MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16003	NC_004551	TGT	2	6	869512	869517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572913
16004	NC_004551	AAC	2	6	869623	869628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572913
16005	NC_004551	TCC	2	6	869638	869643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572913
16006	NC_004551	GA	3	6	869648	869653	50 %	0 %	50 %	0 %	28572913
16007	NC_004551	AGA	2	6	869777	869782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572913
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16009	NC_004551	TGT	2	6	869830	869835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572913
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16011	NC_004551	CTTG	2	8	869896	869903	0 %	50 %	25 %	25 %	28572913
16012	NC_004551	GTT	2	6	869906	869911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572913
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16014	NC_004551	GAT	2	6	870071	870076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572913
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16017	NC_004551	AGGT	2	8	870246	870253	25 %	25 %	50 %	0 %	28572913
16018	NC_004551	TTGG	2	8	870278	870285	0 %	50 %	50 %	0 %	28572913
16019	NC_004551	GAGG	2	8	870296	870303	25 %	0 %	75 %	0 %	28572913
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16055	NC_004551	GAT	2	6	871241	871246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572913
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16081	NC_004551	ATTG	2	8	872348	872355	25 %	50 %	25 %	0 %	28572915
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16109	NC_004551	T	6	6	873979	873984	0 %	100 %	0 %	0 %	28572916
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16120	NC_004551	ATA	2	6	874637	874642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_004551	TTC	2	6	874701	874706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_004551	AT	3	6	874775	874780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_004551	AT	3	6	874786	874791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16125	NC_004551	GCA	2	6	874843	874848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16127	NC_004551	TGGA	2	8	874877	874884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16248	NC_004551	ACC	2	6	880557	880562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572917
16249	NC_004551	AT	3	6	880622	880627	50 %	50 %	0 %	0 %	28572917
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16263	NC_004551	TGC	2	6	881274	881279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572917
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16265	NC_004551	GCG	2	6	881380	881385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572917
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16267	NC_004551	TATG	2	8	881406	881413	25 %	50 %	25 %	0 %	28572917
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16272	NC_004551	GCGA	2	8	881490	881497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16273	NC_004551	TCG	2	6	881562	881567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572918
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16281	NC_004551	CTA	2	6	881807	881812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572918
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16292	NC_004551	AACA	2	8	882378	882385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16293	NC_004551	GAC	2	6	882444	882449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16346	NC_004551	GTA	2	6	885334	885339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572922
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16351	NC_004551	GA	3	6	885528	885533	50 %	0 %	50 %	0 %	28572922
16352	NC_004551	CAC	2	6	885642	885647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572922
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16358	NC_004551	TTG	2	6	886211	886216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572923
16359	NC_004551	TTGA	2	8	886225	886232	25 %	50 %	25 %	0 %	28572923
16360	NC_004551	CCAAAC	2	12	886400	886411	50 %	0 %	0 %	50 %	28572923
16361	NC_004551	GGC	2	6	886471	886476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572923
16362	NC_004551	TTG	3	9	886508	886516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572923
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16365	NC_004551	GGA	2	6	886799	886804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16366	NC_004551	GC	4	8	886823	886830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16367	NC_004551	TCC	2	6	886877	886882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16368	NC_004551	AAG	2	6	886982	886987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16369	NC_004551	GGT	2	6	887018	887023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572924
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16496	NC_004551	TTG	2	6	893577	893582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572929
16497	NC_004551	GTG	2	6	893586	893591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572929
16498	NC_004551	ATT	2	6	893600	893605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572929
16499	NC_004551	G	6	6	893621	893626	0 %	0 %	100 %	0 %	28572929
16500	NC_004551	CA	3	6	893665	893670	50 %	0 %	0 %	50 %	28572929

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