MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_005835	CCA	2	6	218355	218360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198538
6003	NC_005835	TCC	2	6	218417	218422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198538
6004	NC_005835	C	6	6	218427	218432	0 %	0 %	0 %	100 %	46198538
6005	NC_005835	GGA	2	6	218436	218441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198538
6006	NC_005835	GAG	2	6	218479	218484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198538
6007	NC_005835	G	6	6	218484	218489	0 %	0 %	100 %	0 %	46198538
6008	NC_005835	CAC	2	6	218518	218523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198538
6009	NC_005835	GGA	2	6	218526	218531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198538
6010	NC_005835	CCT	2	6	218640	218645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198538
6011	NC_005835	C	7	7	218671	218677	0 %	0 %	0 %	100 %	46198538
6012	NC_005835	CCA	2	6	218679	218684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198538
6013	NC_005835	CCT	2	6	218691	218696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198538
6014	NC_005835	C	6	6	218716	218721	0 %	0 %	0 %	100 %	46198538
6015	NC_005835	AGG	3	9	218741	218749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198538
6016	NC_005835	CCT	2	6	218763	218768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198538
6017	NC_005835	GCG	2	6	218780	218785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198538
6018	NC_005835	C	6	6	218800	218805	0 %	0 %	0 %	100 %	46198538
6019	NC_005835	CAC	2	6	218809	218814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198538
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6021	NC_005835	CCA	2	6	218843	218848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198539
6022	NC_005835	GAG	2	6	218901	218906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198539
6023	NC_005835	AGA	2	6	218957	218962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198539
6024	NC_005835	GGT	2	6	218969	218974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198539
6025	NC_005835	CGG	2	6	218975	218980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198539
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6029	NC_005835	TCT	2	6	219146	219151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198539
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6031	NC_005835	CGG	2	6	219185	219190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198539
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6035	NC_005835	GGC	2	6	219279	219284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198539
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6042	NC_005835	G	6	6	219521	219526	0 %	0 %	100 %	0 %	46198539
6043	NC_005835	GGGA	2	8	219531	219538	25 %	0 %	75 %	0 %	46198539
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6112	NC_005835	G	6	6	221934	221939	0 %	0 %	100 %	0 %	46198542
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6126	NC_005835	CGC	2	6	222340	222345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198542
6127	NC_005835	AGG	2	6	222367	222372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198542
6128	NC_005835	CCG	2	6	222388	222393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198542
6129	NC_005835	GGA	3	9	222401	222409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198542
6130	NC_005835	GGC	2	6	222435	222440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198542
6131	NC_005835	CGGGG	2	10	222447	222456	0 %	0 %	80 %	20 %	46198542
6132	NC_005835	GAG	2	6	222474	222479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198542
6133	NC_005835	CCG	2	6	222506	222511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198542
6134	NC_005835	GGCCT	2	10	222526	222535	0 %	20 %	40 %	40 %	46198542
6135	NC_005835	CCG	2	6	222588	222593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198543
6136	NC_005835	GGA	2	6	222601	222606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198543
6137	NC_005835	CCGCC	2	10	222652	222661	0 %	0 %	20 %	80 %	46198543
6138	NC_005835	GGC	2	6	222682	222687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198543
6139	NC_005835	GGA	2	6	222727	222732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198543
6140	NC_005835	GAA	2	6	222755	222760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198543
6141	NC_005835	CCT	2	6	222837	222842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198543
6142	NC_005835	GCC	2	6	222954	222959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198543
6143	NC_005835	CCA	2	6	222982	222987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198543
6144	NC_005835	C	6	6	223042	223047	0 %	0 %	0 %	100 %	46198543
6145	NC_005835	CGG	2	6	223057	223062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198543
6146	NC_005835	TCC	2	6	223095	223100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198543
6147	NC_005835	CCT	2	6	223102	223107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198543
6148	NC_005835	TCC	2	6	223164	223169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198543
6149	NC_005835	CGCC	2	8	223202	223209	0 %	0 %	25 %	75 %	46198543
6150	NC_005835	CCA	2	6	223213	223218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198543
