MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 50244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006461	GGA	2	6	204177	204182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980175
5502	NC_006461	GCC	2	6	204196	204201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980175
5503	NC_006461	CTC	2	6	204202	204207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980175
5504	NC_006461	AGG	2	6	204212	204217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980175
5505	NC_006461	CCA	2	6	204236	204241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980175
5506	NC_006461	CTT	2	6	204311	204316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980176
5507	NC_006461	TCA	2	6	204328	204333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980176
5508	NC_006461	TCC	2	6	204349	204354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980176
5509	NC_006461	GTG	4	12	204393	204404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980176
5510	NC_006461	TGG	2	6	204412	204417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980176
5511	NC_006461	GGC	2	6	204479	204484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980176
5512	NC_006461	CGC	2	6	204488	204493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980176
5513	NC_006461	G	6	6	204495	204500	0 %	0 %	100 %	0 %	55980176
5514	NC_006461	GGT	2	6	204555	204560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980176
5515	NC_006461	GGC	2	6	204580	204585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980177
5516	NC_006461	GTG	2	6	204593	204598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980177
5517	NC_006461	CCCAC	2	10	204633	204642	20 %	0 %	0 %	80 %	55980177
5518	NC_006461	GGGC	2	8	204666	204673	0 %	0 %	75 %	25 %	55980177
5519	NC_006461	CTT	2	6	204703	204708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980177
5520	NC_006461	TCC	2	6	204738	204743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980177
5521	NC_006461	CGG	2	6	204762	204767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980177
5522	NC_006461	TGG	2	6	204773	204778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980177
5523	NC_006461	GCG	2	6	204779	204784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980177
5524	NC_006461	TGG	2	6	204816	204821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980177
5525	NC_006461	GGCGG	2	10	204842	204851	0 %	0 %	80 %	20 %	55980177
5526	NC_006461	CCA	2	6	204855	204860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980177
5527	NC_006461	CGC	2	6	204862	204867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980177
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5529	NC_006461	GGC	2	6	204926	204931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980177
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5535	NC_006461	CTCTT	2	10	205125	205134	0 %	60 %	0 %	40 %	55980177
5536	NC_006461	CGG	3	9	205159	205167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980177
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5540	NC_006461	CTC	2	6	205292	205297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980177
5541	NC_006461	TGG	2	6	205344	205349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980177
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5544	NC_006461	GGA	2	6	205411	205416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980177
5545	NC_006461	CGC	2	6	205417	205422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980177
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5548	NC_006461	GGCGG	2	10	205564	205573	0 %	0 %	80 %	20 %	55980177
5549	NC_006461	TCC	2	6	205593	205598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980177
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5554	NC_006461	CGTCAT	2	12	205777	205788	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55980177
5555	NC_006461	GAC	2	6	205924	205929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_006461	GC	3	6	205968	205973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_006461	G	6	6	205996	206001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_006461	CCG	2	6	206021	206026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_006461	CCGG	2	8	206070	206077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_006461	GGA	2	6	206097	206102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_006461	CTT	2	6	206175	206180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980178
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5602	NC_006461	CGGGC	2	10	207755	207764	0 %	0 %	60 %	40 %	55980180
5603	NC_006461	C	6	6	207801	207806	0 %	0 %	0 %	100 %	55980180
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5609	NC_006461	GCC	3	9	207946	207954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980180
5610	NC_006461	AGGG	2	8	207972	207979	25 %	0 %	75 %	0 %	55980180
5611	NC_006461	G	7	7	207977	207983	0 %	0 %	100 %	0 %	55980180
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5614	NC_006461	CACGCC	2	12	208101	208112	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980180
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5620	NC_006461	GGA	2	6	208424	208429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980181
5621	NC_006461	G	6	6	208496	208501	0 %	0 %	100 %	0 %	55980181
5622	NC_006461	GAG	2	6	208605	208610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980181
5623	NC_006461	CCT	2	6	208640	208645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_006461	GGC	2	6	208685	208690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_006461	CGC	2	6	208764	208769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_006461	AAG	2	6	208785	208790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_006461	TCC	2	6	208819	208824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980182
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5871	NC_006461	GC	3	6	218099	218104	0 %	0 %	50 %	50 %	55980192
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5874	NC_006461	TCT	2	6	218331	218336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980192
5875	NC_006461	GGC	2	6	218356	218361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980192
5876	NC_006461	CTC	2	6	218452	218457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980192
5877	NC_006461	CGGG	2	8	218511	218518	0 %	0 %	75 %	25 %	55980192
5878	NC_006461	CGTAGG	2	12	218535	218546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980192
5879	NC_006461	CCTTA	2	10	218572	218581	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5880	NC_006461	GGCGG	2	10	218688	218697	0 %	0 %	80 %	20 %	55980193
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5886	NC_006461	TCT	2	6	219104	219109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980193
5887	NC_006461	GTC	2	6	219127	219132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980193
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5894	NC_006461	GAG	2	6	219292	219297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980193
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5902	NC_006461	GGA	3	9	219507	219515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980193
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5939	NC_006461	TGAG	2	8	220584	220591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5985	NC_006461	GGGC	2	8	221904	221911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5997	NC_006461	CAA	2	6	222312	222317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980198
5998	NC_006461	GCC	2	6	222320	222325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980198
5999	NC_006461	CTT	2	6	222360	222365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980198
6000	NC_006461	TCCC	2	8	222395	222402	0 %	25 %	0 %	75 %	55980198

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