MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_004572	TCC	2	6	809916	809921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493663
15003	NC_004572	GC	3	6	810000	810005	0 %	0 %	50 %	50 %	28493663
15004	NC_004572	ATC	2	6	810017	810022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493663
15005	NC_004572	GA	3	6	810102	810107	50 %	0 %	50 %	0 %	28493663
15006	NC_004572	TA	3	6	810152	810157	50 %	50 %	0 %	0 %	28493663
15007	NC_004572	CAG	2	6	810233	810238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493663
15008	NC_004572	AT	3	6	810330	810335	50 %	50 %	0 %	0 %	28493663
15009	NC_004572	T	6	6	810436	810441	0 %	100 %	0 %	0 %	28493663
15010	NC_004572	CAT	2	6	810466	810471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493663
15011	NC_004572	ATTG	2	8	810557	810564	25 %	50 %	25 %	0 %	28493663
15012	NC_004572	TCA	2	6	810621	810626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493663
15013	NC_004572	TCA	2	6	810681	810686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493663
15014	NC_004572	GA	3	6	810730	810735	50 %	0 %	50 %	0 %	28493663
15015	NC_004572	AAG	2	6	810746	810751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493663
15016	NC_004572	ACA	2	6	810756	810761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493663
15017	NC_004572	AAGC	2	8	810766	810773	50 %	0 %	25 %	25 %	28493663
15018	NC_004572	CTC	2	6	810872	810877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493663
15019	NC_004572	TG	3	6	810926	810931	0 %	50 %	50 %	0 %	28493663
15020	NC_004572	CAA	2	6	810949	810954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493663
15021	NC_004572	GGACA	2	10	811058	811067	40 %	0 %	40 %	20 %	28493663
15022	NC_004572	AG	3	6	811094	811099	50 %	0 %	50 %	0 %	28493663
15023	NC_004572	CTT	2	6	811258	811263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493663
15024	NC_004572	CTTTGC	2	12	811271	811282	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28493663
15025	NC_004572	CGG	2	6	811348	811353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493663
15026	NC_004572	AGAC	2	8	811367	811374	50 %	0 %	25 %	25 %	28493663
15027	NC_004572	GTG	2	6	811375	811380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493663
15028	NC_004572	TTG	2	6	811421	811426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493663
15029	NC_004572	CTG	2	6	811478	811483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493663
15030	NC_004572	AAG	2	6	811690	811695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493663
15031	NC_004572	CCA	2	6	811783	811788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493663
15032	NC_004572	CCT	2	6	811900	811905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493663
15033	NC_004572	CAA	2	6	811912	811917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493663
15034	NC_004572	TCA	2	6	811923	811928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493663
15035	NC_004572	TGT	2	6	811941	811946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493663
15036	NC_004572	ATT	2	6	812090	812095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493663
15037	NC_004572	CTC	2	6	812111	812116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493663
15038	NC_004572	CTT	2	6	812123	812128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493663
15039	NC_004572	GAC	2	6	812141	812146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493663
15040	NC_004572	TAG	2	6	812148	812153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493663
15041	NC_004572	GGGC	2	8	812230	812237	0 %	0 %	75 %	25 %	28493663
15042	NC_004572	GAC	2	6	812259	812264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493663
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15044	NC_004572	CGA	2	6	812300	812305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493663
15045	NC_004572	TTGG	2	8	812310	812317	0 %	50 %	50 %	0 %	28493663
15046	NC_004572	CGACT	2	10	812318	812327	20 %	20 %	20 %	40 %	28493663
15047	NC_004572	T	6	6	812336	812341	0 %	100 %	0 %	0 %	28493663
15048	NC_004572	AAG	2	6	812407	812412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493664
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15050	NC_004572	CAG	2	6	812611	812616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493664
15051	NC_004572	GCT	2	6	812836	812841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493665
15052	NC_004572	CA	3	6	812893	812898	50 %	0 %	0 %	50 %	28493665
15053	NC_004572	CTT	2	6	812951	812956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493665
15054	NC_004572	GA	3	6	812976	812981	50 %	0 %	50 %	0 %	28493665
15055	NC_004572	GCA	2	6	812990	812995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493665
15056	NC_004572	CTG	2	6	812997	813002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493665
15057	NC_004572	AC	3	6	813165	813170	50 %	0 %	0 %	50 %	28493665
15058	NC_004572	TC	3	6	813204	813209	0 %	50 %	0 %	50 %	28493666
15059	NC_004572	GCT	2	6	813211	813216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493666
15060	NC_004572	GAC	2	6	813239	813244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493666
15061	NC_004572	TAG	2	6	813248	813253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493666
