MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_004572	TCT	2	6	565211	565216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493443
10503	NC_004572	AC	4	8	565265	565272	50 %	0 %	0 %	50 %	28493443
10504	NC_004572	ACA	2	6	565283	565288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493443
10505	NC_004572	CAC	2	6	565305	565310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493443
10506	NC_004572	A	6	6	565387	565392	100 %	0 %	0 %	0 %	28493443
10507	NC_004572	T	8	8	565409	565416	0 %	100 %	0 %	0 %	28493443
10508	NC_004572	AACTGA	2	12	565442	565453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28493443
10509	NC_004572	TC	3	6	565513	565518	0 %	50 %	0 %	50 %	28493443
10510	NC_004572	TAAA	2	8	565545	565552	75 %	25 %	0 %	0 %	28493443
10511	NC_004572	GA	3	6	565567	565572	50 %	0 %	50 %	0 %	28493443
10512	NC_004572	ATC	2	6	565589	565594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493443
10513	NC_004572	GTT	2	6	565604	565609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493443
10514	NC_004572	ATC	2	6	565771	565776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_004572	CA	3	6	565834	565839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_004572	AGA	2	6	565950	565955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493444
10517	NC_004572	TCTTTT	2	12	566019	566030	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	28493444
10518	NC_004572	T	6	6	566142	566147	0 %	100 %	0 %	0 %	28493444
10519	NC_004572	CAA	2	6	566164	566169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493444
10520	NC_004572	ACC	2	6	566198	566203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493444
10521	NC_004572	CGT	2	6	566218	566223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493444
10522	NC_004572	CAGTC	2	10	566227	566236	20 %	20 %	20 %	40 %	28493444
10523	NC_004572	CTC	2	6	566336	566341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493444
10524	NC_004572	CAA	2	6	566518	566523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493444
10525	NC_004572	GCG	2	6	566720	566725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493444
10526	NC_004572	CAA	2	6	566749	566754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493444
10527	NC_004572	TCT	2	6	566814	566819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493444
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10529	NC_004572	GAAA	2	8	566926	566933	75 %	0 %	25 %	0 %	28493444
10530	NC_004572	GCT	2	6	566939	566944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493444
10531	NC_004572	T	8	8	566983	566990	0 %	100 %	0 %	0 %	28493444
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10533	NC_004572	TCG	2	6	567126	567131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493444
10534	NC_004572	ACGCC	2	10	567166	567175	20 %	0 %	20 %	60 %	28493444
10535	NC_004572	GCA	2	6	567324	567329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493444
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10537	NC_004572	ATC	2	6	567386	567391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493444
10538	NC_004572	ATCT	2	8	567413	567420	25 %	50 %	0 %	25 %	28493444
10539	NC_004572	ATC	2	6	567455	567460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493444
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10542	NC_004572	AATT	2	8	567628	567635	50 %	50 %	0 %	0 %	28493444
10543	NC_004572	A	6	6	567680	567685	100 %	0 %	0 %	0 %	28493444
10544	NC_004572	TA	3	6	567705	567710	50 %	50 %	0 %	0 %	28493444
10545	NC_004572	TAA	2	6	567844	567849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493444
10546	NC_004572	ATTG	2	8	567872	567879	25 %	50 %	25 %	0 %	28493444
10547	NC_004572	CA	3	6	567907	567912	50 %	0 %	0 %	50 %	28493444
10548	NC_004572	ATC	2	6	567920	567925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493444
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10552	NC_004572	AGAATT	2	12	568169	568180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28493444
10553	NC_004572	AGA	2	6	568190	568195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493444
10554	NC_004572	AAC	3	9	568196	568204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493444
10555	NC_004572	GTC	2	6	568263	568268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493444
10556	NC_004572	ATC	2	6	568346	568351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493444
10557	NC_004572	GTT	2	6	568357	568362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493444
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10559	NC_004572	TA	3	6	568449	568454	50 %	50 %	0 %	0 %	28493444
10560	NC_004572	TTC	2	6	568568	568573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493444
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10568	NC_004572	GAA	2	6	569014	569019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493444
10569	NC_004572	ATT	2	6	569068	569073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_004572	ATGACA	2	12	569074	569085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10571	NC_004572	AAG	2	6	569161	569166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_004572	ACC	2	6	569339	569344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493445
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10581	NC_004572	ATCT	2	8	569725	569732	25 %	50 %	0 %	25 %	28493445
10582	NC_004572	TTTC	2	8	569738	569745	0 %	75 %	0 %	25 %	28493445
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10590	NC_004572	GTG	2	6	570168	570173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493445
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10607	NC_004572	CATAC	2	10	571448	571457	40 %	20 %	0 %	40 %	28493445
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10613	NC_004572	GA	3	6	571762	571767	50 %	0 %	50 %	0 %	28493445
10614	NC_004572	CTGAT	2	10	571775	571784	20 %	40 %	20 %	20 %	28493445
10615	NC_004572	CATCG	2	10	571801	571810	20 %	20 %	20 %	40 %	28493446
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10618	NC_004572	A	6	6	572018	572023	100 %	0 %	0 %	0 %	28493446
10619	NC_004572	GGC	2	6	572120	572125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493446
10620	NC_004572	AAT	2	6	572250	572255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493446
10621	NC_004572	CAA	2	6	572282	572287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493446
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10623	NC_004572	CAT	2	6	572552	572557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493446
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10995	NC_004572	CAT	2	6	594767	594772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493465
10996	NC_004572	GCA	2	6	594829	594834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493465
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