MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_004572	CATT	2	8	537974	537981	25 %	50 %	0 %	25 %	28493411
10003	NC_004572	AAGCC	2	10	537985	537994	40 %	0 %	20 %	40 %	28493411
10004	NC_004572	AATTG	2	10	538018	538027	40 %	40 %	20 %	0 %	28493411
10005	NC_004572	CGCA	2	8	538046	538053	25 %	0 %	25 %	50 %	28493411
10006	NC_004572	GAT	2	6	538056	538061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493411
10007	NC_004572	AAAG	2	8	538114	538121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_004572	AG	3	6	538181	538186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_004572	TCC	2	6	538273	538278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493412
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10011	NC_004572	GGC	2	6	538378	538383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493412
10012	NC_004572	AGC	2	6	538412	538417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493412
10013	NC_004572	A	6	6	538438	538443	100 %	0 %	0 %	0 %	28493412
10014	NC_004572	GA	3	6	538444	538449	50 %	0 %	50 %	0 %	28493412
10015	NC_004572	ACC	2	6	538459	538464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493412
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10017	NC_004572	TA	3	6	538645	538650	50 %	50 %	0 %	0 %	28493412
10018	NC_004572	A	7	7	538652	538658	100 %	0 %	0 %	0 %	28493412
10019	NC_004572	AAT	2	6	538661	538666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493412
10020	NC_004572	A	6	6	538693	538698	100 %	0 %	0 %	0 %	28493412
10021	NC_004572	A	6	6	538756	538761	100 %	0 %	0 %	0 %	28493412
10022	NC_004572	AAC	2	6	538780	538785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493412
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10024	NC_004572	AACA	2	8	538888	538895	75 %	0 %	0 %	25 %	28493412
10025	NC_004572	AG	3	6	538913	538918	50 %	0 %	50 %	0 %	28493412
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10030	NC_004572	TAC	2	6	539121	539126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493413
10031	NC_004572	TTAG	2	8	539140	539147	25 %	50 %	25 %	0 %	28493413
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10041	NC_004572	CA	3	6	539669	539674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_004572	CAA	2	6	539901	539906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493414
10043	NC_004572	ATTT	2	8	539968	539975	25 %	75 %	0 %	0 %	28493414
10044	NC_004572	ATC	2	6	539980	539985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493414
10045	NC_004572	CT	3	6	540048	540053	0 %	50 %	0 %	50 %	28493414
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10048	NC_004572	CGA	2	6	540299	540304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493414
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10055	NC_004572	AAG	2	6	540593	540598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493415
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10057	NC_004572	GATA	2	8	540738	540745	50 %	25 %	25 %	0 %	28493415
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10063	NC_004572	CA	3	6	541310	541315	50 %	0 %	0 %	50 %	28493415
10064	NC_004572	CTTC	2	8	541320	541327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_004572	AAAG	2	8	541330	541337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10084	NC_004572	TGA	2	6	542295	542300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10101	NC_004572	GTC	2	6	542980	542985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493417
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10106	NC_004572	TTG	2	6	543213	543218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493418
10107	NC_004572	GCAG	2	8	543307	543314	25 %	0 %	50 %	25 %	28493418
10108	NC_004572	CGA	2	6	543415	543420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493418
10109	NC_004572	TA	3	6	543585	543590	50 %	50 %	0 %	0 %	28493418
10110	NC_004572	ATA	2	6	543620	543625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493418
10111	NC_004572	AGA	2	6	543762	543767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_004572	TTGAC	2	10	543863	543872	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10113	NC_004572	ATA	2	6	543895	543900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_004572	TTA	2	6	543945	543950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493419
10115	NC_004572	TG	3	6	543968	543973	0 %	50 %	50 %	0 %	28493419
10116	NC_004572	CTA	2	6	543995	544000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493419
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10119	NC_004572	ATA	2	6	544197	544202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493419
10120	NC_004572	ACA	2	6	544257	544262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493419
10121	NC_004572	AG	3	6	544334	544339	50 %	0 %	50 %	0 %	28493419
10122	NC_004572	T	6	6	544452	544457	0 %	100 %	0 %	0 %	28493419
10123	NC_004572	GCA	3	9	544505	544513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493419
10124	NC_004572	A	6	6	544552	544557	100 %	0 %	0 %	0 %	28493419
10125	NC_004572	AGA	2	6	544567	544572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493419
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10129	NC_004572	ATA	2	6	544772	544777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493419
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10163	NC_004572	CT	3	6	546351	546356	0 %	50 %	0 %	50 %	28493421
10164	NC_004572	GAG	2	6	546360	546365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493421
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10231	NC_004572	AAC	2	6	549975	549980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493425
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10235	NC_004572	ATA	2	6	550223	550228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10243	NC_004572	CAA	2	6	550417	550422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493426
10244	NC_004572	CCAA	2	8	550464	550471	50 %	0 %	0 %	50 %	28493426
10245	NC_004572	CTT	2	6	550570	550575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493426
10246	NC_004572	A	8	8	550577	550584	100 %	0 %	0 %	0 %	28493426
10247	NC_004572	CTT	2	6	550619	550624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493426
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10355	NC_004572	ATA	2	6	557448	557453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10356	NC_004572	GTA	2	6	557508	557513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10358	NC_004572	ACAA	2	8	557589	557596	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10359	NC_004572	A	6	6	557595	557600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10360	NC_004572	CATGC	2	10	557652	557661	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10362	NC_004572	CGA	2	6	557755	557760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10366	NC_004572	CAG	2	6	557879	557884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493435
10367	NC_004572	A	6	6	557904	557909	100 %	0 %	0 %	0 %	28493435
10368	NC_004572	A	6	6	557915	557920	100 %	0 %	0 %	0 %	28493435
10369	NC_004572	T	6	6	557947	557952	0 %	100 %	0 %	0 %	28493435
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10371	NC_004572	CCA	2	6	558061	558066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493435
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10483	NC_004572	AG	3	6	564324	564329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10491	NC_004572	A	7	7	564735	564741	100 %	0 %	0 %	0 %	28493443
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10497	NC_004572	CCA	2	6	564944	564949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493443
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