6151	NC_005835	GGC	2	6	223253	223258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198543
6152	NC_005835	C	6	6	223280	223285	0 %	0 %	0 %	100 %	46198543
6153	NC_005835	GGC	2	6	223295	223300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198543
6154	NC_005835	GTA	2	6	223345	223350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198544
6155	NC_005835	TCC	2	6	223412	223417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6156	NC_005835	AGG	2	6	223466	223471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198544
6157	NC_005835	CTC	2	6	223483	223488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6158	NC_005835	CAC	3	9	223513	223521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
6159	NC_005835	TGGGG	2	10	223545	223554	0 %	20 %	80 %	0 %	46198544
6160	NC_005835	CCA	2	6	223560	223565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
6161	NC_005835	GCC	2	6	223568	223573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198544
6162	NC_005835	CCCG	2	8	223633	223640	0 %	0 %	25 %	75 %	46198544
6163	NC_005835	CTC	2	6	223684	223689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6164	NC_005835	GAA	2	6	223717	223722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198544
6165	NC_005835	CCT	2	6	223752	223757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6166	NC_005835	GTA	2	6	223765	223770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198544
6167	NC_005835	CTC	2	6	223843	223848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6168	NC_005835	TCC	2	6	223913	223918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6169	NC_005835	TGA	2	6	223944	223949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198544
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6172	NC_005835	GCC	2	6	224067	224072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198544
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6176	NC_005835	CCA	2	6	224229	224234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
6177	NC_005835	GGC	2	6	224239	224244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198544
6178	NC_005835	GGCA	2	8	224249	224256	25 %	0 %	50 %	25 %	46198544
6179	NC_005835	CAC	2	6	224281	224286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
6180	NC_005835	CGC	2	6	224335	224340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198544
6181	NC_005835	GGA	2	6	224349	224354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198544
6182	NC_005835	ACC	2	6	224375	224380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
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6184	NC_005835	GGC	2	6	224425	224430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198544
6185	NC_005835	CCT	2	6	224457	224462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
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6187	NC_005835	CCA	2	6	224559	224564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
6188	NC_005835	AGG	2	6	224570	224575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198544
6189	NC_005835	AGG	2	6	224588	224593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198544
6190	NC_005835	GGA	2	6	224661	224666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198544
6191	NC_005835	C	7	7	224770	224776	0 %	0 %	0 %	100 %	46198544
6192	NC_005835	CCT	2	6	224782	224787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6193	NC_005835	GGT	2	6	224812	224817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198544
6194	NC_005835	ACC	2	6	224849	224854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198544
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6196	NC_005835	GCC	3	9	224873	224881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198544
6197	NC_005835	CTC	3	9	224908	224916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198544
6198	NC_005835	CAT	2	6	224917	224922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198544
6199	NC_005835	CAT	2	6	224956	224961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198544
6200	NC_005835	CCG	2	6	225005	225010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198545
6201	NC_005835	CAC	2	6	225038	225043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198545
6202	NC_005835	CT	3	6	225129	225134	0 %	50 %	0 %	50 %	46198545
6203	NC_005835	CCAG	2	8	225190	225197	25 %	0 %	25 %	50 %	46198545
6204	NC_005835	CAC	2	6	225359	225364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198545
6205	NC_005835	GTG	2	6	225393	225398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198545
6206	NC_005835	CATGGG	2	12	225431	225442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198545
6207	NC_005835	TCCC	2	8	225444	225451	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6208	NC_005835	GAT	2	6	225488	225493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198546
6209	NC_005835	CTCG	2	8	225506	225513	0 %	25 %	25 %	50 %	46198546
6210	NC_005835	CTC	2	6	225569	225574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6211	NC_005835	AAG	2	6	225576	225581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198546
6212	NC_005835	C	6	6	225587	225592	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6213	NC_005835	GCC	2	6	225627	225632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6214	NC_005835	CTT	2	6	225689	225694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198546
