MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_006461	GAC	2	6	443575	443580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980442
12003	NC_006461	TCG	2	6	443630	443635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_006461	TGA	2	6	443664	443669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980443
12005	NC_006461	GAG	2	6	443708	443713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980443
12006	NC_006461	CTC	2	6	443723	443728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980443
12007	NC_006461	GTG	2	6	443756	443761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980443
12008	NC_006461	GAG	2	6	443762	443767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980443
12009	NC_006461	ACCG	2	8	443789	443796	25 %	0 %	25 %	50 %	55980443
12010	NC_006461	TGA	2	6	443868	443873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980443
12011	NC_006461	GGT	2	6	443881	443886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980443
12012	NC_006461	GGA	2	6	443911	443916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980443
12013	NC_006461	GGC	2	6	443917	443922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980443
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12015	NC_006461	CTC	2	6	444017	444022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980443
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12021	NC_006461	GGAGG	2	10	444154	444163	20 %	0 %	80 %	0 %	55980443
12022	NC_006461	GCGG	2	8	444172	444179	0 %	0 %	75 %	25 %	55980443
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12030	NC_006461	C	6	6	444393	444398	0 %	0 %	0 %	100 %	55980444
12031	NC_006461	GAGG	2	8	444408	444415	25 %	0 %	75 %	0 %	55980444
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12123	NC_006461	CTC	2	6	447804	447809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980447
12124	NC_006461	GGGGA	2	10	447820	447829	20 %	0 %	80 %	0 %	55980447
12125	NC_006461	G	6	6	447913	447918	0 %	0 %	100 %	0 %	55980447
12126	NC_006461	TGC	2	6	447925	447930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980447
12127	NC_006461	CCA	3	9	448010	448018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980447
12128	NC_006461	GCG	2	6	448137	448142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980447
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12131	NC_006461	GTA	2	6	448356	448361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980447
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12136	NC_006461	CTC	3	9	448515	448523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980447
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12142	NC_006461	GAG	2	6	448752	448757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980447
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12151	NC_006461	GGA	2	6	449255	449260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980447
12152	NC_006461	GTA	2	6	449265	449270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980447
12153	NC_006461	CGT	2	6	449288	449293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980447
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12155	NC_006461	CTC	2	6	449346	449351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980447
12156	NC_006461	CGT	2	6	449396	449401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980447
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12159	NC_006461	CCT	2	6	449519	449524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980448
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12187	NC_006461	CCT	2	6	450349	450354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980449
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12191	NC_006461	GTG	2	6	450429	450434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980449
12192	NC_006461	CTC	2	6	450450	450455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980449
12193	NC_006461	GCT	2	6	450476	450481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12194	NC_006461	CGC	2	6	450482	450487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12195	NC_006461	TGG	2	6	450572	450577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980450
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12199	NC_006461	ACT	2	6	450759	450764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980450
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12203	NC_006461	C	7	7	450967	450973	0 %	0 %	0 %	100 %	55980450
12204	NC_006461	AAC	2	6	450974	450979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980450
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12214	NC_006461	CCTACG	2	12	451281	451292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980450
12215	NC_006461	GGGA	2	8	451334	451341	25 %	0 %	75 %	0 %	55980450
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12228	NC_006461	GAGG	2	8	451963	451970	25 %	0 %	75 %	0 %	55980450
12229	NC_006461	G	6	6	451989	451994	0 %	0 %	100 %	0 %	55980450
12230	NC_006461	G	6	6	452054	452059	0 %	0 %	100 %	0 %	55980450
12231	NC_006461	GGT	2	6	452062	452067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980450
12232	NC_006461	CCAC	2	8	452073	452080	25 %	0 %	0 %	75 %	55980450
