MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004572	AAT	2	6	164705	164710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493108
3002	NC_004572	GAT	2	6	164768	164773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493108
3003	NC_004572	AT	3	6	164826	164831	50 %	50 %	0 %	0 %	28493108
3004	NC_004572	TGC	2	6	164896	164901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493108
3005	NC_004572	CCG	2	6	164930	164935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493108
3006	NC_004572	CGG	2	6	164965	164970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493108
3007	NC_004572	ATT	2	6	165146	165151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493108
3008	NC_004572	GCT	2	6	165158	165163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493108
3009	NC_004572	AT	3	6	165165	165170	50 %	50 %	0 %	0 %	28493108
3010	NC_004572	TTG	2	6	165189	165194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493108
3011	NC_004572	GTT	2	6	165203	165208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493108
3012	NC_004572	AAG	2	6	165295	165300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493108
3013	NC_004572	A	6	6	165316	165321	100 %	0 %	0 %	0 %	28493108
3014	NC_004572	GTTT	2	8	165328	165335	0 %	75 %	25 %	0 %	28493108
3015	NC_004572	TGA	2	6	165375	165380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493108
3016	NC_004572	CTAT	2	8	165408	165415	25 %	50 %	0 %	25 %	28493108
3017	NC_004572	CTTT	2	8	165464	165471	0 %	75 %	0 %	25 %	28493108
3018	NC_004572	TGA	2	6	165498	165503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493108
3019	NC_004572	CTT	2	6	165608	165613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493108
3020	NC_004572	AAT	2	6	165635	165640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493108
3021	NC_004572	CGCT	2	8	165779	165786	0 %	25 %	25 %	50 %	28493109
3022	NC_004572	GAA	2	6	165857	165862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493109
3023	NC_004572	AAAT	2	8	165875	165882	75 %	25 %	0 %	0 %	28493109
3024	NC_004572	CGGG	2	8	165888	165895	0 %	0 %	75 %	25 %	28493109
3025	NC_004572	ATA	2	6	165941	165946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493109
3026	NC_004572	AGG	2	6	166013	166018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493109
3027	NC_004572	ATA	2	6	166046	166051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493109
3028	NC_004572	CAA	2	6	166153	166158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493109
3029	NC_004572	TCT	2	6	166197	166202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493109
3030	NC_004572	CAA	2	6	166217	166222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493109
3031	NC_004572	CTT	2	6	166277	166282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493109
3032	NC_004572	GCT	2	6	166327	166332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493109
3033	NC_004572	TCT	2	6	166347	166352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493109
3034	NC_004572	AGT	2	6	166371	166376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493109
3035	NC_004572	GAG	2	6	166393	166398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493109
3036	NC_004572	A	6	6	166404	166409	100 %	0 %	0 %	0 %	28493109
3037	NC_004572	ACG	2	6	166458	166463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493109
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3039	NC_004572	GTT	2	6	166507	166512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493109
3040	NC_004572	CTT	2	6	166567	166572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493109
3041	NC_004572	ATT	2	6	166828	166833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493109
3042	NC_004572	CTT	2	6	166897	166902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493109
3043	NC_004572	GTTA	2	8	167104	167111	25 %	50 %	25 %	0 %	28493109
3044	NC_004572	CA	3	6	167121	167126	50 %	0 %	0 %	50 %	28493109
3045	NC_004572	TG	4	8	167160	167167	0 %	50 %	50 %	0 %	28493109
3046	NC_004572	CAA	2	6	167217	167222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493109
3047	NC_004572	AGTA	2	8	167230	167237	50 %	25 %	25 %	0 %	28493109
3048	NC_004572	TAT	2	6	167349	167354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_004572	ACAGC	2	10	167399	167408	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3050	NC_004572	CA	3	6	167425	167430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_004572	CA	3	6	167440	167445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_004572	ACCA	2	8	167568	167575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_004572	AT	3	6	167591	167596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_004572	CTTA	2	8	167648	167655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_004572	AG	3	6	167739	167744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_004572	ATC	2	6	167758	167763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_004572	CTT	2	6	167770	167775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_004572	CTA	2	6	167783	167788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_004572	GGT	2	6	167789	167794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_004572	TAC	2	6	167842	167847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_004572	CTA	2	6	167941	167946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_004572	AAC	2	6	167958	167963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_004572	GCAG	2	8	168025	168032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_004572	TCTA	2	8	168060	168067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_004572	AGT	2	6	168097	168102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004572	TA	3	6	168142	168147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004572	TA	3	6	168187	168192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_004572	AG	3	6	168269	168274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_004572	TAC	2	6	168342	168347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_004572	CAA	2	6	168392	