MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_005835	GCC	2	6	709867	709872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199032
19502	NC_005835	GGT	2	6	709875	709880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199032
19503	NC_005835	ACG	2	6	709940	709945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46199032
19504	NC_005835	CGC	2	6	709980	709985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199032
19505	NC_005835	GTG	2	6	710005	710010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199032
19506	NC_005835	CCCCG	2	10	710011	710020	0 %	0 %	20 %	80 %	46199032
19507	NC_005835	ACGGGG	2	12	710090	710101	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46199032
19508	NC_005835	CCT	2	6	710129	710134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19509	NC_005835	CACC	2	8	710170	710177	25 %	0 %	0 %	75 %	46199033
19510	NC_005835	GTG	2	6	710189	710194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199033
19511	NC_005835	CCT	2	6	710227	710232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199033
19512	NC_005835	GGT	2	6	710242	710247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199033
19513	NC_005835	CGC	2	6	710256	710261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199033
19514	NC_005835	TCC	2	6	710313	710318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199033
19515	NC_005835	GGCGGT	2	12	710335	710346	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46199033
19516	NC_005835	GGA	2	6	710347	710352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199033
19517	NC_005835	TTC	2	6	710357	710362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46199033
19518	NC_005835	TGGGC	2	10	710391	710400	0 %	20 %	60 %	20 %	46199033
19519	NC_005835	GGC	2	6	710419	710424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199033
19520	NC_005835	CGC	2	6	710497	710502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199033
19521	NC_005835	AGG	3	9	710505	710513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199033
19522	NC_005835	AGG	2	6	710547	710552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199033
19523	NC_005835	GGA	2	6	710761	710766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199034
19524	NC_005835	TCC	2	6	710796	710801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199034
19525	NC_005835	CTC	2	6	710855	710860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199034
19526	NC_005835	CCA	3	9	710863	710871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199034
19527	NC_005835	TGGCGG	2	12	710884	710895	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46199034
19528	NC_005835	ACC	2	6	710907	710912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199034
19529	NC_005835	GGA	2	6	710935	710940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199034
19530	NC_005835	GAG	2	6	711002	711007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199034
19531	NC_005835	TTC	2	6	711009	711014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46199034
19532	NC_005835	GTCC	2	8	711038	711045	0 %	25 %	25 %	50 %	46199034
19533	NC_005835	GCG	2	6	711050	711055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199034
19534	NC_005835	CGG	2	6	711112	711117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199034
19535	NC_005835	TCC	2	6	711138	711143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199034
19536	NC_005835	TGA	2	6	711151	711156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46199034
19537	NC_005835	CCGAGG	2	12	711321	711332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46199035
19538	NC_005835	CGC	3	9	711367	711375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199035
19539	NC_005835	AAG	2	6	711395	711400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46199035
19540	NC_005835	GGT	2	6	711412	711417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199035
19541	NC_005835	GAG	2	6	711530	711535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199035
19542	NC_005835	GGA	2	6	711550	711555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199035
19543	NC_005835	G	6	6	711568	711573	0 %	0 %	100 %	0 %	46199035
19544	NC_005835	CCT	2	6	711634	711639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199035
19545	NC_005835	GAG	2	6	711692	711697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199035
19546	NC_005835	CGGGGC	2	12	711781	711792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199035
19547	NC_005835	TGG	2	6	711801	711806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199035
19548	NC_005835	GGC	2	6	711823	711828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199035
19549	NC_005835	CCCG	2	8	711830	711837	0 %	0 %	25 %	75 %	46199035
19550	NC_005835	CGG	2	6	711846	711851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199035
19551	NC_005835	CGC	2	6	711871	711876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199035
19552	NC_005835	CCA	2	6	711903	711908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199035
19553	NC_005835	CCT	2	6	711952	711957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199035