6215	NC_005835	GCC	2	6	225699	225704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6216	NC_005835	GAG	2	6	225713	225718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6217	NC_005835	GCGG	2	8	225719	225726	0 %	0 %	75 %	25 %	46198546
6218	NC_005835	GGC	2	6	225746	225751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198546
6219	NC_005835	GC	3	6	225837	225842	0 %	0 %	50 %	50 %	46198546
6220	NC_005835	CGC	2	6	225863	225868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6221	NC_005835	CCCCTC	2	12	225914	225925	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	46198546
6222	NC_005835	GCACCC	2	12	225949	225960	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198546
6223	NC_005835	CCG	2	6	225985	225990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6224	NC_005835	GGTC	2	8	226084	226091	0 %	25 %	50 %	25 %	46198546
6225	NC_005835	TCT	2	6	226141	226146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198546
6226	NC_005835	CGG	2	6	226176	226181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198546
6227	NC_005835	C	6	6	226252	226257	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6228	NC_005835	GAG	2	6	226307	226312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6229	NC_005835	G	6	6	226312	226317	0 %	0 %	100 %	0 %	46198546
6230	NC_005835	CTG	2	6	226331	226336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198546
6231	NC_005835	AGG	2	6	226357	226362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6232	NC_005835	C	7	7	226367	226373	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6233	NC_005835	TCC	2	6	226377	226382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6234	NC_005835	AGG	2	6	226383	226388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6235	NC_005835	GAA	2	6	226400	226405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198546
6236	NC_005835	C	6	6	226419	226424	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6237	NC_005835	TCC	2	6	226470	226475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6238	NC_005835	CCT	4	12	226495	226506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6239	NC_005835	GCCCC	2	10	226521	226530	0 %	0 %	20 %	80 %	46198546
6240	NC_005835	GA	3	6	226536	226541	50 %	0 %	50 %	0 %	46198546
6241	NC_005835	CCT	2	6	226631	226636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198547
6242	NC_005835	CCGC	2	8	226637	226644	0 %	0 %	25 %	75 %	46198547
6243	NC_005835	ATC	2	6	226672	226677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198547
6244	NC_005835	GCCC	2	8	226699	226706	0 %	0 %	25 %	75 %	46198547
6245	NC_005835	GAA	2	6	226857	226862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198547
6246	NC_005835	GAA	2	6	226907	226912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198547
6247	NC_005835	GGC	2	6	226914	226919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198547
6248	NC_005835	CGC	2	6	226953	226958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198547
6249	NC_005835	AGG	2	6	226978	226983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198547
6250	NC_005835	TCC	2	6	227002	227007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198547
6251	NC_005835	GTG	2	6	227019	227024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198547
6252	NC_005835	GGC	2	6	227031	227036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198547
6253	NC_005835	TGG	2	6	227075	227080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198547
6254	NC_005835	GGC	2	6	227109	227114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198547
6255	NC_005835	CTC	2	6	227115	227120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198547
6256	NC_005835	TCG	3	9	227135	227143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198547
6257	NC_005835	ACCG	2	8	227156	227163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_005835	GAG	2	6	227216	227221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6259	NC_005835	GAA	2	6	227273	227278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198548
6260	NC_005835	CCACCT	2	12	227281	227292	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46198548
6261	NC_005835	AGG	2	6	227328	227333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6262	NC_005835	CCA	2	6	227344	227349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198548
6263	NC_005835	GTA	2	6	227363	227368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198548
6264	NC_005835	GCGG	2	8	227468	227475	0 %	0 %	75 %	25 %	46198548
6265	NC_005835	C	6	6	227615	227620	0 %	0 %	0 %	100 %	46198548
6266	NC_005835	GGC	2	6	227621	227626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198548
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6270	NC_005835	GAG	2	6	227720	227725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
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6272	NC_005835	GAG	2	6	227780	227785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6273	NC_005835	AGGGTC	2	12	227790	227801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198548
6274	NC_005835	GCC	2	6	227866	227871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198548
6275	NC_005835	GCCATG	2	12	227892	227903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198548
6276	NC_005835	CCA	2	6	227914	227919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198548
