MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_005835	G	6	6	548231	548236	0 %	0 %	100 %	0 %	46198870
15003	NC_005835	GTG	2	6	548254	548259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198870
15004	NC_005835	GAG	2	6	548394	548399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198870
15005	NC_005835	CTC	2	6	548460	548465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198870
15006	NC_005835	GAG	2	6	548496	548501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198870
15007	NC_005835	CGG	2	6	548533	548538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198870
15008	NC_005835	GCCT	2	8	548566	548573	0 %	25 %	25 %	50 %	46198870
15009	NC_005835	CCGCCT	2	12	548612	548623	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198870
15010	NC_005835	CCA	2	6	548699	548704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198870
15011	NC_005835	CGG	2	6	548719	548724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198870
15012	NC_005835	CCA	2	6	548756	548761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198870
15013	NC_005835	TCC	2	6	548764	548769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198870
15014	NC_005835	G	6	6	548783	548788	0 %	0 %	100 %	0 %	46198870
15015	NC_005835	GAG	3	9	548799	548807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198870
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15017	NC_005835	CCCT	2	8	548865	548872	0 %	25 %	0 %	75 %	46198870
15018	NC_005835	GGC	2	6	548907	548912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198870
15019	NC_005835	CAC	2	6	548943	548948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198870
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15021	NC_005835	GC	3	6	549004	549009	0 %	0 %	50 %	50 %	46198870
15022	NC_005835	TCC	2	6	549023	549028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198871
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15024	NC_005835	GGC	2	6	549121	549126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198871
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15026	NC_005835	CCCA	2	8	549188	549195	25 %	0 %	0 %	75 %	46198871
15027	NC_005835	CCA	2	6	549198	549203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198871
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15033	NC_005835	GCG	2	6	549461	549466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198871
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15036	NC_005835	GCGCC	2	10	549660	549669	0 %	0 %	40 %	60 %	46198871
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15039	NC_005835	GAG	2	6	549832	549837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198871
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15041	NC_005835	CCA	2	6	549885	549890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198871
15042	NC_005835	ACC	2	6	549926	549931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198871
15043	NC_005835	AGG	2	6	549938	549943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198871
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15050	NC_005835	GGAG	2	8	550303	550310	25 %	0 %	75 %	0 %	46198872
15051	NC_005835	GAA	2	6	550342	550347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198872
15052	NC_005835	TCCGTG	2	12	550361	550372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198872
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15054	NC_005835	CCT	2	6	550476	550481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198872
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15056	NC_005835	GTA	2	6	550525	550530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198872
15057	NC_005835	TCC	2	6	550541	550546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198872
15058	NC_005835	CGC	2	6	550570	550575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198872
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15060	NC_005835	CGG	2	6	550671	550676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198872
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15062	NC_005835	AAG	2	6	550729	550734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198872
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15065	NC_005835	TCG	2	6	550778	550783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198872
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15093	NC_005835	TGG	2	6	551819	551824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198873
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15107	NC_005835	TTG	2	6	552532	552537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_005835	C	6	6	552598	552603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15109	NC_005835	GAA	2	6	552725	552730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198875
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15111	NC_005835	CCT	2	6	552848	552853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198875
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15119	NC_005835	GAA	2	6	553147	553152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_005835	CCT	2	6	553187	553192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15121	NC_005835	TAG	2	6	553196	553201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198876
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15123	NC_005835	G	6	6	553273	553278	0 %	0 %	100 %	0 %	46198876
15124	NC_005835	CGT	2	6	553287	553292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198876
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15134	NC_005835	GTA	2	6	553609	553614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198876
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15145	NC_005835	GCC	2	6	554076	554081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198876
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15152	NC_005835	GCCCC	2	10	554373	554382	0 %	0 %	20 %	80 %	46198877
15153	NC_005835	GGA	2	6	554402	554407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198877
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15155	NC_005835	TGC	2	6	554444	554449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198877
15156	NC_005835	GTC	2	6	554463	554468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198877
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15188	NC_005835	GGCG	2	8	555792	555799	0 %	0 %	75 %	25 %	46198878
15189	NC_005835	ATC	2	6	555824	555829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198878
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15191	NC_005835	GAG	2	6	555868	555873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198879
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15210	NC_005835	GGAGG	2	10	556646	556655	20 %	0 %	80 %	0 %	46198880
