MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_006461	CCT	2	6	461950	461955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980464
12502	NC_006461	AGG	2	6	461979	461984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980464
12503	NC_006461	CCT	2	6	462031	462036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980464
12504	NC_006461	CCA	2	6	462040	462045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980464
12505	NC_006461	CGG	2	6	462072	462077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980464
12506	NC_006461	GCC	2	6	462094	462099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980464
12507	NC_006461	GAG	2	6	462167	462172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980464
12508	NC_006461	CCA	2	6	462205	462210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980464
12509	NC_006461	GAG	2	6	462245	462250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980464
12510	NC_006461	CCT	2	6	462283	462288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980464
12511	NC_006461	CTC	2	6	462353	462358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980464
12512	NC_006461	AGG	2	6	462408	462413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980464
12513	NC_006461	CCA	2	6	462418	462423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980464
12514	NC_006461	GGCGCA	2	12	462454	462465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980464
12515	NC_006461	CCGG	2	8	462626	462633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_006461	GGT	2	6	462699	462704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_006461	CCA	2	6	462721	462726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12518	NC_006461	CTC	2	6	462812	462817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980465
12519	NC_006461	GCGT	2	8	462849	462856	0 %	25 %	50 %	25 %	55980465
12520	NC_006461	AGG	2	6	462864	462869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980465
12521	NC_006461	CAC	2	6	462919	462924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980465
12522	NC_006461	CAT	2	6	462925	462930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980465
12523	NC_006461	CCTC	2	8	462936	462943	0 %	25 %	0 %	75 %	55980465
12524	NC_006461	TCC	2	6	462966	462971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980465
12525	NC_006461	CTT	2	6	463108	463113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980465
12526	NC_006461	ACC	2	6	463184	463189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980466
12527	NC_006461	GGA	2	6	463194	463199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980466
12528	NC_006461	GAA	2	6	463221	463226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980466
12529	NC_006461	GGA	2	6	463245	463250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980466
12530	NC_006461	CTT	2	6	463254	463259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980466
12531	NC_006461	CCCT	2	8	463275	463282	0 %	25 %	0 %	75 %	55980466
12532	NC_006461	GGA	2	6	463284	463289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980466
12533	NC_006461	TCCTC	2	10	463311	463320	0 %	40 %	0 %	60 %	55980466
12534	NC_006461	CCT	3	9	463401	463409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980466
12535	NC_006461	GGGGC	2	10	463440	463449	0 %	0 %	80 %	20 %	55980466
12536	NC_006461	C	7	7	463470	463476	0 %	0 %	0 %	100 %	55980466
12537	NC_006461	GCCC	2	8	463525	463532	0 %	0 %	25 %	75 %	55980466
12538	NC_006461	CCT	2	6	463557	463562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980466
12539	NC_006461	CCT	2	6	463620	463625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980466
12540	NC_006461	CCGC	2	8	463626	463633	0 %	0 %	25 %	75 %	55980466
12541	NC_006461	AGG	2	6	463676	463681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980466
12542	NC_006461	GCC	2	6	463745	463750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980466
12543	NC_006461	TCC	2	6	463857	463862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980466
12544	NC_006461	GCCC	2	8	463868	463875	0 %	0 %	25 %	75 %	55980466
12545	NC_006461	GGA	2	6	463944	463949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980466
12546	NC_006461	GGC	2	6	463956	463961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980466
12547	NC_006461	C	6	6	464077	464082	0 %	0 %	0 %	100 %	55980466
12548	NC_006461	CTTC	2	8	464139	464146	0 %	50 %	0 %	50 %	55980466
12549	NC_006461	TAGG	2	8	464155	464162	25 %	25 %	50 %	0 %	55980466
12550	NC_006461	CCAC	2	8	464166	464173	25 %	0 %	0 %	75 %	55980466
12551	NC_006461	CGG	2	6	464183	464188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980466
12552	NC_006461	GGACGT	2	12	464232	464243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980466
12553	NC_006461	GCT	2	6	464258	464263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980467
12554	NC_006461	CCT	2	6	464272	464277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980467
12555	NC_006461	CGCGAG	2	12	464300	464311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980467
12556	NC_006461	AGA	2	6	464493	464498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980467
12557	NC_006461	TTC	2	6	464543	464548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980467
12558	NC_006461	CGGGCC	2	12	464580	464591	0 %	0 %	50 %	50 %	55980467
12559	NC_006461	AGCCA	2	10	464613	464622	40 %	0 %	20 %	40 %	55980467
12560	NC_006461	TCC	2	6	464716	464721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980468
12561	NC_006461	CAG	2	6	464730	464735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980468
12562	NC_006461	CAC	3	9	464820	464828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980468
12563	NC_006461	GAG	2	6	464829	464834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980468
12564	NC_006461	CT	3	6	464845	464850	0 %	50 %	0 %	50 %	55980468
12565	NC_006461	C	6	6	464861	464866	0 %	0 %	0 %	100 %	55980468
12566	NC_006461	AGG	3	9	464969	464977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
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12569	NC_006461	GAA	2	6	465037	465042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980469
