MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_005835	TGG	2	6	1614943	1614948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200002
44003	NC_005835	GAG	2	6	1614960	1614965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200002
44004	NC_005835	C	6	6	1615003	1615008	0 %	0 %	0 %	100 %	46200002
44005	NC_005835	C	6	6	1615013	1615018	0 %	0 %	0 %	100 %	46200002
44006	NC_005835	GTG	2	6	1615044	1615049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200002
44007	NC_005835	TTCC	2	8	1615067	1615074	0 %	50 %	0 %	50 %	46200002
44008	NC_005835	GTG	2	6	1615098	1615103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200002
44009	NC_005835	G	6	6	1615103	1615108	0 %	0 %	100 %	0 %	46200002
44010	NC_005835	GGT	2	6	1615133	1615138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200002
44011	NC_005835	TCC	2	6	1615189	1615194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200002
44012	NC_005835	CCA	2	6	1615195	1615200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200002
44013	NC_005835	GCG	2	6	1615221	1615226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200002
44014	NC_005835	AAG	2	6	1615239	1615244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200002
44015	NC_005835	CCG	2	6	1615279	1615284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200002
44016	NC_005835	G	6	6	1615322	1615327	0 %	0 %	100 %	0 %	46200002
44017	NC_005835	CGAG	2	8	1615421	1615428	25 %	0 %	50 %	25 %	46200002
44018	NC_005835	GTG	2	6	1615491	1615496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200002
44019	NC_005835	GCGA	2	8	1615521	1615528	25 %	0 %	50 %	25 %	46200002
44020	NC_005835	CGC	2	6	1615538	1615543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200002
44021	NC_005835	ACCC	2	8	1615608	1615615	25 %	0 %	0 %	75 %	46200002
44022	NC_005835	CGC	2	6	1615622	1615627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200002
44023	NC_005835	TTA	2	6	1615738	1615743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46200002
44024	NC_005835	GCC	2	6	1615824	1615829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200002
44025	NC_005835	CTT	2	6	1615838	1615843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200002
44026	NC_005835	C	6	6	1615873	1615878	0 %	0 %	0 %	100 %	46200002
44027	NC_005835	CCCT	2	8	1615887	1615894	0 %	25 %	0 %	75 %	46200002
44028	NC_005835	AGG	2	6	1615909	1615914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200002
44029	NC_005835	GGC	2	6	1615922	1615927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200002
44030	NC_005835	G	6	6	1616021	1616026	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44031	NC_005835	GGGA	2	8	1616033	1616040	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44032	NC_005835	CGG	2	6	1616065	1616070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200003
44033	NC_005835	CAT	2	6	1616083	1616088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200003
44034	NC_005835	GAG	2	6	1616156	1616161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200003
44035	NC_005835	GGA	2	6	1616164	1616169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200003
44036	NC_005835	AGG	2	6	1616226	1616231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200003
44037	NC_005835	ATG	2	6	1616258	1616263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200003
44038	NC_005835	CTA	2	6	1616287	1616292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200003
44039	NC_005835	CCT	2	6	1616293	1616298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200003
44040	NC_005835	GAG	3	9	1616351	1616359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200003
44041	NC_005835	GGGGAA	2	12	1616389	1616400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200003
44042	NC_005835	GAT	2	6	1616497	1616502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200003
44043	NC_005835	TCCCCG	2	12	1616526	1616537	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46200003
44044	NC_005835	C	6	6	1616624	1616629	0 %	0 %	0 %	100 %	46200003
44045	NC_005835	GAG	2	6	1616660	1616665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200003
44046	NC_005835	GTGGAG	2	12	1616687	1616698	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46200003
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44048	NC_005835	CGG	2	6	1616745	1616750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200003
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44051	NC_005835	G	6	6	1616841	1616846	0 %	0 %	100 %	0 %	46200003
44052	NC_005835	G	7	7	1616860	1616866	0 %	0 %	100 %	0 %	46200003
44053	NC_005835	GGCG	2	8	1616886	1616893	0 %	0 %	75 %	25 %	46200003
44054	NC_005835	TCC	2	6	1616922	1616927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200003
44055	NC_005835	CTA	2	6	1616968	1616973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200003
