MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 17064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004551	CTTG	2	8	812212	812219	0 %	50 %	25 %	25 %	28572860
15002	NC_004551	GCA	2	6	812246	812251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572860
15003	NC_004551	CGG	2	6	812258	812263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572860
15004	NC_004551	AAAGG	2	10	812277	812286	60 %	0 %	40 %	0 %	28572860
15005	NC_004551	AAT	2	6	812289	812294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572860
15006	NC_004551	AC	3	6	812353	812358	50 %	0 %	0 %	50 %	28572860
15007	NC_004551	GCC	3	9	812379	812387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572860
15008	NC_004551	ATG	2	6	812398	812403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572860
15009	NC_004551	TAAA	2	8	812479	812486	75 %	25 %	0 %	0 %	28572860
15010	NC_004551	C	6	6	812499	812504	0 %	0 %	0 %	100 %	28572860
15011	NC_004551	CAA	2	6	812603	812608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572860
15012	NC_004551	TGC	2	6	812618	812623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572860
15013	NC_004551	ACA	2	6	812693	812698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572860
15014	NC_004551	AGC	2	6	812742	812747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572860
15015	NC_004551	GCCG	2	8	812811	812818	0 %	0 %	50 %	50 %	28572860
15016	NC_004551	GCA	2	6	812851	812856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572860
15017	NC_004551	CGT	2	6	812880	812885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572860
15018	NC_004551	AGC	2	6	812932	812937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572860
15019	NC_004551	AAC	2	6	813049	813054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572861
15020	NC_004551	TTC	2	6	813067	813072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572861
15021	NC_004551	AAT	2	6	813101	813106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572861
15022	NC_004551	TGA	2	6	813137	813142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572861
15023	NC_004551	CA	3	6	813163	813168	50 %	0 %	0 %	50 %	28572861
15024	NC_004551	CAC	2	6	813274	813279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572861
15025	NC_004551	AAT	2	6	813440	813445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572861
15026	NC_004551	GTT	2	6	813489	813494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572861
15027	NC_004551	TAA	2	6	813517	813522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572861
15028	NC_004551	T	6	6	813600	813605	0 %	100 %	0 %	0 %	28572861
15029	NC_004551	AGAA	2	8	813647	813654	75 %	0 %	25 %	0 %	28572861
15030	NC_004551	ACC	2	6	813701	813706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572861
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15032	NC_004551	GA	3	6	813758	813763	50 %	0 %	50 %	0 %	28572861
15033	NC_004551	GAT	2	6	813773	813778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572861
15034	NC_004551	TGT	2	6	813792	813797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572861
15035	NC_004551	GTG	2	6	813904	813909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572861
15036	NC_004551	ACT	2	6	813923	813928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572861
15037	NC_004551	AGCTCA	2	12	814136	814147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28572862
15038	NC_004551	CAG	2	6	814182	814187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572862
15039	NC_004551	AGCA	2	8	814220	814227	50 %	0 %	25 %	25 %	28572862
15040	NC_004551	TGGC	2	8	814249	814256	0 %	25 %	50 %	25 %	28572862
15041	NC_004551	CAA	2	6	814278	814283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572862
15042	NC_004551	CAA	2	6	814410	814415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572862
15043	NC_004551	CTT	2	6	814419	814424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572862
15044	NC_004551	GCA	2	6	814502	814507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572862
15045	NC_004551	GC	3	6	814513	814518	0 %	0 %	50 %	50 %	28572862
15046	NC_004551	TTC	2	6	814555	814560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572862
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15048	NC_004551	CT	3	6	814643	814648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15049	NC_004551	TCAA	2	8	814718	814725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15050	NC_004551	CAA	2	6	814762	814767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_004551	CAA	2	6	814883	814888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_004551	TCC	2	6	814893	814898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15053	NC_004551	TTGC	2	8	815002	815009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15054	NC_004551	CGT	2	6	815105	815110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_004551	CTT	2	6	815155	815160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572863
15056	NC_004551	CAG	2	6	815235	815240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572863
15057	NC_004551	TTAT	2	8	815300	815307	25 %	75 %	0 %	0 %	28572863
15058	NC_004551	TGA	2	6	815382	815387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572863
