MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004572	TGAG	2	8	83598	83605	25 %	25 %	50 %	0 %	28493042
1502	NC_004572	GTTTCT	2	12	83627	83638	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28493042
1503	NC_004572	GGA	2	6	83653	83658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493042
1504	NC_004572	AGC	2	6	83664	83669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493042
1505	NC_004572	ATA	2	6	83715	83720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493042
1506	NC_004572	TGA	2	6	83799	83804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493042
1507	NC_004572	AT	3	6	83835	83840	50 %	50 %	0 %	0 %	28493042
1508	NC_004572	TTA	2	6	83925	83930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493042
1509	NC_004572	GCA	2	6	84005	84010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493042
1510	NC_004572	CTT	2	6	84016	84021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493042
1511	NC_004572	GCT	2	6	84053	84058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493042
1512	NC_004572	GAT	2	6	84118	84123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493042
1513	NC_004572	TGG	2	6	84169	84174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493042
1514	NC_004572	ACC	2	6	84263	84268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493042
1515	NC_004572	TA	3	6	84307	84312	50 %	50 %	0 %	0 %	28493042
1516	NC_004572	GC	3	6	84318	84323	0 %	0 %	50 %	50 %	28493042
1517	NC_004572	CAT	2	6	84327	84332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493042
1518	NC_004572	AAT	2	6	84340	84345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493042
1519	NC_004572	TGG	2	6	84352	84357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493042
1520	NC_004572	ATT	2	6	84363	84368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493042
1521	NC_004572	TGA	2	6	84439	84444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493042
1522	NC_004572	GTG	2	6	84468	84473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493042
1523	NC_004572	GATA	2	8	84545	84552	50 %	25 %	25 %	0 %	28493042
1524	NC_004572	T	6	6	84633	84638	0 %	100 %	0 %	0 %	28493042
1525	NC_004572	AGA	2	6	84837	84842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493043
1526	NC_004572	TGT	2	6	84866	84871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493043
1527	NC_004572	GATG	2	8	84920	84927	25 %	25 %	50 %	0 %	28493043
1528	NC_004572	AC	3	6	84940	84945	50 %	0 %	0 %	50 %	28493043
1529	NC_004572	ATT	2	6	84948	84953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493043
1530	NC_004572	TCT	2	6	84954	84959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493043
1531	NC_004572	TGT	2	6	84971	84976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493043
1532	NC_004572	TTG	2	6	84991	84996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493043
1533	NC_004572	GGA	2	6	85097	85102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493043
1534	NC_004572	TTG	2	6	85198	85203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493043
1535	NC_004572	TA	3	6	85346	85351	50 %	50 %	0 %	0 %	28493043
1536	NC_004572	TGG	2	6	85372	85377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493043
1537	NC_004572	ATG	2	6	85410	85415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493043
1538	NC_004572	ATT	2	6	85540	85545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493043
1539	NC_004572	ATG	2	6	85647	85652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493043
1540	NC_004572	AG	3	6	85707	85712	50 %	0 %	50 %	0 %	28493043
1541	NC_004572	CGA	2	6	85836	85841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493043
1542	NC_004572	CTGG	2	8	85851	85858	0 %	25 %	50 %	25 %	28493043
1543	NC_004572	GAA	2	6	85871	85876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493043
1544	NC_004572	GTT	2	6	85896	85901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493043
1545	NC_004572	ACG	2	6	85913	85918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493043
1546	NC_004572	TTTTG	2	10	85987	85996	0 %	80 %	20 %	0 %	28493044
1547	NC_004572	GAT	2	6	86041	86046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493044
1548	NC_004572	TACA	2	8	86078	86085	50 %	25 %	0 %	25 %	28493044
1549	NC_004572	AGA	2	6	86133	86138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493044
1550	NC_004572	GATA	2	8	86155	86162	50 %	25 %	25 %	0 %	28493044
1551	NC_004572	TGG	2	6	86182	86187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493044
1552	NC_004572	TTG	2	6	86189	86194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493044
1553	NC_004572	AGA	2	6	86306	86311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493044
1554	NC_004572	TTA	2	6	86325	86330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493044
1555	NC_004572	ACC	2	6	86337	86342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493044
1556	NC_004572	TCT	2	6	86386	86391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493044
1557	NC_004572	T	6	6	86435	86440	0 %	100 %	0 %	0 %	28493044
1558	NC_004572	GAC	2	6	86458	86463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493044
1559	NC_004572	T	6	6	86534	86539	0 %	100 %	0 %	0 %	28493044
1560	NC_004572	TG	3	6	86580	86585	0 %	50 %	50 %	0 %	28493044
1561	NC_004572	TTTA	2	8	86588	86595	25 %	75 %	0 %	0 %	28493044