15211	NC_005835	AGG	2	6	556657	556662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198880
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15218	NC_005835	GAG	3	9	556914	556922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15219	NC_005835	AAAG	2	8	557052	557059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15220	NC_005835	CAC	3	9	557067	557075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15221	NC_005835	AGG	2	6	557104	557109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15222	NC_005835	ACC	2	6	557140	557145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15223	NC_005835	G	7	7	557209	557215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15224	NC_005835	GGC	2	6	557228	557233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15225	NC_005835	GC	3	6	557239	557244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15226	NC_005835	AGG	2	6	557257	557262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15227	NC_005835	GCC	2	6	557359	557364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15228	NC_005835	GGGC	2	8	557424	557431	0 %	0 %	75 %	25 %	46198881
15229	NC_005835	GGA	2	6	557446	557451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
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15231	NC_005835	GGA	2	6	557596	557601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
15232	NC_005835	GGA	3	9	557659	557667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
15233	NC_005835	GCC	2	6	557683	557688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198881
15234	NC_005835	C	6	6	557695	557700	0 %	0 %	0 %	100 %	46198881
15235	NC_005835	GGA	2	6	557704	557709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
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15240	NC_005835	CTCC	2	8	557810	557817	0 %	25 %	0 %	75 %	46198881
15241	NC_005835	AGG	3	9	557853	557861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
15242	NC_005835	AGGGCC	3	18	557880	557897	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198881
15243	NC_005835	CTG	2	6	557903	557908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198881
15244	NC_005835	GAGG	2	8	557921	557928	25 %	0 %	75 %	0 %	46198881
15245	NC_005835	G	6	6	557932	557937	0 %	0 %	100 %	0 %	46198881
15246	NC_005835	CCAG	2	8	557968	557975	25 %	0 %	25 %	50 %	46198881
15247	NC_005835	AGG	2	6	558045	558050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
15248	NC_005835	AGG	2	6	558084	558089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
15249	NC_005835	GCGCC	2	10	558116	558125	0 %	0 %	40 %	60 %	46198881
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15251	NC_005835	ACC	2	6	558141	558146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198881
15252	NC_005835	GAG	3	9	558161	558169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198881
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15290	NC_005835	GGGCCA	2	12	559559	559570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198883
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15294	NC_005835	AG	3	6	559803	559808	50 %	0 %	50 %	0 %	46198883
15295	NC_005835	GCA	2	6	559864	559869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15299	NC_005835	CCT	2	6	560023	560028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15300	NC_005835	CGCCT	2	10	560063	560072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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15321	NC_005835	CCT	2	6	561124	561129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198885
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15341	NC_005835	GGA	2	6	561900	561905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198886
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15351	NC_005835	C	6	6	562290	562295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15352	NC_005835	GCCC	2	8	562299	562306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15353	NC_005835	CTC	2	6	562403	562408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
15354	NC_005835	CCCGGG	2	12	562423	562434	0 %	0 %	50 %	50 %	46198887
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15361	NC_005835	CCTC	2	8	562651	562658	0 %	25 %	0 %	75 %	46198887
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15364	NC_005835	AGGGCC	2	12	562809	562820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198887
15365	NC_005835	CTC	2	6	562823	562828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
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15367	NC_005835	CCT	2	6	562840	562845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
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15369	NC_005835	GAG	2	6	562865	562870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15370	NC_005835	AGG	2	6	562989	562994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15371	NC_005835	AGG	2	6	563016	563021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15372	NC_005835	CCT	2	6	563032	563037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
15373	NC_005835	CCT	2	6	563044	563049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
15374	NC_005835	AGG	3	9	563052	563060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15375	NC_005835	TCC	2	6	563088	563093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
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15378	NC_005835	GGA	2	6	563164	563169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
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15380	NC_005835	AGG	2	6	563190	563195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
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15382	NC_005835	CTC	2	6	563240	563245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198887
15383	NC_005835	CT	3	6	563277	563282	0 %	50 %	0 %	50 %	46198887
15384	NC_005835	GGA	2	6	563290	563295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15385	NC_005835	C	6	6	563337	563342	0 %	0 %	0 %	100 %	46198887
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15396	NC_005835	CCAGGG	2	12	563581	563592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198887
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15399	NC_005835	G	6	6	563638	563643	0 %	0 %	100 %	0 %	46198887
15400	NC_005835	GGC	2	6	563657	563662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198887
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15402	NC_005835	AGG	2	6	563745	563750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15403	NC_005835	G	6	6	563758	563763	0 %	0 %	100 %	0 %	46198887
15404	NC_005835	GGA	2	6	563767	563772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