15062	NC_004572	TAA	2	6	813358	813363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493666
15063	NC_004572	T	6	6	813365	813370	0 %	100 %	0 %	0 %	28493666
15064	NC_004572	TCC	2	6	813379	813384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15065	NC_004572	TTTCTT	2	12	813386	813397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15066	NC_004572	CCCG	2	8	813413	813420	0 %	0 %	25 %	75 %	28493667
15067	NC_004572	CTTG	2	8	813540	813547	0 %	50 %	25 %	25 %	28493667
15068	NC_004572	GCA	2	6	813574	813579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493667
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15070	NC_004572	AAAGG	2	10	813605	813614	60 %	0 %	40 %	0 %	28493667
15071	NC_004572	AAT	2	6	813617	813622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493667
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15073	NC_004572	GCC	3	9	813707	813715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493667
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15076	NC_004572	C	6	6	813827	813832	0 %	0 %	0 %	100 %	28493667
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15081	NC_004572	GCCG	2	8	814139	814146	0 %	0 %	50 %	50 %	28493667
15082	NC_004572	GCA	2	6	814179	814184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493667
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15094	NC_004572	T	6	6	814928	814933	0 %	100 %	0 %	0 %	28493668
15095	NC_004572	AGAA	2	8	814975	814982	75 %	0 %	25 %	0 %	28493668
15096	NC_004572	ACC	2	6	815029	815034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493668
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15102	NC_004572	ACT	2	6	815251	815256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493668
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15105	NC_004572	AGCA	2	8	815548	815555	50 %	0 %	25 %	25 %	28493669
15106	NC_004572	TGGC	2	8	815577	815584	0 %	25 %	50 %	25 %	28493669
15107	NC_004572	CAA	2	6	815606	815611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493669
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15109	NC_004572	CTT	2	6	815747	815752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493669
15110	NC_004572	GCA	2	6	815830	815835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493669
15111	NC_004572	GC	3	6	815841	815846	0 %	0 %	50 %	50 %	28493669
15112	NC_004572	TTC	2	6	815883	815888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493669
15113	NC_004572	ACC	2	6	815910	815915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15114	NC_004572	CT	3	6	815989	815994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15115	NC_004572	TCAA	2	8	816064	816071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15116	NC_004572	CAA	2	6	816108	816113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493670
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15118	NC_004572	TCC	2	6	816239	816244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493671
15119	NC_004572	TTGC	2	8	816348	816355	0 %	50 %	25 %	25 %	28493671
15120	NC_004572	CGT	2	6	816451	816456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493671
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15123	NC_004572	TTAT	2	8	816646	816653	25 %	75 %	0 %	0 %	28493672
15124	NC_004572	TGA	2	6	816728	816733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493672
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15128	NC_004572	GAA	2	6	816896	816901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493672
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15144	NC_004572	ATT	2	6	817639	817644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493672
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15238	NC_004572	TCGCC	2	10	823062	823071	0 %	20 %	20 %	60 %	28493676
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15247	NC_004572	TCT	2	6	823316	823321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493676
15248	NC_004572	GAA	2	6	823423	823428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493676
15249	NC_004572	ACAT	2	8	823505	823512	50 %	25 %	0 %	25 %	28493676
15250	NC_004572	CTC	2	6	823527	823532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493677
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15252	NC_004572	ATC	2	6	823704	823709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493677
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15261	NC_004572	AT	3	6	824507	824512	50 %	50 %	0 %	0 %	28493677
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15268	NC_004572	ATGG	2	8	825103	825110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15269	NC_004572	CAT	2	6	825130	825135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15271	NC_004572	A	7	7	825189	825195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15272	NC_004572	CGA	2	6	825314	825319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15359	NC_004572	A	6	6	829400	829405	100 %	0 %	0 %	0 %	28493684
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15370	NC_004572	TCA	2	6	829970	829975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493685
15371	NC_004572	A	6	6	830062	830067	100 %	0 %	0 %	0 %	28493685
15372	NC_004572	AAT	2	6	830258	830263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493685
