MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_006461	CCGC	2	8	279930	279937	0 %	0 %	25 %	75 %	55980257
7502	NC_006461	CGG	2	6	279998	280003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980257
7503	NC_006461	CGG	2	6	280043	280048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980257
7504	NC_006461	CCCTC	2	10	280076	280085	0 %	20 %	0 %	80 %	55980257
7505	NC_006461	AGG	2	6	280090	280095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980257
7506	NC_006461	TGA	2	6	280196	280201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980257
7507	NC_006461	CCA	2	6	280205	280210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980257
7508	NC_006461	CCT	2	6	280319	280324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7509	NC_006461	TCC	2	6	280337	280342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7510	NC_006461	AGC	2	6	280343	280348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980258
7511	NC_006461	TCC	2	6	280349	280354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7512	NC_006461	GGA	2	6	280375	280380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7513	NC_006461	CGG	2	6	280386	280391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
7514	NC_006461	CGGGC	2	10	280404	280413	0 %	0 %	60 %	40 %	55980258
7515	NC_006461	CAC	2	6	280414	280419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
7516	NC_006461	CGC	2	6	280443	280448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980258
7517	NC_006461	GCGG	2	8	280453	280460	0 %	0 %	75 %	25 %	55980258
7518	NC_006461	ACC	2	6	280467	280472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
7519	NC_006461	CTC	2	6	280492	280497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7520	NC_006461	CTT	2	6	280519	280524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980258
7521	NC_006461	CCT	2	6	280542	280547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7522	NC_006461	TCC	2	6	280601	280606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7523	NC_006461	AGG	2	6	280631	280636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7524	NC_006461	GTA	2	6	280639	280644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980258
7525	NC_006461	AGG	2	6	280661	280666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7526	NC_006461	CTC	2	6	280726	280731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7527	NC_006461	ACC	2	6	280742	280747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
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7529	NC_006461	GGC	2	6	280815	280820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
7530	NC_006461	GGA	2	6	280821	280826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7531	NC_006461	GAA	2	6	280831	280836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980258
7532	NC_006461	GTG	2	6	280847	280852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980258
7533	NC_006461	GGC	2	6	280879	280884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
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7535	NC_006461	GAG	2	6	280913	280918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7536	NC_006461	AGG	3	9	280952	280960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7537	NC_006461	G	6	6	281130	281135	0 %	0 %	100 %	0 %	55980258
7538	NC_006461	GCG	2	6	281219	281224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
7539	NC_006461	CGG	2	6	281316	281321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
7540	NC_006461	CGG	2	6	281360	281365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
7541	NC_006461	AGG	2	6	281432	281437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7542	NC_006461	TTC	2	6	281438	281443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980258
7543	NC_006461	CCT	2	6	281448	281453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7544	NC_006461	GGT	2	6	281484	281489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980258
7545	NC_006461	GCCC	2	8	281493	281500	0 %	0 %	25 %	75 %	55980258
7546	NC_006461	CCT	2	6	281598	281603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7547	NC_006461	CTC	3	9	281617	281625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
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7549	NC_006461	CGTC	2	8	281727	281734	0 %	25 %	25 %	50 %	55980258
7550	NC_006461	CGG	3	9	281747	281755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980258
7551	NC_006461	AGGGCG	2	12	281807	281818	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980258
7552	NC_006461	CCA	2	6	281874	281879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
7553	NC_006461	GAGGG	2	10	281921	281930	20 %	0 %	80 %	0 %	55980258
7554	NC_006461	GTT	2	6	281947	281952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980258
7555	NC_006461	CCA	2	6	281955	281960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
7556	NC_006461	C	6	6	281972	281977	0 %	0 %	0 %	100 %	55980258
7557	NC_006461	GGT	2	6	282222	282227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980258
7558	NC_006461	CTC	2	6	282262	282267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7559	NC_006461	CCA	2	6	282300	282305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
7560	NC_006461	CAC	2	6	282349	282354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980258
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7562	NC_006461	CCT	2	6	282390	282395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
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7565	NC_006461	GGA	2	6	282489	282494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980258
7566	NC_006461	GGGC	2	8	282525	282532	0 %	0 %	75 %	25 %	55980258
7567	NC_006461	AGGT	2	8	282617	282624	25 %	25 %	50 %	0 %	55980258
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7570	NC_006461	G	7	7	282672	282678	0 %	0 %	100 %	0 %	55980258
