MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_005835	C	6	6	456115	456120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12502	NC_005835	GAGG	2	8	456197	456204	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_005835	ACC	2	6	456298	456303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12504	NC_005835	G	6	6	456389	456394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_005835	CGT	2	6	456449	456454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198777
12506	NC_005835	TCC	2	6	456499	456504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198777
12507	NC_005835	G	6	6	456505	456510	0 %	0 %	100 %	0 %	46198777
12508	NC_005835	TGC	2	6	456532	456537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198777
12509	NC_005835	ACC	2	6	456538	456543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198777
12510	NC_005835	TCC	3	9	456637	456645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198777
12511	NC_005835	GCC	2	6	456670	456675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198777
12512	NC_005835	GCC	2	6	456682	456687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198777
12513	NC_005835	GAC	2	6	456702	456707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198777
12514	NC_005835	CGC	2	6	456715	456720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198777
12515	NC_005835	GTG	2	6	456745	456750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198777
12516	NC_005835	TGCT	2	8	456766	456773	0 %	50 %	25 %	25 %	46198777
12517	NC_005835	TGCGG	2	10	456795	456804	0 %	20 %	60 %	20 %	46198777
12518	NC_005835	CCG	2	6	456844	456849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198777
12519	NC_005835	CGC	2	6	456899	456904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198777
12520	NC_005835	AGG	2	6	456919	456924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198777
12521	NC_005835	CGT	2	6	456947	456952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198777
12522	NC_005835	GGC	2	6	456960	456965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198777
12523	NC_005835	GCC	3	9	457024	457032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198777
12524	NC_005835	CTT	2	6	457089	457094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198777
12525	NC_005835	CTT	2	6	457191	457196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198778
12526	NC_005835	TCC	2	6	457244	457249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198778
12527	NC_005835	TGG	2	6	457263	457268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198778
12528	NC_005835	GCGG	2	8	457306	457313	0 %	0 %	75 %	25 %	46198778
12529	NC_005835	CAC	2	6	457538	457543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198778
12530	NC_005835	GGA	3	9	457606	457614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12531	NC_005835	GCCC	2	8	457721	457728	0 %	0 %	25 %	75 %	46198778
12532	NC_005835	GAG	3	9	457820	457828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
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12534	NC_005835	G	6	6	457843	457848	0 %	0 %	100 %	0 %	46198778
12535	NC_005835	GAG	2	6	457853	457858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12536	NC_005835	GAG	2	6	457862	457867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12537	NC_005835	CCCT	2	8	457908	457915	0 %	25 %	0 %	75 %	46198778
12538	NC_005835	GAA	2	6	457931	457936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198778
12539	NC_005835	CCT	2	6	457951	457956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198778
12540	NC_005835	GAG	2	6	458006	458011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12541	NC_005835	GAG	2	6	458021	458026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12542	NC_005835	CGC	2	6	458068	458073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198778
12543	NC_005835	GAG	2	6	458105	458110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12544	NC_005835	CTC	2	6	458111	458116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198778
12545	NC_005835	GGA	2	6	458155	458160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
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12550	NC_005835	TCC	2	6	458269	458274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198778
12551	NC_005835	AGG	2	6	458281	458286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12552	NC_005835	CTT	2	6	458294	458299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198778
12553	NC_005835	TCC	2	6	458301	458306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198778
12554	NC_005835	CCA	2	6	458317	458322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198778
12555	NC_005835	C	6	6	458412	458417	0 %	0 %	0 %	100 %	46198778
12556	NC_005835	GAG	2	6	458420	458425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12557	NC_005835	AGG	2	6	458439	458444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12558	NC_005835	AGG	4	12	458478	458489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12559	NC_005835	TGG	2	6	458508	458513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198778
12560	NC_005835	G	8	8	458578	458585	0 %	0 %	100 %	0 %	46198778
12561	NC_005835	GGC	2	6	458593	458598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198778
12562	NC_005835	AGG	2	6	458604	458609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198778
12563	NC_005835	AAGGCG	2	12	458613	458624	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198778
