MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_005835	TCC	2	6	401145	401150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198721
11002	NC_005835	GCC	2	6	401177	401182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198721
11003	NC_005835	GTG	2	6	401192	401197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198721
11004	NC_005835	CGC	2	6	401260	401265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198721
11005	NC_005835	AGG	2	6	401344	401349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198721
11006	NC_005835	GGGC	2	8	401373	401380	0 %	0 %	75 %	25 %	46198721
11007	NC_005835	GGCG	2	8	401392	401399	0 %	0 %	75 %	25 %	46198721
11008	NC_005835	CCT	2	6	401431	401436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198721
11009	NC_005835	GGA	2	6	401437	401442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198721
11010	NC_005835	CGC	2	6	401464	401469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198721
11011	NC_005835	GCC	2	6	401484	401489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198721
11012	NC_005835	CCT	2	6	401527	401532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198721
11013	NC_005835	GGA	2	6	401539	401544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198721
11014	NC_005835	CTC	2	6	401552	401557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198721
11015	NC_005835	CCTTC	2	10	401599	401608	0 %	40 %	0 %	60 %	46198721
11016	NC_005835	CTC	2	6	401609	401614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198721
11017	NC_005835	ACC	2	6	401624	401629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198721
11018	NC_005835	GGT	2	6	401635	401640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198721
11019	NC_005835	C	6	6	401652	401657	0 %	0 %	0 %	100 %	46198721
11020	NC_005835	CAT	2	6	401686	401691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198721
11021	NC_005835	CCGCC	2	10	401719	401728	0 %	0 %	20 %	80 %	46198721
11022	NC_005835	GCCCTG	2	12	401759	401770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198721
11023	NC_005835	G	6	6	401781	401786	0 %	0 %	100 %	0 %	46198721
11024	NC_005835	CTT	2	6	401795	401800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198721
11025	NC_005835	CTC	2	6	401801	401806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198721
11026	NC_005835	CGC	2	6	401821	401826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198721
11027	NC_005835	G	6	6	401853	401858	0 %	0 %	100 %	0 %	46198721
11028	NC_005835	GTG	2	6	401976	401981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_005835	TGA	2	6	401982	401987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_005835	AAAG	2	8	401997	402004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_005835	GC	3	6	402032	402037	0 %	0 %	50 %	50 %	46198722
11032	NC_005835	GAG	2	6	402044	402049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198722
11033	NC_005835	GGC	2	6	402065	402070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198722
11034	NC_005835	GTG	2	6	402243	402248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198722
11035	NC_005835	GGGCG	2	10	402319	402328	0 %	0 %	80 %	20 %	46198722
11036	NC_005835	CTTT	2	8	402344	402351	0 %	75 %	0 %	25 %	46198722
11037	NC_005835	CCT	2	6	402352	402357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198722
11038	NC_005835	GGC	2	6	402411	402416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198722
11039	NC_005835	CAT	2	6	402488	402493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198722
11040	NC_005835	CCG	2	6	402512	402517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198722
11041	NC_005835	G	7	7	402554	402560	0 %	0 %	100 %	0 %	46198722
11042	NC_005835	CGC	2	6	402578	402583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198722
11043	NC_005835	CGGG	2	8	402610	402617	0 %	0 %	75 %	25 %	46198722
11044	NC_005835	CGC	2	6	402653	402658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198722
11045	NC_005835	CAT	3	9	402716	402724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198722
11046	NC_005835	GCC	2	6	402728	402733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198722
11047	NC_005835	CCG	2	6	402962	402967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198722
11048	NC_005835	GCCA	2	8	403029	403036	25 %	0 %	25 %	50 %	46198722
11049	NC_005835	GAG	2	6	403074	403079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198722
11050	NC_005835	CTG	2	6	403114	403119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198723
11051	NC_005835	GGCGGT	2	12	403140	403151	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46198723
11052	NC_005835	TGGG	2	8	403153	403160	0 %	25 %	75 %	0 %	46198723
11053	NC_005835	GGT	2	6	403212	403217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198723
11054	NC_005835	TTC	2	6	403228	403233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198723
11055	NC_005835	CACCT	2	10	403255	403264	20 %	20 %	0 %	60 %	46198723
11056	NC_005835	CTT	2	6	403270	403275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198723
11057	NC_005835	CCT	2	6	403281	403286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198723
11058	NC_005835	AGA	2	6	403319	403324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198723
11059	NC_005835	TCT	2	6	403343	403348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198723
11060	NC_005835	GGC	2	6	403374	403379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198723
11061	NC_005835	CTT	2	6	403446	403451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198723
11062	NC_005835	CCT	2	6	403457	403462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198723
11063	NC_005835	CTG	2	6	403546	403551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198723
11064	NC_005835	TCC	2	6	403589	403594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198723
11065	NC_005835	G	6	6	403691	403696	0 %	0 %	100 %	0 %	46198724
11066	NC_005835	GCCTTG	2	12	403736	403747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198724
11067	NC_005835	AAC	2	6	403766	403771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198724
11068	NC_005835	CCT	2	6	403783	403788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198724