12570	NC_006461	TCC	2	6	465059	465064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980469
12571	NC_006461	CCG	2	6	465099	465104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980469
12572	NC_006461	GAG	2	6	465109	465114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
12573	NC_006461	CGG	2	6	465120	465125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980469
12574	NC_006461	CGC	2	6	465126	465131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980469
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12577	NC_006461	GAG	2	6	465202	465207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
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12579	NC_006461	CCCTTC	2	12	465228	465239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980469
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12582	NC_006461	GAG	2	6	465271	465276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
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12588	NC_006461	GGA	2	6	465531	465536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
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12590	NC_006461	GTC	2	6	465643	465648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980469
12591	NC_006461	GAG	3	9	465664	465672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
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12593	NC_006461	GAG	2	6	465697	465702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
12594	NC_006461	GAG	2	6	465775	465780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980469
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12603	NC_006461	GGT	2	6	466005	466010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980469
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12605	NC_006461	GCC	3	9	466055	466063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980469
12606	NC_006461	GCC	2	6	466089	466094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980469
12607	NC_006461	G	6	6	466097	466102	0 %	0 %	100 %	0 %	55980469
12608	NC_006461	CTTC	2	8	466158	466165	0 %	50 %	0 %	50 %	55980469
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12610	NC_006461	GTCC	2	8	466185	466192	0 %	25 %	25 %	50 %	55980470
12611	NC_006461	AGG	2	6	466216	466221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980470
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12613	NC_006461	CCCG	2	8	466292	466299	0 %	0 %	25 %	75 %	55980470
12614	NC_006461	AGA	2	6	466387	466392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980470
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12619	NC_006461	TCC	2	6	466590	466595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980471
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12623	NC_006461	CCT	2	6	466768	466773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980471
12624	NC_006461	CCT	2	6	466789	466794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980471
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12627	NC_006461	TCC	2	6	467001	467006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980472
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12656	NC_006461	CCT	2	6	467937	467942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980472
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12692	NC_006461	CTT	2	6	469377	469382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980474
12693	NC_006461	CGT	2	6	469385	469390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980474
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12697	NC_006461	CCT	3	9	469679	469687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980474
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12709	NC_006461	GCTG	2	8	470126	470133	0 %	25 %	50 %	25 %	55980474
12710	NC_006461	GTA	2	6	470148	470153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980474
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12717	NC_006461	CAC	2	6	470364	470369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980474
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12720	NC_006461	CCGG	2	8	470481	470488	0 %	0 %	50 %	50 %	55980474
12721	NC_006461	TCC	2	6	470506	470511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980474
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12724	NC_006461	G	6	6	470558	470563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12725	NC_006461	CCA	2	6	470604	470609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980475
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12728	NC_006461	CTC	3	9	470710	470718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980475
12729	NC_006461	TCC	2	6	470759	470764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980475
12730	NC_006461	C	6	6	470772	470777	0 %	0 %	0 %	100 %	55980475
12731	NC_006461	CGG	2	6	470814	470819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980475
12732	NC_006461	GGC	2	6	470821	470826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980475
12733	NC_006461	TCC	2	6	470828	470833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980475
12734	NC_006461	TGT	2	6	470904	470909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980475
12735	NC_006461	CCCTC	2	10	470931	470940	0 %	20 %	0 %	80 %	55980475
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12742	NC_006461	GC	3	6	471137	471142	0 %	0 %	50 %	50 %	55980475
12743	NC_006461	GCC	2	6	471179	471184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980475
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12994	NC_006461	G	6	6	481186	481191	0 %	0 %	100 %	0 %	55980486
12995	NC_006461	GAG	4	12	481193	481204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980486
12996	NC_006461	GGGC	2	8	481218	481225	0 %	0 %	75 %	25 %	55980487
12997	NC_006461	AGG	3	9	481250	481258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980487
12998	NC_006461	CCT	2	6	481284	481289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980487
12999	NC_006461	GGA	2	6	481320	481325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980487
13000	NC_006461	CCT	2	6	481326	481331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980487

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