MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004551	ATG	2	6	135390	135395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572293
2502	NC_004551	CGA	2	6	135455	135460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572293
2503	NC_004551	TGT	2	6	135542	135547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572293
2504	NC_004551	ATT	2	6	135603	135608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572293
2505	NC_004551	GAT	2	6	135615	135620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572293
2506	NC_004551	TGT	2	6	135676	135681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572293
2507	NC_004551	GTT	2	6	135711	135716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572293
2508	NC_004551	A	6	6	135734	135739	100 %	0 %	0 %	0 %	28572293
2509	NC_004551	TTC	2	6	135743	135748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572293
2510	NC_004551	GAAA	2	8	135790	135797	75 %	0 %	25 %	0 %	28572293
2511	NC_004551	TGA	2	6	135811	135816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572293
2512	NC_004551	ACG	2	6	136016	136021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572293
2513	NC_004551	AGAA	2	8	136052	136059	75 %	0 %	25 %	0 %	28572293
2514	NC_004551	A	6	6	136109	136114	100 %	0 %	0 %	0 %	28572293
2515	NC_004551	GAT	2	6	136122	136127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572293
2516	NC_004551	CGA	2	6	136178	136183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572293
2517	NC_004551	T	6	6	136252	136257	0 %	100 %	0 %	0 %	28572293
2518	NC_004551	T	8	8	136342	136349	0 %	100 %	0 %	0 %	28572293
2519	NC_004551	CAG	2	6	136395	136400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572293
2520	NC_004551	TGA	2	6	136469	136474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572293
2521	NC_004551	GCT	2	6	136512	136517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572293
2522	NC_004551	GCC	2	6	136578	136583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572293
2523	NC_004551	GCT	2	6	136683	136688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572293
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2525	NC_004551	AG	3	6	136757	136762	50 %	0 %	50 %	0 %	28572293
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2527	NC_004551	CTTG	2	8	136787	136794	0 %	50 %	25 %	25 %	28572293
2528	NC_004551	AGC	2	6	136816	136821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572293
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2530	NC_004551	CG	3	6	136866	136871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_004551	TG	3	6	136885	136890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_004551	TTGTA	2	10	136913	136922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_004551	TAG	2	6	136954	136959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_004551	CCG	2	6	137057	137062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572294
2535	NC_004551	CTTC	2	8	137089	137096	0 %	50 %	0 %	50 %	28572294
2536	NC_004551	GATG	2	8	137274	137281	25 %	25 %	50 %	0 %	28572294
2537	NC_004551	TTG	3	9	137291	137299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572294
2538	NC_004551	CTTG	2	8	137340	137347	0 %	50 %	25 %	25 %	28572294
2539	NC_004551	TGA	2	6	137406	137411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572294
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2541	NC_004551	TGT	2	6	137450	137455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572294
2542	NC_004551	TGA	2	6	137568	137573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572294
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2545	NC_004551	CTG	2	6	137809	137814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572294
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2548	NC_004551	TATCC	2	10	138229	138238	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2549	NC_004551	CTT	2	6	138257	138262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_004551	TCA	2	6	138271	138276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_004551	CTT	2	6	138376	138381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_004551	GCAT	2	8	138446	138453	25 %	25 %	25 %	25 %	28572295
2553	NC_004551	ATC	2	6	138472	138477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572295
2554	NC_004551	GCCAT	2	10	138506	138515	20 %	20 %	20 %	40 %	28572295
2555	NC_004551	CA	3	6	138539	138544	50 %	0 %	0 %	50 %	28572295
2556	NC_004551	GCC	2	6	138550	138555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572295
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2559	NC_004551	AGA	2	6	138586	138591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572295
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2562	NC_004551	GCA	3	9	138784	138792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572295
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2569	NC_004551	CACC	2	8	139231	139238	25 %	0 %	0 %	75 %	28572295
2570	NC_004551	AACTG	2	10	139290	139299	40 %	20 %	20 %	20 %	28572295
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2574	NC_004551	CAG	2	6	139457	139462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572295
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2582	NC_004551	GTA	2	6	140004	140009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572295
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2584	NC_004551	TAA	2	6	140267	140272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_004551	CAAGA	2	10	140292	140301	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2586	NC_004551	ACA	2	6	140314	140319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_004551	AACC	2	8	140325	140332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_004551	ATA	2	6	140337	140342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_004551	CTA	2	6	140352	140357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_004551	GCGT	2	8	140477	140484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_004551	CTGC	2	8	140486	140493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2592	NC_004551	AC	3	6	140528	140533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_004551	CAT	2	6	140604	140609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2597	NC_004551	AGA	2	6	140808	140813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572296
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2599	NC_004551	TG	3	6	141011	141016	0 %	50 %	50 %	0 %	28572296
2600	NC_004551	TC	3	6	141059	141064	0 %	50 %	0 %	50 %	28572296
2601	NC_004551	A	7	7	141072	141078	100 %	0 %	0 %	0 %	28572296
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2604	NC_004551	GAAG	2	8	141178	141185	50 %	0 %	50 %	0 %	28572296
2605	NC_004551	AAC	2	6	141396	141401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572296
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2607	NC_004551	CA	3	6	141473	141478	50 %	0 %	0 %	50 %	28572296
2608	NC_004551	GAG	2	6	141529	141534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572296
2609	NC_004551	CT	3	6	141541	141546	0 %	50 %	0 %	50 %	28572296
2610	NC_004551	CTA	2	6	141572	141577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572296
2611	NC_004551	TGC	2	6	141629	141634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572296
2612	NC_004551	ATG	2	6	141656	141661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572296
2613	NC_004551	CATG	2	8	141700	141707	25 %	25 %	25 %	25 %	28572296
2614	NC_004551	CGGCCA	2	12	141749	141760	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28572296
2615	NC_004551	TGG	2	6	141765	141770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572296
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2621	NC_004551	T	6	6	142167	142172	0 %	100 %	0 %	0 %	28572297
2622	NC_004551	GAGG	2	8	142194	142201	25 %	0 %	75 %	0 %	28572297
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2624	NC_004551	TCG	2	6	142216	142221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572297
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2753	NC_004551	AC	3	6	150278	150283	50 %	0 %	0 %	50 %	28572302
2754	NC_004551	AAC	2	6	150381	150386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572302
2755	NC_004551	TGA	2	6	150448	150453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572302
2756	NC_004551	TGA	2	6	150458	150463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572302
2757	NC_004551	CGT	2	6	150489	150494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572302
2758	NC_004551	TCA	2	6	150509	150514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572302
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2761	NC_004551	TGT	2	6	150674	150679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572302
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2765	NC_004551	CTT	2	6	150852	150857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572302
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2772	NC_004551	GGC	2	6	151298	151303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572302
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2781	NC_004551	GCGAGA	2	12	151732	151743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	28572302
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2790	NC_004551	TCT	2	6	152118	152123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2791	NC_004551	T	6	6	152214	152219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2792	NC_004551	AT	3	6	152224	152229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2795	NC_004551	TCT	2	6	152446	152451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2798	NC_004551	AAT	3	9	152584	152592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2860	NC_004551	CTG	2	6	155971	155976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572307
2861	NC_004551	GCTCA	2	10	156029	156038	20 %	20 %	20 %	40 %	28572307
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2863	NC_004551	TTG	2	6	156128	156133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572307
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2872	NC_004551	GCA	2	6	156627	156632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572307
2873	NC_004551	TTCA	2	8	156677	156684	25 %	50 %	0 %	25 %	28572307
2874	NC_004551	GCG	2	6	156856	156861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572307
2875	NC_004551	AAT	2	6	156945	156950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572307
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