MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_006461	TGGGCC	2	12	353989	354000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980340
9502	NC_006461	TCC	2	6	354001	354006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980340
9503	NC_006461	C	7	7	354038	354044	0 %	0 %	0 %	100 %	55980340
9504	NC_006461	TGG	2	6	354064	354069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980340
9505	NC_006461	CG	3	6	354077	354082	0 %	0 %	50 %	50 %	55980340
9506	NC_006461	TCT	2	6	354092	354097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980340
9507	NC_006461	TGGAGG	2	12	354121	354132	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980340
9508	NC_006461	AGG	2	6	354157	354162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980340
9509	NC_006461	C	6	6	354179	354184	0 %	0 %	0 %	100 %	55980340
9510	NC_006461	CGGG	2	8	354206	354213	0 %	0 %	75 %	25 %	55980340
9511	NC_006461	GCGGAG	2	12	354279	354290	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980340
9512	NC_006461	GAG	2	6	354345	354350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980340
9513	NC_006461	GCG	2	6	354351	354356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980340
9514	NC_006461	C	6	6	354377	354382	0 %	0 %	0 %	100 %	55980340
9515	NC_006461	CCT	2	6	354419	354424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980340
9516	NC_006461	GTC	2	6	354453	354458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980340
9517	NC_006461	GGA	2	6	354485	354490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980340
9518	NC_006461	CTT	2	6	354497	354502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980340
9519	NC_006461	CGC	2	6	354509	354514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980340
9520	NC_006461	GGA	2	6	354533	354538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980340
9521	NC_006461	GCCGGG	2	12	354581	354592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980340
9522	NC_006461	TCC	2	6	354601	354606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980340
9523	NC_006461	C	6	6	354676	354681	0 %	0 %	0 %	100 %	55980340
9524	NC_006461	C	6	6	354711	354716	0 %	0 %	0 %	100 %	55980340
9525	NC_006461	CCT	3	9	354740	354748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980340
9526	NC_006461	GGT	2	6	354770	354775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980340
9527	NC_006461	GAG	2	6	354792	354797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980340
9528	NC_006461	GAG	3	9	354905	354913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980341
9529	NC_006461	TCC	2	6	354924	354929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980341
9530	NC_006461	CCT	2	6	354946	354951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980341
9531	NC_006461	GGA	2	6	354954	354959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980341
9532	NC_006461	CCG	2	6	354961	354966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980341
9533	NC_006461	GTG	3	9	355016	355024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980341
9534	NC_006461	AGC	2	6	355032	355037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980341
9535	NC_006461	CCGC	2	8	355044	355051	0 %	0 %	25 %	75 %	55980341
9536	NC_006461	GAG	2	6	355090	355095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980341
9537	NC_006461	TCC	2	6	355116	355121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980341
9538	NC_006461	GGACG	2	10	355124	355133	20 %	0 %	60 %	20 %	55980341
9539	NC_006461	G	6	6	355274	355279	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9540	NC_006461	GTG	2	6	355342	355347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980342
9541	NC_006461	G	6	6	355353	355358	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9542	NC_006461	CTC	2	6	355366	355371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
9543	NC_006461	GGT	2	6	355380	355385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980342
9544	NC_006461	GC	3	6	355429	355434	0 %	0 %	50 %	50 %	55980342
9545	NC_006461	GGA	2	6	355455	355460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
9546	NC_006461	CTC	2	6	355492	355497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
9547	NC_006461	G	7	7	355515	355521	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9548	NC_006461	CCT	2	6	355530	355535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
9549	NC_006461	CCT	2	6	355539	355544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
9550	NC_006461	CTC	2	6	355558	355563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
9551	NC_006461	CTT	2	6	355569	355574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980342
9552	NC_006461	CCG	2	6	355587	355592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980342
9553	NC_006461	AGG	2	6	355604	355609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
9554	NC_006461	G	6	6	355619	355624	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9555	NC_006461	AGG	2	6	355625	355630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
9556	NC_006461	G	6	6	355675	355680	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9557	NC_006461	TCA	2	6	355703	355708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980342
9558	NC_006461	GCC	3	9	355808	355816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980342
9559	NC_006461	GGA	2	6	355841	355846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
9560	NC_006461	GTGGCC	2	12	355855	355866	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980342
9561	NC_006461	G	8	8	355869	355876	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9562	NC_006461	CGC	2	6	355893	355898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980342
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9564	NC_006461	TCC	2	6	355952	355957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
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9566	NC_006461	G	6	6	355982	355987	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
9567	NC_006461	CCG	2	6	356009	356014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980342
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9570	NC_006461	AGG	2	6	356066	356071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
9571	NC_006461	CCG	2	6	356135	356140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980342
9572	NC_006461	CACC	2	8	356142	356149	25 %	0 %	0 %	75 %	55980342
9573	NC_006461	TCG	2	6	356177	356182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980342
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9575	NC_006461	GGA	2	6	356196	356201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
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9582	NC_006461	CGGG	2	8	356481	356488	0 %	0 %	75 %	25 %	55980342
9583	NC_006461	CTC	3	9	356494	356502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980342
9584	NC_006461	GCCTTC	2	12	356539	356550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55980342
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9588	NC_006461	G	6	6	356684	356689	0 %	0 %	100 %	0 %	55980342
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9592	NC_006461	CGA	2	6	356787	356792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980342
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9596	NC_006461	GAG	2	6	356923	356928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980342
9597	NC_006461	TGG	2	6	356984	356989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980342
9598	NC_006461	GGTG	2	8	357027	357034	0 %	25 %	75 %	0 %	55980342
9599	NC_006461	GGAC	2	8	357114	357121	25 %	0 %	50 %	25 %	55980343
9600	NC_006461	CGG	2	6	357129	357134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980343
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9604	NC_006461	GCGGA	2	10	357305	357314	20 %	0 %	60 %	20 %	55980343
9605	NC_006461	CCG	2	6	357321	357326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980343
9606	NC_006461	GGT	2	6	357331	357336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980343
9607	NC_006461	TCC	2	6	357368	357373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980343
9608	NC_006461	CCT	2	6	357385	357390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980343
9609	NC_006461	CCT	2	6	357421	357426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980343
9610	NC_006461	TGGCGG	2	12	357453	357464	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980343
9611	NC_006461	AGG	2	6	357465	357470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980343
9612	NC_006461	GGA	2	6	357601	357606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980343
9613	NC_006461	CCT	2	6	357660	357665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980343
9614	NC_006461	GAA	2	6	357817	357822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_006461	GCC	2	6	357833	357838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9616	NC_006461	GAG	2	6	357913	357918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980344
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9619	NC_006461	ACC	2	6	358007	358012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980344
9620	NC_006461	C	6	6	358025	358030	0 %	0 %	0 %	100 %	55980344
9621	NC_006461	AGA	2	6	358053	358058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980344
9622	NC_006461	G	6	6	358080	358085	0 %	0 %	100 %	0 %	55980344
9623	NC_006461	CTTC	2	8	358098	358105	0 %	50 %	0 %	50 %	55980344
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9625	NC_006461	GCG	2	6	358121	358126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980344
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