MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 51419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005835	GTC	2	6	164584	164589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198490
4502	NC_005835	GGA	2	6	164598	164603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198490
4503	NC_005835	AACG	2	8	164807	164814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_005835	CGT	2	6	164836	164841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_005835	AGC	2	6	164856	164861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_005835	CAT	2	6	164866	164871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198491
4507	NC_005835	TGGACC	2	12	164907	164918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198491
4508	NC_005835	TGG	2	6	164925	164930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198491
4509	NC_005835	ACT	2	6	164967	164972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198491
4510	NC_005835	AGC	2	6	164988	164993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198491
4511	NC_005835	AGG	2	6	165006	165011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198491
4512	NC_005835	GAA	2	6	165016	165021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198491
4513	NC_005835	AGG	2	6	165117	165122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198491
4514	NC_005835	CAAGGT	2	12	165127	165138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46198491
4515	NC_005835	CAT	2	6	165142	165147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198491
4516	NC_005835	GTG	2	6	165230	165235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198491
4517	NC_005835	CTC	2	6	165275	165280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198491
4518	NC_005835	G	7	7	165332	165338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_005835	GGA	2	6	165386	165391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_005835	AAG	2	6	165427	165432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161611246
4521	NC_005835	GCGGA	2	10	165559	165568	20 %	0 %	60 %	20 %	161611246
4522	NC_005835	CTC	3	9	165574	165582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161611246
4523	NC_005835	CG	3	6	165610	165615	0 %	0 %	50 %	50 %	46198493
4524	NC_005835	CGT	2	6	165626	165631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198493
4525	NC_005835	CCG	2	6	165632	165637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198493
4526	NC_005835	AAG	2	6	165648	165653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198493
4527	NC_005835	CGC	2	6	165725	165730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198493
4528	NC_005835	CTACGC	2	12	165737	165748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46198493
4529	NC_005835	GCG	2	6	165758	165763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198493
4530	NC_005835	CGC	2	6	165803	165808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198493
4531	NC_005835	GCC	2	6	165811	165816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198493
4532	NC_005835	ACT	2	6	165829	165834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198493
4533	NC_005835	GAA	2	6	165854	165859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198493
4534	NC_005835	GAA	2	6	165881	165886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198493
4535	NC_005835	TGG	2	6	165931	165936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198493
4536	NC_005835	GCC	2	6	165948	165953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198493
4537	NC_005835	CCTC	2	8	165995	166002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4538	NC_005835	TCCC	2	8	166012	166019	0 %	25 %	0 %	75 %	46198494
4539	NC_005835	TGG	2	6	166036	166041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198494
4540	NC_005835	GGT	2	6	166052	166057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198494
4541	NC_005835	G	6	6	166066	166071	0 %	0 %	100 %	0 %	46198494
4542	NC_005835	CCT	2	6	166139	166144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198494
4543	NC_005835	GTG	2	6	166146	166151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198494
4544	NC_005835	CCCTGG	2	12	166153	166164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198494
4545	NC_005835	GGTCCG	2	12	166235	166246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198494
4546	NC_005835	CCTCTT	2	12	166289	166300	0 %	50 %	0 %	50 %	46198494
4547	NC_005835	CGCCCT	2	12	166388	166399	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198494
4548	NC_005835	GTG	2	6	166404	166409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198494
4549	NC_005835	GCG	2	6	166410	166415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198494
4550	NC_005835	CCT	2	6	166418	166423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198494
4551	NC_005835	TCC	3	9	166426	166434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198494
4552	NC_005835	G	7	7	166439	166445	0 %	0 %	100 %	0 %	46198494
4553	NC_005835	GGC	2	6	166539	166544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198495
4554	NC_005835	GCCTGG	2	12	166605	166616	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198495
4555	NC_005835	TCC	2	6	166623	166628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198495
4556	NC_005835	TCCT	2	8	166631	166638	0 %	50 %	0 %	50 %	46198495
4557	NC_005835	CTT	2	6	166667	166672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198495
4558	NC_005835	GGGC	2	8	166676	166683	0 %	0 %	75 %	25 %	46198495
4559	NC_005835	CCT	2	6	166705	166710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198495
4560	NC_005835	CTT	2	6	166753	166758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198495
4561	NC_005835	TCC	2	6	166797	166802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198495
4562	NC_005835	CT	3	6	166811	166816	0 %	50 %	0 %	50 %	46198495