19554	NC_005835	CAG	2	6	711971	711976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46199035
19555	NC_005835	CGC	2	6	712009	712014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199035
19556	NC_005835	CGCC	2	8	712108	712115	0 %	0 %	25 %	75 %	46199035
19557	NC_005835	CCT	2	6	712146	712151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199035
19558	NC_005835	GGC	2	6	712180	712185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199035
19559	NC_005835	CTA	2	6	712189	712194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46199035
19560	NC_005835	CGA	2	6	712201	712206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46199035
19561	NC_005835	GGA	2	6	712225	712230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199035
19562	NC_005835	CCACG	2	10	712267	712276	20 %	0 %	20 %	60 %	46199035
19563	NC_005835	CGG	2	6	712320	712325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199035
19564	NC_005835	TCC	2	6	712347	712352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199035
19565	NC_005835	CGAGCC	2	12	712381	712392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46199035
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19567	NC_005835	CCCA	2	8	712535	712542	25 %	0 %	0 %	75 %	46199036
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19570	NC_005835	GTC	3	9	712636	712644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199036
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19573	NC_005835	CGT	2	6	712765	712770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199036
19574	NC_005835	CCA	2	6	712776	712781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199036
19575	NC_005835	C	6	6	712846	712851	0 %	0 %	0 %	100 %	46199036
19576	NC_005835	GAG	3	9	712879	712887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199036
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19580	NC_005835	CCTCC	2	10	713038	713047	0 %	20 %	0 %	80 %	46199037
19581	NC_005835	CAC	3	9	713074	713082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199037
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19585	NC_005835	CGTGG	2	10	713254	713263	0 %	20 %	60 %	20 %	46199037
19586	NC_005835	GAAG	2	8	713307	713314	50 %	0 %	50 %	0 %	46199037
19587	NC_005835	TCG	2	6	713363	713368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199037
19588	NC_005835	G	6	6	713368	713373	0 %	0 %	100 %	0 %	46199037
19589	NC_005835	GAA	2	6	713422	713427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46199037
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19592	NC_005835	GC	3	6	713495	713500	0 %	0 %	50 %	50 %	46199037
19593	NC_005835	CCT	2	6	713643	713648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199037
19594	NC_005835	CGGCC	2	10	713709	713718	0 %	0 %	40 %	60 %	46199037
19595	NC_005835	GGT	2	6	713749	713754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199037
19596	NC_005835	CTCCC	2	10	713760	713769	0 %	20 %	0 %	80 %	46199038
19597	NC_005835	C	6	6	713801	713806	0 %	0 %	0 %	100 %	46199038
19598	NC_005835	TGA	2	6	713819	713824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46199038
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19601	NC_005835	GGC	2	6	713862	713867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199038
19602	NC_005835	GAT	2	6	713901	713906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46199038
19603	NC_005835	CCT	2	6	713945	713950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199038
19604	NC_005835	CGGCGT	2	12	713981	713992	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46199038
19605	NC_005835	AGG	2	6	714079	714084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199038
19606	NC_005835	GCA	2	6	714101	714106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46199038
19607	NC_005835	C	6	6	714107	714112	0 %	0 %	0 %	100 %	46199038
19608	NC_005835	CCCCG	2	10	714117	714126	0 %	0 %	20 %	80 %	46199038
19609	NC_005835	TGCC	2	8	714139	714146	0 %	25 %	25 %	50 %	46199038
19610	NC_005835	CGG	2	6	714164	714169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199038
19611	NC_005835	CAGG	2	8	714200	714207	25 %	0 %	50 %	25 %	46199038
19612	NC_005835	C	6	6	714247	714252	0 %	0 %	0 %	100 %	46199038
19613	NC_005835	GGC	2	6	714278	714283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199038
19614	NC_005835	CCT	2	6	714311	714316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199038
19615	NC_005835	CAT	2	6	714345	714350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46199038
19616	NC_005835	CAC	2	6	714369	714374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199038
19617	NC_005835	GGT	2	6	714393	714398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199038
19618	NC_005835	TGG	2	6	714434	714439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199038
19619	NC_005835	GAG	2	6	714489	714494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199038
19620	NC_005835	TCC	3	9	714532	714540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199038
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19998	NC_005835	GGC	2	6	728022	728027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199050
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