MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_006461	CGG	2	6	372203	372208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980361
10003	NC_006461	TCC	2	6	372223	372228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980361
10004	NC_006461	TGG	2	6	372262	372267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980361
10005	NC_006461	CTC	2	6	372293	372298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980362
10006	NC_006461	CCT	2	6	372301	372306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980362
10007	NC_006461	TGG	2	6	372323	372328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980362
10008	NC_006461	CTC	2	6	372404	372409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980362
10009	NC_006461	GGC	2	6	372420	372425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980362
10010	NC_006461	TCC	2	6	372441	372446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980362
10011	NC_006461	TCC	2	6	372453	372458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980362
10012	NC_006461	CGC	2	6	372460	372465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980362
10013	NC_006461	GTG	2	6	372476	372481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980362
10014	NC_006461	CGC	2	6	372618	372623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980363
10015	NC_006461	CCA	3	9	372626	372634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980363
10016	NC_006461	GCCC	2	8	372825	372832	0 %	0 %	25 %	75 %	55980363
10017	NC_006461	CGG	2	6	372848	372853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980363
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10021	NC_006461	GAG	2	6	372909	372914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980363
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10029	NC_006461	TCC	2	6	373066	373071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980363
10030	NC_006461	CGA	2	6	373088	373093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980363
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10033	NC_006461	GGA	2	6	373266	373271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980364
10034	NC_006461	GGGGA	2	10	373325	373334	20 %	0 %	80 %	0 %	55980364
10035	NC_006461	CGTAGA	2	12	373341	373352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55980364
10036	NC_006461	CAGGTA	2	12	373369	373380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55980364
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10040	NC_006461	GGC	2	6	373621	373626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980364
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10044	NC_006461	GAGGT	2	10	373733	373742	20 %	20 %	60 %	0 %	55980364
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10052	NC_006461	CGG	2	6	373953	373958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980364
10053	NC_006461	CGT	2	6	373995	374000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980364
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10062	NC_006461	AGGCG	2	10	374312	374321	20 %	0 %	60 %	20 %	55980365
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10095	NC_006461	G	7	7	375763	375769	0 %	0 %	100 %	0 %	55980365
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10231	NC_006461	TCCCCG	2	12	379697	379708	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980369
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10234	NC_006461	GGCCTT	2	12	379810	379821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980369
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10239	NC_006461	C	7	7	379959	379965	0 %	0 %	0 %	100 %	55980369
10240	NC_006461	GTG	2	6	379973	379978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980369
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10242	NC_006461	CGG	2	6	380007	380012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980369
10243	NC_006461	GCACCC	2	12	380052	380063	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980369
10244	NC_006461	GCCGAA	2	12	380101	380112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980369
10245	NC_006461	GAA	2	6	380134	380139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980369
10246	NC_006461	GGCA	2	8	380151	380158	25 %	0 %	50 %	25 %	55980369
10247	NC_006461	CAC	2	6	380191	380196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980369
10248	NC_006461	GAG	2	6	380347	380352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980369
10249	NC_006461	CCT	2	6	380388	380393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980369
10250	NC_006461	GCC	2	6	380470	380475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980370
10251	NC_006461	GCG	2	6	380494	380499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980370
10252	NC_006461	CTT	2	6	380508	380513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980370
10253	NC_006461	CCT	2	6	380570	380575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980370
10254	NC_006461	TCCGCC	2	12	380608	380619	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980370
10255	NC_006461	C	6	6	380639	380644	0 %	0 %	0 %	100 %	55980370
10256	NC_006461	CGC	2	6	380748	380753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980370
10257	NC_006461	CCT	2	6	380833	380838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10258	NC_006461	GGT	2	6	380869	380874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980371
10259	NC_006461	CCT	2	6	380878	380883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980371
10260	NC_006461	CTC	2	6	380924	380929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980371
10261	NC_006461	CCT	2	6	380932	380937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980371
10262	NC_006461	GAG	2	6	380942	380947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980371
10263	NC_006461	CTC	2	6	380990	380995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980371
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10265	NC_006461	C	6	6	381128	381133	0 %	0 %	0 %	100 %	55980371
10266	NC_006461	GAC	2	6	381230	381235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980371
10267	NC_006461	GCGG	2	8	381274	381281	0 %	0 %	75 %	25 %	55980371
10268	NC_006461	GGA	2	6	381331	381336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980372
10269	NC_006461	TCC	2	6	381366	381371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
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10271	NC_006461	CTC	2	6	381380	381385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
10272	NC_006461	GGTG	2	8	381409	381416	0 %	25 %	75 %	0 %	55980372
10273	NC_006461	ATG	2	6	381462	381467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980372
10274	NC_006461	CTT	3	9	381506	381514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980372
10275	NC_006461	GTC	2	6	381635	381640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980372
10276	NC_006461	CTC	2	6	381674	381679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
10277	NC_006461	CTC	2	6	381746	381751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
10278	NC_006461	CAC	2	6	381839	381844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980372
10279	NC_006461	TCC	2	6	381882	381887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
10280	NC_006461	GCG	2	6	381984	381989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980372
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10282	NC_006461	GAG	2	6	382106	382111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980372
10283	NC_006461	CTC	2	6	382124	382129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
10284	NC_006461	AGGG	2	8	382131	382138	25 %	0 %	75 %	0 %	55980372
10285	NC_006461	CAC	3	9	382145	382153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980372
10286	NC_006461	AGG	2	6	382179	382184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980372
