MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005838	GGGACA	2	12	110445	110456	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46255189
3002	NC_005838	CTC	4	12	110534	110545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255189
3003	NC_005838	CCT	2	6	110593	110598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255189
3004	NC_005838	CCG	2	6	110608	110613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255189
3005	NC_005838	CCCA	2	8	110666	110673	25 %	0 %	0 %	75 %	46255189
3006	NC_005838	GGACCT	2	12	110731	110742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255189
3007	NC_005838	GAG	2	6	110756	110761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255189
3008	NC_005838	CGC	2	6	110767	110772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255189
3009	NC_005838	GTG	2	6	110828	110833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255189
3010	NC_005838	ACG	2	6	110835	110840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255189
3011	NC_005838	TCC	2	6	110853	110858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255189
3012	NC_005838	GGT	2	6	110875	110880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255189
3013	NC_005838	GAC	2	6	110897	110902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255189
3014	NC_005838	GAG	2	6	110939	110944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255189
3015	NC_005838	CCT	2	6	110962	110967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255189
3016	NC_005838	GGA	2	6	111055	111060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255189
3017	NC_005838	G	7	7	111065	111071	0 %	0 %	100 %	0 %	46255189
3018	NC_005838	CCGGGT	2	12	111115	111126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46255189
3019	NC_005838	AGG	2	6	111306	111311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255190
3020	NC_005838	ACC	2	6	111330	111335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255190
3021	NC_005838	GCC	2	6	111380	111385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255190
3022	NC_005838	CTC	2	6	111398	111403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255190
3023	NC_005838	CGG	2	6	111438	111443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255190
3024	NC_005838	GAG	2	6	111476	111481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255190
3025	NC_005838	CAAGG	2	10	111526	111535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_005838	CTGG	2	8	111552	111559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_005838	GGA	2	6	111585	111590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_005838	GCG	2	6	111622	111627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_005838	T	6	6	111658	111663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_005838	TGG	3	9	111730	111738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_005838	TGGG	2	8	111742	111749	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_005838	GGC	2	6	111871	111876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255191
3033	NC_005838	CCA	2	6	111893	111898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255191
3034	NC_005838	CAC	2	6	111926	111931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255191
3035	NC_005838	GGA	2	6	111932	111937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255191
3036	NC_005838	TCT	2	6	111952	111957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255191
3037	NC_005838	CAC	2	6	112014	112019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255191
3038	NC_005838	ACT	2	6	112024	112029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255191
3039	NC_005838	C	7	7	112045	112051	0 %	0 %	0 %	100 %	46255191
3040	NC_005838	TCC	2	6	112105	112110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255191
3041	NC_005838	GAG	2	6	112143	112148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255191
3042	NC_005838	GCC	2	6	112167	112172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255191
3043	NC_005838	CCTGG	2	10	112181	112190	0 %	20 %	40 %	40 %	46255191
3044	NC_005838	GAG	2	6	112200	112205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255191
3045	NC_005838	CCT	2	6	112222	112227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255191
3046	NC_005838	GGA	2	6	112250	112255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255191
3047	NC_005838	CCT	2	6	112313	112318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255191
3048	NC_005838	GGA	2	6	112400	112405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255191
3049	NC_005838	GGA	2	6	112430	112435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255191
3050	NC_005838	TCC	2	6	112444	112449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255191
3051	NC_005838	TCCG	2	8	112572	112579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_005838	CTT	2	6	112589	112594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_005838	GC	3	6	112687	112692	0 %	0 %	50 %	50 %	46255192
3054	NC_005838	CTT	3	9	112801	112809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255192
3055	NC_005838	CGG	2	6	112840	112845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255192
3056	NC_005838	TGA	2	6	112870	112875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255192
3057	NC_005838	TGG	2	6	112965	112970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255192
3058	NC_005838	CCTGG	2	10	112972	112981	0 %	20 %	40 %	40 %	46255192
3059	NC_005838	ACGG	2	8	112982	112989	25 %	0 %	50 %	25 %	46255192
3060	NC_005838	GCG	2	6	112993	112998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255192
3061	NC_005838	GAA	2	6	113030	113035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255192
3062	NC_005838	CCTGGC	2	12	113050	113061	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255192
3063	NC_005838	CTG	2	6	113063	113068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255192
3064	NC_005838	ACATGG	2	12	113163	113174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46255192
3065	NC_005838	AGA	2	6	113191	113196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255192
3066	NC_005838	TGG	2	6	113240	113245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_005838	TGG	2	6	113247	113252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_005838	GAG	2	6	113257	113262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_005838	GAG	2	6	113349	113354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255193
3070	NC_005838	CGG	2	6	113363	113368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255193
3071	NC_005838	AGG	2	6	113536	113541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255193