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6278	NC_005835	GAG	2	6	227972	227977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6279	NC_005835	C	6	6	227981	227986	0 %	0 %	0 %	100 %	46198548
6280	NC_005835	CGCGGG	2	12	228071	228082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6281	NC_005835	CCA	2	6	228123	228128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198549
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6283	NC_005835	GGT	2	6	228277	228282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198549
6284	NC_005835	AGGA	2	8	228328	228335	50 %	0 %	50 %	0 %	46198549
6285	NC_005835	CGG	2	6	228339	228344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198549
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6289	NC_005835	GGC	2	6	228644	228649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
6290	NC_005835	CGG	2	6	228678	228683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
6291	NC_005835	TCT	2	6	228698	228703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198550
6292	NC_005835	GCC	2	6	228768	228773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198550
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6302	NC_005835	ACC	2	6	229065	229070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198550
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6305	NC_005835	GC	3	6	229295	229300	0 %	0 %	50 %	50 %	46198550
6306	NC_005835	CGG	2	6	229357	229362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
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6309	NC_005835	ACC	2	6	229525	229530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6310	NC_005835	TGCGG	2	10	229549	229558	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6311	NC_005835	GCCC	2	8	229585	229592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6312	NC_005835	GGC	2	6	229612	229617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6313	NC_005835	GGA	2	6	229634	229639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6319	NC_005835	GGC	2	6	229816	229821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198551
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6326	NC_005835	GCGAGG	2	12	230051	230062	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198551
6327	NC_005835	TCCAGG	2	12	230069	230080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198551
6328	NC_005835	CTC	2	6	230164	230169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
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6334	NC_005835	CCT	2	6	230346	230351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
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6350	NC_005835	CCT	2	6	230772	230777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
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6362	NC_005835	GCC	2	6	231107	231112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198551
6363	NC_005835	CTC	2	6	231118	231123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
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6371	NC_005835	CCT	2	6	231488	231493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198552
6372	NC_005835	CGTTC	2	10	231545	231554	0 %	40 %	20 %	40 %	46198552
6373	NC_005835	GGT	2	6	231566	231571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198552
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6375	NC_005835	CCA	2	6	231593	231598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198552
6376	NC_005835	AGG	2	6	231691	231696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198552
6377	NC_005835	GGA	2	6	231752	231757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198552
6378	NC_005835	CTC	2	6	231762	231767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198552
6379	NC_005835	CTC	2	6	231792	231797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198552
6380	NC_005835	CAC	2	6	231813	231818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198552
6381	NC_005835	C	7	7	231818	231824	0 %	0 %	0 %	100 %	46198552
6382	NC_005835	GAG	2	6	231837	231842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198552
6383	NC_005835	TGG	3	9	231868	231876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198552
6384	NC_005835	CCTT	2	8	231886	231893	0 %	50 %	0 %	50 %	46198552
6385	NC_005835	GGCCC	2	10	231909	231918	0 %	0 %	40 %	60 %	46198552
6386	NC_005835	GAG	2	6	231930	231935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198552
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6388	NC_005835	CCT	2	6	231963	231968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6389	NC_005835	AGGC	2	8	232140	232147	25 %	0 %	50 %	25 %	46198553
6390	NC_005835	AGCCG	2	10	232168	232177	20 %	0 %	40 %	40 %	46198553
6391	NC_005835	GAG	2	6	232217	232222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198553
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6414	NC_005835	C	7	7	233062	233068	0 %	0 %	0 %	100 %	46198554
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6418	NC_005835	G	6	6	233231	233236	0 %	0 %	100 %	0 %	46198555
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6424	NC_005835	TCC	2	6	233458	233463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198555
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