15405	NC_005835	AGG	2	6	563805	563810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198887
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15407	NC_005835	GCGGA	2	10	563952	563961	20 %	0 %	60 %	20 %	46198888
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15412	NC_005835	C	6	6	564098	564103	0 %	0 %	0 %	100 %	46198889
15413	NC_005835	GAG	2	6	564122	564127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198889
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15416	NC_005835	CGTC	2	8	564472	564479	0 %	25 %	25 %	50 %	46198889
15417	NC_005835	CCT	2	6	564577	564582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198889
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15419	NC_005835	GGA	2	6	564649	564654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198889
15420	NC_005835	CGG	2	6	564673	564678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198889
15421	NC_005835	G	6	6	564692	564697	0 %	0 %	100 %	0 %	46198889
15422	NC_005835	CCA	2	6	564769	564774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198889
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15424	NC_005835	CTT	2	6	564790	564795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15425	NC_005835	GCG	2	6	564812	564817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198890
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15433	NC_005835	AGGT	2	8	565067	565074	25 %	25 %	50 %	0 %	46198890
15434	NC_005835	GGC	2	6	565087	565092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198890
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15441	NC_005835	GGCG	2	8	565503	565510	0 %	0 %	75 %	25 %	46198890
15442	NC_005835	GTG	2	6	565525	565530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198890
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15446	NC_005835	GAA	2	6	565594	565599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198890
15447	NC_005835	CGT	2	6	565614	565619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198890
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15449	NC_005835	AG	3	6	565647	565652	50 %	0 %	50 %	0 %	46198890
15450	NC_005835	CGA	2	6	565656	565661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198890
15451	NC_005835	CCAGGG	2	12	565665	565676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198890
15452	NC_005835	GAG	3	9	565678	565686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198890
15453	NC_005835	AGA	2	6	565716	565721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198890
15454	NC_005835	GAG	2	6	565726	565731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198890
15455	NC_005835	AGG	2	6	565736	565741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198890
15456	NC_005835	TCC	2	6	565926	565931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198891
15457	NC_005835	CTG	2	6	566018	566023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198891
15458	NC_005835	GCC	2	6	566040	566045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198891
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15460	NC_005835	AGG	2	6	566089	566094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198891
15461	NC_005835	CCTCC	2	10	566149	566158	0 %	20 %	0 %	80 %	46198891
15462	NC_005835	GAG	2	6	566273	566278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198891
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15466	NC_005835	CTCCAC	2	12	566318	566329	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46198891
15467	NC_005835	CAC	2	6	566351	566356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198891
15468	NC_005835	GCC	2	6	566391	566396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198892
15469	NC_005835	CCG	2	6	566425	566430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198892
15470	NC_005835	CGG	2	6	566434	566439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198892
15471	NC_005835	C	7	7	566461	566467	0 %	0 %	0 %	100 %	46198892
15472	NC_005835	CGG	2	6	566553	566558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198892
15473	NC_005835	GCC	2	6	566565	566570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198892
15474	NC_005835	GGA	2	6	566656	566661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198892
15475	NC_005835	TCC	2	6	566692	566697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198892
15476	NC_005835	CCT	2	6	566770	566775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198892
15477	NC_005835	GCC	2	6	566809	566814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198892
15478	NC_005835	AGG	3	9	566832	566840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198892
15479	NC_005835	CCG	2	6	566841	566846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198892
15480	NC_005835	GAG	2	6	566927	566932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198892
15481	NC_005835	TCC	2	6	567000	567005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198892
15482	NC_005835	GTG	2	6	567021	567026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198892
15483	NC_005835	AAG	2	6	567044	567049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198892
15484	NC_005835	CCA	2	6	567076	567081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198892
15485	NC_005835	CTG	2	6	567113	567118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198892
15486	NC_005835	CAC	2	6	567122	567127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198892
15487	NC_005835	CCT	2	6	567148	567153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198892
15488	NC_005835	GCTC	2	8	567260	567267	0 %	25 %	25 %	50 %	46198893
15489	NC_005835	GCC	2	6	567319	567324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198893
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15491	NC_005835	T	7	7	567421	567427	0 %	100 %	0 %	0 %	46198893
15492	NC_005835	C	6	6	567428	567433	0 %	0 %	0 %	100 %	46198893
15493	NC_005835	CCT	2	6	567461	567466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198893
15494	NC_005835	GAG	2	6	567492	567497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198893
15495	NC_005835	CCG	2	6	567520	567525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198893
15496	NC_005835	CGG	2	6	567586	567591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198893
15497	NC_005835	TCC	2	6	567634	567639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198893
15498	NC_005835	CAT	2	6	567663	567668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198893
15499	NC_005835	GGC	2	6	567684	567689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198893
15500	NC_005835	CCA	2	6	567698	567703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198893

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