MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006461	GCG	2	6	407816	407821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980401
11002	NC_006461	CTC	2	6	407859	407864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980401
11003	NC_006461	GCG	2	6	407871	407876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980401
11004	NC_006461	TGG	2	6	407917	407922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980401
11005	NC_006461	G	6	6	408079	408084	0 %	0 %	100 %	0 %	55980401
11006	NC_006461	CAC	2	6	408125	408130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980401
11007	NC_006461	GGT	2	6	408134	408139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980401
11008	NC_006461	GGGGGT	2	12	408143	408154	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	55980401
11009	NC_006461	G	6	6	408225	408230	0 %	0 %	100 %	0 %	55980401
11010	NC_006461	CGC	2	6	408263	408268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980401
11011	NC_006461	GCA	2	6	408292	408297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980401
11012	NC_006461	GAG	2	6	408327	408332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980401
11013	NC_006461	CCG	2	6	408403	408408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980401
11014	NC_006461	AAG	2	6	408450	408455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980401
11015	NC_006461	G	6	6	408527	408532	0 %	0 %	100 %	0 %	55980401
11016	NC_006461	AAG	2	6	408585	408590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980401
11017	NC_006461	ACG	2	6	408640	408645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980401
11018	NC_006461	TGG	3	9	408646	408654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980401
11019	NC_006461	AGG	2	6	408658	408663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980401
11020	NC_006461	ACT	2	6	408670	408675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980401
11021	NC_006461	GGC	2	6	408694	408699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980402
11022	NC_006461	CTT	2	6	408719	408724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980402
11023	NC_006461	CGGG	2	8	408726	408733	0 %	0 %	75 %	25 %	55980402
11024	NC_006461	TCC	2	6	408753	408758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980402
11025	NC_006461	CCA	2	6	408772	408777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980402
11026	NC_006461	CTT	2	6	408803	408808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980402
11027	NC_006461	CCGC	2	8	408880	408887	0 %	0 %	25 %	75 %	55980402
11028	NC_006461	CCA	2	6	408912	408917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_006461	CTC	2	6	408996	409001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980403
11030	NC_006461	CGCC	2	8	409046	409053	0 %	0 %	25 %	75 %	55980403
11031	NC_006461	CGC	2	6	409086	409091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980403
11032	NC_006461	CCTCCG	2	12	409148	409159	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980403
11033	NC_006461	CCT	2	6	409220	409225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980403
11034	NC_006461	GAG	2	6	409233	409238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980403
11035	NC_006461	TAC	2	6	409275	409280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980403
11036	NC_006461	CCTC	2	8	409295	409302	0 %	25 %	0 %	75 %	55980403
11037	NC_006461	CTC	2	6	409305	409310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980403
11038	NC_006461	GAG	2	6	409329	409334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980403
11039	NC_006461	AGG	2	6	409348	409353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980403
11040	NC_006461	GGGC	2	8	409359	409366	0 %	0 %	75 %	25 %	55980403
11041	NC_006461	GGCG	2	8	409404	409411	0 %	0 %	75 %	25 %	55980403
11042	NC_006461	G	6	6	409504	409509	0 %	0 %	100 %	0 %	55980404
11043	NC_006461	CTG	2	6	409543	409548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980404
11044	NC_006461	GGA	2	6	409557	409562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980404
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11048	NC_006461	GCAGG	2	10	409693	409702	20 %	0 %	60 %	20 %	55980404
11049	NC_006461	AGT	2	6	409719	409724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980404
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11051	NC_006461	CCA	2	6	409752	409757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980404
11052	NC_006461	G	6	6	409822	409827	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_006461	GCT	2	6	409871	409876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_006461	GAG	2	6	409949	409954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980405
11055	NC_006461	GTC	2	6	409991	409996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980405
11056	NC_006461	CCGTC	2	10	410074	410083	0 %	20 %	20 %	60 %	55980405
11057	NC_006461	CTT	2	6	410231	410236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980405
11058	NC_006461	CTC	2	6	410240	410245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980405
11059	NC_006461	GGC	2	6	410269	410274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980405
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11061	NC_006461	GGC	2	6	410324	410329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980405
11062	NC_006461	GCG	2	6	410343	410348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980405
11063	NC_006461	C	6	6	410418	410423	0 %	0 %	0 %	100 %	55980405
11064	NC_006461	GCG	2	6	410424	410429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980405
11065	NC_006461	AGA	2	6	410449	410454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980405
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11067	NC_006461	GGC	2	6	410482	410487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980405
11068	NC_006461	TGG	3	9	410500	410508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980405
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11072	NC_006461	CAC	2	6	410651	410656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980405
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11082	NC_006461	CGC	2	6	410776	410781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980405
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11084	NC_006461	GCCC	2	8	410825	410832	0 %	0 %	25 %	75 %	55980405
11085	NC_006461	AGGCG	2	10	410874	410883	20 %	0 %	60 %	20 %	55980406
11086	NC_006461	GCC	2	6	410920	410925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980406
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11091	NC_006461	GAG	2	6	411040	411045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980406
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11093	NC_006461	CGG	2	6	411135	411140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980406
11094	NC_006461	GGC	2	6	411144	411149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980406
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11097	NC_006461	GAC	2	6	411274	411279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980406
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11102	NC_006461	CTC	2	6	411500	411505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
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11104	NC_006461	CCGC	2	8	411664	411671	0 %	0 %	25 %	75 %	55980407
11105	NC_006461	GGA	2	6	411712	411717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980407
11106	NC_006461	CCT	2	6	411739	411744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
11107	NC_006461	C	7	7	411812	411818	0 %	0 %	0 %	100 %	55980407
11108	NC_006461	CTC	2	6	411854	411859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
11109	NC_006461	CCCG	2	8	411874	411881	0 %	0 %	25 %	75 %	55980407