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15061	NC_004551	CAA	2	6	815539	815544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572863
15062	NC_004551	GAA	2	6	815550	815555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572863
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15064	NC_004551	TGT	2	6	815703	815708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572863
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15072	NC_004551	GCAA	2	8	815988	815995	50 %	0 %	25 %	25 %	28572863
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15081	NC_004551	GGT	2	6	816552	816557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572863
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15089	NC_004551	GAC	2	6	816920	816925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572863
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15091	NC_004551	GACT	2	8	816990	816997	25 %	25 %	25 %	25 %	28572863
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15098	NC_004551	GT	3	6	817253	817258	0 %	50 %	50 %	0 %	28572863
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15101	NC_004551	ATCAG	2	10	817557	817566	40 %	20 %	20 %	20 %	28572863
15102	NC_004551	AGA	2	6	817602	817607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572863
15103	NC_004551	GGCA	2	8	817674	817681	25 %	0 %	50 %	25 %	28572863
15104	NC_004551	TTC	2	6	817694	817699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572863
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15106	NC_004551	TGT	2	6	817788	817793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_004551	TG	3	6	817825	817830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_004551	AAG	2	6	817882	817887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572864
15109	NC_004551	TGC	2	6	817920	817925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572864
15110	NC_004551	GTA	2	6	818000	818005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572864
15111	NC_004551	CAT	2	6	818045	818050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572864
15112	NC_004551	G	6	6	818055	818060	0 %	0 %	100 %	0 %	28572864
15113	NC_004551	TAT	2	6	818106	818111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572864
15114	NC_004551	AAT	2	6	818350	818355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572864
15115	NC_004551	CA	3	6	818363	818368	50 %	0 %	0 %	50 %	28572864
15116	NC_004551	TGA	2	6	818406	818411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572864
15117	NC_004551	TGC	2	6	818444	818449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572864
15118	NC_004551	TGT	2	6	818469	818474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572864
15119	NC_004551	ACGC	2	8	818485	818492	25 %	0 %	25 %	50 %	28572864
15120	NC_004551	AC	3	6	818557	818562	50 %	0 %	0 %	50 %	28572864
15121	NC_004551	ACTA	2	8	818589	818596	50 %	25 %	0 %	25 %	28572864
15122	NC_004551	GCC	2	6	818819	818824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15123	NC_004551	AGG	2	6	818895	818900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_004551	GC	3	6	819001	819006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15125	NC_004551	GAG	2	6	819019	819024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_004551	CTT	2	6	819119	819124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15234	NC_004551	CAA	2	6	824897	824902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15235	NC_004551	GCGG	2	8	824935	824942	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15236	NC_004551	A	6	6	824966	824971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15237	NC_004551	CAAG	2	8	825024	825031	50 %	0 %	25 %	25 %	28572871
15238	NC_004551	T	8	8	825073	825080	0 %	100 %	0 %	0 %	28572871
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15248	NC_004551	TTA	2	6	826098	826103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572872
15249	NC_004551	T	6	6	826114	826119	0 %	100 %	0 %	0 %	28572872
15250	NC_004551	GC	3	6	826158	826163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15251	NC_004551	GCTT	2	8	826169	826176	0 %	50 %	25 %	25 %	28572873
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15269	NC_004551	AACC	2	8	827019	827026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15362	NC_004551	TGGC	2	8	832549	832556	0 %	25 %	50 %	25 %	28572878
15363	NC_004551	CA	3	6	832582	832587	50 %	0 %	0 %	50 %	28572878
15364	NC_004551	TGT	2	6	832650	832655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15369	NC_004551	GCA	2	6	832988	832993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572879
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15494	NC_004551	A	6	6	840660	840665	100 %	0 %	0 %	0 %	28572884
15495	NC_004551	CCG	2	6	840675	840680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572884
15496	NC_004551	GCA	2	6	840684	840689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572884
15497	NC_004551	C	7	7	840712	840718	0 %	0 %	0 %	100 %	28572884
15498	NC_004551	TTCG	2	8	840756	840763	0 %	50 %	25 %	25 %	28572884
15499	NC_004551	GCA	2	6	840795	840800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572885
15500	NC_004551	CG	3	6	840836	840841	0 %	0 %	50 %	50 %	28572885

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