MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_005835	AAG	2	6	603962	603967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198930
16503	NC_005835	CCT	2	6	603974	603979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16504	NC_005835	GGA	2	6	603989	603994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16505	NC_005835	GAG	2	6	604020	604025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16506	NC_005835	GAG	2	6	604128	604133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16507	NC_005835	CCT	2	6	604142	604147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16508	NC_005835	GGA	2	6	604181	604186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16509	NC_005835	CGC	2	6	604202	604207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198930
16510	NC_005835	G	6	6	604241	604246	0 %	0 %	100 %	0 %	46198930
16511	NC_005835	CTT	2	6	604286	604291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198930
16512	NC_005835	AGG	2	6	604312	604317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16513	NC_005835	TGGCCG	2	12	604354	604365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198930
16514	NC_005835	GGA	3	9	604472	604480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16515	NC_005835	ACC	2	6	604489	604494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198930
16516	NC_005835	TCC	2	6	604528	604533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16517	NC_005835	CTC	3	9	604560	604568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16518	NC_005835	CCT	2	6	604571	604576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16519	NC_005835	GC	3	6	604601	604606	0 %	0 %	50 %	50 %	46198930
16520	NC_005835	CG	3	6	604607	604612	0 %	0 %	50 %	50 %	46198930
16521	NC_005835	CCT	2	6	604613	604618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16522	NC_005835	G	7	7	604647	604653	0 %	0 %	100 %	0 %	46198930
16523	NC_005835	G	6	6	604671	604676	0 %	0 %	100 %	0 %	46198930
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16527	NC_005835	GAG	2	6	604893	604898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16528	NC_005835	CTA	2	6	604904	604909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198930
16529	NC_005835	GGA	2	6	604946	604951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16530	NC_005835	GGA	2	6	604985	604990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
16531	NC_005835	GTCC	2	8	605003	605010	0 %	25 %	25 %	50 %	46198930
16532	NC_005835	CGAGGC	2	12	605024	605035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198930
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16541	NC_005835	CCT	2	6	605270	605275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198930
16542	NC_005835	GAG	2	6	605304	605309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
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16545	NC_005835	TCCC	2	8	605442	605449	0 %	25 %	0 %	75 %	46198930
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16551	NC_005835	AGG	2	6	605563	605568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198930
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16553	NC_005835	CCCTGC	2	12	605665	605676	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198930
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16561	NC_005835	TTCT	2	8	605900	605907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16562	NC_005835	C	6	6	605908	605913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16563	NC_005835	CCCCGC	2	12	605925	605936	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
16564	NC_005835	CTA	2	6	605949	605954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_005835	AGG	2	6	605969	605974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_005835	CGA	2	6	606057	606062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198931
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16570	NC_005835	CTC	3	9	606190	606198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198931
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16594	NC_005835	CCA	2	6	607127	607132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198931
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16713	NC_005835	GAG	2	6	611000	611005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198934
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16715	NC_005835	ACC	2	6	611057	611062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16716	NC_005835	CCCAGG	2	12	611079	611090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16717	NC_005835	GCC	2	6	611141	611146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198935
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16721	NC_005835	GCC	2	6	611255	611260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198935
16722	NC_005835	CCT	3	9	611275	611283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198935
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16729	NC_005835	CTC	2	6	611414	611419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198935
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16731	NC_005835	CGCC	2	8	611491	611498	0 %	0 %	25 %	75 %	46198935
16732	NC_005835	GCCTCC	2	12	611544	611555	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198935
16733	NC_005835	CGC	2	6	611557	611562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198935
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16735	NC_005835	GTG	2	6	611603	611608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198935
16736	NC_005835	GGGAG	2	10	611622	611631	20 %	0 %	80 %	0 %	46198935
16737	NC_005835	C	7	7	611676	611682	0 %	0 %	0 %	100 %	46198935
16738	NC_005835	G	6	6	611727	611732	0 %	0 %	100 %	0 %	46198935
16739	NC_005835	GGT	2	6	611734	611739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198935
