MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005838	G	8	8	172072	172079	0 %	0 %	100 %	0 %	46255243
4502	NC_005838	CCT	2	6	172192	172197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4503	NC_005838	CTC	2	6	172259	172264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4504	NC_005838	CGC	2	6	172351	172356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255243
4505	NC_005838	CGG	2	6	172396	172401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255243
4506	NC_005838	TCC	3	9	172543	172551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_005838	CCG	2	6	172572	172577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_005838	G	6	6	172595	172600	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_005838	CTC	2	6	172615	172620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_005838	C	6	6	172679	172684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4511	NC_005838	GGA	2	6	172720	172725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
4512	NC_005838	CCT	2	6	172771	172776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4513	NC_005838	CCG	2	6	172785	172790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255244
4514	NC_005838	CCT	2	6	172804	172809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4515	NC_005838	GCCC	2	8	172821	172828	0 %	0 %	25 %	75 %	46255244
4516	NC_005838	GGA	3	9	172960	172968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
4517	NC_005838	C	6	6	172988	172993	0 %	0 %	0 %	100 %	46255244
4518	NC_005838	G	6	6	173071	173076	0 %	0 %	100 %	0 %	46255244
4519	NC_005838	CTC	3	9	173120	173128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4520	NC_005838	GCCC	2	8	173139	173146	0 %	0 %	25 %	75 %	46255244
4521	NC_005838	CTC	2	6	173147	173152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4522	NC_005838	TCC	2	6	173181	173186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4523	NC_005838	GCTCT	2	10	173201	173210	0 %	40 %	20 %	40 %	46255244
4524	NC_005838	GGCG	2	8	173263	173270	0 %	0 %	75 %	25 %	46255244
4525	NC_005838	CCCGTC	2	12	173285	173296	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255244
4526	NC_005838	TCT	2	6	173310	173315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255244
4527	NC_005838	GCC	2	6	173328	173333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255244
4528	NC_005838	CGGG	2	8	173368	173375	0 %	0 %	75 %	25 %	46255244
4529	NC_005838	TCC	2	6	173487	173492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4530	NC_005838	CTGGAG	2	12	173543	173554	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46255244
4531	NC_005838	G	6	6	173569	173574	0 %	0 %	100 %	0 %	46255244
4532	NC_005838	CCCG	2	8	173638	173645	0 %	0 %	25 %	75 %	46255244
4533	NC_005838	TGG	2	6	173673	173678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255244
4534	NC_005838	TCC	2	6	173700	173705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4535	NC_005838	CCT	2	6	173758	173763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4536	NC_005838	GAG	2	6	173799	173804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
4537	NC_005838	CGGG	2	8	173823	173830	0 %	0 %	75 %	25 %	46255244
4538	NC_005838	GAG	2	6	173840	173845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
4539	NC_005838	GAA	2	6	173863	173868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255244
4540	NC_005838	GGC	2	6	173869	173874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255244
4541	NC_005838	GGA	2	6	173937	173942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255245
4542	NC_005838	TCC	2	6	173945	173950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4543	NC_005838	GC	3	6	173993	173998	0 %	0 %	50 %	50 %	46255245
4544	NC_005838	CCT	3	9	174033	174041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4545	NC_005838	GGC	2	6	174061	174066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255245
4546	NC_005838	CTC	2	6	174121	174126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4547	NC_005838	AGG	2	6	174146	174151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255245
4548	NC_005838	GC	3	6	174152	174157	0 %	0 %	50 %	50 %	46255245
4549	NC_005838	GGC	2	6	174190	174195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255245
4550	NC_005838	AGGGCC	2	12	174218	174229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255245
4551	NC_005838	GTC	2	6	174238	174243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255245
4552	NC_005838	CCGC	2	8	174279	174286	0 %	0 %	25 %	75 %	46255245
4553	NC_005838	TCCAGG	2	12	174287	174298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255245
4554	NC_005838	AGG	2	6	174329	174334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255245
4555	NC_005838	CGG	2	6	174378	174383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255245
4556	NC_005838	CTC	2	6	174433	174438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4557	NC_005838	GCG	2	6	174455	174460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255245
4558	NC_005838	CTC	3	9	174478	174486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4559	NC_005838	TCT	2	6	174492	174497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255245
4560	NC_005838	GCC	2	6	174575	174580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255245
4561	NC_005838	GCGG	2	8	174589	174596	0 %	0 %	75 %	25 %	46255245
4562	NC_005838	AGG	2	6	174608	174613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255245
4563	NC_005838	CCG	3	9	174654	174662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255245
4564	NC_005838	C	7	7	174727	174733	0 %	0 %	0 %	100 %	46255245
