MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_005838	GC	3	6	231645	231650	0 %	0 %	50 %	50 %	46255299
6002	NC_005838	G	6	6	231672	231677	0 %	0 %	100 %	0 %	46255299
6003	NC_005838	TCC	2	6	231683	231688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
6004	NC_005838	CGG	2	6	231735	231740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255299
6005	NC_005838	TCC	2	6	231755	231760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
6006	NC_005838	AGC	2	6	231950	231955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255299
6007	NC_005838	GGC	2	6	231986	231991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255299
6008	NC_005838	GGC	2	6	232035	232040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255299
6009	NC_005838	G	6	6	232044	232049	0 %	0 %	100 %	0 %	46255299
6010	NC_005838	CGG	2	6	232054	232059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255299
6011	NC_005838	GGCCCG	2	12	232074	232085	0 %	0 %	50 %	50 %	46255299
6012	NC_005838	CGC	2	6	232107	232112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255299
6013	NC_005838	CTC	2	6	232113	232118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
6014	NC_005838	CTG	2	6	232150	232155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255299
6015	NC_005838	GA	3	6	232181	232186	50 %	0 %	50 %	0 %	46255299
6016	NC_005838	GGC	2	6	232236	232241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255299
6017	NC_005838	GCGGA	2	10	232249	232258	20 %	0 %	60 %	20 %	46255299
6018	NC_005838	AGCG	2	8	232266	232273	25 %	0 %	50 %	25 %	46255299
6019	NC_005838	AGG	2	6	232307	232312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255299
6020	NC_005838	GAG	2	6	232315	232320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255299
6021	NC_005838	CTT	2	6	232354	232359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255299
6022	NC_005838	G	6	6	232486	232491	0 %	0 %	100 %	0 %	46255299
6023	NC_005838	GGA	2	6	232497	232502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255299
6024	NC_005838	GGA	2	6	232533	232538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255299

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.