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16742	NC_005835	GGC	2	6	611856	611861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198935
16743	NC_005835	GAG	2	6	611906	611911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198935
16744	NC_005835	GCG	2	6	611912	611917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198935
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16746	NC_005835	CGC	2	6	612004	612009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198935
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16869	NC_005835	ACG	2	6	616265	616270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198937
16870	NC_005835	TCC	2	6	616298	616303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198937
16871	NC_005835	GGA	3	9	616323	616331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198937
16872	NC_005835	TGA	2	6	616340	616345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198937
16873	NC_005835	AAG	2	6	616396	616401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198937
16874	NC_005835	CAC	2	6	616423	616428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198937
16875	NC_005835	ACG	2	6	616517	616522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198937
16876	NC_005835	GGT	2	6	616617	616622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198937
16877	NC_005835	GAG	2	6	616648	616653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198937
16878	NC_005835	GGC	2	6	616683	616688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198938
16879	NC_005835	CTC	2	6	616695	616700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198938
16880	NC_005835	GCCC	2	8	616707	616714	0 %	0 %	25 %	75 %	46198938
16881	NC_005835	C	6	6	616712	616717	0 %	0 %	0 %	100 %	46198938
16882	NC_005835	GCC	2	6	616750	616755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198938
16883	NC_005835	C	6	6	616799	616804	0 %	0 %	0 %	100 %	46198938
16884	NC_005835	C	6	6	616806	616811	0 %	0 %	0 %	100 %	46198938
16885	NC_005835	GAG	3	9	616821	616829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198938
16886	NC_005835	GAG	2	6	616833	616838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198938
16887	NC_005835	CCG	2	6	616841	616846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198938
16888	NC_005835	CCA	2	6	616874	616879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198938
16889	NC_005835	CCCGCA	2	12	616880	616891	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198938
16890	NC_005835	GGGA	2	8	616968	616975	25 %	0 %	75 %	0 %	46198938
16891	NC_005835	GGC	2	6	616976	616981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198938
16892	NC_005835	AGG	2	6	617011	617016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198938
16893	NC_005835	TCC	2	6	617023	617028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198938
16894	NC_005835	CCCG	2	8	617051	617058	0 %	0 %	25 %	75 %	46198938
16895	NC_005835	AAG	2	6	617124	617129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198938
16896	NC_005835	CCT	2	6	617147	617152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198938
16897	NC_005835	GGC	2	6	617160	617165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198938
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16899	NC_005835	GACG	2	8	617309	617316	25 %	0 %	50 %	25 %	46198938
16900	NC_005835	TCC	2	6	617407	617412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198938
16901	NC_005835	AAG	2	6	617425	617430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198938
16902	NC_005835	AGCCG	2	10	617441	617450	20 %	0 %	40 %	40 %	46198938
16903	NC_005835	GCC	2	6	617481	617486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198938
16904	NC_005835	CCA	2	6	617534	617539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198938
16905	NC_005835	CCA	2	6	617573	617578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198938
16906	NC_005835	TAT	2	6	617585	617590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46198939
16907	NC_005835	CTC	3	9	617629	617637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198939
16908	NC_005835	CTC	2	6	617656	617661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198939
16909	NC_005835	GCC	2	6	617675	617680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198939
16910	NC_005835	CCCGAG	2	12	617683	617694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198939
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16915	NC_005835	CGC	2	6	617844	617849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198939
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16917	NC_005835	CCTG	2	8	617937	617944	0 %	25 %	25 %	50 %	46198939
16918	NC_005835	GGGAGG	2	12	617981	617992	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198939
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16920	NC_005835	CGC	2	6	618114	618119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198939
16921	NC_005835	G	6	6	618122	618127	0 %	0 %	100 %	0 %	46198939
16922	NC_005835	GAG	2	6	618139	618144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198939
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16924	NC_005835	CTGG	2	8	618159	618166	0 %	25 %	50 %	25 %	46198939
16925	NC_005835	ACC	2	6	618167	618172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198939
16926	NC_005835	G	6	6	618176	618181	0 %	0 %	100 %	0 %	46198939
16927	NC_005835	GCC	2	6	618199	618204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198939
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16929	NC_005835	GGT	2	6	618282	618287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198939
16930	NC_005835	GGA	2	6	618327	618332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198939
16931	NC_005835	CTTC	2	8	618345	618352	0 %	50 %	0 %	50 %	46198939
16932	NC_005835	CTC	2	6	618372	618377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198939