3072	NC_005838	CGG	2	6	113546	113551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255193
3073	NC_005838	GTGG	2	8	113621	113628	0 %	25 %	75 %	0 %	46255193
3074	NC_005838	TCC	2	6	113629	113634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255193
3075	NC_005838	CCT	2	6	113678	113683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255193
3076	NC_005838	GGC	2	6	113702	113707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255193
3077	NC_005838	GGC	2	6	113710	113715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255193
3078	NC_005838	CGC	2	6	113720	113725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255193
3079	NC_005838	CCT	2	6	113780	113785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255193
3080	NC_005838	CGGC	2	8	113813	113820	0 %	0 %	50 %	50 %	46255193
3081	NC_005838	CGC	2	6	113831	113836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255193
3082	NC_005838	GTG	2	6	113886	113891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255193
3083	NC_005838	CCG	2	6	113945	113950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255193
3084	NC_005838	G	6	6	114042	114047	0 %	0 %	100 %	0 %	46255193
3085	NC_005838	GGGC	2	8	114104	114111	0 %	0 %	75 %	25 %	46255193
3086	NC_005838	C	6	6	114121	114126	0 %	0 %	0 %	100 %	46255193
3087	NC_005838	GGC	2	6	114141	114146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255193
3088	NC_005838	GAG	2	6	114216	114221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255193
3089	NC_005838	C	6	6	114229	114234	0 %	0 %	0 %	100 %	46255193
3090	NC_005838	CTC	2	6	114363	114368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255193
3091	NC_005838	G	6	6	114391	114396	0 %	0 %	100 %	0 %	46255193
3092	NC_005838	GAG	2	6	114444	114449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255193
3093	NC_005838	GTG	2	6	114552	114557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255193
3094	NC_005838	ATG	2	6	114576	114581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255193
3095	NC_005838	CGG	2	6	114607	114612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255193
3096	NC_005838	C	6	6	114619	114624	0 %	0 %	0 %	100 %	46255193
3097	NC_005838	GGA	2	6	114650	114655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255193
3098	NC_005838	CGC	3	9	114689	114697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255193
3099	NC_005838	G	6	6	114726	114731	0 %	0 %	100 %	0 %	46255193
3100	NC_005838	CAA	2	6	114740	114745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255193
3101	NC_005838	GTG	2	6	114759	114764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255193
3102	NC_005838	CGC	2	6	114776	114781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255193
3103	NC_005838	ACC	2	6	114856	114861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255193
3104	NC_005838	GAC	2	6	114882	114887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255193
3105	NC_005838	CTT	2	6	114899	114904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255193
3106	NC_005838	GAG	2	6	114909	114914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255193
3107	NC_005838	C	6	6	114921	114926	0 %	0 %	0 %	100 %	46255193
3108	NC_005838	CCGC	2	8	114937	114944	0 %	0 %	25 %	75 %	46255193
3109	NC_005838	CCA	2	6	114983	114988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255193
3110	NC_005838	GAG	2	6	115037	115042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3111	NC_005838	CAC	2	6	115061	115066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255194
3112	NC_005838	GAG	2	6	115100	115105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3113	NC_005838	AGG	2	6	115185	115190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3114	NC_005838	CAT	2	6	115220	115225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255194
3115	NC_005838	AGG	2	6	115236	115241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3116	NC_005838	GGT	2	6	115243	115248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255194
3117	NC_005838	AGG	2	6	115269	115274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3118	NC_005838	G	6	6	115279	115284	0 %	0 %	100 %	0 %	46255194
3119	NC_005838	AGA	2	6	115372	115377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255194
3120	NC_005838	CTC	2	6	115379	115384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255194
3121	NC_005838	GGC	2	6	115391	115396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255194
3122	NC_005838	GAG	2	6	115397	115402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3123	NC_005838	GGA	3	9	115432	115440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3124	NC_005838	GGC	2	6	115454	115459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255194
3125	NC_005838	CAGGC	2	10	115494	115503	20 %	0 %	40 %	40 %	46255194
3126	NC_005838	GAG	2	6	115541	115546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3127	NC_005838	CCT	2	6	115621	115626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255194
3128	NC_005838	AGGGCC	2	12	115635	115646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255194
3129	NC_005838	GCGG	2	8	115702	115709	0 %	0 %	75 %	25 %	46255194
3130	NC_005838	GAG	2	6	115715	115720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255194
3131	NC_005838	GGC	2	6	115724	115729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255194
3132	NC_005838	AG	3	6	115745	115750	50 %	0 %	50 %	0 %	46255194
3133	NC_005838	GC	3	6	115770	115775	0 %	0 %	50 %	50 %	46255194
3134	NC_005838	TCCCT	2	10	115777	115786	0 %	40 %	0 %	60 %	46255194
3135	NC_005838	AGG	2	6	115802	115807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255195
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3140	NC_005838	CGA	2	6	115937	115942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255195
3141	NC_005838	G	7	7	115964	115970	0 %	0 %	100 %	0 %	46255195
3142	NC_005838	GAG	2	6	115980	115985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255195
3143	NC_005838	CGG	2	6	116032	116037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255195
3144	NC_005838	GCG	2	6	116046	116051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255195
3145	NC_005838	GGC	2	6	116090	116095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255195
3146	NC_005838	CGC	2	6	116104	116109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255195
3147	NC_005838	CCA	2	6	116117	116122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255195
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3149	NC_005838	GAG	2	6	116336	116341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_005838	CCCT	2	8	116529	116536	0 %	25 %	0 %	75 %	46255196
