MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48503	NC_005835	GGT	2	6	1786446	1786451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200182
48504	NC_005835	CA	3	6	1786461	1786466	50 %	0 %	0 %	50 %	46200182
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48506	NC_005835	TGC	2	6	1786588	1786593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200182
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48508	NC_005835	GAGTA	2	10	1786630	1786639	40 %	20 %	40 %	0 %	46200182
48509	NC_005835	CTT	2	6	1786650	1786655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200182
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48512	NC_005835	CGT	2	6	1786736	1786741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200182
48513	NC_005835	CTA	2	6	1786835	1786840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200182
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48517	NC_005835	TTCG	2	8	1787181	1787188	0 %	50 %	25 %	25 %	46200182
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48612	NC_005835	TCCC	2	8	1792614	1792621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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48617	NC_005835	GAG	2	6	1792877	1792882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48742	NC_005835	GGT	2	6	1797609	1797614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200191
48743	NC_005835	GGA	2	6	1797719	1797724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200192
48744	NC_005835	TCC	2	6	1797749	1797754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200192
48745	NC_005835	G	6	6	1797759	1797764	0 %	0 %	100 %	0 %	46200192
48746	NC_005835	AAG	2	6	1797841	1797846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200192
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48749	NC_005835	CTACCG	2	12	1797954	1797965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46200192
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48752	NC_005835	AGA	2	6	1798082	1798087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200192
48753	NC_005835	CGCCAA	2	12	1798095	1798106	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	46200192
48754	NC_005835	GCG	2	6	1798121	1798126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200192
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48757	NC_005835	GGGCG	2	10	1798341	1798350	0 %	0 %	80 %	20 %	46200192
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48764	NC_005835	TCC	2	6	1798658	1798663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200192
48765	NC_005835	GGA	2	6	1798665	1798670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200192
48766	NC_005835	CGGG	2	8	1798716	1798723	0 %	0 %	75 %	25 %	46200192
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48770	NC_005835	GCGG	2	8	1798857	1798864	0 %	0 %	75 %	25 %	46200192
48771	NC_005835	G	6	6	1798871	1798876	0 %	0 %	100 %	0 %	46200192
48772	NC_005835	C	6	6	1798890	1798895	0 %	0 %	0 %	100 %	46200192
48773	NC_005835	GCGGG	2	10	1798925	1798934	0 %	0 %	80 %	20 %	46200192
48774	NC_005835	ACC	2	6	1798939	1798944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200192
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48776	NC_005835	GAGG	2	8	1799031	1799038	25 %	0 %	75 %	0 %	46200192
48777	NC_005835	GGC	2	6	1799097	1799102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200192
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48788	NC_005835	ACC	2	6	1799407	1799412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200192
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48797	NC_005835	TCC	2	6	1799704	1799709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200193
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48799	NC_005835	AAGG	2	8	1799806	1799813	50 %	0 %	50 %	0 %	46200194
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48802	NC_005835	GCC	2	6	1799863	1799868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200194
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48807	NC_005835	GAG	2	6	1800099	1800104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200194
48808	NC_005835	GGA	2	6	1800111	1800116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200194
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48812	NC_005835	AGG	2	6	1800326	1800331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200194
48813	NC_005835	CCA	2	6	1800345	1800350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200194
48814	NC_005835	TCC	2	6	1800359	1800364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200194
48815	NC_005835	AGG	2	6	1800388	1800393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200194
48816	NC_005835	GGA	2	6	1800452	1800457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48817	NC_005835	GC	4	8	1800467	1800474	0 %	0 %	50 %	50 %	46200195
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48822	NC_005835	TCC	2	6	1800688	1800693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200195
48823	NC_005835	GCG	2	6	1800786	1800791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200195
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48832	NC_005835	G	7	7	1800991	1800997	0 %	0 %	100 %	0 %	46200195
48833	NC_005835	GGGGA	2	10	1800999	1801008	20 %	0 %	80 %	0 %	46200195
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48845	NC_005835	G	6	6	1801333	1801338	0 %	0 %	100 %	0 %	46200195
48846	NC_005835	TGA	2	6	1801342	1801347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200195
48847	NC_005835	CGC	2	6	1801349	1801354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200195
48848	NC_005835	CGC	2	6	1801367	1801372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200195
48849	NC_005835	GAG	3	9	1801395	1801403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200195
48850	NC_005835	CTT	2	6	1801412	1801417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200195
48851	NC_005835	CCT	2	6	1801418	1801423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200195
48852	NC_005835	CCT	2	6	1801442	1801447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200195
48853	NC_005835	AGG	2	6	1801483	1801488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200195
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48855	NC_005835	G	6	6	1801521	1801526	0 %	0 %	100 %	0 %	46200195
48856	NC_005835	GGA	2	6	1801625	1801630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200196
48857	NC_005835	GGC	2	6	1801652	1801657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200196
48858	NC_005835	GGA	2	6	1801676	1801681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200196
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48980	NC_005835	CACC	2	8	1806067	1806074	25 %	0 %	0 %	75 %	46200198
48981	NC_005835	AAGG	2	8	1806182	1806189	50 %	0 %	50 %	0 %	46200198
48982	NC_005835	CTC	2	6	1806227	1806232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200198
48983	NC_005835	GGA	2	6	1806277	1806282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200198
48984	NC_005835	GGA	2	6	1806286	1806291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200198
48985	NC_005835	CTC	2	6	1806353	1806358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200198
48986	NC_005835	GTG	2	6	1806383	1806388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200198
48987	NC_005835	GCCT	2	8	1806390	1806397	0 %	25 %	25 %	50 %	46200198
48988	NC_005835	CGC	2	6	1806412	1806417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200198
48989	NC_005835	AGG	2	6	1806438	1806443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200198
48990	NC_005835	GGT	2	6	1806463	1806468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200198
48991	NC_005835	GGT	2	6	1806517	1806522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200198
48992	NC_005835	CGGCT	2	10	1806572	1806581	0 %	20 %	40 %	40 %	46200198
48993	NC_005835	GGC	2	6	1806706	1806711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200199
48994	NC_005835	CTC	2	6	1806731	1806736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200199
48995	NC_005835	G	6	6	1806799	1806804	0 %	0 %	100 %	0 %	46200199
48996	NC_005835	G	6	6	1806806	1806811	0 %	0 %	100 %	0 %	46200199
48997	NC_005835	TCC	2	6	1806828	1806833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200199
48998	NC_005835	CTC	2	6	1806845	1806850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200199
48999	NC_005835	TGA	2	6	1806855	1806860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200199
49000	NC_005835	GCG	2	6	1806952	1806957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200199

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