MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13503	NC_005835	CTG	2	6	492529	492534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198816
13504	NC_005835	GGC	2	6	492553	492558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198816
13505	NC_005835	CTC	2	6	492589	492594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198816
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13624	NC_005835	TGG	2	6	497213	497218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198821
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13649	NC_005835	GAGGT	2	10	498258	498267	20 %	20 %	60 %	0 %	46198822
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13740	NC_005835	ACC	2	6	501393	501398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198825
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13746	NC_005835	AGGGCG	2	12	501523	501534	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198826
13747	NC_005835	GGA	2	6	501545	501550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198826
13748	NC_005835	TCC	2	6	501551	501556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198826
13749	NC_005835	GCCTC	2	10	501605	501614	0 %	20 %	20 %	60 %	46198826
13750	NC_005835	CTCGGG	2	12	501663	501674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198826
13751	NC_005835	G	7	7	501676	501682	0 %	0 %	100 %	0 %	46198826
13752	NC_005835	GAG	2	6	501711	501716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198826
13753	NC_005835	GAG	2	6	501729	501734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198826
13754	NC_005835	AGGT	2	8	501790	501797	25 %	25 %	50 %	0 %	46198826
13755	NC_005835	C	6	6	501842	501847	0 %	0 %	0 %	100 %	46198826
13756	NC_005835	ACC	2	6	501868	501873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198826
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13762	NC_005835	GAG	2	6	502080	502085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198826
13763	NC_005835	CG	3	6	502110	502115	0 %	0 %	50 %	50 %	46198826
13764	NC_005835	CCA	2	6	502139	502144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198826
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13767	NC_005835	CCT	2	6	502288	502293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198827
13768	NC_005835	TCC	2	6	502302	502307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198827
13769	NC_005835	C	7	7	502409	502415	0 %	0 %	0 %	100 %	46198827
13770	NC_005835	GCC	2	6	502475	502480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198827
13771	NC_005835	GGCG	2	8	502483	502490	0 %	0 %	75 %	25 %	46198827
13772	NC_005835	GCCC	2	8	502511	502518	0 %	0 %	25 %	75 %	46198827
13773	NC_005835	AGG	2	6	502614	502619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198827
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13775	NC_005835	GCT	2	6	502636	502641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198827
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13777	NC_005835	GCG	2	6	502802	502807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198827
13778	NC_005835	CTC	2	6	502814	502819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198827
13779	NC_005835	TCC	2	6	502848	502853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198827
13780	NC_005835	AAG	2	6	502956	502961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198827
13781	NC_005835	AGG	2	6	503079	503084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198827
13782	NC_005835	TCC	2	6	503106	503111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198827
13783	NC_005835	AGG	3	9	503178	503186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198827
13784	NC_005835	GCC	2	6	503262	503267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198827
13785	NC_005835	CCT	2	6	503289	503294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198828
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13787	NC_005835	TGG	2	6	503348	503353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198828
13788	NC_005835	G	6	6	503379	503384	0 %	0 %	100 %	0 %	46198828
13789	NC_005835	GTT	2	6	503398	503403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198828
13790	NC_005835	CGCC	2	8	503455	503462	0 %	0 %	25 %	75 %	46198828
13791	NC_005835	GCC	2	6	503547	503552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198828
13792	NC_005835	CCA	2	6	503586	503591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198828
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13794	NC_005835	AAGG	2	8	503799	503806	50 %	0 %	50 %	0 %	46198828
13795	NC_005835	GGA	2	6	503817	503822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
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13797	NC_005835	CGG	2	6	503856	503861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198828
13798	NC_005835	GGTC	2	8	503877	503884	0 %	25 %	50 %	25 %	46198828
13799	NC_005835	AGG	2	6	503958	503963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
13800	NC_005835	GGA	2	6	503976	503981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
13801	NC_005835	GGA	2	6	504015	504020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
13802	NC_005835	CCA	2	6	504097	504102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198828
13803	NC_005835	TTC	2	6	504107	504112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198828
13804	NC_005835	AGG	2	6	504136	504141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
13805	NC_005835	CGG	2	6	504154	504159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198828
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13809	NC_005835	G	7	7	504220	504226	0 %	0 %	100 %	0 %	46198828
13810	NC_005835	GGA	3	9	504237	504245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
