MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004551	GCT	2	6	840871	840876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572885
15502	NC_004551	GCT	2	6	840891	840896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572885
15503	NC_004551	TTG	2	6	841117	841122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572885
15504	NC_004551	GA	3	6	841175	841180	50 %	0 %	50 %	0 %	28572885
15505	NC_004551	CCAT	2	8	841233	841240	25 %	25 %	0 %	50 %	28572885
15506	NC_004551	GCC	2	6	841275	841280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572885
15507	NC_004551	CAT	2	6	841318	841323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572885
15508	NC_004551	CGC	2	6	841351	841356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572885
15509	NC_004551	TG	3	6	841368	841373	0 %	50 %	50 %	0 %	28572885
15510	NC_004551	TCA	2	6	841377	841382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572885
15511	NC_004551	C	7	7	841522	841528	0 %	0 %	0 %	100 %	28572885
15512	NC_004551	AAGACG	2	12	841706	841717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28572885
15513	NC_004551	T	6	6	841729	841734	0 %	100 %	0 %	0 %	28572885
15514	NC_004551	AC	3	6	841863	841868	50 %	0 %	0 %	50 %	28572886
15515	NC_004551	A	6	6	841881	841886	100 %	0 %	0 %	0 %	28572886
15516	NC_004551	TGT	2	6	841946	841951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572886
15517	NC_004551	TA	4	8	841991	841998	50 %	50 %	0 %	0 %	28572886
15518	NC_004551	TCAGAA	2	12	842069	842080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28572886
15519	NC_004551	TCCC	2	8	842224	842231	0 %	25 %	0 %	75 %	28572886
15520	NC_004551	AGT	2	6	842283	842288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572886
15521	NC_004551	A	6	6	842313	842318	100 %	0 %	0 %	0 %	28572886
15522	NC_004551	CA	3	6	842358	842363	50 %	0 %	0 %	50 %	28572886
15523	NC_004551	ATCA	2	8	842364	842371	50 %	25 %	0 %	25 %	28572886
15524	NC_004551	ACA	2	6	842380	842385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572886
15525	NC_004551	C	6	6	842393	842398	0 %	0 %	0 %	100 %	28572886
15526	NC_004551	CG	3	6	842423	842428	0 %	0 %	50 %	50 %	28572886
15527	NC_004551	TGG	2	6	842458	842463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572886
15528	NC_004551	T	6	6	842499	842504	0 %	100 %	0 %	0 %	28572887
15529	NC_004551	CAA	2	6	842518	842523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572887
15530	NC_004551	ATC	2	6	842567	842572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572887
15531	NC_004551	T	6	6	842583	842588	0 %	100 %	0 %	0 %	28572887
15532	NC_004551	TGATTT	2	12	842592	842603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	28572887
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15534	NC_004551	CTCG	2	8	842773	842780	0 %	25 %	25 %	50 %	28572887
15535	NC_004551	GTC	2	6	842846	842851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572887
15536	NC_004551	CAG	2	6	842893	842898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572887
15537	NC_004551	TCC	2	6	842940	842945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572887
15538	NC_004551	GCA	2	6	842967	842972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572887
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15540	NC_004551	ACG	3	9	843077	843085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572887
15541	NC_004551	GTT	2	6	843123	843128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572887
15542	NC_004551	GCACA	2	10	843149	843158	40 %	0 %	20 %	40 %	28572887
15543	NC_004551	CAA	2	6	843286	843291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572887
15544	NC_004551	ACG	2	6	843302	843307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572887
15545	NC_004551	T	6	6	843370	843375	0 %	100 %	0 %	0 %	28572887
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15550	NC_004551	CAT	2	6	843782	843787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572888
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15552	NC_004551	CAA	2	6	843899	843904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572888
15553	NC_004551	TGC	2	6	843913	843918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572888
15554	NC_004551	GCA	2	6	843970	843975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572888
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15557	NC_004551	AAT	2	6	844128	844133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572888
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15561	NC_004551	GCA	2	6	844265	844270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572888
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15570	NC_004551	CCG	2	6	844700	844705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572889
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15573	NC_004551	A	6	6	845038	845043	100 %	0 %	0 %	0 %	28572889
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15578	NC_004551	GAAA	2	8	845367	845374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_004551	TGT	2	6	845394	845399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_004551	CAA	2	6	845423	845428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572890
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15586	NC_004551	CAT	2	6	845970	845975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572890
15587	NC_004551	GCCC	2	8	846005	846012	0 %	0 %	25 %	75 %	28572890
15588	NC_004551	GT	3	6	846032	846037	0 %	50 %	50 %	0 %	28572890
15589	NC_004551	CGC	2	6	846267	846272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572890
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15591	NC_004551	GACC	2	8	846481	846488	25 %	0 %	25 %	50 %	28572890
15592	NC_004551	TAA	2	6	846566	846571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_004551	AAG	2	6	846604	846609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572891
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15596	NC_004551	CCT	2	6	846780	846785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572891
15597	NC_004551	AT	3	6	846815	846820	50 %	50 %	0 %	0 %	28572891
15598	NC_004551	CAGGT	2	10	846935	846944	20 %	20 %	40 %	20 %	28572891
15599	NC_004551	AG	3	6	847010	847015	50 %	0 %	50 %	0 %	28572891
15600	NC_004551	CTG	2	6	847019	847024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572891
15601	NC_004551	AAT	2	6	847137	847142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572891
15602	NC_004551	GTT	2	6	847198	847203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572891
15603	NC_004551	ATA	2	6	847238	847243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572891
15604	NC_004551	AT	3	6	847268	847273	50 %	50 %	0 %	0 %	28572891
15605	NC_004551	TTG	2	6	847307	847312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572891
15606	NC_004551	A	6	6	847583	847588	100 %	0 %	0 %	0 %	28572891
15607	NC_004551	AGC	2	6	847640	847645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572891
15608	NC_004551	AGC	2	6	847796	847801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572891
15609	NC_004551	TGC	2	6	847803	847808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572891
15610	NC_004551	CA	3	6	847820	847825	50 %	0 %	0 %	50 %	28572891
15611	NC_004551	CA	3	6	847881	847886	50 %	0 %	0 %	50 %	28572891
15612	NC_004551	ATCA	2	8	847889	847896	50 %	25 %	0 %	25 %	28572891
15613	NC_004551	CTGTT	2	10	848014	848023	0 %	60 %	20 %	20 %	28572892
15614	NC_004551	ACA	2	6	848155	848160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572892
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15616	NC_004551	ACA	2	6	848230	848235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572892
15617	NC_004551	AC	3	6	848245	848250	50 %	0 %	0 %	50 %	28572892
15618	NC_004551	ACC	2	6	848260	848265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572892
15619	NC_004551	GA	3	6	848266	848271	50 %	0 %	50 %	0 %	28572892
15620	NC_004551	CAA	2	6	848486	848491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572892
15621	NC_004551	AGA	2	6	848504	848509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572892
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15623	NC_004551	AAC	2	6	848542	848547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572892
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15995	NC_004551	TTGG	2	8	869156	869163	0 %	50 %	50 %	0 %	28572913
15996	NC_004551	AGC	3	9	869173	869181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572913
15997	NC_004551	TA	3	6	869223	869228	50 %	50 %	0 %	0 %	28572913
15998	NC_004551	AACC	2	8	869283	869290	50 %	0 %	0 %	50 %	28572913
15999	NC_004551	AATA	2	8	869315	869322	75 %	25 %	0 %	0 %	28572913
16000	NC_004551	GGCA	2	8	869323	869330	25 %	0 %	50 %	25 %	28572913

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