4565	NC_005838	CGAAGG	2	12	174741	174752	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46255245
4566	NC_005838	CTC	2	6	174760	174765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4567	NC_005838	GGT	2	6	174817	174822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255245
4568	NC_005838	GCC	2	6	174826	174831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255245
4569	NC_005838	CCG	2	6	174843	174848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255245
4570	NC_005838	GGGCCA	2	12	174930	174941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255245
4571	NC_005838	AAC	2	6	174947	174952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255245
4572	NC_005838	CCT	2	6	174985	174990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255246
4573	NC_005838	GC	3	6	174994	174999	0 %	0 %	50 %	50 %	46255246
4574	NC_005838	CCT	2	6	175004	175009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255246
4575	NC_005838	CCA	2	6	175010	175015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255246
4576	NC_005838	CCG	2	6	175036	175041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255246
4577	NC_005838	GGT	2	6	175050	175055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255246
4578	NC_005838	CCG	2	6	175106	175111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255246
4579	NC_005838	GTT	2	6	175125	175130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46255246
4580	NC_005838	GCCCT	2	10	175228	175237	0 %	20 %	20 %	60 %	46255246
4581	NC_005838	TGG	2	6	175283	175288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255246
4582	NC_005838	AGG	2	6	175336	175341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255246
4583	NC_005838	GGA	3	9	175457	175465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255246
4584	NC_005838	GGC	2	6	175479	175484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255246
4585	NC_005838	CTT	2	6	175493	175498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255246
4586	NC_005838	GGC	2	6	175599	175604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255246
4587	NC_005838	G	6	6	175654	175659	0 %	0 %	100 %	0 %	46255246
4588	NC_005838	CACC	2	8	175671	175678	25 %	0 %	0 %	75 %	46255246
4589	NC_005838	GAG	4	12	175722	175733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255246
4590	NC_005838	CAC	2	6	175761	175766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255246
4591	NC_005838	G	8	8	175773	175780	0 %	0 %	100 %	0 %	46255246
4592	NC_005838	C	6	6	175818	175823	0 %	0 %	0 %	100 %	46255246
4593	NC_005838	GGC	2	6	175830	175835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255246
4594	NC_005838	AGC	2	6	175851	175856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255246
4595	NC_005838	CCA	2	6	175865	175870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255246
4596	NC_005838	GGC	2	6	175929	175934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255247
4597	NC_005838	GCA	2	6	175960	175965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255247
4598	NC_005838	GGA	2	6	175969	175974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255247
4599	NC_005838	CCGAG	2	10	176011	176020	20 %	0 %	40 %	40 %	46255247
4600	NC_005838	CTCC	2	8	176029	176036	0 %	25 %	0 %	75 %	46255247
4601	NC_005838	AGG	2	6	176052	176057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255247
4602	NC_005838	TCC	2	6	176058	176063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255247
4603	NC_005838	GGT	2	6	176128	176133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255247
4604	NC_005838	CCA	2	6	176188	176193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255247
4605	NC_005838	ACC	2	6	176218	176223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255247
4606	NC_005838	GGGGCA	2	12	176228	176239	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255247
4607	NC_005838	C	6	6	176253	176258	0 %	0 %	0 %	100 %	46255247
4608	NC_005838	CCCTC	2	10	176348	176357	0 %	20 %	0 %	80 %	46255248
4609	NC_005838	CCA	2	6	176417	176422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255248
4610	NC_005838	GGT	2	6	176489	176494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255248
4611	NC_005838	TGG	2	6	176495	176500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255248
4612	NC_005838	AGG	3	9	176509	176517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255248
4613	NC_005838	CCT	2	6	176525	176530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255248
4614	NC_005838	GAG	2	6	176535	176540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255248
4615	NC_005838	C	6	6	176569	176574	0 %	0 %	0 %	100 %	46255248
4616	NC_005838	GGT	2	6	176645	176650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255248
4617	NC_005838	CCA	2	6	176669	176674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255248
4618	NC_005838	GCC	2	6	176684	176689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255248
4619	NC_005838	AGG	2	6	176803	176808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255248
4620	NC_005838	GAG	2	6	176844	176849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255248
4621	NC_005838	AGG	2	6	176854	176859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255248
4622	NC_005838	CTCCCC	2	12	176901	176912	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	46255248
4623	NC_005838	GAA	2	6	177022	177027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255249
4624	NC_005838	C	7	7	177031	177037	0 %	0 %	0 %	100 %	46255249
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4626	NC_005838	ACC	2	6	177050	177055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255249
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