MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 17134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_004572	TAA	2	6	423141	423146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493307
8003	NC_004572	TGG	2	6	423181	423186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493307
8004	NC_004572	T	6	6	423190	423195	0 %	100 %	0 %	0 %	28493307
8005	NC_004572	TGC	2	6	423232	423237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493307
8006	NC_004572	TTTG	2	8	423260	423267	0 %	75 %	25 %	0 %	28493307
8007	NC_004572	TCA	2	6	423307	423312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493307
8008	NC_004572	GAAA	2	8	423400	423407	75 %	0 %	25 %	0 %	28493307
8009	NC_004572	CAA	2	6	423665	423670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493307
8010	NC_004572	TCCT	2	8	423693	423700	0 %	50 %	0 %	50 %	28493307
8011	NC_004572	CAG	2	6	423867	423872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493307
8012	NC_004572	GTG	2	6	423891	423896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493307
8013	NC_004572	GT	3	6	423931	423936	0 %	50 %	50 %	0 %	28493308
8014	NC_004572	TGA	2	6	423941	423946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493308
8015	NC_004572	GAA	2	6	423980	423985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493308
8016	NC_004572	GTT	2	6	424005	424010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493308
8017	NC_004572	TGA	2	6	424109	424114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493308
8018	NC_004572	CTG	2	6	424161	424166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493308
8019	NC_004572	TTCCG	2	10	424254	424263	0 %	40 %	20 %	40 %	28493308
8020	NC_004572	GT	4	8	424365	424372	0 %	50 %	50 %	0 %	28493308
8021	NC_004572	T	6	6	424477	424482	0 %	100 %	0 %	0 %	28493308
8022	NC_004572	TGA	2	6	424523	424528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493308
8023	NC_004572	AGGGC	2	10	424570	424579	20 %	0 %	60 %	20 %	28493308
8024	NC_004572	GAG	2	6	424617	424622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493308
8025	NC_004572	GTTAC	2	10	424729	424738	20 %	40 %	20 %	20 %	28493308
8026	NC_004572	TGT	2	6	424757	424762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493308
8027	NC_004572	GAAA	2	8	425055	425062	75 %	0 %	25 %	0 %	28493309
8028	NC_004572	A	7	7	425095	425101	100 %	0 %	0 %	0 %	28493309
8029	NC_004572	AG	3	6	425152	425157	50 %	0 %	50 %	0 %	28493309
8030	NC_004572	CT	3	6	425199	425204	0 %	50 %	0 %	50 %	28493309
8031	NC_004572	TCT	2	6	425241	425246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493309
8032	NC_004572	TC	3	6	425293	425298	0 %	50 %	0 %	50 %	28493309
8033	NC_004572	TGA	2	6	425309	425314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493309
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8035	NC_004572	GGCG	2	8	425596	425603	0 %	0 %	75 %	25 %	28493309
8036	NC_004572	TTG	2	6	425693	425698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493309
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8041	NC_004572	TC	3	6	426078	426083	0 %	50 %	0 %	50 %	28493309
8042	NC_004572	AGG	2	6	426122	426127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493309
8043	NC_004572	A	6	6	426154	426159	100 %	0 %	0 %	0 %	28493309
8044	NC_004572	TTA	2	6	426238	426243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493309
8045	NC_004572	TGC	2	6	426347	426352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493309
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8049	NC_004572	CAG	2	6	426712	426717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493310
8050	NC_004572	CCTG	2	8	426723	426730	0 %	25 %	25 %	50 %	28493310
8051	NC_004572	A	6	6	426772	426777	100 %	0 %	0 %	0 %	28493310
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8053	NC_004572	A	6	6	426947	426952	100 %	0 %	0 %	0 %	28493310
8054	NC_004572	CAT	2	6	426958	426963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493310
8055	NC_004572	AT	3	6	426993	426998	50 %	50 %	0 %	0 %	28493310
8056	NC_004572	CT	3	6	427003	427008	0 %	50 %	0 %	50 %	28493310
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8059	NC_004572	TC	3	6	427059	427064	0 %	50 %	0 %	50 %	28493310
8060	NC_004572	CAT	2	6	427089	427094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493310
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8062	NC_004572	TGC	2	6	427404	427409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493310
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8065	NC_004572	AG	3	6	427511	427516	50 %	0 %	50 %	0 %	28493310
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8076	NC_004572	GAA	2	6	428216	428221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_004572	CA	3	6	428281	428286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8078	NC_004572	TGC	2	6	428298	428303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8081	NC_004572	GCT	2	6	428423	428428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493311
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8083	NC_004572	A	7	7	428448	428454	100 %	0 %	0 %	0 %	28493311
8084	NC_004572	GATA	2	8	428495	428502	50 %	25 %	25 %	0 %	28493311
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8092	NC_004572	AAACC	2	10	428804	428813	60 %	0 %	0 %	40 %	28493311
8093	NC_004572	AGAT	2	8	428934	428941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8103	NC_004572	AGT	2	6	429440	429445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493312
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8105	NC_004572	CTG	2	6	429556	429561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493312
8106	NC_004572	GGAT	2	8	429682	429689	25 %	25 %	50 %	0 %	28493312
8107	NC_004572	A	6	6	429779	429784	100 %	0 %	0 %	0 %	28493312
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8109	NC_004572	GC	4	8	429854	429861	0 %	0 %	50 %	50 %	28493312
8110	NC_004572	TTC	2	6	429963	429968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_004572	TCA	2	6	430147	430152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493313
8112	NC_004572	T	7	7	430158	430164	0 %	100 %	0 %	0 %	28493313
8113	NC_004572	CAA	2	6	430196	430201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493313
8114	NC_004572	TCC	2	6	430222	430227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493313
8115	NC_004572	T	6	6	430228	430233	0 %	100 %	0 %	0 %	28493313
8116	NC_004572	A	7	7	430234	430240	100 %	0 %	0 %	0 %	28493313
8117	NC_004572	ACC	2	6	430290	430295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493313
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8119	NC_004572	CCATA	2	10	430380	430389	40 %	20 %	0 %	40 %	28493313
8120	NC_004572	AGG	2	6	430512	430517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493313
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8122	NC_004572	TGA	2	6	430591	430596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493313
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8124	NC_004572	AT	3	6	430637	430642	50 %	50 %	0 %	0 %	28493313
8125	NC_004572	AAT	2	6	430655	430660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493313
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8127	NC_004572	CTT	2	6	430810	430815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493313
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8249	NC_004572	A	6	6	437923	437928	100 %	0 %	0 %	0 %	28493320
8250	NC_004572	A	7	7	437950	437956	100 %	0 %	0 %	0 %	28493320
8251	NC_004572	TGCA	2	8	438027	438034	25 %	25 %	25 %	25 %	28493320
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8497	NC_004572	CG	3	6	453084	453089	0 %	0 %	50 %	50 %	28493332
8498	NC_004572	TGT	2	6	453147	453152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493332
8499	NC_004572	CCA	2	6	453185	453190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493332
8500	NC_004572	TA	3	6	453262	453267	50 %	50 %	0 %	0 %	28493332

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