MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005838	AAAG	2	8	213681	213688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_005838	C	6	6	213763	213768	0 %	0 %	0 %	100 %	46255284
5503	NC_005838	GCC	2	6	213780	213785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255284
5504	NC_005838	CAA	2	6	213860	213865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255284
5505	NC_005838	CTC	2	6	213869	213874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255284
5506	NC_005838	GCC	2	6	213889	213894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255284
5507	NC_005838	GGA	2	6	213910	213915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255284
5508	NC_005838	CCA	2	6	213952	213957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255284
5509	NC_005838	AGG	3	9	213970	213978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255284
5510	NC_005838	CCT	2	6	213997	214002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255284
5511	NC_005838	CAG	2	6	214105	214110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_005838	TAG	2	6	214115	214120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_005838	AAG	2	6	214135	214140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_005838	AG	3	6	214167	214172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_005838	AGG	2	6	214192	214197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255285
5516	NC_005838	GTTG	2	8	214240	214247	0 %	50 %	50 %	0 %	46255285
5517	NC_005838	CTC	2	6	214283	214288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255285
5518	NC_005838	ACA	2	6	214367	214372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255285
5519	NC_005838	TGG	2	6	214390	214395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255285
5520	NC_005838	GA	3	6	214397	214402	50 %	0 %	50 %	0 %	46255285
5521	NC_005838	GCA	2	6	214688	214693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255285
5522	NC_005838	GGGA	2	8	214766	214773	25 %	0 %	75 %	0 %	46255285
5523	NC_005838	AGCA	2	8	214792	214799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_005838	CT	3	6	214848	214853	0 %	50 %	0 %	50 %	46255286
5525	NC_005838	TCC	2	6	215024	215029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255286
5526	NC_005838	CAACC	2	10	215115	215124	40 %	0 %	0 %	60 %	46255286
5527	NC_005838	TCG	2	6	215264	215269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255286
5528	NC_005838	AGA	2	6	215277	215282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255286
5529	NC_005838	C	6	6	215307	215312	0 %	0 %	0 %	100 %	46255286
5530	NC_005838	AGG	2	6	215465	215470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255287
5531	NC_005838	GCG	2	6	215471	215476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255287
5532	NC_005838	TCC	2	6	215485	215490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255287
5533	NC_005838	ACG	2	6	215494	215499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255287
5534	NC_005838	GGA	2	6	215600	215605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255287
5535	NC_005838	GCCC	2	8	215639	215646	0 %	0 %	25 %	75 %	46255287
5536	NC_005838	GAG	2	6	215742	215747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255287
5537	NC_005838	GCG	2	6	215778	215783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255287
5538	NC_005838	CCCA	2	8	215799	215806	25 %	0 %	0 %	75 %	46255287
5539	NC_005838	CCA	2	6	215816	215821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255287
5540	NC_005838	TCC	2	6	215935	215940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255287
5541	NC_005838	CCT	2	6	215954	215959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255287
5542	NC_005838	C	6	6	216008	216013	0 %	0 %	0 %	100 %	46255287
5543	NC_005838	GGA	2	6	216014	216019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255287
5544	NC_005838	CGGCT	2	10	216021	216030	0 %	20 %	40 %	40 %	46255287
5545	NC_005838	C	6	6	216053	216058	0 %	0 %	0 %	100 %	46255287
5546	NC_005838	CTA	2	6	216065	216070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255287
5547	NC_005838	CCA	2	6	216077	216082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255287
5548	NC_005838	GGGCC	2	10	216104	216113	0 %	0 %	60 %	40 %	46255287
5549	NC_005838	ACT	2	6	216142	216147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255287
5550	NC_005838	GC	3	6	216206	216211	0 %	0 %	50 %	50 %	46255287
5551	NC_005838	T	6	6	216226	216231	0 %	100 %	0 %	0 %	46255287
5552	NC_005838	AGG	2	6	216233	216238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255287
5553	NC_005838	GAA	2	6	216249	216254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255288
5554	NC_005838	GCG	2	6	216255	216260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255288
5555	NC_005838	ACCT	2	8	216310	216317	25 %	25 %	0 %	50 %	46255288
5556	NC_005838	CTT	2	6	216321	216326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255288
5557	NC_005838	CCG	2	6	216350	216355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255288
5558	NC_005838	CGGAC	2	10	216428	216437	20 %	0 %	40 %	40 %	46255288
5559	NC_005838	GGC	2	6	216458	216463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255288
5560	NC_005838	CTC	3	9	216469	216477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5561	NC_005838	TCC	2	6	216491	216496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5562	NC_005838	CCT	2	6	216504	216509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5563	NC_005838	TCT	2	6	216512	216517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255288
5564	NC_005838	TCC	2	6	216548	216553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5565	NC_005838	CTA	2	6	216555	216560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255288
5566	NC_005838	TCC	2	6	216575	216580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5567	NC_005838	ACCA	2	8	216610	216617	50 %	0 %	0 %	50 %	46255288