168397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_004572	AAC	2	6	168447	168452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_004572	GAA	3	9	168496	168504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_004572	ACA	2	6	168539	168544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_004572	CAC	2	6	168563	168568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_004572	CCG	2	6	168629	168634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_004572	AT	3	6	168689	168694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_004572	TGG	2	6	168704	168709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_004572	CA	3	6	168741	168746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_004572	AG	3	6	168779	168784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_004572	CCA	2	6	168788	168793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_004572	ATC	2	6	168798	168803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_004572	CTT	2	6	168810	168815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_004572	TAC	2	6	168852	168857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_004572	GCACC	2	10	168899	168908	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3085	NC_004572	AAC	2	6	168917	168922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_004572	TAG	2	6	168983	168988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_004572	GCAG	2	8	169052	169059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_004572	AT	3	6	169105	169110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_004572	AAAC	2	8	169155	169162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_004572	TA	3	6	169164	169169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_004572	ACA	2	6	169179	169184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_004572	CACAA	2	10	169204	169213	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3093	NC_004572	TAA	2	6	169239	169244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_004572	GAT	2	6	169262	169267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_004572	ACCA	2	8	169270	169277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_004572	ACT	2	6	169302	169307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_004572	CT	3	6	169331	169336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_004572	CCCA	2	8	169378	169385	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3099	NC_004572	ATA	2	6	169472	169477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_004572	AG	3	6	169502	169507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_004572	CA	3	6	169512	169517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_004572	ACA	2	6	169538	169543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_004572	GCACC	2	10	169667	169676	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3104	NC_004572	AAC	2	6	169685	169690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_004572	CCTA	2	8	169724	169731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_004572	AACT	2	8	169751	169758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_004572	ATC	2	6	169786	169791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_004572	CTT	2	6	169798	169803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_004572	GGC	2	6	169805	169810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_004572	GCCACA	2	12	169859	169870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_004572	ACA	2	6	169952	169957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_004572	AACCAT	2	12	170320	170331	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_004572	ACA	3	9	170336	170344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_004572	ATC	2	6	170373	170378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_004572	CAA	2	6	170421	170426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_004572	AG	3	6	170442	170447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_004572	ACC	2	6	170450	170455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_004572	ATC	2	6	170461	170466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_004572	CTT	2	6	170473	170478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_004572	GCA	2	6	170481	170486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_004572	CAA	2	6	170604	170609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_004572	TGG	2	6	170632	170637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_004572	CCT	2	6	170638	170643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_004572	GTA	2	6	170651	170656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_004572	GCA	2	6	170693	170698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_004572	CAG	2	6	170742	170747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_004572	CCT	2	6	170766	170771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_004572	CAA	2	6	170780	170785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_004572	TTG	2	6	170804	170809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_004572	TAG	2	6	170844	170849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3132	NC_004572	GT	3	6	171012	171017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3269	NC_004572	CA	3	6	176671	176676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3270	NC_004572	ATC	2	6	176677	176682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3304	NC_004572	AC	3	6	178704	178709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3392	NC_004572	TCT	3	9	182846	182854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3398	NC_004572	CAAA	2	8	182978	182985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3399	NC_004572	ATAG	2	8	182995	183002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3401	NC_004572	AGCCAT	2	12	183051	183062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3402	NC_004572	ACC	2	6	183076	183081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3403	NC_004572	TGA	2	6	183102	183107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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