12564	NC_005835	CCT	2	6	458677	458682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_005835	CTC	2	6	458732	458737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198779
12566	NC_005835	GGA	2	6	458743	458748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198779
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12568	NC_005835	CCT	2	6	458833	458838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198779
12569	NC_005835	CGAGG	2	10	458852	458861	20 %	0 %	60 %	20 %	46198779
12570	NC_005835	CGC	3	9	458954	458962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198779
12571	NC_005835	GTA	2	6	458987	458992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198779
12572	NC_005835	CGG	2	6	459004	459009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198779
12573	NC_005835	CTCG	2	8	459023	459030	0 %	25 %	25 %	50 %	46198779
12574	NC_005835	GGGGAA	2	12	459053	459064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198779
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12581	NC_005835	CG	4	8	459314	459321	0 %	0 %	50 %	50 %	46198779
12582	NC_005835	CGT	2	6	459363	459368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12584	NC_005835	G	6	6	459392	459397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_005835	C	6	6	459430	459435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12586	NC_005835	GAG	2	6	459552	459557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198780
12587	NC_005835	GGC	2	6	459660	459665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198780
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12589	NC_005835	GAA	2	6	459708	459713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198780
12590	NC_005835	GGT	2	6	459791	459796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198780
12591	NC_005835	GAG	2	6	459801	459806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198780
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12593	NC_005835	C	6	6	459835	459840	0 %	0 %	0 %	100 %	46198780
12594	NC_005835	TCC	2	6	459904	459909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198780
12595	NC_005835	ATG	2	6	459931	459936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198780
12596	NC_005835	ACG	2	6	459937	459942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198780
12597	NC_005835	CTC	2	6	459951	459956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198780
12598	NC_005835	CGT	2	6	459980	459985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198780
12599	NC_005835	GTC	2	6	460008	460013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198780
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12601	NC_005835	C	6	6	460144	460149	0 %	0 %	0 %	100 %	46198780
12602	NC_005835	GGGT	2	8	460174	460181	0 %	25 %	75 %	0 %	46198780
12603	NC_005835	AGT	2	6	460295	460300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198780
12604	NC_005835	CCG	2	6	460341	460346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198780
12605	NC_005835	AAG	2	6	460378	460383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198780
12606	NC_005835	TCC	2	6	460404	460409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12607	NC_005835	CTC	2	6	460487	460492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198781
12608	NC_005835	CCT	2	6	460528	460533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198781
12609	NC_005835	ATC	2	6	460605	460610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198781
12610	NC_005835	CAC	2	6	460628	460633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198781
12611	NC_005835	CGC	2	6	460634	460639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198781
12612	NC_005835	ACC	2	6	460668	460673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198781
12613	NC_005835	GCC	2	6	460725	460730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198781
12614	NC_005835	CCA	2	6	460732	460737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198781
12615	NC_005835	TCC	2	6	460746	460751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198781
12616	NC_005835	GCCC	2	8	460792	460799	0 %	0 %	25 %	75 %	46198781
12617	NC_005835	C	6	6	460829	460834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12618	NC_005835	G	7	7	460841	460847	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_005835	GAA	2	6	460862	460867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198782
12620	NC_005835	GGGC	2	8	460919	460926	0 %	0 %	75 %	25 %	46198782
12621	NC_005835	CG	3	6	460967	460972	0 %	0 %	50 %	50 %	46198782
12622	NC_005835	GCC	2	6	460990	460995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198782
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12624	NC_005835	CTC	2	6	461024	461029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198782
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12983	NC_005835	GGC	2	6	473226	473231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12994	NC_005835	TTC	2	6	473761	473766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198793
12995	NC_005835	GGCGAA	2	12	473805	473816	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46198793
12996	NC_005835	CAGC	2	8	473853	473860	25 %	0 %	25 %	50 %	46198793
12997	NC_005835	GGC	2	6	473882	473887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198793
12998	NC_005835	GCC	2	6	473901	473906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198793
12999	NC_005835	TCCCG	2	10	473918	473927	0 %	20 %	20 %	60 %	46198793
13000	NC_005835	GGA	2	6	473978	473983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198793

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