5568	NC_005838	GCC	3	9	216667	216675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255288
5569	NC_005838	TCGCCC	2	12	216716	216727	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255288
5570	NC_005838	CTC	2	6	216766	216771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5571	NC_005838	CTT	2	6	216804	216809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255288
5572	NC_005838	GGA	2	6	216822	216827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255288
5573	NC_005838	CGGG	2	8	216832	216839	0 %	0 %	75 %	25 %	46255288
5574	NC_005838	GTG	2	6	216898	216903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5575	NC_005838	CCT	2	6	216915	216920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5576	NC_005838	GGA	2	6	216987	216992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255288
5577	NC_005838	CCA	2	6	216998	217003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255288
5578	NC_005838	CGC	2	6	217014	217019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255288
5579	NC_005838	GGC	2	6	217029	217034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255288
5580	NC_005838	CCTCC	2	10	217035	217044	0 %	20 %	0 %	80 %	46255288
5581	NC_005838	CTC	2	6	217048	217053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5582	NC_005838	G	7	7	217076	217082	0 %	0 %	100 %	0 %	46255288
5583	NC_005838	GGC	2	6	217094	217099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255288
5584	NC_005838	CCT	2	6	217107	217112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5585	NC_005838	CTC	3	9	217129	217137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5586	NC_005838	CTC	2	6	217165	217170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5587	NC_005838	TGG	2	6	217181	217186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5588	NC_005838	GGT	2	6	217221	217226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5589	NC_005838	CTA	2	6	217284	217289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255288
5590	NC_005838	TGG	2	6	217295	217300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5591	NC_005838	GGGCC	2	10	217308	217317	0 %	0 %	60 %	40 %	46255288
5592	NC_005838	TGG	2	6	217328	217333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5593	NC_005838	CTC	2	6	217348	217353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5594	NC_005838	GGC	2	6	217404	217409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255288
5595	NC_005838	TGG	2	6	217421	217426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5596	NC_005838	GGT	2	6	217428	217433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5597	NC_005838	TCC	2	6	217448	217453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5598	NC_005838	ACC	2	6	217519	217524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255289
5599	NC_005838	CGAGGC	2	12	217589	217600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255289
5600	NC_005838	CGG	2	6	217604	217609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5601	NC_005838	C	7	7	217643	217649	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5602	NC_005838	TGGG	2	8	217680	217687	0 %	25 %	75 %	0 %	46255289
5603	NC_005838	CGG	2	6	217734	217739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5604	NC_005838	TCC	2	6	217744	217749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5605	NC_005838	G	7	7	217814	217820	0 %	0 %	100 %	0 %	46255289
5606	NC_005838	GAC	2	6	217890	217895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255289
5607	NC_005838	C	6	6	217912	217917	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5608	NC_005838	TCT	2	6	217951	217956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255289
5609	NC_005838	CAC	2	6	217964	217969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255289
5610	NC_005838	CTGG	2	8	217988	217995	0 %	25 %	50 %	25 %	46255289
5611	NC_005838	CGC	2	6	218018	218023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5612	NC_005838	C	6	6	218134	218139	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5613	NC_005838	CTGG	2	8	218153	218160	0 %	25 %	50 %	25 %	46255289
5614	NC_005838	CTC	2	6	218175	218180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5615	NC_005838	CCT	2	6	218234	218239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5616	NC_005838	GGC	2	6	218242	218247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5617	NC_005838	GCCTCC	2	12	218275	218286	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255289
5618	NC_005838	G	6	6	218325	218330	0 %	0 %	100 %	0 %	46255289
5619	NC_005838	GCC	2	6	218343	218348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5620	NC_005838	TCC	2	6	218362	218367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5621	NC_005838	CGC	2	6	218447	218452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5622	NC_005838	CGG	2	6	218457	218462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5623	NC_005838	GGA	2	6	218519	218524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255289
5624	NC_005838	CCT	2	6	218558	218563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
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5626	NC_005838	GGC	2	6	218606	218611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
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5743	NC_005838	G	6	6	222118	222123	0 %	0 %	100 %	0 %	46255291
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5747	NC_005838	GC	3	6	222178	222183	0 %	0 %	50 %	50 %	46255291
5748	NC_005838	GGCGG	2	10	222249	222258	0 %	0 %	80 %	20 %	46255291
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5999	NC_005838	CCT	2	6	231561	231566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
6000	NC_005838	GTG	2	6	231622	231627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255299

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