10287	NC_006461	TGG	2	6	382210	382215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980372
10288	NC_006461	TCG	2	6	382293	382298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980372
10289	NC_006461	GCC	2	6	382301	382306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980372
10290	NC_006461	GAT	2	6	382358	382363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980372
10291	NC_006461	CCCACG	2	12	382416	382427	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980372
10292	NC_006461	CGGAGA	2	12	382450	382461	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55980372
10293	NC_006461	GAG	2	6	382499	382504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980372
10294	NC_006461	CGGG	2	8	382519	382526	0 %	0 %	75 %	25 %	55980372
10295	NC_006461	GAG	2	6	382532	382537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980372
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10300	NC_006461	GGT	2	6	382652	382657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980372
10301	NC_006461	GGCC	2	8	382717	382724	0 %	0 %	50 %	50 %	55980372
10302	NC_006461	GAA	3	9	382742	382750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980372
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10304	NC_006461	GATGAG	2	12	382763	382774	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	55980372
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10309	NC_006461	GAG	2	6	382961	382966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980372
10310	NC_006461	TCC	2	6	382983	382988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980372
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10312	NC_006461	GCG	2	6	383207	383212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980373
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10315	NC_006461	AGG	2	6	383310	383315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
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10326	NC_006461	TCT	2	6	383544	383549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980373
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10328	NC_006461	C	7	7	383597	383603	0 %	0 %	0 %	100 %	55980373
10329	NC_006461	CCTGG	2	10	383605	383614	0 %	20 %	40 %	40 %	55980373
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10343	NC_006461	GGA	2	6	383899	383904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
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10350	NC_006461	GGC	2	6	384085	384090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980373
10351	NC_006461	GAG	2	6	384119	384124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
10352	NC_006461	GAG	2	6	384146	384151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
10353	NC_006461	AGG	2	6	384219	384224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
10354	NC_006461	GCC	3	9	384230	384238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980373
10355	NC_006461	G	6	6	384255	384260	0 %	0 %	100 %	0 %	55980373
10356	NC_006461	CCT	2	6	384304	384309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980373
10357	NC_006461	GGA	2	6	384316	384321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
10358	NC_006461	GGC	2	6	384343	384348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980373
10359	NC_006461	GAG	2	6	384359	384364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
10360	NC_006461	GTGG	2	8	384376	384383	0 %	25 %	75 %	0 %	55980373
10361	NC_006461	TGG	3	9	384396	384404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980373
10362	NC_006461	GAG	2	6	384437	384442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980373
10363	NC_006461	TGC	2	6	384465	384470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980373
10364	NC_006461	CGG	2	6	384483	384488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980373
10365	NC_006461	CGC	2	6	384499	384504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980373
10366	NC_006461	GC	3	6	384523	384528	0 %	0 %	50 %	50 %	55980373
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10368	NC_006461	GGA	2	6	384651	384656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980374
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10372	NC_006461	GCC	2	6	384749	384754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980374
10373	NC_006461	GGA	2	6	384774	384779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980374
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10420	NC_006461	AGG	3	9	386461	386469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980375
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10422	NC_006461	CTC	2	6	386590	386595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10444	NC_006461	AGG	2	6	387173	387178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980376
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10460	NC_006461	GGT	2	6	387752	387757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980377
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10467	NC_006461	TGA	2	6	387925	387930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980377
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10470	NC_006461	CACC	2	8	388121	388128	25 %	0 %	0 %	75 %	55980377
10471	NC_006461	GGC	3	9	388298	388306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980377
10472	NC_006461	G	7	7	388319	388325	0 %	0 %	100 %	0 %	55980377
10473	NC_006461	GGA	2	6	388334	388339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980377
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10475	NC_006461	CCT	2	6	388470	388475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980378
10476	NC_006461	TGG	2	6	388497	388502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980378
10477	NC_006461	CCT	2	6	388624	388629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980378
10478	NC_006461	GTG	2	6	388655	388660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980378
10479	NC_006461	CGTGGC	2	12	388666	388677	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980378
10480	NC_006461	CAT	2	6	388768	388773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980378
10481	NC_006461	GGGGC	2	10	388810	388819	0 %	0 %	80 %	20 %	55980378
10482	NC_006461	CAT	2	6	388852	388857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980378
10483	NC_006461	G	6	6	388898	388903	0 %	0 %	100 %	0 %	55980378
10484	NC_006461	CCCA	2	8	388913	388920	25 %	0 %	0 %	75 %	55980378
10485	NC_006461	AGC	2	6	388923	388928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980378
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10489	NC_006461	GAC	2	6	388985	388990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980378
10490	NC_006461	ACC	2	6	389013	389018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980378
10491	NC_006461	CCGGGA	2	12	389100	389111	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980378
10492	NC_006461	CGC	2	6	389122	389127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980378
10493	NC_006461	GAG	2	6	389140	389145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980378
10494	NC_006461	TGGA	2	8	389235	389242	25 %	25 %	50 %	0 %	55980378
10495	NC_006461	GGA	2	6	389342	389347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980379
10496	NC_006461	AAG	2	6	389475	389480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980379
10497	NC_006461	GGT	2	6	389594	389599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980379
10498	NC_006461	TGG	2	6	389611	389616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980379
10499	NC_006461	GCC	2	6	389718	389723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980379
10500	NC_006461	CCG	2	6	389795	389800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980379

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