44056	NC_005835	GAA	2	6	1617031	1617036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200003
44057	NC_005835	GTG	2	6	1617083	1617088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200003
44058	NC_005835	GGAA	2	8	1617089	1617096	50 %	0 %	50 %	0 %	46200003
44059	NC_005835	TCA	2	6	1617177	1617182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200003
44060	NC_005835	GAGG	2	8	1617223	1617230	25 %	0 %	75 %	0 %	46200003
44061	NC_005835	G	8	8	1617250	1617257	0 %	0 %	100 %	0 %	46200004
44062	NC_005835	GGA	2	6	1617332	1617337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
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44064	NC_005835	GGA	2	6	1617395	1617400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
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44066	NC_005835	GAG	2	6	1617471	1617476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
44067	NC_005835	TCG	2	6	1617520	1617525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200004
44068	NC_005835	C	6	6	1617527	1617532	0 %	0 %	0 %	100 %	46200004
44069	NC_005835	G	6	6	1617533	1617538	0 %	0 %	100 %	0 %	46200004
44070	NC_005835	G	6	6	1617601	1617606	0 %	0 %	100 %	0 %	46200004
44071	NC_005835	CGG	2	6	1617642	1617647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200004
44072	NC_005835	CTA	2	6	1617755	1617760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200004
44073	NC_005835	GGA	2	6	1617791	1617796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
44074	NC_005835	GCC	2	6	1617834	1617839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200004
44075	NC_005835	GGA	2	6	1618001	1618006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
44076	NC_005835	GAG	2	6	1618026	1618031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
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44078	NC_005835	AGA	3	9	1618087	1618095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200004
44079	NC_005835	TGG	2	6	1618150	1618155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200004
44080	NC_005835	GGT	2	6	1618166	1618171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200004
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44085	NC_005835	CTC	2	6	1618275	1618280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200004
44086	NC_005835	GGCG	2	8	1618312	1618319	0 %	0 %	75 %	25 %	46200004
44087	NC_005835	G	6	6	1618325	1618330	0 %	0 %	100 %	0 %	46200004
44088	NC_005835	CTTCC	2	10	1618377	1618386	0 %	40 %	0 %	60 %	46200004
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44090	NC_005835	GTG	2	6	1618401	1618406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200004
44091	NC_005835	GGA	2	6	1618430	1618435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200004
44092	NC_005835	GGGC	2	8	1618437	1618444	0 %	0 %	75 %	25 %	46200004
44093	NC_005835	GAA	2	6	1618464	1618469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200004
44094	NC_005835	CAC	2	6	1618479	1618484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200004
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44101	NC_005835	GGT	2	6	1618647	1618652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200005
44102	NC_005835	GCG	2	6	1618665	1618670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200005
44103	NC_005835	AGCCAC	2	12	1618771	1618782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	46200005
44104	NC_005835	CGAGGA	2	12	1618815	1618826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46200005
44105	NC_005835	CAGGGC	2	12	1618912	1618923	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46200005
44106	NC_005835	CTT	2	6	1619010	1619015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200005
44107	NC_005835	C	6	6	1619056	1619061	0 %	0 %	0 %	100 %	46200005
44108	NC_005835	TCA	2	6	1619120	1619125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200005
44109	NC_005835	GAG	2	6	1619192	1619197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200006
44110	NC_005835	GGCCCG	2	12	1619203	1619214	0 %	0 %	50 %	50 %	46200006
44111	NC_005835	CGA	2	6	1619230	1619235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200006
44112	NC_005835	TAT	2	6	1619243	1619248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46200006
44113	NC_005835	GGC	2	6	1619320	1619325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200006
44114	NC_005835	GGA	2	6	1619329	1619334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200006
44115	NC_005835	C	7	7	1619367	1619373	0 %	0 %	0 %	100 %	46200006
44116	NC_005835	GGC	2	6	1619413	1619418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200006
44117	NC_005835	GGAG	2	8	1619434	1619441	25 %	0 %	75 %	0 %	46200007
44118	NC_005835	G	6	6	1619486	1619491	0 %	0 %	100 %	0 %	46200007
