MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8504	NC_006461	GCCCC	2	10	315768	315777	0 %	0 %	20 %	80 %	55980298
8505	NC_006461	C	6	6	315806	315811	0 %	0 %	0 %	100 %	55980298
8506	NC_006461	GTG	2	6	315833	315838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980298
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8625	NC_006461	CCT	2	6	320316	320321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980307
8626	NC_006461	GCG	2	6	320428	320433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980307
8627	NC_006461	C	6	6	320450	320455	0 %	0 %	0 %	100 %	55980307
8628	NC_006461	GCC	2	6	320467	320472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980307
8629	NC_006461	GGA	2	6	320484	320489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980307
8630	NC_006461	GTG	2	6	320492	320497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980307
8631	NC_006461	G	6	6	320609	320614	0 %	0 %	100 %	0 %	55980307
8632	NC_006461	GGC	2	6	320632	320637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980307
8633	NC_006461	GGC	2	6	320698	320703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980307
8634	NC_006461	GGC	2	6	320720	320725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980307
8635	NC_006461	AGG	2	6	320729	320734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980307
8636	NC_006461	CCG	2	6	320740	320745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980307
8637	NC_006461	GGC	2	6	320815	320820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980307
8638	NC_006461	GC	3	6	320830	320835	0 %	0 %	50 %	50 %	55980307
8639	NC_006461	CCA	2	6	320853	320858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980307
8640	NC_006461	ACC	2	6	320867	320872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980307
8641	NC_006461	AGGGC	2	10	320889	320898	20 %	0 %	60 %	20 %	55980307
8642	NC_006461	GCC	2	6	320915	320920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980307
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8645	NC_006461	CAC	2	6	321001	321006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980307
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8647	NC_006461	ACC	2	6	321100	321105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980308
8648	NC_006461	CCCAG	2	10	321116	321125	20 %	0 %	20 %	60 %	55980308
8649	NC_006461	C	7	7	321141	321147	0 %	0 %	0 %	100 %	55980308
8650	NC_006461	GGA	2	6	321164	321169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
8651	NC_006461	AGCC	2	8	321172	321179	25 %	0 %	25 %	50 %	55980308
8652	NC_006461	GAG	3	9	321183	321191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
8653	NC_006461	GGGC	2	8	321197	321204	0 %	0 %	75 %	25 %	55980308
8654	NC_006461	GAA	2	6	321222	321227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980308
8655	NC_006461	GGC	2	6	321231	321236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980308
8656	NC_006461	GAG	2	6	321330	321335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
8657	NC_006461	CCCA	2	8	321412	321419	25 %	0 %	0 %	75 %	55980308
8658	NC_006461	CCT	2	6	321437	321442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980308
8659	NC_006461	ACC	2	6	321535	321540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980308
8660	NC_006461	CTG	2	6	321543	321548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980308
8661	NC_006461	AGGGCG	2	12	321562	321573	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980308
8662	NC_006461	AAGCCC	2	12	321582	321593	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55980308
8663	NC_006461	AGG	2	6	321610	321615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
8664	NC_006461	C	7	7	321627	321633	0 %	0 %	0 %	100 %	55980308
8665	NC_006461	GCC	2	6	321650	321655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980308
8666	NC_006461	CCGGG	2	10	321656	321665	0 %	0 %	60 %	40 %	55980308
8667	NC_006461	TCC	2	6	321673	321678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980308
8668	NC_006461	ACC	2	6	321679	321684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980308
8669	NC_006461	C	7	7	321831	321837	0 %	0 %	0 %	100 %	55980308
8670	NC_006461	GCC	2	6	321848	321853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980308
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8673	NC_006461	AGG	2	6	321934	321939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
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8675	NC_006461	GCC	2	6	321956	321961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980308
8676	NC_006461	C	6	6	321960	321965	0 %	0 %	0 %	100 %	55980308
8677	NC_006461	AGG	2	6	321970	321975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
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8681	NC_006461	GCC	2	6	322058	322063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980308
8682	NC_006461	GGGCCA	2	12	322103	322114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980308
8683	NC_006461	CCT	2	6	322118	322123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980308
8684	NC_006461	CCTCC	2	10	322164	322173	0 %	20 %	0 %	80 %	55980308
8685	NC_006461	GAG	2	6	322221	322226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980308
