MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_006461	GAG	2	6	425920	425925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980422
11502	NC_006461	GGC	2	6	425980	425985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980422
11503	NC_006461	CTT	2	6	426010	426015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980423
11504	NC_006461	CTC	2	6	426026	426031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11505	NC_006461	GTG	2	6	426077	426082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980423
11506	NC_006461	TCCT	2	8	426095	426102	0 %	50 %	0 %	50 %	55980423
11507	NC_006461	CGC	2	6	426121	426126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980423
11508	NC_006461	GAGG	2	8	426157	426164	25 %	0 %	75 %	0 %	55980423
11509	NC_006461	GGA	2	6	426244	426249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980423
11510	NC_006461	TCT	2	6	426264	426269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980423
11511	NC_006461	CTCC	2	8	426352	426359	0 %	25 %	0 %	75 %	55980423
11512	NC_006461	G	8	8	426391	426398	0 %	0 %	100 %	0 %	55980423
11513	NC_006461	CCT	2	6	426418	426423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11514	NC_006461	CTCGCC	2	12	426467	426478	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980423
11515	NC_006461	CCT	2	6	426508	426513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11516	NC_006461	TGG	3	9	426537	426545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980423
11517	NC_006461	GGT	2	6	426553	426558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980423
11518	NC_006461	TCC	2	6	426564	426569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11519	NC_006461	GCC	2	6	426575	426580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980423
11520	NC_006461	GCG	2	6	426599	426604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980423
11521	NC_006461	CCT	2	6	426640	426645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11522	NC_006461	CTC	2	6	426650	426655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11523	NC_006461	CTC	2	6	426674	426679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11524	NC_006461	CCT	2	6	426690	426695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11525	NC_006461	TCC	2	6	426696	426701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11526	NC_006461	CTC	2	6	426743	426748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980423
11527	NC_006461	CCTT	2	8	426759	426766	0 %	50 %	0 %	50 %	55980423
11528	NC_006461	G	6	6	426782	426787	0 %	0 %	100 %	0 %	55980423
11529	NC_006461	TGG	2	6	426858	426863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980424
11530	NC_006461	AGG	2	6	426900	426905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980424
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11532	NC_006461	CGC	2	6	426949	426954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980424
11533	NC_006461	G	6	6	426990	426995	0 %	0 %	100 %	0 %	55980424
11534	NC_006461	G	7	7	427000	427006	0 %	0 %	100 %	0 %	55980424
11535	NC_006461	CGCC	2	8	427015	427022	0 %	0 %	25 %	75 %	55980424
11536	NC_006461	C	6	6	427021	427026	0 %	0 %	0 %	100 %	55980424
11537	NC_006461	GGT	2	6	427048	427053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980424
11538	NC_006461	GGA	2	6	427093	427098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980424
11539	NC_006461	GGC	2	6	427146	427151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980424
11540	NC_006461	CAC	2	6	427186	427191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980424
11541	NC_006461	GAG	2	6	427208	427213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980424
11542	NC_006461	GGC	2	6	427215	427220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980424
11543	NC_006461	G	6	6	427233	427238	0 %	0 %	100 %	0 %	55980424
11544	NC_006461	GGC	2	6	427277	427282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_006461	CCA	2	6	427311	427316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980425
11546	NC_006461	GCGG	2	8	427348	427355	0 %	0 %	75 %	25 %	55980425
11547	NC_006461	GGA	2	6	427357	427362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980425
11548	NC_006461	CAG	2	6	427378	427383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980425
11549	NC_006461	AGG	2	6	427401	427406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980425
11550	NC_006461	GGA	2	6	427420	427425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980425
11551	NC_006461	GGT	2	6	427471	427476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980425
11552	NC_006461	CGCCCT	2	12	427504	427515	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980425
11553	NC_006461	GGCCC	2	10	427520	427529	0 %	0 %	40 %	60 %	55980425
11554	NC_006461	GTG	2	6	427550	427555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980425
11555	NC_006461	CGG	2	6	427560	427565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980425
11556	NC_006461	CGC	2	6	427573	427578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980425
11557	NC_006461	CTC	2	6	427628	427633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980425
11558	NC_006461	GGA	2	6	427672	427677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980425
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11560	NC_006461	CTC	2	6	427907	427912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980425
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11563	NC_006461	GGCGG	2	10	427968	427977	0 %	0 %	80 %	20 %	55980425
11564	NC_006461	GAG	2	6	428045	428050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980425
11565	NC_006461	GCG	2	6	428051	428056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980425
11566	NC_006461	GCG	3	9	428071	428079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980425
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11570	NC_006461	TCC	2	6	428271	428276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980425
11571	NC_006461	CCT	2	6	428310	428315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980425
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11574	NC_006461	GGCGGT	2	12	428362	428373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980425
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11576	NC_006461	CGGAA	2	10	428419	428428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11577	NC_006461	G	6	6	428434	428439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_006461	CTC	2	6	428530	428535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980426
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11589	NC_006461	AGG	2	6	428864	428869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980426
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11591	NC_006461	CTC	3	9	428959	428967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980426
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11595	NC_006461	GAAG	2	8	429074	429081	50 %	0 %	50 %	0 %	55980426
11596	NC_006461	GTG	2	6	429124	429129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980426
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11603	NC_006461	CCT	2	6	429333	429338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980426
11604	NC_006461	TGG	2	6	429377	429382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980426
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11609	NC_006461	G	7	7	429556	429562	0 %	0 %	100 %	0 %	55980426
11610	NC_006461	GGCCG	2	10	429566	429575	0 %	0 %	60 %	40 %	55980426
11611	NC_006461	ACC	2	6	429593	429598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980426
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11621	NC_006461	ACCTC	2	10	429955	429964	20 %	20 %	0 %	60 %	55980427
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11747	NC_006461	GGC	2	6	434232	434237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
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11838	NC_006461	TCC	2	6	437283	437288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11990	NC_006461	G	6	6	443086	443091	0 %	0 %	100 %	0 %	55980442
11991	NC_006461	GGATCG	2	12	443102	443113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980442
11992	NC_006461	CGA	2	6	443151	443156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980442
11993	NC_006461	TCCA	2	8	443179	443186	25 %	25 %	0 %	50 %	55980442
11994	NC_006461	GGT	2	6	443193	443198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980442
11995	NC_006461	AGG	2	6	443219	443224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980442
11996	NC_006461	GGT	2	6	443265	443270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980442
11997	NC_006461	GCT	2	6	443376	443381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980442
11998	NC_006461	CGG	2	6	443384	443389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980442
11999	NC_006461	GT	3	6	443472	443477	0 %	50 %	50 %	0 %	55980442
12000	NC_006461	GGT	2	6	443520	443525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980442

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