12233	NC_006461	GGA	2	6	452089	452094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980450
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12235	NC_006461	CGA	2	6	452125	452130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980450
12236	NC_006461	GAG	3	9	452235	452243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
12237	NC_006461	C	6	6	452265	452270	0 %	0 %	0 %	100 %	55980451
12238	NC_006461	CCT	2	6	452279	452284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
12239	NC_006461	GAG	2	6	452378	452383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
12240	NC_006461	GCCCT	2	10	452424	452433	0 %	20 %	20 %	60 %	55980451
12241	NC_006461	TCC	2	6	452458	452463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
12242	NC_006461	CAC	2	6	452468	452473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980451
12243	NC_006461	GGA	2	6	452486	452491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
12244	NC_006461	TCC	2	6	452503	452508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
12245	NC_006461	TCC	2	6	452524	452529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
12246	NC_006461	CGGG	2	8	452533	452540	0 %	0 %	75 %	25 %	55980451
12247	NC_006461	TGG	2	6	452548	452553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980451
12248	NC_006461	GCC	2	6	452580	452585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980451
12249	NC_006461	TCC	2	6	452614	452619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
12250	NC_006461	GGA	2	6	452648	452653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
12251	NC_006461	CCT	2	6	452673	452678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
12252	NC_006461	C	6	6	452721	452726	0 %	0 %	0 %	100 %	55980451
12253	NC_006461	GAG	2	6	452730	452735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
12254	NC_006461	GC	3	6	452753	452758	0 %	0 %	50 %	50 %	55980451
12255	NC_006461	CCGCC	2	10	452765	452774	0 %	0 %	20 %	80 %	55980451
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12258	NC_006461	GGA	2	6	452869	452874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980452
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12262	NC_006461	GGA	2	6	452974	452979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980452
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12266	NC_006461	CGGCAC	2	12	453127	453138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980452
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12269	NC_006461	GGGC	2	8	453254	453261	0 %	0 %	75 %	25 %	55980452
12270	NC_006461	GCCCT	2	10	453266	453275	0 %	20 %	20 %	60 %	55980452
12271	NC_006461	CTT	2	6	453301	453306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980452
12272	NC_006461	CCA	2	6	453319	453324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980452
12273	NC_006461	GAG	3	9	453401	453409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980452
12274	NC_006461	GCC	2	6	453415	453420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980452
12275	NC_006461	GCCC	2	8	453480	453487	0 %	0 %	25 %	75 %	55980452
12276	NC_006461	CTT	2	6	453490	453495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980452
12277	NC_006461	AGCC	2	8	453563	453570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12278	NC_006461	CAG	2	6	453644	453649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12279	NC_006461	CGG	2	6	453686	453691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980453
12280	NC_006461	AGG	2	6	453714	453719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
12281	NC_006461	GAG	2	6	453800	453805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
12282	NC_006461	G	6	6	453822	453827	0 %	0 %	100 %	0 %	55980453
12283	NC_006461	CCA	2	6	453835	453840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980453
12284	NC_006461	CGT	2	6	453874	453879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980453
12285	NC_006461	GAG	2	6	453890	453895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
12286	NC_006461	TGCC	2	8	453942	453949	0 %	25 %	25 %	50 %	55980453
12287	NC_006461	AGG	2	6	453955	453960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
12288	NC_006461	CGT	2	6	453973	453978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980453
12289	NC_006461	GAG	2	6	453983	453988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
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12298	NC_006461	AGG	2	6	454515	454520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
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12303	NC_006461	GAG	2	6	454589	454594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
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12307	NC_006461	C	6	6	454712	454717	0 %	0 %	0 %	100 %	55980453
12308	NC_006461	AGG	2	6	454752	454757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
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12311	NC_006461	GCCC	2	8	454874	454881	0 %	0 %	25 %	75 %	55980453
12312	NC_006461	C	6	6	454899	454904	0 %	0 %	0 %	100 %	55980453
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12319	NC_006461	GCC	2	6	455120	455125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980454
