MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_006461	G	7	7	261023	261029	0 %	0 %	100 %	0 %	55980242
7002	NC_006461	GCC	2	6	261035	261040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980242
7003	NC_006461	AGG	2	6	261131	261136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980242
7004	NC_006461	TGG	2	6	261188	261193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_006461	GAAGG	2	10	261194	261203	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_006461	AGGTG	2	10	261246	261255	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_006461	GAA	2	6	261256	261261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_006461	AGG	2	6	261275	261280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_006461	GGC	2	6	261312	261317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_006461	GCAG	2	8	261363	261370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7011	NC_006461	CCT	2	6	261381	261386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980243
7012	NC_006461	GAAG	2	8	261405	261412	50 %	0 %	50 %	0 %	55980243
7013	NC_006461	GA	4	8	261430	261437	50 %	0 %	50 %	0 %	55980243
7014	NC_006461	TCC	2	6	261448	261453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980243
7015	NC_006461	GCAAG	2	10	261462	261471	40 %	0 %	40 %	20 %	55980243
7016	NC_006461	G	8	8	261485	261492	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_006461	AGG	3	9	261536	261544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980244
7018	NC_006461	GCG	2	6	261545	261550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980244
7019	NC_006461	CCGCAC	2	12	261595	261606	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980244
7020	NC_006461	CGC	2	6	261614	261619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980244
7021	NC_006461	TCC	2	6	261644	261649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980244
7022	NC_006461	GAG	2	6	261655	261660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980244
7023	NC_006461	GCC	2	6	261719	261724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980244
7024	NC_006461	TCC	2	6	261743	261748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980244
7025	NC_006461	GCC	2	6	261758	261763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980244
7026	NC_006461	CCA	2	6	261855	261860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980244
7027	NC_006461	CCGCCC	2	12	261870	261881	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	55980244
7028	NC_006461	CCG	2	6	261885	261890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980244
7029	NC_006461	GGA	2	6	261894	261899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980244
7030	NC_006461	G	6	6	261948	261953	0 %	0 %	100 %	0 %	55980244
7031	NC_006461	CTT	2	6	261980	261985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980244
7032	NC_006461	GGGC	2	8	262103	262110	0 %	0 %	75 %	25 %	55980244
7033	NC_006461	GAG	3	9	262120	262128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980244
7034	NC_006461	CGC	2	6	262172	262177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980244
7035	NC_006461	CCGCTC	2	12	262201	262212	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980244
7036	NC_006461	GCG	2	6	262229	262234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980244
7037	NC_006461	GCC	2	6	262293	262298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980245
7038	NC_006461	CTC	2	6	262346	262351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7039	NC_006461	GGA	2	6	262369	262374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980245
7040	NC_006461	GGA	2	6	262423	262428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980245
7041	NC_006461	CTC	2	6	262430	262435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7042	NC_006461	G	6	6	262453	262458	0 %	0 %	100 %	0 %	55980245
7043	NC_006461	GCT	2	6	262465	262470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980245
7044	NC_006461	G	6	6	262489	262494	0 %	0 %	100 %	0 %	55980245
7045	NC_006461	CTC	3	9	262565	262573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7046	NC_006461	GC	3	6	262593	262598	0 %	0 %	50 %	50 %	55980245
7047	NC_006461	CTC	2	6	262613	262618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7048	NC_006461	GC	3	6	262629	262634	0 %	0 %	50 %	50 %	55980245
7049	NC_006461	CCT	2	6	262649	262654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7050	NC_006461	CCT	2	6	262657	262662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7051	NC_006461	GAA	2	6	262688	262693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980245
7052	NC_006461	CTC	2	6	262700	262705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7053	NC_006461	GGGCGA	2	12	262732	262743	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980245
7054	NC_006461	GCCC	2	8	262794	262801	0 %	0 %	25 %	75 %	55980245
7055	NC_006461	AGGC	2	8	262818	262825	25 %	0 %	50 %	25 %	55980245
7056	NC_006461	AGGT	2	8	262827	262834	25 %	25 %	50 %	0 %	55980245
7057	NC_006461	TCCC	2	8	262837	262844	0 %	25 %	0 %	75 %	55980245
7058	NC_006461	CCT	3	9	262870	262878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7059	NC_006461	AGG	2	6	262905	262910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980245
7060	NC_006461	TCGC	2	8	262926	262933	0 %	25 %	25 %	50 %	55980245
7061	NC_006461	CGG	2	6	262953	262958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980245
7062	NC_006461	C	6	6	263009	263014	0 %	0 %	0 %	100 %	55980245
7063	NC_006461	CCCG	2	8	263074	263081	0 %	0 %	25 %	75 %	55980245
7064	NC_006461	AGG	2	6	263109	263114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980245
7065	NC_006461	CCT	2	6	263128	263133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7066	NC_006461	CAC	2	6	263150	263155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980245
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7069	NC_006461	TCC	3	9	263310	263318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
7070	NC_006461	GGA	2	6	263326	263331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980245
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7072	NC_006461	CGCCA	2	10	263378	263387	20 %	0 %	20 %	60 %	55980245
7073	NC_006461	CTGG	2	8	263438	263445	0 %	25 %	50 %	25 %	55980245
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7084	NC_006461	TCCC	2	8	263763	263770	0 %	25 %	0 %	75 %	55980245
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7089	NC_006461	TCC	3	9	263958	263966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980245
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7098	NC_006461	G	6	6	264239	264244	0 %	0 %	100 %	0 %	55980245
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7107	NC_006461	AGG	2	6	264420	264425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_006461	CGTC	2	8	264432	264439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_006461	GAG	2	6	264443	264448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_006461	CTC	2	6	264458	264463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7111	NC_006461	G	6	6	264475	264480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_006461	G	6	6	264482	264487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_006461	AAG	2	6	264567	264572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_006461	C	6	6	264593	264598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7115	NC_006461	AGG	2	6	264608	264613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_006461	AAG	2	6	264614	264619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_006461	G	6	6	264721	264726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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7119	NC_006461	CCT	2	6	264839	264844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980246
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7121	NC_006461	TGGA	2	8	264879	264886	25 %	25 %	50 %	0 %	55980246
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7127	NC_006461	GAGCCC	2	12	265056	265067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980246
7128	NC_006461	CTC	2	6	265077	265082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980246
7129	NC_006461	CGG	2	6	265138	265143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980246
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7224	NC_006461	G	6	6	268613	268618	0 %	0 %	100 %	0 %	55980248
7225	NC_006461	A	6	6	268639	268644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7226	NC_006461	CCT	2	6	268724	268729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980249
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7232	NC_006461	CTGG	2	8	268911	268918	0 %	25 %	50 %	25 %	55980249
7233	NC_006461	TTC	2	6	268945	268950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980249
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7243	NC_006461	GTCC	2	8	269337	269344	0 %	25 %	25 %	50 %	55980249
7244	NC_006461	CTC	2	6	269376	269381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980249
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7248	NC_006461	ACC	2	6	269731	269736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980249
7249	NC_006461	GC	3	6	269809	269814	0 %	0 %	50 %	50 %	55980249
7250	NC_006461	TCC	3	9	269832	269840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7251	NC_006461	C	6	6	269950	269955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7252	NC_006461	CTCC	2	8	270000	270007	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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7378	NC_006461	ACC	2	6	275707	275712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980255
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7500	NC_006461	TCC	2	6	279916	279921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980257

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