11069	NC_005835	CGC	2	6	403789	403794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198724
11070	NC_005835	AGG	2	6	403848	403853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198724
11071	NC_005835	G	7	7	403891	403897	0 %	0 %	100 %	0 %	46198724
11072	NC_005835	GGT	2	6	403912	403917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198724
11073	NC_005835	TGG	2	6	403941	403946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198724
11074	NC_005835	GCG	2	6	403958	403963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198724
11075	NC_005835	GTG	2	6	403964	403969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198724
11076	NC_005835	TGG	2	6	403980	403985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198724
11077	NC_005835	CCCT	2	8	403986	403993	0 %	25 %	0 %	75 %	46198724
11078	NC_005835	CCG	2	6	404002	404007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198724
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11080	NC_005835	C	6	6	404072	404077	0 %	0 %	0 %	100 %	46198724
11081	NC_005835	TGG	2	6	404103	404108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198724
11082	NC_005835	TTCTC	2	10	404178	404187	0 %	60 %	0 %	40 %	46198724
11083	NC_005835	CCT	2	6	404200	404205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198724
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11086	NC_005835	GGA	2	6	404236	404241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198724
11087	NC_005835	GGCG	2	8	404265	404272	0 %	0 %	75 %	25 %	46198724
11088	NC_005835	GCC	2	6	404339	404344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198724
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11091	NC_005835	G	7	7	404519	404525	0 %	0 %	100 %	0 %	46198724
11092	NC_005835	CTG	2	6	404546	404551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198724
11093	NC_005835	GGGAC	2	10	404552	404561	20 %	0 %	60 %	20 %	46198724
11094	NC_005835	TCC	3	9	404577	404585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198724
11095	NC_005835	TGGG	2	8	404627	404634	0 %	25 %	75 %	0 %	46198724
11096	NC_005835	ATC	2	6	404669	404674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198724
11097	NC_005835	CCCTT	2	10	404823	404832	0 %	40 %	0 %	60 %	46198724
11098	NC_005835	TCC	2	6	404838	404843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198724
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11101	NC_005835	CGC	2	6	404972	404977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198725
11102	NC_005835	GCG	2	6	405010	405015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198725
11103	NC_005835	CGC	2	6	405084	405089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198725
11104	NC_005835	C	6	6	405099	405104	0 %	0 %	0 %	100 %	46198725
11105	NC_005835	GCC	2	6	405122	405127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198725
11106	NC_005835	ACC	2	6	405137	405142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198725
11107	NC_005835	CCA	2	6	405147	405152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198725
11108	NC_005835	CCCG	2	8	405157	405164	0 %	0 %	25 %	75 %	46198725
11109	NC_005835	CTC	2	6	405238	405243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198725
11110	NC_005835	GCCC	2	8	405247	405254	0 %	0 %	25 %	75 %	46198725
11111	NC_005835	G	6	6	405288	405293	0 %	0 %	100 %	0 %	46198725
11112	NC_005835	CTC	2	6	405313	405318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198725
11113	NC_005835	GGCCAC	2	12	405331	405342	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198725
11114	NC_005835	CCCTC	2	10	405351	405360	0 %	20 %	0 %	80 %	46198725
11115	NC_005835	C	6	6	405376	405381	0 %	0 %	0 %	100 %	46198725
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11122	NC_005835	GAC	2	6	405664	405669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198725
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11124	NC_005835	CGG	2	6	405771	405776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198725
11125	NC_005835	CGG	2	6	405822	405827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198725
11126	NC_005835	AGA	2	6	405837	405842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198725
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11128	NC_005835	GAG	2	6	405892	405897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198725
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11152	NC_005835	CCT	2	6	406756	406761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198726
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11154	NC_005835	TGG	2	6	406867	406872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198726
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11191	NC_005835	GGT	3	9	408236	408244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198726
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11224	NC_005835	GGGCCA	2	12	409444	409455	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198728
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11227	NC_005835	GGCCTC	2	12	409532	409543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198728
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11231	NC_005835	CCG	2	6	409670	409675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198728
11232	NC_005835	CCA	2	6	409750	409755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198728
11233	NC_005835	AGG	2	6	409886	409891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198729
11234	NC_005835	G	7	7	409890	409896	0 %	0 %	100 %	0 %	46198729
11235	NC_005835	AGG	2	6	409897	409902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198729
11236	NC_005835	CCT	2	6	409907	409912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198729
11237	NC_005835	CCA	2	6	409922	409927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198729
11238	NC_005835	CGG	2	6	409930	409935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198729
11239	NC_005835	CTC	2	6	410010	410015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198729
11240	NC_005835	C	7	7	410018	410024	0 %	0 %	0 %	100 %	46198729
11241	NC_005835	GGCG	2	8	410060	410067	0 %	0 %	75 %	25 %	46198729
11242	NC_005835	CGG	2	6	410069	410074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198729