4563	NC_005835	CCCG	2	8	166828	166835	0 %	0 %	25 %	75 %	46198495
4564	NC_005835	GCC	2	6	166901	166906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198495
4565	NC_005835	G	6	6	166946	166951	0 %	0 %	100 %	0 %	46198495
4566	NC_005835	CGCCCT	2	12	166975	166986	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198495
4567	NC_005835	TCC	2	6	166989	166994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198495
4568	NC_005835	CCCCT	2	10	167069	167078	0 %	20 %	0 %	80 %	46198495
4569	NC_005835	GGT	2	6	167089	167094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4570	NC_005835	GGA	2	6	167125	167130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198495
4571	NC_005835	CCT	2	6	167182	167187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198495
4572	NC_005835	G	6	6	167250	167255	0 %	0 %	100 %	0 %	46198495
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4574	NC_005835	CGGG	2	8	167269	167276	0 %	0 %	75 %	25 %	46198495
4575	NC_005835	C	6	6	167301	167306	0 %	0 %	0 %	100 %	46198495
4576	NC_005835	CCA	2	6	167314	167319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198495
4577	NC_005835	GCG	2	6	167347	167352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198495
4578	NC_005835	GGT	2	6	167395	167400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4579	NC_005835	GTG	2	6	167423	167428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4580	NC_005835	AGG	2	6	167451	167456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198495
4581	NC_005835	CGG	2	6	167482	167487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198495
4582	NC_005835	CG	3	6	167510	167515	0 %	0 %	50 %	50 %	46198495
4583	NC_005835	CGG	2	6	167574	167579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198495
4584	NC_005835	GTG	2	6	167582	167587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4585	NC_005835	GTG	2	6	167600	167605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4586	NC_005835	CGCC	2	8	167617	167624	0 %	0 %	25 %	75 %	46198495
4587	NC_005835	TGG	2	6	167637	167642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
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4589	NC_005835	TGG	2	6	167655	167660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4590	NC_005835	GCG	2	6	167687	167692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198495
4591	NC_005835	GAA	2	6	167704	167709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198495
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4593	NC_005835	CGC	2	6	167758	167763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198495
4594	NC_005835	CCA	2	6	167793	167798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198495
4595	NC_005835	ACG	2	6	167853	167858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198495
4596	NC_005835	C	7	7	167866	167872	0 %	0 %	0 %	100 %	46198495
4597	NC_005835	G	7	7	167921	167927	0 %	0 %	100 %	0 %	46198495
4598	NC_005835	GCCT	2	8	167996	168003	0 %	25 %	25 %	50 %	46198495
4599	NC_005835	GGC	2	6	168022	168027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198495
4600	NC_005835	GGA	2	6	168028	168033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198495
4601	NC_005835	G	7	7	168056	168062	0 %	0 %	100 %	0 %	46198495
4602	NC_005835	TTC	2	6	168086	168091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198495
4603	NC_005835	GTG	2	6	168122	168127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198495
4604	NC_005835	AGT	2	6	168129	168134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198495
4605	NC_005835	CTC	2	6	168139	168144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198496
4606	NC_005835	CCTGG	2	10	168198	168207	0 %	20 %	40 %	40 %	46198496
4607	NC_005835	CGC	2	6	168264	168269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198496
4608	NC_005835	CGC	2	6	168288	168293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198496
4609	NC_005835	CTC	2	6	168316	168321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198496
4610	NC_005835	G	6	6	168346	168351	0 %	0 %	100 %	0 %	46198496
4611	NC_005835	CCTT	2	8	168352	168359	0 %	50 %	0 %	50 %	46198496
4612	NC_005835	TGG	2	6	168374	168379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198496
4613	NC_005835	AGG	3	9	168380	168388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198496
4614	NC_005835	AGG	2	6	168410	168415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198496
4615	NC_005835	GAG	2	6	168571	168576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198496
4616	NC_005835	GCCCTG	2	12	168577	168588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198496
4617	NC_005835	G	6	6	168599	168604	0 %	0 %	100 %	0 %	46198496
4618	NC_005835	GGC	2	6	168627	168632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198496
4619	NC_005835	GCCT	2	8	168643	168650	0 %	25 %	25 %	50 %	46198496
4620	NC_005835	GGAGC	2	10	168667	168676	20 %	0 %	60 %	20 %	46198496
4621	NC_005835	CCG	2	6	168695	168700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198496
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4750	NC_005835	TGG	2	6	173534	173539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198501
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4856	NC_005835	G	6	6	177823	177828	0 %	0 %	100 %	0 %	46198506
4857	NC_005835	GGC	2	6	177863	177868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198506
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4871	NC_005835	GGA	2	6	178257	178262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198506
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4999	NC_005835	GGGGA	2	10	182835	182844	20 %	0 %	80 %	0 %	46198508
5000	NC_005835	CCT	2	6	182854	182859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198508

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