MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_005835	GCGGT	2	10	439920	439929	0 %	20 %	60 %	20 %	46198760
12003	NC_005835	CCG	2	6	439948	439953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198760
12004	NC_005835	CCGCC	2	10	440002	440011	0 %	0 %	20 %	80 %	46198760
12005	NC_005835	CCT	2	6	440035	440040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198760
12006	NC_005835	GGCG	2	8	440071	440078	0 %	0 %	75 %	25 %	46198760
12007	NC_005835	GTG	2	6	440090	440095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198760
12008	NC_005835	CCG	2	6	440101	440106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198760
12009	NC_005835	CCAGGT	2	12	440158	440169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198760
12010	NC_005835	GTG	2	6	440192	440197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198760
12011	NC_005835	CCG	2	6	440200	440205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198760
12012	NC_005835	CCA	2	6	440254	440259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198760
12013	NC_005835	GTCCCA	2	12	440270	440281	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46198760
12014	NC_005835	CCT	2	6	440588	440593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198761
12015	NC_005835	TCC	2	6	440594	440599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198761
12016	NC_005835	C	7	7	440601	440607	0 %	0 %	0 %	100 %	46198761
12017	NC_005835	GAG	2	6	440622	440627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12018	NC_005835	CGGT	2	8	440641	440648	0 %	25 %	50 %	25 %	46198761
12019	NC_005835	GAG	3	9	440649	440657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12020	NC_005835	GCC	2	6	440680	440685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198761
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12022	NC_005835	GAG	2	6	440748	440753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12023	NC_005835	GAG	2	6	440760	440765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12024	NC_005835	CCT	2	6	440780	440785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198761
12025	NC_005835	CCG	2	6	440888	440893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198761
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12027	NC_005835	GAG	2	6	440919	440924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12028	NC_005835	TCC	2	6	440926	440931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198761
12029	NC_005835	CCT	2	6	440963	440968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198761
12030	NC_005835	GCC	2	6	440988	440993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198761
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12032	NC_005835	CCT	2	6	441011	441016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198761
12033	NC_005835	GAG	2	6	441027	441032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12034	NC_005835	AGG	2	6	441166	441171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198761
12035	NC_005835	ACT	2	6	441217	441222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198761
12036	NC_005835	AGG	2	6	441252	441257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198762
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12039	NC_005835	AGG	2	6	441396	441401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198762
12040	NC_005835	CGG	2	6	441472	441477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198762
12041	NC_005835	AGG	2	6	441480	441485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198762
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12043	NC_005835	GGC	2	6	441518	441523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198762
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12045	NC_005835	GGA	2	6	441610	441615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198762
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12048	NC_005835	AGG	2	6	441777	441782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198763
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12052	NC_005835	TCCC	2	8	441885	441892	0 %	25 %	0 %	75 %	46198763
12053	NC_005835	CTT	2	6	441916	441921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198763
12054	NC_005835	C	7	7	442010	442016	0 %	0 %	0 %	100 %	46198763
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12056	NC_005835	CGGC	2	8	442062	442069	0 %	0 %	50 %	50 %	46198763
12057	NC_005835	CCT	2	6	442081	442086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198763
12058	NC_005835	GCG	2	6	442118	442123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198763
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12062	NC_005835	CAC	2	6	442265	442270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198763
12063	NC_005835	CCTT	2	8	442289	442296	0 %	50 %	0 %	50 %	46198763
12064	NC_005835	AGG	2	6	442321	442326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198763
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12070	NC_005835	CTC	2	6	442565	442570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198763
12071	NC_005835	CCCGGG	2	12	442585	442596	0 %	0 %	50 %	50 %	46198763
12072	NC_005835	GGT	2	6	442615	442620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198763
12073	NC_005835	CGCC	2	8	442654	442661	0 %	0 %	25 %	75 %	46198763
12074	NC_005835	GCC	2	6	442665	442670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198763
12075	NC_005835	CGT	2	6	442672	442677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198763
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12079	NC_005835	TGG	2	6	442832	442837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198764
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12084	NC_005835	TGG	2	6	442961	442966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198764
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12086	NC_005835	GCG	3	9	443054	443062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198764
12087	NC_005835	CTT	2	6	443082	443087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198764
12088	NC_005835	GGC	2	6	443096	443101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198764
12089	NC_005835	CGG	2	6	443102	443107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198764
12090	NC_005835	ACC	2	6	443153	443158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198764
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12092	NC_005835	GGC	2	6	443174	443179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198764
12093	NC_005835	CCT	3	9	443223	443231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198764
12094	NC_005835	GAGGC	2	10	443251	443260	20 %	0 %	60 %	20 %	46198764
12095	NC_005835	GCT	2	6	443268	443273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198764
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12099	NC_005835	G	6	6	443369	443374	0 %	0 %	100 %	0 %	46198765
12100	NC_005835	GACG	2	8	443400	443407	25 %	0 %	50 %	25 %	46198765
12101	NC_005835	G	6	6	443413	443418	0 %	0 %	100 %	0 %	46198765
12102	NC_005835	CTG	2	6	443458	443463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198765
12103	NC_005835	CCA	2	6	443477	443482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198765
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12105	NC_005835	GGCCC	2	10	443595	443604	0 %	0 %	40 %	60 %	46198765
12106	NC_005835	CCG	2	6	443630	443635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198765
12107	NC_005835	GAG	2	6	443662	443667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198765
12108	NC_005835	GTC	2	6	443695	443700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198765
12109	NC_005835	C	6	6	443721	443726	0 %	0 %	0 %	100 %	46198765
12110	NC_005835	CCGTGG	2	12	443759	443770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198765
12111	NC_005835	AGA	2	6	443792	443797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198765
12112	NC_005835	CTGG	2	8	443853	443860	0 %	25 %	50 %	25 %	46198765
12113	NC_005835	GAT	2	6	443940	443945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198765
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12115	NC_005835	GTG	2	6	444126	444131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198765
12116	NC_005835	GCT	2	6	444232	444237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198766
12117	NC_005835	GCGG	2	8	444260	444267	0 %	0 %	75 %	25 %	46198766
12118	NC_005835	GAG	2	6	444282	444287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198766
12119	NC_005835	GGC	2	6	444332	444337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198766
12120	NC_005835	C	6	6	444388	444393	0 %	0 %	0 %	100 %	46198766
12121	NC_005835	TGG	2	6	444397	444402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198766
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12123	NC_005835	CGG	2	6	444424	444429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198766
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12484	NC_005835	AGT	2	6	455503	455508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198775
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12491	NC_005835	CGC	2	6	455722	455727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198775
12492	NC_005835	CCG	2	6	455746	455751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198775
12493	NC_005835	GGTCCA	2	12	455813	455824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198775
12494	NC_005835	CCT	2	6	455845	455850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198776
12495	NC_005835	CTG	2	6	455936	455941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198776
12496	NC_005835	CCG	2	6	455967	455972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198776
12497	NC_005835	GAG	2	6	456002	456007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198776
12498	NC_005835	CCA	2	6	456025	456030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198776
12499	NC_005835	GAG	2	6	456044	456049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198776
12500	NC_005835	TCC	2	6	456111	456116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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