11243	NC_005835	TCC	2	6	410125	410130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198729
11244	NC_005835	TTC	2	6	410145	410150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198729
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11246	NC_005835	GCCC	2	8	410183	410190	0 %	0 %	25 %	75 %	46198729
11247	NC_005835	GCCT	2	8	410203	410210	0 %	25 %	25 %	50 %	46198729
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11251	NC_005835	CTT	2	6	410370	410375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198729
11252	NC_005835	GAG	2	6	410376	410381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198729
11253	NC_005835	GAG	2	6	410388	410393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198729
11254	NC_005835	CGC	2	6	410478	410483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198729
11255	NC_005835	GGA	2	6	410522	410527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198729
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11264	NC_005835	GCA	2	6	410820	410825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198729
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11277	NC_005835	C	6	6	411433	411438	0 %	0 %	0 %	100 %	46198730
11278	NC_005835	AGG	2	6	411450	411455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198730
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11280	NC_005835	CGC	2	6	411561	411566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198730
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11298	NC_005835	CTC	2	6	412466	412471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198730
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11302	NC_005835	CCT	2	6	412609	412614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198730
11303	NC_005835	TCC	2	6	412629	412634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198730
11304	NC_005835	GCC	2	6	412647	412652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198730
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11308	NC_005835	GC	3	6	412938	412943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11309	NC_005835	GCC	2	6	412982	412987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11310	NC_005835	CTC	2	6	413021	413026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198731
11311	NC_005835	TC	3	6	413116	413121	0 %	50 %	0 %	50 %	46198731
11312	NC_005835	CGC	2	6	413146	413151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198731
11313	NC_005835	CGGCC	2	10	413298	413307	0 %	0 %	40 %	60 %	46198731
11314	NC_005835	C	6	6	413319	413324	0 %	0 %	0 %	100 %	46198731
11315	NC_005835	CAC	2	6	413326	413331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198731
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11317	NC_005835	GGC	2	6	413470	413475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198731
11318	NC_005835	AGG	3	9	413477	413485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198731
11319	NC_005835	TGGG	2	8	413527	413534	0 %	25 %	75 %	0 %	46198731
11320	NC_005835	GCC	2	6	413570	413575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198732
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11322	NC_005835	CGC	2	6	413716	413721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198732
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11325	NC_005835	TGG	2	6	413844	413849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198732
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11327	NC_005835	CAA	2	6	413881	413886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198732
11328	NC_005835	G	6	6	413889	413894	0 %	0 %	100 %	0 %	46198732
11329	NC_005835	GGA	2	6	413896	413901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198732
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11333	NC_005835	GGA	2	6	414001	414006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198732
11334	NC_005835	ACT	2	6	414045	414050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198732
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11340	NC_005835	G	6	6	414305	414310	0 %	0 %	100 %	0 %	46198732
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11344	NC_005835	G	6	6	414482	414487	0 %	0 %	100 %	0 %	46198732
11345	NC_005835	AGG	2	6	414500	414505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198732
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11350	NC_005835	ACC	2	6	414742	414747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198733
11351	NC_005835	CAC	2	6	414819	414824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198733
11352	NC_005835	CCA	2	6	414827	414832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198733
11353	NC_005835	CTC	2	6	414867	414872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198733
11354	NC_005835	AGA	2	6	414884	414889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198733
11355	NC_005835	AGG	2	6	414962	414967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198733
11356	NC_005835	CCT	2	6	414971	414976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198733
11357	NC_005835	C	7	7	415053	415059	0 %	0 %	0 %	100 %	46198733
11358	NC_005835	GCT	2	6	415100	415105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198733
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11361	NC_005835	ACCC	2	8	415181	415188	25 %	0 %	0 %	75 %	46198734
11362	NC_005835	GAG	2	6	415255	415260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198734
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11364	NC_005835	G	7	7	415296	415302	0 %	0 %	100 %	0 %	46198734
11365	NC_005835	AGG	2	6	415391	415396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198734
11366	NC_005835	AGG	2	6	415439	415444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198734
11367	NC_005835	G	6	6	415470	415475	0 %	0 %	100 %	0 %	46198734
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11493	NC_005835	GCC	2	6	419753	419758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198739
11494	NC_005835	CCA	2	6	419763	419768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198739
11495	NC_005835	GAG	3	9	419785	419793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198739
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