MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_006461	G	6	6	296760	296765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_006461	TGGG	2	8	296796	296803	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_006461	ACCC	2	8	296830	296837	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8004	NC_006461	TCC	2	6	296934	296939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8005	NC_006461	CG	3	6	297044	297049	0 %	0 %	50 %	50 %	55980279
8006	NC_006461	CACC	2	8	297076	297083	25 %	0 %	0 %	75 %	55980279
8007	NC_006461	GGCCT	2	10	297095	297104	0 %	20 %	40 %	40 %	55980279
8008	NC_006461	CTT	2	6	297190	297195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980279
8009	NC_006461	TGG	2	6	297213	297218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980279
8010	NC_006461	CGG	2	6	297246	297251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980279
8011	NC_006461	TCC	2	6	297309	297314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8012	NC_006461	CGC	2	6	297316	297321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980279
8013	NC_006461	TGG	2	6	297338	297343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980279
8014	NC_006461	CTC	2	6	297419	297424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8015	NC_006461	CCT	2	6	297463	297468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8016	NC_006461	TCC	2	6	297546	297551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8017	NC_006461	TGG	2	6	297603	297608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980279
8018	NC_006461	CTC	2	6	297677	297682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8019	NC_006461	TCA	2	6	297690	297695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980279
8020	NC_006461	TCC	2	6	297729	297734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8021	NC_006461	CCT	3	9	297736	297744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8022	NC_006461	CTC	2	6	297761	297766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8023	NC_006461	GCG	2	6	297828	297833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980279
8024	NC_006461	CGGG	2	8	297852	297859	0 %	0 %	75 %	25 %	55980279
8025	NC_006461	CGC	2	6	297943	297948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980279
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8030	NC_006461	TTCGCC	2	12	298124	298135	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55980279
8031	NC_006461	TGG	2	6	298163	298168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980279
8032	NC_006461	G	6	6	298167	298172	0 %	0 %	100 %	0 %	55980279
8033	NC_006461	CCT	2	6	298177	298182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8034	NC_006461	CGC	2	6	298183	298188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980279
8035	NC_006461	GCG	2	6	298246	298251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980279
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8038	NC_006461	TGGGC	2	10	298305	298314	0 %	20 %	60 %	20 %	55980279
8039	NC_006461	TCT	3	9	298365	298373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980279
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8041	NC_006461	GAC	2	6	298415	298420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980279
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8043	NC_006461	CTC	3	9	298529	298537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8044	NC_006461	CCT	2	6	298549	298554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8045	NC_006461	CCT	3	9	298570	298578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980279
8046	NC_006461	CCTTCT	2	12	298585	298596	0 %	50 %	0 %	50 %	55980279
8047	NC_006461	CCG	2	6	298615	298620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980279
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8054	NC_006461	TGG	3	9	298880	298888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980280
8055	NC_006461	AGG	2	6	298940	298945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980280
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8057	NC_006461	TGG	2	6	299107	299112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980280
8058	NC_006461	TCC	2	6	299159	299164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980280
8059	NC_006461	CCG	2	6	299165	299170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980280
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8061	NC_006461	CGT	2	6	299361	299366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980280
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8063	NC_006461	AGG	2	6	299378	299383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980280
8064	NC_006461	GGC	2	6	299403	299408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980280
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8066	NC_006461	CAG	2	6	299458	299463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980280
8067	NC_006461	GCC	2	6	299470	299475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980280
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8101	NC_006461	C	6	6	300863	300868	0 %	0 %	0 %	100 %	55980281
8102	NC_006461	GTG	2	6	300898	300903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980281
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8109	NC_006461	CCA	2	6	301151	301156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980281
8110	NC_006461	CCTGGG	2	12	301170	301181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980281
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8113	NC_006461	GAA	3	9	301356	301364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980281
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8119	NC_006461	CTACCT	2	12	301668	301679	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	55980281
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8121	NC_006461	GCCC	2	8	301716	301723	0 %	0 %	25 %	75 %	55980281
8122	NC_006461	CTC	2	6	301735	301740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980281
8123	NC_006461	TCC	2	6	301748	301753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980281
8124	NC_006461	CTC	2	6	301761	301766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980281
8125	NC_006461	CAC	2	6	301786	301791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980281
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8127	NC_006461	CAT	2	6	301842	301847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980281
8128	NC_006461	CTT	2	6	301860	301865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980281
8129	NC_006461	ACC	2	6	301898	301903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980281