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44120	NC_005835	GC	3	6	1619629	1619634	0 %	0 %	50 %	50 %	46200008
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44240	NC_005835	GAA	2	6	1624331	1624336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200011
44241	NC_005835	CTTC	2	8	1624351	1624358	0 %	50 %	0 %	50 %	46200011
44242	NC_005835	C	6	6	1624390	1624395	0 %	0 %	0 %	100 %	46200011
44243	NC_005835	CTT	2	6	1624433	1624438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200011
44244	NC_005835	CCT	2	6	1624478	1624483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200011
44245	NC_005835	CTC	2	6	1624512	1624517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200011
44246	NC_005835	GTCCC	2	10	1624518	1624527	0 %	20 %	20 %	60 %	46200011
44247	NC_005835	TCG	3	9	1624593	1624601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200011
44248	NC_005835	GCG	2	6	1624610	1624615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200011
44249	NC_005835	GGA	2	6	1624618	1624623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200011
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44252	NC_005835	GGTT	2	8	1624794	1624801	0 %	50 %	50 %	0 %	46200011
44253	NC_005835	CCA	2	6	1624811	1624816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200011
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44255	NC_005835	GTG	2	6	1624884	1624889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200011
44256	NC_005835	CCA	3	9	1624891	1624899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200011
44257	NC_005835	GTG	2	6	1624907	1624912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200011
44258	NC_005835	GGA	2	6	1624933	1624938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200011
44259	NC_005835	GT	3	6	1624941	1624946	0 %	50 %	50 %	0 %	46200011
44260	NC_005835	AGA	2	6	1624975	1624980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200011
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44262	NC_005835	GCCTC	2	10	1625024	1625033	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44263	NC_005835	CGAGG	2	10	1625093	1625102	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44264	NC_005835	TGC	2	6	1625221	1625226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200012
44265	NC_005835	AGCC	2	8	1625230	1625237	25 %	0 %	25 %	50 %	46200012
44266	NC_005835	GGA	2	6	1625261	1625266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200012
44267	NC_005835	GGCCTC	2	12	1625313	1625324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46200012
44268	NC_005835	AGG	2	6	1625363	1625368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200012
44269	NC_005835	C	6	6	1625380	1625385	0 %	0 %	0 %	100 %	46200012
44270	NC_005835	G	6	6	1625411	1625416	0 %	0 %	100 %	0 %	46200012
44271	NC_005835	GAG	2	6	1625436	1625441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200012
44272	NC_005835	GGT	2	6	1625514	1625519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200012
44273	NC_005835	TCG	2	6	1625560	1625565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200012
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44280	NC_005835	GCCC	2	8	1625801	1625808	0 %	0 %	25 %	75 %	46200012
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44282	NC_005835	GC	3	6	1625857	1625862	0 %	0 %	50 %	50 %	46200012
44283	NC_005835	CCT	2	6	1625870	1625875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200012
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44293	NC_005835	TCC	2	6	1626157	1626162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200012
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44295	NC_005835	CCTC	2	8	1626194	1626201	0 %	25 %	0 %	75 %	46200012
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44301	NC_005835	C	6	6	1626386	1626391	0 %	0 %	0 %	100 %	46200012
44302	NC_005835	CTT	2	6	1626493	1626498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200012
44303	NC_005835	CCT	2	6	1626499	1626504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200012
44304	NC_005835	G	6	6	1626514	1626519	0 %	0 %	100 %	0 %	46200012
44305	NC_005835	CTT	2	6	1626540	1626545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200012
44306	NC_005835	C	6	6	1626625	1626630	0 %	0 %	0 %	100 %	46200013
44307	NC_005835	C	6	6	1626632	1626637	0 %	0 %	0 %	100 %	46200013
44308	NC_005835	GAG	2	6	1626649	1626654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200013
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44310	NC_005835	GGAC	2	8	1626672	1626679	25 %	0 %	50 %	25 %	46200013
44311	NC_005835	CTC	2	6	1626688	1626693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
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44330	NC_005835	G	6	6	1627226	1627231	0 %	0 %	100 %	0 %	46200013
44331	NC_005835	GGT	2	6	1627236	1627241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200013
