MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_005835	ACC	2	6	236176	236181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198555
6503	NC_005835	GCCC	2	8	236187	236194	0 %	0 %	25 %	75 %	46198555
6504	NC_005835	C	6	6	236192	236197	0 %	0 %	0 %	100 %	46198555
6505	NC_005835	AGT	2	6	236225	236230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198555
6506	NC_005835	GCC	2	6	236239	236244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198555
6507	NC_005835	GAT	2	6	236271	236276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198555
6508	NC_005835	TCT	2	6	236282	236287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198555
6509	NC_005835	TC	3	6	236293	236298	0 %	50 %	0 %	50 %	46198555
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6511	NC_005835	GAG	2	6	236448	236453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198556
6512	NC_005835	GGA	2	6	236468	236473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198556
6513	NC_005835	TGG	2	6	236485	236490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198556
6514	NC_005835	CGG	2	6	236500	236505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198556
6515	NC_005835	CCCCT	2	10	236520	236529	0 %	20 %	0 %	80 %	46198556
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6519	NC_005835	GGC	2	6	236682	236687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198556
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6521	NC_005835	GGT	2	6	236838	236843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_005835	G	8	8	236852	236859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_005835	CTC	2	6	236943	236948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_005835	C	6	6	236964	236969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6525	NC_005835	CCG	2	6	237047	237052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198557
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6534	NC_005835	CCCG	2	8	237372	237379	0 %	0 %	25 %	75 %	46198557
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6543	NC_005835	GAG	2	6	237769	237774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198557
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6558	NC_005835	C	6	6	238238	238243	0 %	0 %	0 %	100 %	46198558
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6565	NC_005835	GGC	2	6	238580	238585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198558
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6604	NC_005835	TGG	2	6	239924	239929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198559
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6606	NC_005835	GAG	2	6	240013	240018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198559
6607	NC_005835	CCT	2	6	240035	240040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198559
6608	NC_005835	G	6	6	240062	240067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6613	NC_005835	GTCCCG	2	12	240186	240197	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198560
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6615	NC_005835	G	8	8	240224	240231	0 %	0 %	100 %	0 %	46198560
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6622	NC_005835	CCT	3	9	240356	240364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198560
6623	NC_005835	GGCCAA	2	12	240366	240377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198560
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6625	NC_005835	TCG	2	6	240403	240408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198560
6626	NC_005835	CCA	2	6	240506	240511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198560
6627	NC_005835	ACC	2	6	240550	240555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198560
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6629	NC_005835	G	6	6	240617	240622	0 %	0 %	100 %	0 %	46198560
6630	NC_005835	CCT	2	6	240623	240628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198560
6631	NC_005835	CTC	2	6	240804	240809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198560
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6633	NC_005835	GTC	2	6	240876	240881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198560
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6637	NC_005835	GCTC	2	8	241038	241045	0 %	25 %	25 %	50 %	46198560
6638	NC_005835	GCG	2	6	241077	241082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198560
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6641	NC_005835	AGG	2	6	241174	241179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198560
6642	NC_005835	GGA	2	6	241202	241207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198560
6643	NC_005835	TCC	2	6	241399	241404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198560
6644	NC_005835	AGG	2	6	241414	241419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198560
6645	NC_005835	TGG	2	6	241453	241458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198560
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6647	NC_005835	CCCG	2	8	241604	241611	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6648	NC_005835	TGG	2	6	241633	241638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198561
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6652	NC_005835	G	6	6	241690	241695	0 %	0 %	100 %	0 %	46198561
6653	NC_005835	ACA	2	6	241720	241725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198561
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6656	NC_005835	CGG	2	6	241841	241846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198561
6657	NC_005835	GGT	2	6	241895	241900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198561
6658	NC_005835	GGA	2	6	241997	242002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6659	NC_005835	GGC	2	6	242003	242008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198561
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6664	NC_005835	TCC	2	6	242218	242223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198561
6665	NC_005835	TGCGC	2	10	242227	242236	0 %	20 %	40 %	40 %	46198561
