461	TCC	2	6	497432	497437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980503
13452	NC_006461	AGG	2	6	497480	497485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980503
13453	NC_006461	TGGACC	2	12	497525	497536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980503
13454	NC_006461	ATC	2	6	497632	497637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980503
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13459	NC_006461	GAT	2	6	497871	497876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980503
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13462	NC_006461	CCG	2	6	497912	497917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980503
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13471	NC_006461	TCC	2	6	498211	498216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980504
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13475	NC_006461	TGG	2	6	498316	498321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980504
13476	NC_006461	GAG	2	6	498381	498386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980504
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13479	NC_006461	GGT	2	6	498531	498536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13480	NC_006461	GGCC	2	8	498574	498581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13488	NC_006461	GGGC	2	8	498952	498959	0 %	0 %	75 %	25 %	55980505
13489	NC_006461	TGG	2	6	498997	499002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980505
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13492	NC_006461	CAC	2	6	499181	499186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980505
13493	NC_006461	CTT	2	6	499202	499207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980505
13494	NC_006461	GGCCC	2	10	499223	499232	0 %	0 %	40 %	60 %	55980505
13495	NC_006461	G	6	6	499294	499299	0 %	0 %	100 %	0 %	55980505
13496	NC_006461	AGG	2	6	499311	499316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980505
13497	NC_006461	GTC	2	6	499349	499354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980505
13498	NC_006461	TCC	2	6	499392	499397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980505
13499	NC_006461	GGA	2	6	499453	499458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980505
13500	NC_006461	AGG	2	6	499506	499511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980505

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