44332	NC_005835	GGGA	2	8	1627342	1627349	25 %	0 %	75 %	0 %	46200013
44333	NC_005835	G	7	7	1627350	1627356	0 %	0 %	100 %	0 %	46200013
44334	NC_005835	CTC	2	6	1627369	1627374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
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44339	NC_005835	AGGCG	2	10	1627544	1627553	20 %	0 %	60 %	20 %	46200013
44340	NC_005835	CACC	2	8	1627599	1627606	25 %	0 %	0 %	75 %	46200013
44341	NC_005835	GGC	2	6	1627620	1627625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200013
44342	NC_005835	C	6	6	1627634	1627639	0 %	0 %	0 %	100 %	46200013
44343	NC_005835	CCAG	2	8	1627667	1627674	25 %	0 %	25 %	50 %	46200013
44344	NC_005835	GAG	2	6	1627711	1627716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200013
44345	NC_005835	TGGCG	2	10	1627725	1627734	0 %	20 %	60 %	20 %	46200013
44346	NC_005835	TCC	2	6	1627768	1627773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
44347	NC_005835	CCT	2	6	1627779	1627784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
44348	NC_005835	GAG	2	6	1627795	1627800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200013
44349	NC_005835	TCC	2	6	1627820	1627825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
44350	NC_005835	GAA	2	6	1627884	1627889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200013
44351	NC_005835	GTG	2	6	1627957	1627962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200013
44352	NC_005835	GGA	2	6	1627977	1627982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200013
44353	NC_005835	CCT	2	6	1627998	1628003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
44354	NC_005835	CGGG	2	8	1628031	1628038	0 %	0 %	75 %	25 %	46200013
44355	NC_005835	GAAG	2	8	1628091	1628098	50 %	0 %	50 %	0 %	46200013
44356	NC_005835	G	6	6	1628098	1628103	0 %	0 %	100 %	0 %	46200013
44357	NC_005835	CCG	2	6	1628154	1628159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200013
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44359	NC_005835	TCC	2	6	1628201	1628206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200013
44360	NC_005835	GGA	3	9	1628232	1628240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200013
44361	NC_005835	ACCT	2	8	1628278	1628285	25 %	25 %	0 %	50 %	46200013
44362	NC_005835	GCCT	2	8	1628287	1628294	0 %	25 %	25 %	50 %	46200013
44363	NC_005835	GGGC	2	8	1628311	1628318	0 %	0 %	75 %	25 %	46200013
44364	NC_005835	TCGCCC	2	12	1628369	1628380	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46200013
44365	NC_005835	GAG	2	6	1628407	1628412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200013
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44402	NC_005835	GGTGCG	2	12	1629505	1629516	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46200014
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44406	NC_005835	CCCTC	2	10	1629620	1629629	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
44407	NC_005835	GCCAG	2	10	1629650	1629659	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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44466	NC_005835	GGCCC	2	10	1631697	1631706	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44467	NC_005835	GCG	2	6	1631743	1631748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200017
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44473	NC_005835	C	6	6	1631997	1632002	0 %	0 %	0 %	100 %	46200017
44474	NC_005835	GGT	2	6	1632059	1632064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200017
44475	NC_005835	AGCTCC	2	12	1632130	1632141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46200017
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44477	NC_005835	CCCGGG	2	12	1632269	1632280	0 %	0 %	50 %	50 %	46200017
44478	NC_005835	GAA	2	6	1632282	1632287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200017
44479	NC_005835	CCA	2	6	1632314	1632319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200017
44480	NC_005835	C	6	6	1632371	1632376	0 %	0 %	0 %	100 %	46200017
44481	NC_005835	GAA	2	6	1632462	1632467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200017
44482	NC_005835	GTA	2	6	1632474	1632479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200017
44483	NC_005835	GTG	2	6	1632484	1632489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200017
44484	NC_005835	GGC	2	6	1632545	1632550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200017
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44486	NC_005835	CCT	2	6	1632692	1632697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200017
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44491	NC_005835	G	6	6	1632802	1632807	0 %	0 %	100 %	0 %	46200017
44492	NC_005835	GTC	2	6	1632882	1632887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200017
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