6666	NC_005835	TCCAGG	2	12	242287	242298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198561
6667	NC_005835	GGC	2	6	242345	242350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198561
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6669	NC_005835	AGCAC	2	10	242446	242455	40 %	0 %	20 %	40 %	46198561
6670	NC_005835	G	7	7	242501	242507	0 %	0 %	100 %	0 %	46198561
6671	NC_005835	GGT	2	6	242510	242515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198561
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6674	NC_005835	TGC	2	6	242595	242600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198561
6675	NC_005835	AAGG	2	8	242621	242628	50 %	0 %	50 %	0 %	46198561
6676	NC_005835	TCCC	2	8	242677	242684	0 %	25 %	0 %	75 %	46198561
6677	NC_005835	CCT	2	6	242692	242697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198561
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6682	NC_005835	TGG	2	6	242953	242958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198561
6683	NC_005835	TCC	2	6	243013	243018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198561
6684	NC_005835	GGC	2	6	243089	243094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198561
6685	NC_005835	GAG	2	6	243141	243146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
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6689	NC_005835	GAG	2	6	243255	243260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6690	NC_005835	GCC	2	6	243262	243267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198561
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6692	NC_005835	CGAGG	2	10	243407	243416	20 %	0 %	60 %	20 %	46198561
6693	NC_005835	TCC	2	6	243457	243462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198561
6694	NC_005835	GAG	2	6	243480	243485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
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6700	NC_005835	CCCTTC	2	12	243613	243624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198561
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6702	NC_005835	GGA	2	6	243655	243660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6703	NC_005835	GGA	2	6	243683	243688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
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6706	NC_005835	AGG	2	6	243751	243756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6707	NC_005835	CGGGG	2	10	243770	243779	0 %	0 %	80 %	20 %	46198561
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6740	NC_005835	AGGCCC	2	12	244828	244839	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198561
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6742	NC_005835	CCA	2	6	245134	245139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198561
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6744	NC_005835	CCA	2	6	245192	245197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198562
6745	NC_005835	CTT	2	6	245204	245209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198562
6746	NC_005835	AGG	2	6	245250	245255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198562
6747	NC_005835	GA	3	6	245286	245291	50 %	0 %	50 %	0 %	46198562
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6749	NC_005835	GCCC	2	8	245575	245582	0 %	0 %	25 %	75 %	46198563
6750	NC_005835	CTCC	2	8	245623	245630	0 %	25 %	0 %	75 %	46198563
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6754	NC_005835	CTT	2	6	245842	245847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198563
6755	NC_005835	CTA	2	6	245851	245856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198563
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6758	NC_005835	CTT	2	6	245983	245988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198563
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6770	NC_005835	CCT	2	6	246456	246461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
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6773	NC_005835	CGGGG	2	10	246594	246603	0 %	0 %	80 %	20 %	46198563
6774	NC_005835	G	6	6	246600	246605	0 %	0 %	100 %	0 %	46198563
6775	NC_005835	TTCC	2	8	246628	246635	0 %	50 %	0 %	50 %	46198563
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6783	NC_005835	TGG	2	6	246882	246887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
6784	NC_005835	GGT	2	6	246919	246924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
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6787	NC_005835	TGG	3	9	246966	246974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
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6792	NC_005835	CTC	2	6	247247	247252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
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6797	NC_005835	GCCCTG	2	12	247525	247536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198564
6798	NC_005835	CTC	2	6	247585	247590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198564
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6807	NC_005835	G	6	6	247911	247916	0 %	0 %	100 %	0 %	46198564
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6809	NC_005835	GGGCCT	2	12	247959	247970	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198564
6810	NC_005835	CCT	3	9	248016	248024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198564
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6869	NC_005835	CGAG	2	8	250015	250022	25 %	0 %	50 %	25 %	46198567
6870	NC_005835	TGGCCC	2	12	250027	250038	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198567
6871	NC_005835	CACCCA	2	12	250073	250084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198567
6872	NC_005835	CAT	2	6	250166	250171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198567
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6998	NC_005835	GGC	2	6	254412	254417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198571
6999	NC_005835	GCGGA	2	10	254444	254453	20 %	0 %	60 %	20 %	46198571
7000	NC_005835	AGGGCC	2	12	254471	254482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46198571

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