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13815	NC_005835	G	7	7	504347	504353	0 %	0 %	100 %	0 %	46198828
13816	NC_005835	CCT	2	6	504396	504401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198828
13817	NC_005835	GAG	2	6	504442	504447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198828
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13819	NC_005835	G	6	6	504549	504554	0 %	0 %	100 %	0 %	46198829
13820	NC_005835	GAA	2	6	504561	504566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198829
13821	NC_005835	TCC	2	6	504571	504576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198829
13822	NC_005835	AGGG	2	8	504613	504620	25 %	0 %	75 %	0 %	46198829
13823	NC_005835	TCC	2	6	504631	504636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198829
13824	NC_005835	GGC	2	6	504641	504646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198829
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13826	NC_005835	TCC	2	6	504670	504675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198829
13827	NC_005835	GAG	2	6	504856	504861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198830
13828	NC_005835	CAGGG	2	10	504862	504871	20 %	0 %	60 %	20 %	46198830
13829	NC_005835	AGGA	2	8	504872	504879	50 %	0 %	50 %	0 %	46198830
13830	NC_005835	CACCCG	2	12	504883	504894	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198830
13831	NC_005835	GATGCC	2	12	504913	504924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198830
13832	NC_005835	CCCA	2	8	504937	504944	25 %	0 %	0 %	75 %	46198830
13833	NC_005835	GAG	2	6	504955	504960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198830
13834	NC_005835	GAG	2	6	505012	505017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198830
13835	NC_005835	C	6	6	505025	505030	0 %	0 %	0 %	100 %	46198830
13836	NC_005835	AGG	2	6	505037	505042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198830
13837	NC_005835	GAG	4	12	505123	505134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198830
13838	NC_005835	GAG	2	6	505171	505176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198830
13839	NC_005835	AGA	2	6	505194	505199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198830
13840	NC_005835	CGC	2	6	505207	505212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198830
13841	NC_005835	CCGC	2	8	505248	505255	0 %	0 %	25 %	75 %	46198830
13842	NC_005835	CTC	2	6	505285	505290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198830
13843	NC_005835	C	7	7	505315	505321	0 %	0 %	0 %	100 %	46198830
13844	NC_005835	ACC	2	6	505346	505351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198830
13845	NC_005835	CCGCC	2	10	505359	505368	0 %	0 %	20 %	80 %	46198830
13846	NC_005835	GTG	2	6	505415	505420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198830
13847	NC_005835	GGC	2	6	505510	505515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198830
13848	NC_005835	GGC	2	6	505561	505566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13849	NC_005835	ACC	2	6	505646	505651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198831
13850	NC_005835	CTC	2	6	505666	505671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198831
13851	NC_005835	CGG	2	6	505678	505683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198831
13852	NC_005835	CACC	2	8	505704	505711	25 %	0 %	0 %	75 %	46198831
13853	NC_005835	C	6	6	505721	505726	0 %	0 %	0 %	100 %	46198831
13854	NC_005835	G	6	6	505793	505798	0 %	0 %	100 %	0 %	46198831
13855	NC_005835	CTT	2	6	505861	505866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198831
13856	NC_005835	CGC	2	6	505893	505898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198831
13857	NC_005835	CCT	2	6	505899	505904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198831
13858	NC_005835	G	6	6	505940	505945	0 %	0 %	100 %	0 %	46198831
13859	NC_005835	CTC	2	6	505954	505959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198831
13860	NC_005835	CTG	2	6	505992	505997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198831
13861	NC_005835	CGG	2	6	506003	506008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198831
13862	NC_005835	TCCC	2	8	506053	506060	0 %	25 %	0 %	75 %	46198831
13863	NC_005835	TCC	2	6	506063	506068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198831
13864	NC_005835	GCGGG	2	10	506091	506100	0 %	0 %	80 %	20 %	46198831
13865	NC_005835	CG	3	6	506211	506216	0 %	0 %	50 %	50 %	46198831
13866	NC_005835	TCC	2	6	506223	506228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198831
13867	NC_005835	CCGGG	2	10	506246	506255	0 %	0 %	60 %	40 %	46198832
13868	NC_005835	C	6	6	506278	506283	0 %	0 %	0 %	100 %	46198832
13869	NC_005835	TCC	2	6	506368	506373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198832
13870	NC_005835	C	6	6	506372	506377	0 %	0 %	0 %	100 %	46198832
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13992	NC_005835	TCC	2	6	510705	510710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198836
13993	NC_005835	AGG	2	6	510726	510731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198836
13994	NC_005835	GGT	2	6	510827	510832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198836
13995	NC_005835	GGC	2	6	510862	510867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198836
13996	NC_005835	GC	3	6	510902	510907	0 %	0 %	50 %	50 %	46198836
13997	NC_005835	CAG	2	6	510914	510919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198836
13998	NC_005835	GCCTTA	2	12	510930	510941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46198836
13999	NC_005835	GTC	3	9	510950	510958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198836
14000	NC_005835	GAGCCA	2	12	510962	510973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198836

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