MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004572	GGT	2	6	866350	866355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493723
16002	NC_004572	AGT	2	6	866470	866475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493723
16003	NC_004572	GGA	2	6	866527	866532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493723
16004	NC_004572	ATCA	2	8	866641	866648	50 %	25 %	0 %	25 %	28493723
16005	NC_004572	TACG	2	8	866716	866723	25 %	25 %	25 %	25 %	28493723
16006	NC_004572	A	6	6	866732	866737	100 %	0 %	0 %	0 %	28493723
16007	NC_004572	GGA	2	6	866763	866768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493723
16008	NC_004572	A	7	7	866825	866831	100 %	0 %	0 %	0 %	28493723
16009	NC_004572	ATG	2	6	866866	866871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_004572	TG	3	6	866874	866879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_004572	GC	3	6	866917	866922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_004572	TGT	2	6	866977	866982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_004572	GCCTCA	2	12	867014	867025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16014	NC_004572	GCC	2	6	867112	867117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493724
16015	NC_004572	TCT	2	6	867138	867143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493724
16016	NC_004572	CT	4	8	867142	867149	0 %	50 %	0 %	50 %	28493724
16017	NC_004572	TGT	2	6	867171	867176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493724
16018	NC_004572	ATTT	2	8	867229	867236	25 %	75 %	0 %	0 %	28493724
16019	NC_004572	AAT	2	6	867318	867323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493724
16020	NC_004572	TCA	2	6	867350	867355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493724
16021	NC_004572	TAA	2	6	867395	867400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493724
16022	NC_004572	TTC	2	6	867519	867524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493724
16023	NC_004572	CTG	2	6	867583	867588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493724
16024	NC_004572	TAAT	2	8	867638	867645	50 %	50 %	0 %	0 %	28493724
16025	NC_004572	GT	3	6	867695	867700	0 %	50 %	50 %	0 %	28493724
16026	NC_004572	ATT	2	6	867931	867936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493725
16027	NC_004572	TA	3	6	867967	867972	50 %	50 %	0 %	0 %	28493725
16028	NC_004572	TA	3	6	868025	868030	50 %	50 %	0 %	0 %	28493725
16029	NC_004572	CA	3	6	868111	868116	50 %	0 %	0 %	50 %	28493725
16030	NC_004572	TGTCAT	2	12	868172	868183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493725
16031	NC_004572	A	6	6	868226	868231	100 %	0 %	0 %	0 %	28493725
16032	NC_004572	CTG	2	6	868269	868274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493725
16033	NC_004572	ACCTT	2	10	868302	868311	20 %	40 %	0 %	40 %	28493725
16034	NC_004572	CTA	2	6	868322	868327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493725
16035	NC_004572	TGG	2	6	868351	868356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493725
16036	NC_004572	GAC	2	6	868443	868448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493725
16037	NC_004572	ACT	2	6	868462	868467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493725
16038	NC_004572	GA	3	6	868522	868527	50 %	0 %	50 %	0 %	28493725
16039	NC_004572	AG	3	6	868597	868602	50 %	0 %	50 %	0 %	28493725
16040	NC_004572	ATA	2	6	868607	868612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493725
16041	NC_004572	GCA	2	6	868795	868800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493725
16042	NC_004572	CA	3	6	868828	868833	50 %	0 %	0 %	50 %	28493725
16043	NC_004572	AT	3	6	868862	868867	50 %	50 %	0 %	0 %	28493725
16044	NC_004572	TA	3	6	868935	868940	50 %	50 %	0 %	0 %	28493725
16045	NC_004572	TTG	2	6	869106	869111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493725
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16047	NC_004572	TGA	2	6	869266	869271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493725
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16051	NC_004572	TCTT	2	8	869754	869761	0 %	75 %	0 %	25 %	28493726
16052	NC_004572	T	8	8	869801	869808	0 %	100 %	0 %	0 %	28493726
16053	NC_004572	CCA	2	6	869873	869878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493726
16054	NC_004572	ATA	2	6	869900	869905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493726
16055	NC_004572	T	6	6	869936	869941	0 %	100 %	0 %	0 %	28493726
16056	NC_004572	TTC	2	6	869987	869992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493726
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16060	NC_004572	TTC	2	6	870290	870295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493726
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16063	NC_004572	TTGG	2	8	870447	870454	0 %	50 %	50 %	0 %	28493727
16064	NC_004572	AGC	3	9	870464	870472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493727
16065	NC_004572	TA	3	6	870514	870519	50 %	50 %	0 %	0 %	28493727
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16067	NC_004572	AATA	2	8	870606	870613	75 %	25 %	0 %	0 %	28493727
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16069	NC_004572	TTG	2	6	870640	870645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493727
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16079	NC_004572	CTTG	2	8	871187	871194	0 %	50 %	25 %	25 %	28493727
16080	NC_004572	GTT	2	6	871197	871202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493727
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16091	NC_004572	TAGG	2	8	871713	871720	25 %	25 %	50 %	0 %	28493727
16092	NC_004572	AGC	2	6	871733	871738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493727
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16094	NC_004572	CTT	2	6	871784	871789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_004572	AGG	2	6	871790	871795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_004572	GGT	2	6	871844	871849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_004572	TATGGC	2	12	871862	871873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16098	NC_004572	GA	3	6	871899	871904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_004572	TATC	2	8	871920	871927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16100	NC_004572	TTTG	2	8	871940	871947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_004572	GT	3	6	871949	871954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_004572	AG	3	6	871956	871961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_004572	GA	3	6	871998	872003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_004572	TATC	2	8	872011	872018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16105	NC_004572	ATGT	2	8	872060	872067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_004572	AGA	3	9	872071	872079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_004572	GTT	2	6	872088	872093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_004572	GTT	2	6	872112	872117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_004572	GAT	2	6	872190	872195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_004572	AG	3	6	872221	872226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_004572	AT	3	6	872227	872232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_004572	GT	3	6	872233	872238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_004572	TA	3	6	872243	872248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_004572	AT	4	8	872288	872295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_004572	AG	3	6	872314	872319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_004572	GTTT	2	8	872337	872344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_004572	GA	3	6	872372	872377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_004572	GTT	2	6	872391	872396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_004572	CTT	2	6	872404	872409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_004572	TTAC	2	8	872421	872428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16121	NC_004572	GAT	2	6	872472	872477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_004572	AGG	2	6	872478	872483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_004572	AGG	2	6	872492	872497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_004572	TGTC	2	8	872498	872505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16125	NC_004572	GAT	2	6	872532	872537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_004572	AGG	2	6	872538	872543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16128	NC_004572	TCA	2	6	872605	872610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16253	NC_004572	TTC	2	6	878343	878348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493731
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16293	NC_004572	TA	3	6	880490	880495	50 %	50 %	0 %	0 %	28493731
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16364	NC_004572	AACA	2	8	883702	883709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16365	NC_004572	GAC	2	6	883768	883773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16367	NC_004572	TGC	2	6	883915	883920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493733
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16371	NC_004572	GAT	2	6	884001	884006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493733
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16373	NC_004572	T	6	6	884128	884133	0 %	100 %	0 %	0 %	28493733
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