12320	NC_006461	TGG	2	6	455178	455183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980454
12321	NC_006461	CCCCA	2	10	455192	455201	20 %	0 %	0 %	80 %	55980454
12322	NC_006461	GGA	2	6	455224	455229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980454
12323	NC_006461	GCC	2	6	455237	455242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980454
12324	NC_006461	G	6	6	455399	455404	0 %	0 %	100 %	0 %	55980454
12325	NC_006461	CG	3	6	455470	455475	0 %	0 %	50 %	50 %	55980454
12326	NC_006461	CTTT	2	8	455484	455491	0 %	75 %	0 %	25 %	55980454
12327	NC_006461	CTC	2	6	455519	455524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980454
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12330	NC_006461	AAG	2	6	455762	455767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980454
12331	NC_006461	CCT	2	6	455776	455781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980455
12332	NC_006461	GGA	2	6	455800	455805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
12333	NC_006461	CCCAGG	2	12	455904	455915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980455
12334	NC_006461	CCCG	2	8	455958	455965	0 %	0 %	25 %	75 %	55980455
12335	NC_006461	TCC	2	6	455989	455994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980455
12336	NC_006461	GCCC	2	8	456000	456007	0 %	0 %	25 %	75 %	55980455
12337	NC_006461	GAA	2	6	456017	456022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980455
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12339	NC_006461	GCTCGG	2	12	456046	456057	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980455
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12341	NC_006461	G	7	7	456158	456164	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
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12344	NC_006461	CCTCCA	2	12	456304	456315	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980455
12345	NC_006461	G	6	6	456316	456321	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
12346	NC_006461	GAG	2	6	456323	456328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
12347	NC_006461	GCCC	2	8	456392	456399	0 %	0 %	25 %	75 %	55980455
12348	NC_006461	GCG	2	6	456408	456413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980455
12349	NC_006461	AGGCCC	2	12	456462	456473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980455
12350	NC_006461	TCC	2	6	456483	456488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980455
12351	NC_006461	GGT	2	6	456517	456522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980455
12352	NC_006461	G	7	7	456573	456579	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
12353	NC_006461	CGGGGT	2	12	456583	456594	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980455
12354	NC_006461	AGG	3	9	456612	456620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
12355	NC_006461	C	6	6	456686	456691	0 %	0 %	0 %	100 %	55980455
12356	NC_006461	GGC	2	6	456694	456699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980455
12357	NC_006461	GGCCTC	2	12	456725	456736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980455
12358	NC_006461	G	6	6	456751	456756	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
12359	NC_006461	AGG	2	6	456768	456773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
12360	NC_006461	TCC	2	6	456792	456797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980455
12361	NC_006461	AGG	2	6	456798	456803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
12362	NC_006461	CAC	2	6	456809	456814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980455
12363	NC_006461	CGGT	2	8	456845	456852	0 %	25 %	50 %	25 %	55980456
12364	NC_006461	GAG	2	6	456856	456861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980456
12365	NC_006461	CCA	2	6	456873	456878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980456
12366	NC_006461	GGC	2	6	456886	456891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980456
12367	NC_006461	GCT	2	6	456915	456920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980456
12368	NC_006461	AGG	2	6	456941	456946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980456
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12491	NC_006461	GAG	2	6	461555	461560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980464
12492	NC_006461	CGAGG	2	10	461645	461654	20 %	0 %	60 %	20 %	55980464
12493	NC_006461	C	7	7	461677	461683	0 %	0 %	0 %	100 %	55980464
12494	NC_006461	TTGC	2	8	461708	461715	0 %	50 %	25 %	25 %	55980464
12495	NC_006461	GCG	2	6	461738	461743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980464
12496	NC_006461	TCC	2	6	461751	461756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980464
12497	NC_006461	GGA	2	6	461767	461772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980464
12498	NC_006461	CGC	2	6	461787	461792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980464
12499	NC_006461	CGG	2	6	461805	461810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980464
12500	NC_006461	CG	3	6	461853	461858	0 %	0 %	50 %	50 %	55980464

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