15373	NC_004572	GCC	2	6	830266	830271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493685
15374	NC_004572	T	6	6	830294	830299	0 %	100 %	0 %	0 %	28493685
15375	NC_004572	GC	3	6	830436	830441	0 %	0 %	50 %	50 %	28493685
15376	NC_004572	ATC	2	6	830515	830520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493685
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15379	NC_004572	CAA	2	6	830631	830636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493685
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15383	NC_004572	CAA	2	6	830700	830705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493685
15384	NC_004572	AACA	2	8	830947	830954	75 %	0 %	0 %	25 %	28493686
15385	NC_004572	TA	3	6	831014	831019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15386	NC_004572	ACT	2	6	831041	831046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15387	NC_004572	AT	3	6	831047	831052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_004572	TCA	2	6	831115	831120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493687
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15391	NC_004572	TCA	2	6	831211	831216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493687
15392	NC_004572	TCA	2	6	831385	831390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493687
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15396	NC_004572	TAA	2	6	831637	831642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15397	NC_004572	CAT	2	6	831656	831661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493688
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15399	NC_004572	GA	3	6	831722	831727	50 %	0 %	50 %	0 %	28493688
15400	NC_004572	TGC	2	6	831839	831844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493688
15401	NC_004572	TA	3	6	831892	831897	50 %	50 %	0 %	0 %	28493688
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15403	NC_004572	GCT	2	6	831974	831979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493688
15404	NC_004572	CCT	2	6	832085	832090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15405	NC_004572	GC	3	6	832169	832174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15406	NC_004572	ACAAG	2	10	832246	832255	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15407	NC_004572	GTC	2	6	832332	832337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493689
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15410	NC_004572	CG	3	6	832572	832577	0 %	0 %	50 %	50 %	28493690
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15429	NC_004572	CA	3	6	833909	833914	50 %	0 %	0 %	50 %	28493690
15430	NC_004572	TGT	2	6	833977	833982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15451	NC_004572	CGC	2	6	835150	835155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15453	NC_004572	ACA	2	6	835268	835273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15454	NC_004572	TCTG	2	8	835296	835303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15455	NC_004572	TGT	2	6	835317	835322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15457	NC_004572	AATC	2	8	835466	835473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15458	NC_004572	ACA	2	6	835489	835494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15459	NC_004572	A	7	7	835518	835524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15475	NC_004572	TGA	2	6	836485	836490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493692
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15479	NC_004572	ATT	2	6	836705	836710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493692
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15483	NC_004572	AGA	2	6	836903	836908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493692
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15485	NC_004572	GTT	2	6	837016	837021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15486	NC_004572	TTG	2	6	837146	837151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493693
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15488	NC_004572	A	7	7	837235	837241	100 %	0 %	0 %	0 %	28493693
15489	NC_004572	AGA	2	6	837252	837257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493693
15490	NC_004572	AGTG	2	8	837343	837350	25 %	25 %	50 %	0 %	28493693
15491	NC_004572	A	6	6	837352	837357	100 %	0 %	0 %	0 %	28493693
15492	NC_004572	TTA	2	6	837358	837363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493693
15493	NC_004572	TCA	2	6	837385	837390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493693
15494	NC_004572	AGC	2	6	837491	837496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493693
15495	NC_004572	AAT	2	6	837663	837668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493693
15496	NC_004572	TAT	2	6	837727	837732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493693
15497	NC_004572	CTC	2	6	837792	837797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493693
15498	NC_004572	GA	3	6	837837	837842	50 %	0 %	50 %	0 %	28493693
15499	NC_004572	CGGG	2	8	837855	837862	0 %	0 %	75 %	25 %	28493693
15500	NC_004572	AC	3	6	837863	837868	50 %	0 %	0 %	50 %	28493693

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