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8132	NC_006461	GCC	2	6	302059	302064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980281
8133	NC_006461	TGG	2	6	302081	302086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980281
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8135	NC_006461	TCT	2	6	302114	302119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980281
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8137	NC_006461	C	6	6	302148	302153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8138	NC_006461	G	6	6	302162	302167	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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8152	NC_006461	CGA	2	6	302540	302545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980282
8153	NC_006461	TCT	2	6	302554	302559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980282
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8157	NC_006461	CCT	2	6	302611	302616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980282
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8162	NC_006461	GCG	2	6	302828	302833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980282
8163	NC_006461	CCA	2	6	303011	303016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8164	NC_006461	CAC	2	6	303093	303098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8165	NC_006461	GGC	2	6	303100	303105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8166	NC_006461	GCC	2	6	303165	303170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8167	NC_006461	GGCGG	2	10	303176	303185	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8168	NC_006461	GCCC	2	8	303195	303202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8169	NC_006461	TTTC	2	8	303203	303210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8170	NC_006461	TTC	2	6	303243	303248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8200	NC_006461	GGCG	2	8	304381	304388	0 %	0 %	75 %	25 %	55980283
8201	NC_006461	GAT	2	6	304403	304408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980283
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8204	NC_006461	GAG	2	6	304454	304459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980283
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8208	NC_006461	CCAC	2	8	304541	304548	25 %	0 %	0 %	75 %	55980284
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8230	NC_006461	GAGCGG	2	12	305349	305360	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980284
8231	NC_006461	G	6	6	305377	305382	0 %	0 %	100 %	0 %	55980284
8232	NC_006461	GGA	2	6	305405	305410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980284
8233	NC_006461	G	6	6	305509	305514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8234	NC_006461	CGC	2	6	305552	305557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980285
8235	NC_006461	CGC	2	6	305575	305580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980285
8236	NC_006461	GGGCG	2	10	305610	305619	0 %	0 %	80 %	20 %	55980285
8237	NC_006461	C	6	6	305631	305636	0 %	0 %	0 %	100 %	55980285
8238	NC_006461	G	8	8	305695	305702	0 %	0 %	100 %	0 %	55980285
8239	NC_006461	CCG	2	6	305722	305727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980285
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8241	NC_006461	TGG	2	6	305793	305798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980285
8242	NC_006461	C	6	6	305840	305845	0 %	0 %	0 %	100 %	55980285
8243	NC_006461	TTCC	2	8	305849	305856	0 %	50 %	0 %	50 %	55980285
8244	NC_006461	CCT	2	6	305857	305862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980285
8245	NC_006461	GCC	2	6	305912	305917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980285
8246	NC_006461	GGC	2	6	305978	305983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980286
8247	NC_006461	CCT	2	6	306037	306042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980286
8248	NC_006461	GGC	2	6	306047	306052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980286
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8376	NC_006461	CGG	2	6	310528	310533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980291
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8380	NC_006461	CAC	2	6	310667	310672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980291
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8406	NC_006461	GGC	2	6	311505	311510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980292
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8459	NC_006461	GCG	2	6	313925	313930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980295
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8462	NC_006461	CTAAGG	2	12	314082	314093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55980295
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8480	NC_006461	CTC	2	6	314904	314909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980296
8481	NC_006461	GGCGG	2	10	314951	314960	0 %	0 %	80 %	20 %	55980296
8482	NC_006461	CTC	2	6	314972	314977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980296
8483	NC_006461	CCT	2	6	314995	315000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980296
8484	NC_006461	G	6	6	315018	315023	0 %	0 %	100 %	0 %	55980296
8485	NC_006461	CGC	2	6	315051	315056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980296
8486	NC_006461	GAG	2	6	315062	315067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980296
8487	NC_006461	C	6	6	315097	315102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8488	NC_006461	TCC	2	6	315103	315108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8489	NC_006461	GGC	2	6	315119	315124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8490	NC_006461	GTG	2	6	315211	315216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980297
8491	NC_006461	C	6	6	315269	315274	0 %	0 %	0 %	100 %	55980297
8492	NC_006461	CTC	2	6	315295	315300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980297
8493	NC_006461	GGT	2	6	315330	315335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980297
8494	NC_006461	GAC	2	6	315361	315366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980297
8495	NC_006461	GGA	2	6	315426	315431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980297
8496	NC_006461	AGCCCG	2	12	315437	315448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980297
8497	NC_006461	ACG	2	6	315476	315481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980297
8498	NC_006461	GTG	2	6	315535	315540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980297
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