3151	NC_005838	GA	3	6	116627	116632	50 %	0 %	50 %	0 %	46255196
3152	NC_005838	CTC	2	6	116635	116640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255196
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3155	NC_005838	CGC	3	9	116787	116795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255196
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3158	NC_005838	C	6	6	116907	116912	0 %	0 %	0 %	100 %	46255196
3159	NC_005838	TGG	2	6	116921	116926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255196
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3180	NC_005838	CCAG	2	8	117905	117912	25 %	0 %	25 %	50 %	46255197
3181	NC_005838	GGC	2	6	117993	117998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255197
3182	NC_005838	GGCGG	2	10	118131	118140	0 %	0 %	80 %	20 %	46255197
3183	NC_005838	TCC	2	6	118201	118206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255197
3184	NC_005838	AAG	2	6	118275	118280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255197
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3200	NC_005838	CTC	2	6	118847	118852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255198
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3203	NC_005838	GGC	2	6	118901	118906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255198
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3205	NC_005838	TGGCCT	2	12	119104	119115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255198
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3220	NC_005838	CCGGTA	2	12	119864	119875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3221	NC_005838	CTT	2	6	119932	119937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255199
3222	NC_005838	CCCG	2	8	119991	119998	0 %	0 %	25 %	75 %	46255199
3223	NC_005838	TCC	2	6	120138	120143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
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3230	NC_005838	CCT	2	6	120373	120378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3231	NC_005838	GCCC	2	8	120389	120396	0 %	0 %	25 %	75 %	46255199
3232	NC_005838	CTG	2	6	120404	120409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3233	NC_005838	CTC	2	6	120416	120421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3234	NC_005838	GGGC	2	8	120431	120438	0 %	0 %	75 %	25 %	46255199
3235	NC_005838	ACC	2	6	120447	120452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3236	NC_005838	GGT	2	6	120491	120496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255199
3237	NC_005838	CCA	3	9	120499	120507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3238	NC_005838	CAGGC	2	10	120618	120627	20 %	0 %	40 %	40 %	46255199
3239	NC_005838	C	6	6	120669	120674	0 %	0 %	0 %	100 %	46255199
3240	NC_005838	AGG	2	6	120690	120695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3241	NC_005838	CGAAG	2	10	120748	120757	40 %	0 %	40 %	20 %	46255199
3242	NC_005838	GCA	2	6	120781	120786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3243	NC_005838	GAA	2	6	120857	120862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3244	NC_005838	ACC	2	6	120963	120968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3245	NC_005838	GCCC	2	8	121067	121074	0 %	0 %	25 %	75 %	46255199
3246	NC_005838	GAGGGC	2	12	121124	121135	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255199
3247	NC_005838	TCA	2	6	121174	121179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255199
3248	NC_005838	CCA	2	6	121183	121188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3249	NC_005838	G	6	6	121189	121194	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3250	NC_005838	GAG	2	6	121268	121273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3251	NC_005838	GAG	2	6	121277	121282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3252	NC_005838	GGC	2	6	121285	121290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
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3259	NC_005838	TCC	2	6	121488	121493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
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3328	NC_005838	AGG	2	6	123840	123845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
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3339	NC_005838	AGG	2	6	124231	124236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3341	NC_005838	G	7	7	124277	124283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3342	NC_005838	GAG	2	6	124335	124340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3343	NC_005838	GAG	2	6	124350	124355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3344	NC_005838	CTCC	2	8	124433	124440	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3345	NC_005838	C	6	6	124439	124444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3347	NC_005838	CAC	2	6	124489	124494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3348	NC_005838	CCCT	2	8	124523	124530	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3349	NC_005838	GGGTGC	2	12	124570	124581	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46255200
3350	NC_005838	GAC	2	6	124602	124607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255200
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3362	NC_005838	C	8	8	125309	125316	0 %	0 %	0 %	100 %	46255200
3363	NC_005838	ACC	2	6	125433	125438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255200
3364	NC_005838	CCT	2	6	125471	125476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255200
3365	NC_005838	AGG	2	6	125485	125490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255200
3366	NC_005838	TCC	4	12	125503	125514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255200
3367	NC_005838	GGA	2	6	125531	125536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255200
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3369	NC_005838	GGA	2	6	125627	125632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255200
3370	NC_005838	GGT	2	6	125749	125754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255201
3371	NC_005838	GGGT	2	8	125763	125770	0 %	25 %	75 %	0 %	46255201
3372	NC_005838	ACG	2	6	125910	125915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255201
3373	NC_005838	G	6	6	125915	125920	0 %	0 %	100 %	0 %	46255201
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3496	NC_005838	GCGA	2	8	130919	130926	25 %	0 %	50 %	25 %	46255201
3497	NC_005838	GGAG	2	8	131045	131052	25 %	0 %	75 %	0 %	46255201
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