8686	NC_006461	GGCCCG	2	12	322227	322238	0 %	0 %	50 %	50 %	55980308
8687	NC_006461	GGCCTG	2	12	322281	322292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980308
8688	NC_006461	G	6	6	322352	322357	0 %	0 %	100 %	0 %	55980308
8689	NC_006461	GCC	2	6	322390	322395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980308
8690	NC_006461	GGCG	2	8	322418	322425	0 %	0 %	75 %	25 %	55980308
8691	NC_006461	C	7	7	322442	322448	0 %	0 %	0 %	100 %	55980308
8692	NC_006461	CGC	2	6	322490	322495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980308
8693	NC_006461	GGT	2	6	322521	322526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8694	NC_006461	TGGCCC	2	12	322585	322596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980309
8695	NC_006461	C	6	6	322669	322674	0 %	0 %	0 %	100 %	55980309
8696	NC_006461	GGC	2	6	322697	322702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980309
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8698	NC_006461	GCC	2	6	322770	322775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980309
8699	NC_006461	CGGGCC	2	12	322824	322835	0 %	0 %	50 %	50 %	55980309
8700	NC_006461	C	6	6	322891	322896	0 %	0 %	0 %	100 %	55980309
8701	NC_006461	GGA	2	6	322913	322918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980309
8702	NC_006461	TGG	2	6	322954	322959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980309
8703	NC_006461	GCTG	2	8	322996	323003	0 %	25 %	50 %	25 %	55980309
8704	NC_006461	GCC	2	6	323115	323120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980309
8705	NC_006461	GAAG	2	8	323125	323132	50 %	0 %	50 %	0 %	55980309
8706	NC_006461	GAG	2	6	323133	323138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980309
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8710	NC_006461	G	6	6	323340	323345	0 %	0 %	100 %	0 %	55980310
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8712	NC_006461	CGA	2	6	323378	323383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980310
8713	NC_006461	C	6	6	323385	323390	0 %	0 %	0 %	100 %	55980310
8714	NC_006461	AAG	2	6	323397	323402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980310
8715	NC_006461	G	6	6	323454	323459	0 %	0 %	100 %	0 %	55980310
8716	NC_006461	C	6	6	323470	323475	0 %	0 %	0 %	100 %	55980310
8717	NC_006461	GGACC	2	10	323477	323486	20 %	0 %	40 %	40 %	55980310
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8722	NC_006461	C	6	6	323848	323853	0 %	0 %	0 %	100 %	55980311
8723	NC_006461	C	6	6	323858	323863	0 %	0 %	0 %	100 %	55980311
8724	NC_006461	CAC	2	6	323895	323900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980311
8725	NC_006461	GGA	2	6	323940	323945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980311
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8727	NC_006461	GGCCCT	2	12	324000	324011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980311
8728	NC_006461	CCT	3	9	324039	324047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980311
8729	NC_006461	CCT	4	12	324069	324080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980311
8730	NC_006461	GGC	2	6	324111	324116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980311
8731	NC_006461	CCT	2	6	324125	324130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980311
8732	NC_006461	GGA	2	6	324156	324161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980311
8733	NC_006461	TCC	3	9	324215	324223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980311
8734	NC_006461	CAA	2	6	324234	324239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980311
8735	NC_006461	GAG	2	6	324274	324279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980311
8736	NC_006461	C	6	6	324365	324370	0 %	0 %	0 %	100 %	55980311
8737	NC_006461	GTG	2	6	324397	324402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980311
8738	NC_006461	GAG	2	6	324469	324474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980311
8739	NC_006461	CGCC	2	8	324480	324487	0 %	0 %	25 %	75 %	55980311
8740	NC_006461	AGG	2	6	324569	324574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980311
8741	NC_006461	CCT	2	6	324648	324653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980311
8742	NC_006461	C	7	7	324654	324660	0 %	0 %	0 %	100 %	55980311
8743	NC_006461	CCA	2	6	324665	324670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980311
8744	NC_006461	GGC	2	6	324683	324688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980311
8745	NC_006461	GAC	2	6	324703	324708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980311
8746	NC_006461	TGG	2	6	324728	324733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980311
8747	NC_006461	TGGCCC	2	12	324743	324754	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980311
8748	NC_006461	GGA	2	6	324775	324780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980311
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8750	NC_006461	GGC	2	6	324831	324836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980311
8751	NC_006461	CTC	2	6	324886	324891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980312
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