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7574	NC_006461	TCG	2	6	282877	282882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980258
7575	NC_006461	TCC	2	6	282887	282892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7576	NC_006461	TCC	2	6	282896	282901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7577	NC_006461	GCC	2	6	282924	282929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980258
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7579	NC_006461	TCC	2	6	282953	282958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980258
7580	NC_006461	G	6	6	283024	283029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_006461	CCTA	2	8	283036	283043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7582	NC_006461	GTG	2	6	283063	283068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_006461	CGC	2	6	283191	283196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980259
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7585	NC_006461	GAG	2	6	283210	283215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980259
7586	NC_006461	GC	3	6	283227	283232	0 %	0 %	50 %	50 %	55980259
7587	NC_006461	CCT	3	9	283233	283241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980259
7588	NC_006461	CGGGC	2	10	283250	283259	0 %	0 %	60 %	40 %	55980259
7589	NC_006461	CCG	2	6	283265	283270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980259
7590	NC_006461	GTG	2	6	283339	283344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980259
7591	NC_006461	GTG	2	6	283375	283380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980259
7592	NC_006461	GGC	2	6	283395	283400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980259
7593	NC_006461	CGGGG	2	10	283401	283410	0 %	0 %	80 %	20 %	55980259
7594	NC_006461	G	6	6	283427	283432	0 %	0 %	100 %	0 %	55980259
7595	NC_006461	CGC	2	6	283443	283448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980259
7596	NC_006461	TCC	3	9	283514	283522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980259
7597	NC_006461	CTC	4	12	283555	283566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980259
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7601	NC_006461	GTG	2	6	283618	283623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980259
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7604	NC_006461	CTC	2	6	283711	283716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980259
7605	NC_006461	TCC	2	6	283766	283771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980259
7606	NC_006461	GGCC	2	8	283779	283786	0 %	0 %	50 %	50 %	55980259
7607	NC_006461	GAG	2	6	283801	283806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980259
7608	NC_006461	GCC	2	6	283833	283838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980259
7609	NC_006461	GAT	2	6	283853	283858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980259
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7611	NC_006461	GGCG	2	8	283892	283899	0 %	0 %	75 %	25 %	55980260
7612	NC_006461	G	7	7	283917	283923	0 %	0 %	100 %	0 %	55980260
7613	NC_006461	TTC	2	6	283929	283934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980260
7614	NC_006461	TCC	2	6	283954	283959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7615	NC_006461	GGA	2	6	283967	283972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980260
7616	NC_006461	AGG	2	6	283978	283983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980260
7617	NC_006461	CACC	2	8	283994	284001	25 %	0 %	0 %	75 %	55980260
7618	NC_006461	TCC	2	6	284002	284007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7619	NC_006461	AGG	3	9	284011	284019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980260
7620	NC_006461	CGA	2	6	284042	284047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980260
7621	NC_006461	CTC	3	9	284070	284078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7622	NC_006461	GCG	2	6	284086	284091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980260
7623	NC_006461	GCCCTC	2	12	284106	284117	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980260
7624	NC_006461	CTC	2	6	284139	284144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7625	NC_006461	CCT	2	6	284153	284158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7626	NC_006461	CTC	2	6	284175	284180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7627	NC_006461	C	7	7	284247	284253	0 %	0 %	0 %	100 %	55980260
7628	NC_006461	CCT	2	6	284255	284260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
7629	NC_006461	GGA	2	6	284291	284296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980260
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7633	NC_006461	CCT	2	6	284360	284365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980260
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7658	NC_006461	C	6	6	285188	285193	0 %	0 %	0 %	100 %	55980262
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7683	NC_006461	C	6	6	285919	285924	0 %	0 %	0 %	100 %	55980263
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7701	NC_006461	GGCT	2	8	286610	286617	0 %	25 %	50 %	25 %	55980265
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7708	NC_006461	GGA	2	6	286747	286752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980265
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7742	NC_006461	CGGG	2	8	287723	287730	0 %	0 %	75 %	25 %	55980266
7743	NC_006461	CGC	2	6	287768	287773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980266
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7747	NC_006461	ACCC	2	8	287880	287887	25 %	0 %	0 %	75 %	55980266
7748	NC_006461	GTG	2	6	287913	287918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980266
7749	NC_006461	CTC	2	6	287967	287972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980266
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