11110	NC_006461	AGG	2	6	412011	412016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980407
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11112	NC_006461	CTC	2	6	412094	412099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
11113	NC_006461	GGT	2	6	412129	412134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980407
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11115	NC_006461	GGT	2	6	412153	412158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980407
11116	NC_006461	GAG	2	6	412181	412186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980407
11117	NC_006461	ACC	3	9	412218	412226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980407
11118	NC_006461	C	6	6	412225	412230	0 %	0 %	0 %	100 %	55980407
11119	NC_006461	CGGGG	2	10	412258	412267	0 %	0 %	80 %	20 %	55980407
11120	NC_006461	CTC	2	6	412310	412315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
11121	NC_006461	CCT	2	6	412318	412323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
11122	NC_006461	G	6	6	412326	412331	0 %	0 %	100 %	0 %	55980407
11123	NC_006461	CGT	2	6	412348	412353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980407
11124	NC_006461	C	6	6	412356	412361	0 %	0 %	0 %	100 %	55980407
11125	NC_006461	CTC	2	6	412385	412390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980407
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11128	NC_006461	GCC	2	6	412493	412498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980407
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11132	NC_006461	C	6	6	412616	412621	0 %	0 %	0 %	100 %	55980407
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11154	NC_006461	TCC	2	6	413690	413695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980409
11155	NC_006461	TCC	2	6	413723	413728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980409
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11157	NC_006461	GGAGGC	2	12	413784	413795	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980409
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11241	NC_006461	CCGC	2	8	416625	416632	0 %	0 %	25 %	75 %	55980412
11242	NC_006461	TTG	2	6	416633	416638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980412
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11245	NC_006461	CTG	2	6	416713	416718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980412
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11248	NC_006461	GCC	2	6	416801	416806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980412
11249	NC_006461	AGG	2	6	416819	416824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980412
11250	NC_006461	AGGAG	2	10	416871	416880	40 %	0 %	60 %	0 %	55980412
11251	NC_006461	GCC	2	6	416914	416919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980412
11252	NC_006461	CCA	2	6	417006	417011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980412
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11363	NC_006461	TGG	2	6	420989	420994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980417
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11368	NC_006461	CTC	2	6	421134	421139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980418
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11371	NC_006461	GTG	2	6	421215	421220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980418
11372	NC_006461	CTTT	2	8	421295	421302	0 %	75 %	0 %	25 %	55980418
11373	NC_006461	TGG	2	6	421375	421380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980418
11374	NC_006461	CAT	2	6	421388	421393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980418
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11377	NC_006461	GCCTC	2	10	421417	421426	0 %	20 %	20 %	60 %	55980418
11378	NC_006461	CCT	2	6	421427	421432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980418
11379	NC_006461	GGGC	2	8	421462	421469	0 %	0 %	75 %	25 %	55980418
11380	NC_006461	CCT	2	6	421511	421516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980418
11381	NC_006461	CTC	2	6	421542	421547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980418
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11383	NC_006461	GGC	2	6	421646	421651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980418
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11387	NC_006461	GTG	2	6	421800	421805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980418
11388	NC_006461	G	7	7	421811	421817	0 %	0 %	100 %	0 %	55980418
11389	NC_006461	GGT	2	6	421838	421843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980418
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11391	NC_006461	CGG	2	6	421907	421912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980418
11392	NC_006461	TCC	2	6	421942	421947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980418
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11402	NC_006461	CGG	3	9	422322	422330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980419
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11406	NC_006461	GGT	2	6	422422	422427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980419
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11417	NC_006461	G	6	6	422818	422823	0 %	0 %	100 %	0 %	55980419
11418	NC_006461	TGG	2	6	422835	422840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980419
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11420	NC_006461	C	6	6	423078	423083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11421	NC_006461	AGGG	2	8	423099	423106	25 %	0 %	75 %	0 %	55980420
11422	NC_006461	GGCA	2	8	423127	423134	25 %	0 %	50 %	25 %	55980420
11423	NC_006461	CGG	2	6	423138	423143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980420
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11452	NC_006461	TCC	3	9	424397	424405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980421
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11476	NC_006461	CCCT	2	8	424894	424901	0 %	25 %	0 %	75 %	55980421
11477	NC_006461	C	6	6	424910	424915	0 %	0 %	0 %	100 %	55980421
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11482	NC_006461	G	6	6	425128	425133	0 %	0 %	100 %	0 %	55980421
11483	NC_006461	AGG	2	6	425147	425152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980421
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11486	NC_006461	GGA	2	6	425310	425315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980422
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11488	NC_006461	G	6	6	425420	425425	0 %	0 %	100 %	0 %	55980422
11489	NC_006461	GCC	2	6	425441	425446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980422
11490	NC_006461	CCG	2	6	425550	425555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980422
11491	NC_006461	GAG	3	9	425578	425586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980422
11492	NC_006461	GGC	2	6	425651	425656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980422
11493	NC_006461	G	6	6	425662	425667	0 %	0 %	100 %	0 %	55980422
11494	NC_006461	CCT	3	9	425715	425723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980422
11495	NC_006461	AGG	2	6	425795	425800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980422
11496	NC_006461	GGC	2	6	425841	425846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980422
11497	NC_006461	CCA	2	6	425847	425852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980422
11498	NC_006461	GCCA	2	8	425854	425861	25 %	0 %	25 %	50 %	55980422
11499	NC_006461	CCG	2	6	425877	425882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980422
11500	NC_006461	CCG	2	6	425899	425904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980422

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