16933	NC_005835	CTGGC	2	10	618394	618403	0 %	20 %	40 %	40 %	46198939
16934	NC_005835	CAC	2	6	618471	618476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198939
16935	NC_005835	AGG	2	6	618633	618638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16936	NC_005835	GAG	2	6	618684	618689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198940
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16941	NC_005835	CTG	2	6	618849	618854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198940
16942	NC_005835	GAAG	2	8	618864	618871	50 %	0 %	50 %	0 %	46198940
16943	NC_005835	TCC	2	6	618880	618885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198940
16944	NC_005835	CCT	2	6	618938	618943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198940
16945	NC_005835	ACG	2	6	618961	618966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198940
16946	NC_005835	C	6	6	619028	619033	0 %	0 %	0 %	100 %	46198940
16947	NC_005835	GCC	2	6	619068	619073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198940
16948	NC_005835	CCT	2	6	619151	619156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198940
16949	NC_005835	GCG	2	6	619181	619186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198940
16950	NC_005835	GAC	2	6	619265	619270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198941
16951	NC_005835	TCC	2	6	619287	619292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16952	NC_005835	CGCC	2	8	619330	619337	0 %	0 %	25 %	75 %	46198941
16953	NC_005835	GCCCC	2	10	619370	619379	0 %	0 %	20 %	80 %	46198941
16954	NC_005835	CTC	3	9	619469	619477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16955	NC_005835	CGG	2	6	619479	619484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198941
16956	NC_005835	CGA	2	6	619528	619533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198941
16957	NC_005835	GCTCCG	2	12	619564	619575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198941
16958	NC_005835	GGC	2	6	619599	619604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198941
16959	NC_005835	GGA	2	6	619618	619623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198941
16960	NC_005835	CTC	2	6	619637	619642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16961	NC_005835	CCT	2	6	619714	619719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16962	NC_005835	GAG	3	9	619745	619753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198941
16963	NC_005835	CTC	2	6	619778	619783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16964	NC_005835	ACG	2	6	619785	619790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198941
16965	NC_005835	TCC	2	6	619818	619823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16966	NC_005835	GGC	2	6	619854	619859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198941
16967	NC_005835	CAC	2	6	619943	619948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198941
16968	NC_005835	CCT	2	6	619996	620001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198941
16969	NC_005835	GCC	2	6	620018	620023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198941
16970	NC_005835	ACG	2	6	620031	620036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198941
16971	NC_005835	GGGAG	2	10	620112	620121	20 %	0 %	80 %	0 %	46198941
16972	NC_005835	C	6	6	620228	620233	0 %	0 %	0 %	100 %	46198942
16973	NC_005835	CGC	2	6	620260	620265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198942
16974	NC_005835	G	6	6	620278	620283	0 %	0 %	100 %	0 %	46198942
16975	NC_005835	CGT	2	6	620296	620301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198942
16976	NC_005835	GGC	2	6	620375	620380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198942
16977	NC_005835	CCT	4	12	620416	620427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16978	NC_005835	TCC	2	6	620466	620471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16979	NC_005835	AGG	2	6	620478	620483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198942
16980	NC_005835	GAA	2	6	620519	620524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198942
16981	NC_005835	CCTCC	2	10	620536	620545	0 %	20 %	0 %	80 %	46198942
16982	NC_005835	TCC	2	6	620577	620582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16983	NC_005835	GGC	2	6	620606	620611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198942
16984	NC_005835	CGTC	2	8	620632	620639	0 %	25 %	25 %	50 %	46198942
16985	NC_005835	TCC	2	6	620640	620645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16986	NC_005835	GGC	2	6	620738	620743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198942
16987	NC_005835	TCC	2	6	620787	620792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16988	NC_005835	GTCGGC	2	12	620807	620818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198942
16989	NC_005835	GCCCC	2	10	620835	620844	0 %	0 %	20 %	80 %	46198942
16990	NC_005835	GCC	2	6	620877	620882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198942
16991	NC_005835	TCC	2	6	620946	620951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16992	NC_005835	CGG	2	6	620971	620976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198942
16993	NC_005835	GGA	2	6	620989	620994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198942
16994	NC_005835	G	6	6	621009	621014	0 %	0 %	100 %	0 %	46198942
16995	NC_005835	C	6	6	621015	621020	0 %	0 %	0 %	100 %	46198942
16996	NC_005835	CTC	2	6	621065	621070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16997	NC_005835	CGC	2	6	621098	621103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198942
16998	NC_005835	CCT	2	6	621250	621255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198942
16999	NC_005835	CCCTC	2	10	621298	621307	0 %	20 %	0 %	80 %	46198942
17000	NC_005835	CAGG	2	8	621426	621433	25 %	0 %	50 %	25 %	46198942

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