1562	NC_004572	TA	3	6	86687	86692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_004572	CT	3	6	86769	86774	0 %	50 %	0 %	50 %	28493045
1564	NC_004572	AT	4	8	86852	86859	50 %	50 %	0 %	0 %	28493045
1565	NC_004572	ACTG	2	8	86879	86886	25 %	25 %	25 %	25 %	28493045
1566	NC_004572	GTG	2	6	86887	86892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493045
1567	NC_004572	TGGT	2	8	86969	86976	0 %	50 %	50 %	0 %	28493045
1568	NC_004572	ATCTCT	2	12	87001	87012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28493045
1569	NC_004572	CGG	2	6	87059	87064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493045
1570	NC_004572	TTG	3	9	87150	87158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493046
1571	NC_004572	AG	3	6	87200	87205	50 %	0 %	50 %	0 %	28493046
1572	NC_004572	CTG	3	9	87243	87251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493046
1573	NC_004572	TC	3	6	87283	87288	0 %	50 %	0 %	50 %	28493046
1574	NC_004572	A	6	6	87419	87424	100 %	0 %	0 %	0 %	28493046
1575	NC_004572	CAA	2	6	87466	87471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493046
1576	NC_004572	T	7	7	87476	87482	0 %	100 %	0 %	0 %	28493046
1577	NC_004572	AC	3	6	87661	87666	50 %	0 %	0 %	50 %	28493046
1578	NC_004572	GTTG	2	8	87755	87762	0 %	50 %	50 %	0 %	28493046
1579	NC_004572	TG	3	6	87774	87779	0 %	50 %	50 %	0 %	28493046
1580	NC_004572	GGA	2	6	87788	87793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493046
1581	NC_004572	CA	3	6	87820	87825	50 %	0 %	0 %	50 %	28493046
1582	NC_004572	TTG	2	6	87858	87863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493046
1583	NC_004572	CTT	2	6	87872	87877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493046
1584	NC_004572	GAG	2	6	87902	87907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493046
1585	NC_004572	ATG	2	6	87942	87947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493046
1586	NC_004572	TCA	2	6	88147	88152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493046
1587	NC_004572	TGG	2	6	88159	88164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493046
1588	NC_004572	ATT	2	6	88189	88194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493046
1589	NC_004572	CCCTGG	2	12	88285	88296	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28493046
1590	NC_004572	AAT	2	6	88309	88314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493046
1591	NC_004572	ACAA	2	8	88325	88332	75 %	0 %	0 %	25 %	28493046
1592	NC_004572	TGCG	2	8	88347	88354	0 %	25 %	50 %	25 %	28493046
1593	NC_004572	GACTG	2	10	88385	88394	20 %	20 %	40 %	20 %	28493046
1594	NC_004572	TAG	2	6	88456	88461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493046
1595	NC_004572	TGA	2	6	88501	88506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493046
1596	NC_004572	CGTG	2	8	88591	88598	0 %	25 %	50 %	25 %	28493046
1597	NC_004572	ACT	2	6	88681	88686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_004572	AG	3	6	88737	88742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_004572	GCA	2	6	88744	88749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_004572	CAG	2	6	88792	88797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493047
1601	NC_004572	CTT	2	6	88828	88833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493047
1602	NC_004572	TG	3	6	89035	89040	0 %	50 %	50 %	0 %	28493047
1603	NC_004572	TTC	2	6	89045	89050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493047
1604	NC_004572	AGGCA	2	10	89070	89079	40 %	0 %	40 %	20 %	28493047
1605	NC_004572	AT	3	6	89092	89097	50 %	50 %	0 %	0 %	28493047
1606	NC_004572	TGC	2	6	89100	89105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493047
1607	NC_004572	CAAA	2	8	89124	89131	75 %	0 %	0 %	25 %	28493047
1608	NC_004572	AG	3	6	89285	89290	50 %	0 %	50 %	0 %	28493047
1609	NC_004572	CTTTGA	2	12	89349	89360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493047
1610	NC_004572	T	7	7	89381	89387	0 %	100 %	0 %	0 %	28493047
1611	NC_004572	TCAGA	2	10	89545	89554	40 %	20 %	20 %	20 %	28493047
1612	NC_004572	CA	3	6	89623	89628	50 %	0 %	0 %	50 %	28493047
1613	NC_004572	AAT	2	6	89695	89700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493047
1614	NC_004572	GAGC	2	8	89727	89734	25 %	0 %	50 %	25 %	28493047
1615	NC_004572	AGA	3	9	89778	89786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493047
1616	NC_004572	TTG	2	6	89795	89800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493047
1617	NC_004572	T	6	6	89855	89860	0 %	100 %	0 %	0 %	28493047
1618	NC_004572	CAGAG	2	10	89875	89884	40 %	0 %	40 %	20 %	28493047
1619	NC_004572	AGA	2	6	89889	89894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493047
1620	NC_004572	TCA	2	6	89900	89905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493047
1621	NC_004572	CAAT	2	8	89908	89915	50 %	25 %	0 %	25 %	28493047
1622	NC_004572	GTT	2	6	89926	89931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493047
1623	NC_004572	GTG	2	6	90047	90052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493047
1624	NC_004572	TTG	2	6	90077	90082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493047
1625	NC_004572	TGA	2	6	90132	90137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493047
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1627	NC_004572	CGA	2	6	90234	90239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493047
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